Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2VJA3

Protein Details
Accession A0A1Y2VJA3    Localization Confidence Low Confidence Score 8.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MESTKSKPRRKKPPSQNPIEAAIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-13SKPRRKKP
Subcellular Location(s) mito 19.5, cyto_mito 12, cyto 3.5, nucl 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030382  MeTrfase_TRM5/TYW2  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR026274  tRNA_wybutosine_synth_prot_2  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0008757  F:S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity  
GO:0031591  P:wybutosine biosynthetic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF02475  Met_10  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51684  SAM_MT_TRM5_TYW2  
Amino Acid Sequences MESTKSKPRRKKPPSQNPIEAAITTWFHSSAAVQRSQLRLEELVAQAPKRWTVYEPMVLLPAGSFDAKTWKELLSGLPTEEAHALWVQILAEISKRTGGAPLTHLAVNEGIPAALHNKTTEESRHNISIETTKDNQTRENILRSPTGLRILHGDFGPSSSSDDTAPDFDRAFWVSTRQNGVFQTWAPRWTMFSRGNIKEKARLLDFHNAHVENGVVLGDAWAVDLYAGIGYFTFSYAKLGMRVLCWELNPWSVEGLRRGAQGNGWSVRVVKEESDLELPMEELLRGDERIIVFLEDNRHAARRIRELNGLDMNILHVNCGLLPSSDASWEDAWDIAVESKGEEAWLHLHENVGVADIEKRREEIEQCFLGLAREDGGDKTTRVEHTELVKTFAPGVWHCVFDLYIKRASSIT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.93
2 0.93
3 0.91
4 0.84
5 0.79
6 0.7
7 0.59
8 0.49
9 0.41
10 0.33
11 0.25
12 0.22
13 0.16
14 0.14
15 0.14
16 0.14
17 0.18
18 0.23
19 0.24
20 0.26
21 0.31
22 0.34
23 0.35
24 0.35
25 0.31
26 0.26
27 0.25
28 0.28
29 0.24
30 0.26
31 0.27
32 0.26
33 0.27
34 0.28
35 0.29
36 0.25
37 0.26
38 0.22
39 0.26
40 0.32
41 0.33
42 0.33
43 0.31
44 0.31
45 0.28
46 0.26
47 0.19
48 0.14
49 0.1
50 0.09
51 0.08
52 0.07
53 0.15
54 0.16
55 0.18
56 0.19
57 0.18
58 0.19
59 0.2
60 0.22
61 0.2
62 0.21
63 0.2
64 0.2
65 0.19
66 0.2
67 0.19
68 0.16
69 0.12
70 0.11
71 0.1
72 0.08
73 0.09
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.06
78 0.08
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.1
83 0.09
84 0.12
85 0.13
86 0.14
87 0.16
88 0.17
89 0.18
90 0.19
91 0.18
92 0.16
93 0.15
94 0.13
95 0.11
96 0.09
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.1
105 0.11
106 0.14
107 0.18
108 0.19
109 0.22
110 0.25
111 0.28
112 0.27
113 0.27
114 0.26
115 0.27
116 0.25
117 0.27
118 0.26
119 0.29
120 0.31
121 0.32
122 0.33
123 0.31
124 0.35
125 0.33
126 0.36
127 0.32
128 0.31
129 0.31
130 0.3
131 0.29
132 0.24
133 0.27
134 0.22
135 0.19
136 0.21
137 0.21
138 0.22
139 0.19
140 0.18
141 0.12
142 0.13
143 0.13
144 0.09
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.1
150 0.1
151 0.11
152 0.12
153 0.12
154 0.12
155 0.11
156 0.12
157 0.12
158 0.13
159 0.11
160 0.14
161 0.14
162 0.17
163 0.2
164 0.2
165 0.21
166 0.2
167 0.21
168 0.18
169 0.17
170 0.2
171 0.17
172 0.18
173 0.17
174 0.16
175 0.18
176 0.18
177 0.24
178 0.21
179 0.26
180 0.33
181 0.36
182 0.41
183 0.42
184 0.42
185 0.41
186 0.41
187 0.38
188 0.3
189 0.29
190 0.27
191 0.32
192 0.31
193 0.28
194 0.29
195 0.27
196 0.25
197 0.23
198 0.19
199 0.1
200 0.09
201 0.07
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.02
209 0.02
210 0.02
211 0.02
212 0.02
213 0.02
214 0.02
215 0.02
216 0.02
217 0.03
218 0.03
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.06
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.11
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.13
235 0.14
236 0.14
237 0.12
238 0.11
239 0.11
240 0.13
241 0.13
242 0.14
243 0.14
244 0.15
245 0.16
246 0.15
247 0.15
248 0.16
249 0.19
250 0.18
251 0.17
252 0.16
253 0.16
254 0.17
255 0.17
256 0.16
257 0.11
258 0.13
259 0.13
260 0.15
261 0.15
262 0.14
263 0.13
264 0.12
265 0.11
266 0.09
267 0.08
268 0.06
269 0.05
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.09
275 0.09
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.09
280 0.12
281 0.15
282 0.14
283 0.16
284 0.16
285 0.17
286 0.19
287 0.24
288 0.26
289 0.31
290 0.35
291 0.37
292 0.42
293 0.41
294 0.45
295 0.43
296 0.38
297 0.29
298 0.24
299 0.22
300 0.19
301 0.17
302 0.12
303 0.09
304 0.09
305 0.08
306 0.09
307 0.08
308 0.05
309 0.07
310 0.08
311 0.08
312 0.1
313 0.1
314 0.12
315 0.12
316 0.12
317 0.12
318 0.1
319 0.1
320 0.09
321 0.09
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.06
330 0.07
331 0.09
332 0.11
333 0.13
334 0.13
335 0.13
336 0.13
337 0.15
338 0.13
339 0.12
340 0.1
341 0.08
342 0.14
343 0.16
344 0.19
345 0.19
346 0.2
347 0.19
348 0.24
349 0.27
350 0.27
351 0.32
352 0.3
353 0.3
354 0.29
355 0.28
356 0.25
357 0.22
358 0.17
359 0.1
360 0.1
361 0.11
362 0.11
363 0.13
364 0.14
365 0.14
366 0.16
367 0.2
368 0.21
369 0.24
370 0.26
371 0.27
372 0.32
373 0.4
374 0.38
375 0.37
376 0.37
377 0.34
378 0.33
379 0.3
380 0.28
381 0.21
382 0.27
383 0.25
384 0.24
385 0.24
386 0.23
387 0.22
388 0.23
389 0.29
390 0.26
391 0.29
392 0.29