Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2VFA6

Protein Details
Accession A0A1Y2VFA6    Localization Confidence High Confidence Score 24.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-52GIIKLKKPVPKQLKPGNWRDGSHydrophilic
118-142AQCLRIKKEKAQRKKEAREARERAKBasic
203-229GDAEKGPKNKKKKEEPKPKVPKPKGPVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-41RPNGIIKLKKPVPK
122-145RIKKEKAQRKKEAREARERAKEQA
174-227KKGTGGKASKKVSGKKPDGEPKGKKRKADGDAEKGPKNKKKKEEPKPKVPKPKG
Subcellular Location(s) nucl 20, pero 4, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013243  SCA7_dom  
IPR037804  SGF73  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF08313  SCA7  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51505  SCA7  
Amino Acid Sequences MATGGEGRKGPDDEGTINVASKKVSKDRPNGIIKLKKPVPKQLKPGNWRDGSVADDDKKYKNANIENLTSPGPLVNQLDDTSRETFATGRPLEDNLNLQQCKHCKKGIIKTAAKEHIAQCLRIKKEKAQRKKEAREARERAKEQAREEEARKNDEDGDAKMHDDSDDDEDGSLKKGTGGKASKKVSGKKPDGEPKGKKRKADGDAEKGPKNKKKKEEPKPKVPKPKGPVDVEKQCGVILPNGQPCARSLTCKSHSMGAKRAVAGRSLPYDMLLAAYQKKNQAKQQKAALDANAPLEDDDDANAGPVDSDEETAAVMSALARWNPQPVIPQPIFAPIKRTYQLARLHEQLQTATNGGRTNIFKVVGFGAQKLPDNHTDINMDLDDAPGEPDVGMVSAMGPRRSSSFSSRRPSVVSRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.27
3 0.23
4 0.24
5 0.24
6 0.21
7 0.19
8 0.22
9 0.26
10 0.31
11 0.4
12 0.48
13 0.56
14 0.64
15 0.72
16 0.75
17 0.75
18 0.76
19 0.76
20 0.69
21 0.71
22 0.69
23 0.67
24 0.65
25 0.69
26 0.7
27 0.7
28 0.77
29 0.77
30 0.8
31 0.81
32 0.85
33 0.84
34 0.75
35 0.68
36 0.6
37 0.52
38 0.44
39 0.4
40 0.36
41 0.29
42 0.31
43 0.33
44 0.33
45 0.36
46 0.36
47 0.34
48 0.37
49 0.4
50 0.44
51 0.46
52 0.48
53 0.46
54 0.46
55 0.44
56 0.35
57 0.29
58 0.21
59 0.16
60 0.15
61 0.14
62 0.12
63 0.13
64 0.14
65 0.16
66 0.17
67 0.2
68 0.19
69 0.19
70 0.18
71 0.17
72 0.17
73 0.17
74 0.23
75 0.2
76 0.2
77 0.2
78 0.22
79 0.23
80 0.24
81 0.25
82 0.21
83 0.29
84 0.27
85 0.27
86 0.31
87 0.36
88 0.41
89 0.42
90 0.41
91 0.4
92 0.48
93 0.58
94 0.61
95 0.65
96 0.64
97 0.64
98 0.69
99 0.67
100 0.59
101 0.53
102 0.44
103 0.43
104 0.4
105 0.37
106 0.34
107 0.37
108 0.4
109 0.43
110 0.45
111 0.44
112 0.52
113 0.61
114 0.66
115 0.69
116 0.75
117 0.79
118 0.86
119 0.87
120 0.87
121 0.85
122 0.85
123 0.82
124 0.8
125 0.79
126 0.72
127 0.68
128 0.66
129 0.63
130 0.55
131 0.56
132 0.52
133 0.47
134 0.48
135 0.49
136 0.43
137 0.42
138 0.4
139 0.33
140 0.29
141 0.27
142 0.26
143 0.19
144 0.2
145 0.17
146 0.16
147 0.15
148 0.14
149 0.11
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.11
158 0.12
159 0.1
160 0.07
161 0.08
162 0.11
163 0.12
164 0.19
165 0.25
166 0.29
167 0.37
168 0.39
169 0.43
170 0.45
171 0.52
172 0.53
173 0.57
174 0.57
175 0.54
176 0.59
177 0.63
178 0.65
179 0.67
180 0.66
181 0.68
182 0.74
183 0.72
184 0.67
185 0.63
186 0.64
187 0.6
188 0.62
189 0.57
190 0.54
191 0.58
192 0.6
193 0.58
194 0.54
195 0.55
196 0.51
197 0.54
198 0.53
199 0.54
200 0.61
201 0.69
202 0.76
203 0.81
204 0.84
205 0.86
206 0.89
207 0.89
208 0.89
209 0.84
210 0.82
211 0.76
212 0.76
213 0.72
214 0.66
215 0.64
216 0.6
217 0.6
218 0.54
219 0.49
220 0.4
221 0.33
222 0.29
223 0.23
224 0.17
225 0.13
226 0.14
227 0.16
228 0.18
229 0.18
230 0.17
231 0.17
232 0.23
233 0.21
234 0.2
235 0.22
236 0.29
237 0.32
238 0.36
239 0.36
240 0.35
241 0.39
242 0.39
243 0.42
244 0.38
245 0.37
246 0.35
247 0.38
248 0.33
249 0.29
250 0.27
251 0.23
252 0.19
253 0.18
254 0.17
255 0.13
256 0.13
257 0.11
258 0.11
259 0.09
260 0.09
261 0.12
262 0.14
263 0.16
264 0.22
265 0.27
266 0.3
267 0.38
268 0.46
269 0.49
270 0.53
271 0.59
272 0.57
273 0.58
274 0.55
275 0.49
276 0.41
277 0.35
278 0.3
279 0.22
280 0.18
281 0.13
282 0.11
283 0.1
284 0.08
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.06
295 0.07
296 0.06
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.04
302 0.04
303 0.03
304 0.05
305 0.07
306 0.07
307 0.09
308 0.09
309 0.13
310 0.13
311 0.15
312 0.19
313 0.2
314 0.29
315 0.28
316 0.28
317 0.26
318 0.34
319 0.36
320 0.3
321 0.33
322 0.27
323 0.34
324 0.34
325 0.36
326 0.29
327 0.34
328 0.42
329 0.42
330 0.44
331 0.42
332 0.43
333 0.42
334 0.41
335 0.35
336 0.29
337 0.25
338 0.21
339 0.18
340 0.18
341 0.17
342 0.17
343 0.2
344 0.19
345 0.21
346 0.23
347 0.23
348 0.21
349 0.22
350 0.23
351 0.23
352 0.22
353 0.21
354 0.21
355 0.23
356 0.27
357 0.28
358 0.3
359 0.3
360 0.34
361 0.33
362 0.32
363 0.31
364 0.27
365 0.28
366 0.24
367 0.21
368 0.15
369 0.15
370 0.13
371 0.11
372 0.12
373 0.08
374 0.09
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.06
379 0.06
380 0.05
381 0.06
382 0.09
383 0.13
384 0.14
385 0.15
386 0.16
387 0.19
388 0.24
389 0.28
390 0.34
391 0.41
392 0.49
393 0.57
394 0.61
395 0.6
396 0.62