FuNGI

A0A1Y2VCC4

Protein Details

Accession

A0A1Y2VCC4

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
56-84	VEAARKKYAAKQASKRKDTQPKANVAKSN	Hydrophilic
472-494	NPQSSEKSAKRPKTSKPASTKAS	Hydrophilic
514-542	PSKGANSSSKPEKKKKYAIKPVKETPVPL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
61-73	KKYAAKQASKRKD
443-468	KKSQKPSAANGERKRKHPGDEGAKSA
477-488	EKSAKRPKTSKP
523-531	KPEKKKKYA

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MASRVRDQKATSATKASGPGGLQNANKNQKFTKDSSSSDNDSSDSEGSDTGSDSDVEAARKKYAAKQASKRKDTQPKANVAKSNATKSPANAKASSPAKPSSKATTSESDDSESDSDTSSQDSDSGKSPAQTPAAKDGKKSKSKDESGSESESSSESESESEAEEASVQQPAKSKSNSSSDSASDSDSSSASEKSSYEDAPDRMDVDGSEMAVSRVNGDATPEDSSSQVSSRPSWLNSSNFVLRKASSDNPGKEVSEFLSKTNLEGKQVWYFTAPASLPITVLKEMEIDLSKAATGEALLKHNGDDYGIELESHATSTQIQLLIPSQAGDNYTALNRAIDSTIHLRRMAKFGPGNTISATAADNYAPVPKAIREQPQGLKPRFTPIGVPTPTPTPVQSLKPQPTPAAKNATLSESESESESDSDQETTEVTKPQPPASSGSSKKSQKPSAANGERKRKHPGDEGAKSAPVQNPQSSEKSAKRPKTSKPASTKASSSAKNTPAQTQTTPMPNGTPSKGANSSSKPEKKKKYAIKPVKETPVPLPTVLSMKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.46
3	0.4
4	0.33
5	0.28
6	0.29
7	0.28
8	0.31
9	0.31
10	0.35
11	0.43
12	0.5
13	0.52
14	0.51
15	0.5
16	0.53
17	0.57
18	0.54
19	0.54
20	0.51
21	0.52
22	0.55
23	0.58
24	0.55
25	0.51
26	0.47
27	0.38
28	0.33
29	0.33
30	0.26
31	0.19
32	0.16
33	0.14
34	0.13
35	0.13
36	0.12
37	0.1
38	0.11
39	0.1
40	0.09
41	0.12
42	0.13
43	0.15
44	0.19
45	0.2
46	0.2
47	0.22
48	0.25
49	0.29
50	0.37
51	0.44
52	0.5
53	0.58
54	0.68
55	0.77
56	0.81
57	0.8
58	0.81
59	0.83
60	0.81
61	0.82
62	0.79
63	0.79
64	0.8
65	0.8
66	0.76
67	0.68
68	0.69
69	0.64
70	0.61
71	0.54
72	0.5
73	0.44
74	0.42
75	0.48
76	0.46
77	0.45
78	0.41
79	0.39
80	0.43
81	0.45
82	0.47
83	0.41
84	0.4
85	0.39
86	0.41
87	0.43
88	0.42
89	0.43
90	0.42
91	0.43
92	0.43
93	0.45
94	0.45
95	0.42
96	0.37
97	0.33
98	0.32
99	0.28
100	0.22
101	0.17
102	0.14
103	0.14
104	0.11
105	0.12
106	0.1
107	0.1
108	0.11
109	0.12
110	0.13
111	0.15
112	0.17
113	0.17
114	0.17
115	0.2
116	0.21
117	0.25
118	0.26
119	0.25
120	0.32
121	0.4
122	0.39
123	0.41
124	0.47
125	0.52
126	0.58
127	0.59
128	0.59
129	0.6
130	0.65
131	0.68
132	0.64
133	0.62
134	0.58
135	0.59
136	0.5
137	0.4
138	0.35
139	0.29
140	0.24
141	0.17
142	0.13
143	0.09
144	0.09
145	0.09
146	0.08
147	0.09
148	0.08
149	0.07
150	0.07
151	0.07
152	0.07
153	0.07
154	0.1
155	0.09
156	0.1
157	0.15
158	0.19
159	0.24
160	0.25
161	0.27
162	0.29
163	0.36
164	0.37
165	0.35
166	0.34
167	0.3
168	0.32
169	0.3
170	0.26
171	0.19
172	0.17
173	0.15
174	0.12
175	0.12
176	0.1
177	0.1
178	0.09
179	0.09
180	0.09
181	0.11
182	0.13
183	0.12
184	0.14
185	0.17
186	0.18
187	0.19
188	0.19
189	0.17
190	0.15
191	0.15
192	0.12
193	0.11
194	0.11
195	0.08
196	0.08
197	0.07
198	0.08
199	0.08
200	0.08
201	0.06
202	0.06
203	0.07
204	0.06
205	0.07
206	0.08
207	0.08
208	0.1
209	0.1
210	0.1
211	0.1
212	0.1
213	0.1
214	0.1
215	0.1
216	0.1
217	0.11
218	0.14
219	0.16
220	0.17
221	0.19
222	0.23
223	0.23
224	0.24
225	0.26
226	0.28
227	0.27
228	0.27
229	0.25
230	0.21
231	0.21
232	0.22
233	0.21
234	0.23
235	0.28
236	0.28
237	0.3
238	0.31
239	0.29
240	0.25
241	0.24
242	0.19
243	0.18
244	0.17
245	0.15
246	0.18
247	0.17
248	0.18
249	0.22
250	0.21
251	0.18
252	0.19
253	0.21
254	0.21
255	0.21
256	0.21
257	0.16
258	0.16
259	0.13
260	0.15
261	0.12
262	0.09
263	0.1
264	0.1
265	0.09
266	0.09
267	0.11
268	0.08
269	0.08
270	0.07
271	0.06
272	0.06
273	0.08
274	0.07
275	0.06
276	0.06
277	0.06
278	0.06
279	0.05
280	0.05
281	0.04
282	0.04
283	0.06
284	0.07
285	0.09
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.1
290	0.1
291	0.07
292	0.06
293	0.06
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.06
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.06
302	0.05
303	0.05
304	0.06
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.07
309	0.08
310	0.08
311	0.08
312	0.08
313	0.06
314	0.06
315	0.07
316	0.08
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.08
321	0.08
322	0.08
323	0.07
324	0.07
325	0.07
326	0.07
327	0.09
328	0.14
329	0.17
330	0.19
331	0.21
332	0.22
333	0.23
334	0.27
335	0.26
336	0.25
337	0.25
338	0.24
339	0.3
340	0.29
341	0.29
342	0.25
343	0.25
344	0.19
345	0.17
346	0.16
347	0.09
348	0.09
349	0.08
350	0.07
351	0.06
352	0.09
353	0.08
354	0.08
355	0.09
356	0.09
357	0.14
358	0.19
359	0.25
360	0.27
361	0.32
362	0.38
363	0.44
364	0.53
365	0.5
366	0.49
367	0.43
368	0.45
369	0.41
370	0.36
371	0.32
372	0.27
373	0.35
374	0.32
375	0.33
376	0.28
377	0.29
378	0.3
379	0.27
380	0.24
381	0.19
382	0.21
383	0.25
384	0.3
385	0.36
386	0.4
387	0.44
388	0.45
389	0.45
390	0.48
391	0.49
392	0.47
393	0.47
394	0.41
395	0.4
396	0.39
397	0.37
398	0.31
399	0.28
400	0.24
401	0.18
402	0.17
403	0.15
404	0.15
405	0.13
406	0.13
407	0.12
408	0.11
409	0.11
410	0.1
411	0.1
412	0.09
413	0.09
414	0.1
415	0.12
416	0.14
417	0.15
418	0.2
419	0.21
420	0.25
421	0.27
422	0.26
423	0.29
424	0.31
425	0.39
426	0.38
427	0.42
428	0.48
429	0.51
430	0.58
431	0.62
432	0.63
433	0.62
434	0.65
435	0.67
436	0.69
437	0.73
438	0.75
439	0.75
440	0.8
441	0.77
442	0.74
443	0.75
444	0.68
445	0.64
446	0.63
447	0.64
448	0.64
449	0.64
450	0.66
451	0.59
452	0.56
453	0.51
454	0.46
455	0.4
456	0.35
457	0.34
458	0.31
459	0.33
460	0.37
461	0.4
462	0.4
463	0.44
464	0.45
465	0.51
466	0.58
467	0.62
468	0.68
469	0.71
470	0.76
471	0.8
472	0.82
473	0.81
474	0.81
475	0.82
476	0.78
477	0.76
478	0.69
479	0.65
480	0.64
481	0.58
482	0.54
483	0.54
484	0.52
485	0.53
486	0.53
487	0.52
488	0.49
489	0.5
490	0.45
491	0.42
492	0.41
493	0.42
494	0.42
495	0.36
496	0.33
497	0.33
498	0.36
499	0.34
500	0.34
501	0.28
502	0.33
503	0.36
504	0.37
505	0.4
506	0.41
507	0.46
508	0.52
509	0.6
510	0.63
511	0.7
512	0.77
513	0.8
514	0.85
515	0.88
516	0.88
517	0.9
518	0.92
519	0.92
520	0.91
521	0.9
522	0.89
523	0.81
524	0.74
525	0.69
526	0.66
527	0.58
528	0.49
529	0.42
530	0.34

A0A1Y2VCC4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer