FuNGI

A0A1Y2VAB9

Protein Details

Accession

A0A1Y2VAB9

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
293-314	IEKRASRKPTKTERAKRSKANT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
189-267	QLKSSRKSTPRSSAKSPPAKSFKHPRTSWSPESVRSPPARRFIKPESLSPEKTRPSKAFKPPPSADLSPSRDRPALRRR
295-314	KRASRKPTKTERAKRSKANT

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 13, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MPIIKPGTSQHLQRVQAPHRVGLSRNQKTDSLLKRVRGQDNPLHESGSVNVKNQTPGSKMRQSAKVREPESIDAPPQSSDGEEDYRHPQDSDDDQDENGRGDIKPTTFKSVQSAPSQRNDTRRSTRDRSRSSYQNEEPSSSAGSKRSAEESLPETGGHLMNAYGFSKQAKKTKSAATYGGKSSQPRSSQLKSSRKSTPRSSAKSPPAKSFKHPRTSWSPESVRSPPARRFIKPESLSPEKTRPSKAFKPPPSADLSPSRDRPALRRRSLPSDTSPPKSKLKLFDVDEELEPSIEKRASRKPTKTERAKRSKANTQRGSPKPVSEESSQRPIFKLHALDDLDYLDDSDDKVIATFENVSDDEIGDVTIESTAAATARCPMCQEVVDAELLAKHSDHGRMNIRKQAAFCRLHNRQTALSDRSEKGYPKIDWRTLDTRLEKHQDMLKDILEGTRESYYREVLKENVESGKNRTLLKTQDSLTPGYYGPRGLRAMTEYIMRTLSSVVRKRAVEDRLVSARGYTGYVQVVLVPELAVRLIMEDMSVAEEDARKIMEDSIEFGELLHEDVGDVIAGVSDEEAI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.56
3	0.6
4	0.58
5	0.52
6	0.49
7	0.5
8	0.45
9	0.46
10	0.51
11	0.51
12	0.53
13	0.53
14	0.49
15	0.51
16	0.58
17	0.56
18	0.55
19	0.53
20	0.54
21	0.59
22	0.66
23	0.69
24	0.66
25	0.66
26	0.62
27	0.65
28	0.66
29	0.59
30	0.52
31	0.44
32	0.39
33	0.34
34	0.36
35	0.29
36	0.25
37	0.28
38	0.29
39	0.32
40	0.34
41	0.36
42	0.3
43	0.36
44	0.42
45	0.45
46	0.49
47	0.53
48	0.6
49	0.62
50	0.68
51	0.69
52	0.7
53	0.64
54	0.63
55	0.6
56	0.55
57	0.53
58	0.46
59	0.4
60	0.33
61	0.32
62	0.28
63	0.24
64	0.2
65	0.16
66	0.14
67	0.15
68	0.17
69	0.17
70	0.19
71	0.25
72	0.27
73	0.28
74	0.26
75	0.24
76	0.25
77	0.29
78	0.33
79	0.3
80	0.28
81	0.27
82	0.3
83	0.3
84	0.25
85	0.21
86	0.16
87	0.12
88	0.13
89	0.17
90	0.16
91	0.23
92	0.24
93	0.32
94	0.32
95	0.33
96	0.36
97	0.39
98	0.41
99	0.43
100	0.48
101	0.45
102	0.5
103	0.56
104	0.55
105	0.58
106	0.58
107	0.58
108	0.6
109	0.63
110	0.65
111	0.66
112	0.72
113	0.74
114	0.76
115	0.75
116	0.73
117	0.74
118	0.72
119	0.73
120	0.68
121	0.67
122	0.61
123	0.56
124	0.49
125	0.42
126	0.38
127	0.3
128	0.27
129	0.2
130	0.21
131	0.2
132	0.21
133	0.23
134	0.21
135	0.2
136	0.21
137	0.22
138	0.22
139	0.21
140	0.19
141	0.16
142	0.17
143	0.17
144	0.13
145	0.1
146	0.07
147	0.07
148	0.09
149	0.09
150	0.07
151	0.07
152	0.1
153	0.15
154	0.21
155	0.27
156	0.29
157	0.33
158	0.38
159	0.45
160	0.48
161	0.46
162	0.48
163	0.47
164	0.48
165	0.46
166	0.45
167	0.4
168	0.37
169	0.37
170	0.35
171	0.33
172	0.34
173	0.39
174	0.38
175	0.44
176	0.52
177	0.58
178	0.55
179	0.58
180	0.63
181	0.63
182	0.65
183	0.64
184	0.64
185	0.64
186	0.67
187	0.68
188	0.68
189	0.71
190	0.73
191	0.69
192	0.67
193	0.65
194	0.62
195	0.63
196	0.64
197	0.63
198	0.64
199	0.61
200	0.58
201	0.6
202	0.65
203	0.62
204	0.59
205	0.53
206	0.46
207	0.51
208	0.48
209	0.45
210	0.42
211	0.42
212	0.4
213	0.46
214	0.48
215	0.44
216	0.48
217	0.48
218	0.53
219	0.5
220	0.49
221	0.47
222	0.49
223	0.51
224	0.47
225	0.48
226	0.43
227	0.45
228	0.45
229	0.42
230	0.45
231	0.5
232	0.57
233	0.61
234	0.61
235	0.67
236	0.63
237	0.62
238	0.6
239	0.52
240	0.45
241	0.43
242	0.43
243	0.38
244	0.39
245	0.38
246	0.34
247	0.34
248	0.38
249	0.41
250	0.45
251	0.44
252	0.49
253	0.5
254	0.56
255	0.58
256	0.53
257	0.48
258	0.48
259	0.48
260	0.46
261	0.47
262	0.43
263	0.44
264	0.44
265	0.43
266	0.38
267	0.39
268	0.41
269	0.38
270	0.38
271	0.37
272	0.35
273	0.32
274	0.27
275	0.23
276	0.16
277	0.13
278	0.1
279	0.08
280	0.08
281	0.08
282	0.11
283	0.19
284	0.28
285	0.36
286	0.42
287	0.49
288	0.58
289	0.68
290	0.75
291	0.77
292	0.79
293	0.82
294	0.83
295	0.81
296	0.78
297	0.77
298	0.76
299	0.77
300	0.72
301	0.67
302	0.71
303	0.68
304	0.68
305	0.6
306	0.52
307	0.45
308	0.41
309	0.39
310	0.31
311	0.34
312	0.3
313	0.38
314	0.37
315	0.34
316	0.33
317	0.3
318	0.29
319	0.25
320	0.24
321	0.16
322	0.21
323	0.21
324	0.2
325	0.2
326	0.18
327	0.15
328	0.13
329	0.11
330	0.06
331	0.05
332	0.05
333	0.05
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.07
343	0.08
344	0.08
345	0.08
346	0.08
347	0.07
348	0.07
349	0.07
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.03
355	0.03
356	0.03
357	0.03
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.09
362	0.1
363	0.1
364	0.11
365	0.12
366	0.13
367	0.14
368	0.15
369	0.11
370	0.12
371	0.11
372	0.1
373	0.09
374	0.08
375	0.09
376	0.08
377	0.06
378	0.06
379	0.08
380	0.13
381	0.14
382	0.19
383	0.28
384	0.34
385	0.38
386	0.44
387	0.45
388	0.42
389	0.43
390	0.45
391	0.45
392	0.43
393	0.42
394	0.46
395	0.49
396	0.53
397	0.56
398	0.51
399	0.45
400	0.44
401	0.47
402	0.41
403	0.39
404	0.38
405	0.35
406	0.36
407	0.36
408	0.33
409	0.31
410	0.35
411	0.32
412	0.36
413	0.42
414	0.44
415	0.43
416	0.47
417	0.49
418	0.46
419	0.51
420	0.47
421	0.43
422	0.45
423	0.49
424	0.43
425	0.42
426	0.43
427	0.37
428	0.36
429	0.35
430	0.28
431	0.23
432	0.23
433	0.21
434	0.17
435	0.15
436	0.14
437	0.15
438	0.15
439	0.16
440	0.17
441	0.19
442	0.21
443	0.23
444	0.23
445	0.22
446	0.26
447	0.25
448	0.26
449	0.28
450	0.28
451	0.29
452	0.31
453	0.35
454	0.35
455	0.35
456	0.35
457	0.35
458	0.37
459	0.4
460	0.39
461	0.34
462	0.36
463	0.37
464	0.36
465	0.32
466	0.29
467	0.24
468	0.22
469	0.22
470	0.19
471	0.17
472	0.21
473	0.21
474	0.19
475	0.2
476	0.21
477	0.22
478	0.21
479	0.24
480	0.2
481	0.2
482	0.2
483	0.18
484	0.16
485	0.15
486	0.19
487	0.25
488	0.3
489	0.33
490	0.38
491	0.39
492	0.42
493	0.48
494	0.47
495	0.45
496	0.42
497	0.44
498	0.43
499	0.44
500	0.4
501	0.33
502	0.3
503	0.24
504	0.23
505	0.17
506	0.14
507	0.14
508	0.15
509	0.14
510	0.14
511	0.14
512	0.13
513	0.12
514	0.09
515	0.08
516	0.08
517	0.08
518	0.06
519	0.05
520	0.06
521	0.06
522	0.06
523	0.06
524	0.05
525	0.06
526	0.07
527	0.08
528	0.07
529	0.08
530	0.1
531	0.1
532	0.11
533	0.12
534	0.11
535	0.12
536	0.14
537	0.16
538	0.15
539	0.18
540	0.19
541	0.2
542	0.19
543	0.18
544	0.17
545	0.14
546	0.15
547	0.11
548	0.08
549	0.07
550	0.07
551	0.08
552	0.06
553	0.06
554	0.04
555	0.04
556	0.04
557	0.04

A0A1Y2VAB9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer