Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2VIH3

Protein Details
Accession A0A1Y2VIH3    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-38TDAPATYKQPSRKGKKAWRKNVDVTEVEHydrophilic
70-91DVALPKKFPKHTSKRLKADEIIHydrophilic
167-188VEDKRNEKKKSPKSFSKKPVSLHydrophilic
279-323EELKVSAKRPERKTKAQRNRIQRRKEEERRKRHEAKTKVRKAQLEBasic
408-434RGRVEARRRIPFKKQAKTKLTEKWAYKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-28RKGKKAW
78-86PKHTSKRLK
98-106PAPPARKRP
170-185KRNEKKKSPKSFSKKP
285-322AKRPERKTKAQRNRIQRRKEEERRKRHEAKTKVRKAQL
410-424RVEARRRIPFKKQAK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011687  Nop53/GLTSCR2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07767  Nop53  
Amino Acid Sequences MPVIQPLKGSTDAPATYKQPSRKGKKAWRKNVDVTEVEKGLEELNEEVIKGGVLAERPSDELFVLDTVGDVALPKKFPKHTSKRLKADEIIAARSAVPAPPARKRPGDKTTDGILPEKRQRREYVTHKELNRLRKVADGVHETTVEVADATYDPWGAVAEPEPEVPVEDKRNEKKKSPKSFSKKPVSLLASGKTPKAVPKPTGGYSYNPAFTDYEARYTEESNKAVEAERKRLQEEEAERLKKEAAARSAAEAEAAEARAELSEWDEDSEWEGFQSGGEELKVSAKRPERKTKAQRNRIQRRKEEERRKRHEAKTKVRKAQLEEIKRIAKEVSERELERRLAVANIVEDSESSAEDNDEALRRRQLGRMKLPEKDLELVLPDELQDSLRLLKPEGNLLKDRYRSLLIRGRVEARRRIPFKKQAKTKLTEKWAYKDFSI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.29
3 0.34
4 0.4
5 0.45
6 0.49
7 0.58
8 0.64
9 0.69
10 0.77
11 0.82
12 0.86
13 0.9
14 0.91
15 0.9
16 0.9
17 0.9
18 0.87
19 0.83
20 0.76
21 0.69
22 0.64
23 0.54
24 0.45
25 0.36
26 0.28
27 0.22
28 0.18
29 0.15
30 0.09
31 0.12
32 0.12
33 0.12
34 0.12
35 0.1
36 0.1
37 0.09
38 0.09
39 0.07
40 0.08
41 0.09
42 0.1
43 0.11
44 0.13
45 0.14
46 0.14
47 0.12
48 0.11
49 0.11
50 0.1
51 0.09
52 0.07
53 0.07
54 0.06
55 0.06
56 0.05
57 0.05
58 0.06
59 0.09
60 0.1
61 0.12
62 0.18
63 0.23
64 0.31
65 0.41
66 0.5
67 0.59
68 0.69
69 0.77
70 0.81
71 0.84
72 0.83
73 0.75
74 0.68
75 0.65
76 0.56
77 0.48
78 0.38
79 0.31
80 0.25
81 0.23
82 0.19
83 0.12
84 0.12
85 0.15
86 0.19
87 0.27
88 0.34
89 0.38
90 0.45
91 0.5
92 0.57
93 0.6
94 0.63
95 0.58
96 0.56
97 0.55
98 0.5
99 0.46
100 0.42
101 0.36
102 0.36
103 0.41
104 0.45
105 0.45
106 0.46
107 0.49
108 0.52
109 0.57
110 0.6
111 0.62
112 0.63
113 0.66
114 0.63
115 0.68
116 0.66
117 0.66
118 0.63
119 0.54
120 0.46
121 0.43
122 0.43
123 0.37
124 0.37
125 0.33
126 0.29
127 0.28
128 0.27
129 0.23
130 0.21
131 0.18
132 0.13
133 0.08
134 0.05
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.04
144 0.05
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.09
153 0.11
154 0.13
155 0.16
156 0.24
157 0.32
158 0.41
159 0.44
160 0.5
161 0.58
162 0.65
163 0.72
164 0.74
165 0.76
166 0.77
167 0.84
168 0.86
169 0.86
170 0.78
171 0.7
172 0.68
173 0.6
174 0.55
175 0.47
176 0.39
177 0.34
178 0.31
179 0.29
180 0.23
181 0.21
182 0.21
183 0.25
184 0.27
185 0.24
186 0.28
187 0.32
188 0.32
189 0.37
190 0.34
191 0.29
192 0.29
193 0.29
194 0.26
195 0.22
196 0.21
197 0.16
198 0.15
199 0.19
200 0.15
201 0.17
202 0.16
203 0.17
204 0.16
205 0.17
206 0.21
207 0.19
208 0.19
209 0.16
210 0.15
211 0.15
212 0.16
213 0.2
214 0.19
215 0.23
216 0.27
217 0.28
218 0.29
219 0.29
220 0.28
221 0.29
222 0.29
223 0.3
224 0.33
225 0.33
226 0.32
227 0.32
228 0.32
229 0.27
230 0.27
231 0.24
232 0.19
233 0.2
234 0.2
235 0.21
236 0.22
237 0.19
238 0.16
239 0.11
240 0.1
241 0.08
242 0.07
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.04
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.09
256 0.09
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.11
269 0.13
270 0.13
271 0.19
272 0.27
273 0.36
274 0.44
275 0.55
276 0.57
277 0.67
278 0.77
279 0.82
280 0.85
281 0.87
282 0.87
283 0.87
284 0.91
285 0.89
286 0.88
287 0.85
288 0.84
289 0.84
290 0.87
291 0.87
292 0.86
293 0.88
294 0.87
295 0.88
296 0.88
297 0.86
298 0.86
299 0.85
300 0.85
301 0.86
302 0.87
303 0.86
304 0.82
305 0.78
306 0.74
307 0.74
308 0.72
309 0.68
310 0.63
311 0.6
312 0.58
313 0.53
314 0.48
315 0.39
316 0.31
317 0.3
318 0.29
319 0.29
320 0.3
321 0.31
322 0.33
323 0.39
324 0.37
325 0.32
326 0.28
327 0.24
328 0.19
329 0.19
330 0.16
331 0.12
332 0.11
333 0.11
334 0.1
335 0.09
336 0.1
337 0.09
338 0.08
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.08
344 0.09
345 0.12
346 0.15
347 0.17
348 0.2
349 0.23
350 0.25
351 0.31
352 0.37
353 0.43
354 0.5
355 0.58
356 0.6
357 0.61
358 0.63
359 0.61
360 0.56
361 0.49
362 0.4
363 0.3
364 0.28
365 0.24
366 0.2
367 0.16
368 0.13
369 0.11
370 0.1
371 0.1
372 0.08
373 0.09
374 0.12
375 0.15
376 0.16
377 0.17
378 0.21
379 0.21
380 0.3
381 0.34
382 0.35
383 0.37
384 0.41
385 0.47
386 0.47
387 0.48
388 0.42
389 0.43
390 0.39
391 0.43
392 0.46
393 0.44
394 0.46
395 0.49
396 0.52
397 0.55
398 0.6
399 0.61
400 0.61
401 0.65
402 0.67
403 0.7
404 0.72
405 0.75
406 0.78
407 0.8
408 0.82
409 0.82
410 0.85
411 0.85
412 0.84
413 0.83
414 0.83
415 0.81
416 0.76
417 0.73
418 0.71