Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2UYQ1

Protein Details
Accession A0A1Y2UYQ1    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-76DNAHREFQKHRAKKGWKEDAKKQKEKTHHSLVSBasic
401-429LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYKGGPLDIHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
52-68KHRAKKGWKEDAKKQKE
407-423KGFTKEKNKKKRGSYKG
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAKKTQKAAKPAASSASASASRGDAPPTQLMDLVESFLSDQGFDNAHREFQKHRAKKGWKEDAKKQKEKTHHSLVSVFQTWKTFSSQSNTPVLPKEDPIQKITKVSSSSSDDSSSESESDSDDSQDVAMDDAPAADESSSSESSSSDDSSSESDSESESDEEEAKPAKPATGVVKNGVNPLKRKAKSDSESSSESDSDEDMSDSSSEEGKRPQTKRAKTTESSDESSSSSSSDSSDDESSEDEDEAEPKATSKSSADNDESSSSSESDSDESDSESDEEPKVDLKEAAQVPLPESGSSSSESESESDSETKKAQRVTKDSTMNNSTGSDSSVTLDTISPDAPLPPDPTALKSNNRGKNGAKNPRGQNQPFSRIRKDVSIDPRLSSNAYVSHGYGEKAHQDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYKGGPLDIHKSRSIKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.4
3 0.37
4 0.29
5 0.25
6 0.23
7 0.2
8 0.19
9 0.19
10 0.21
11 0.19
12 0.22
13 0.25
14 0.26
15 0.26
16 0.25
17 0.24
18 0.24
19 0.21
20 0.19
21 0.14
22 0.12
23 0.12
24 0.12
25 0.11
26 0.09
27 0.09
28 0.1
29 0.12
30 0.12
31 0.15
32 0.15
33 0.2
34 0.21
35 0.23
36 0.25
37 0.34
38 0.44
39 0.48
40 0.55
41 0.61
42 0.68
43 0.76
44 0.83
45 0.84
46 0.82
47 0.83
48 0.86
49 0.87
50 0.88
51 0.87
52 0.83
53 0.81
54 0.81
55 0.83
56 0.81
57 0.8
58 0.74
59 0.68
60 0.64
61 0.58
62 0.55
63 0.5
64 0.42
65 0.33
66 0.31
67 0.29
68 0.27
69 0.28
70 0.24
71 0.22
72 0.27
73 0.29
74 0.32
75 0.36
76 0.35
77 0.34
78 0.35
79 0.36
80 0.32
81 0.3
82 0.32
83 0.33
84 0.35
85 0.37
86 0.37
87 0.35
88 0.37
89 0.36
90 0.34
91 0.29
92 0.28
93 0.29
94 0.31
95 0.32
96 0.3
97 0.3
98 0.26
99 0.26
100 0.25
101 0.22
102 0.16
103 0.14
104 0.12
105 0.12
106 0.13
107 0.12
108 0.11
109 0.1
110 0.1
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.04
123 0.04
124 0.05
125 0.09
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.11
131 0.13
132 0.12
133 0.09
134 0.09
135 0.1
136 0.11
137 0.12
138 0.11
139 0.1
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.1
144 0.09
145 0.08
146 0.09
147 0.1
148 0.09
149 0.1
150 0.11
151 0.1
152 0.12
153 0.11
154 0.11
155 0.1
156 0.12
157 0.17
158 0.22
159 0.23
160 0.23
161 0.25
162 0.26
163 0.3
164 0.32
165 0.29
166 0.25
167 0.31
168 0.39
169 0.38
170 0.41
171 0.42
172 0.47
173 0.47
174 0.52
175 0.49
176 0.43
177 0.44
178 0.41
179 0.37
180 0.28
181 0.25
182 0.18
183 0.14
184 0.11
185 0.09
186 0.08
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.12
196 0.17
197 0.25
198 0.26
199 0.35
200 0.42
201 0.48
202 0.54
203 0.59
204 0.6
205 0.54
206 0.57
207 0.56
208 0.51
209 0.47
210 0.41
211 0.34
212 0.28
213 0.26
214 0.22
215 0.14
216 0.1
217 0.08
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.09
222 0.1
223 0.09
224 0.09
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.07
238 0.08
239 0.09
240 0.13
241 0.15
242 0.19
243 0.21
244 0.21
245 0.22
246 0.23
247 0.22
248 0.19
249 0.17
250 0.13
251 0.12
252 0.11
253 0.1
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.1
262 0.1
263 0.11
264 0.1
265 0.1
266 0.1
267 0.12
268 0.12
269 0.11
270 0.11
271 0.09
272 0.17
273 0.17
274 0.18
275 0.17
276 0.17
277 0.17
278 0.2
279 0.2
280 0.12
281 0.13
282 0.13
283 0.12
284 0.14
285 0.13
286 0.11
287 0.11
288 0.12
289 0.12
290 0.12
291 0.11
292 0.12
293 0.13
294 0.14
295 0.15
296 0.18
297 0.21
298 0.23
299 0.28
300 0.31
301 0.37
302 0.42
303 0.48
304 0.53
305 0.57
306 0.56
307 0.57
308 0.55
309 0.48
310 0.42
311 0.35
312 0.29
313 0.22
314 0.21
315 0.15
316 0.12
317 0.13
318 0.12
319 0.11
320 0.1
321 0.1
322 0.1
323 0.1
324 0.1
325 0.09
326 0.08
327 0.09
328 0.1
329 0.12
330 0.14
331 0.14
332 0.17
333 0.17
334 0.21
335 0.26
336 0.29
337 0.33
338 0.39
339 0.48
340 0.52
341 0.55
342 0.56
343 0.54
344 0.6
345 0.65
346 0.66
347 0.63
348 0.65
349 0.68
350 0.73
351 0.78
352 0.71
353 0.71
354 0.68
355 0.71
356 0.71
357 0.71
358 0.68
359 0.63
360 0.62
361 0.59
362 0.55
363 0.54
364 0.55
365 0.56
366 0.52
367 0.49
368 0.48
369 0.44
370 0.41
371 0.33
372 0.26
373 0.2
374 0.21
375 0.21
376 0.19
377 0.21
378 0.21
379 0.2
380 0.2
381 0.2
382 0.21
383 0.21
384 0.21
385 0.18
386 0.18
387 0.2
388 0.24
389 0.29
390 0.26
391 0.25
392 0.31
393 0.33
394 0.39
395 0.41
396 0.45
397 0.49
398 0.59
399 0.69
400 0.75
401 0.82
402 0.83
403 0.9
404 0.91
405 0.9
406 0.9
407 0.89
408 0.89
409 0.89
410 0.86
411 0.77
412 0.71
413 0.7
414 0.65
415 0.6
416 0.55
417 0.49
418 0.45