Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2VBV8

Protein Details
Accession A0A1Y2VBV8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-127YREIDEKMDKRRRARREAREKAEREEBasic
804-825NEKIWHLTTRPQRKPRSLEAIKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
111-126KRRRARREAREKAERE
Subcellular Location(s) mito 10.5, cyto_mito 9, nucl 7, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
PF14559  TPR_19  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MTGRRDFLSQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEDQIKEALAKRAAALGFSDAVSGKKEEEDDNDERYQDPDNEVGLFAGGVYDKEDDEADRIYREIDEKMDKRRRARREAREKAEREEYERKNPKIQQQFADLKRGLEAVTEEEWASLPEVGDLTGKNRRSKQARQQRFYAVPDSVLAAAGSAGELGTTVVDDGVTSTTGGSSSQDGTMTNFAKIGQARDKVLQVRLDQASQNGTVTSGNATSVDPKGYLTSLAKSQLPESAAQVGDINRVRELLESVIKTNPNNGPGWIAAARLEELAGKIVAARNVIARGCEHCPKNEDVWLESIRLNEGRNAKVIAAQAIQKNNRSVRLWVEAMKLEDDVRSKKRVIRHALDHIPESEALWKEAVNLEEDPDNARLLLAKATELIPLSVDLWLALARLETPENAQKVLNKARKHCPTSHEIWIAAARLQEQLGQGEKVNVMKRAAQVLVKESAMPKREEWIAEAEKCESEGAIITCGAIIRETLGYGLDEDDDRKDTWLDDARGSINRGMYETARAIYAYALRVFPTSKTIWLAAADLERNHGSKEDLWAVLEKAVNAVPRSEVLWMMLAKEKWQAGEIDSARRVLARAFQQNPNNEDIWLAAVKLEAENGHIDEARDLLKTARQEAPTDRVWMKSAVFERQLGDLDAALDLVQQALNLFPASAKLWMMKGQIYEDLDKPLQAREAYSTGVKAVPKSVPLWLLYSRLEEKLGQLPKARSVLDRARLAVPKSAELWCESVRVERRAQNMKQAESLMERALRDVPKPDQGILWNEKIWHLTTRPQRKPRSLEAIKEVDNDPALLVAVARIFWGERRLEKAQNWFEKALVRDSDIGDSWAWYYKFLLEHGTEEKREEVISKCVSVEPRHGEVWQAIAKNPKNAKKSVEEILKLVAAELQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.3
3 0.26
4 0.23
5 0.18
6 0.15
7 0.12
8 0.12
9 0.12
10 0.12
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.3
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.27
37 0.28
38 0.27
39 0.32
40 0.3
41 0.25
42 0.22
43 0.18
44 0.16
45 0.16
46 0.16
47 0.12
48 0.13
49 0.14
50 0.14
51 0.13
52 0.14
53 0.16
54 0.17
55 0.22
56 0.29
57 0.3
58 0.34
59 0.35
60 0.34
61 0.32
62 0.32
63 0.3
64 0.25
65 0.24
66 0.21
67 0.2
68 0.2
69 0.2
70 0.18
71 0.14
72 0.11
73 0.08
74 0.07
75 0.06
76 0.05
77 0.07
78 0.08
79 0.07
80 0.09
81 0.09
82 0.1
83 0.11
84 0.14
85 0.13
86 0.13
87 0.14
88 0.14
89 0.15
90 0.16
91 0.16
92 0.18
93 0.27
94 0.3
95 0.41
96 0.49
97 0.55
98 0.62
99 0.7
100 0.74
101 0.76
102 0.83
103 0.83
104 0.85
105 0.89
106 0.89
107 0.9
108 0.84
109 0.8
110 0.79
111 0.7
112 0.66
113 0.66
114 0.62
115 0.62
116 0.68
117 0.65
118 0.64
119 0.68
120 0.7
121 0.7
122 0.71
123 0.64
124 0.63
125 0.7
126 0.63
127 0.66
128 0.58
129 0.47
130 0.42
131 0.38
132 0.29
133 0.21
134 0.19
135 0.14
136 0.14
137 0.14
138 0.13
139 0.13
140 0.13
141 0.12
142 0.12
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.09
149 0.09
150 0.12
151 0.19
152 0.23
153 0.3
154 0.35
155 0.44
156 0.51
157 0.6
158 0.67
159 0.71
160 0.78
161 0.76
162 0.77
163 0.76
164 0.73
165 0.67
166 0.6
167 0.5
168 0.39
169 0.34
170 0.3
171 0.22
172 0.16
173 0.12
174 0.08
175 0.07
176 0.06
177 0.05
178 0.04
179 0.03
180 0.02
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.09
201 0.1
202 0.1
203 0.12
204 0.17
205 0.17
206 0.16
207 0.15
208 0.14
209 0.18
210 0.19
211 0.22
212 0.23
213 0.25
214 0.27
215 0.29
216 0.33
217 0.33
218 0.35
219 0.34
220 0.29
221 0.32
222 0.32
223 0.31
224 0.28
225 0.26
226 0.24
227 0.21
228 0.2
229 0.13
230 0.12
231 0.1
232 0.1
233 0.1
234 0.08
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.1
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.13
246 0.12
247 0.13
248 0.15
249 0.17
250 0.18
251 0.18
252 0.18
253 0.19
254 0.19
255 0.17
256 0.16
257 0.18
258 0.16
259 0.15
260 0.16
261 0.14
262 0.18
263 0.19
264 0.19
265 0.15
266 0.16
267 0.16
268 0.14
269 0.15
270 0.12
271 0.14
272 0.14
273 0.16
274 0.19
275 0.2
276 0.2
277 0.24
278 0.24
279 0.23
280 0.23
281 0.21
282 0.2
283 0.18
284 0.21
285 0.16
286 0.13
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.09
291 0.09
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.06
296 0.05
297 0.06
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.09
302 0.09
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.13
308 0.17
309 0.23
310 0.23
311 0.24
312 0.27
313 0.29
314 0.31
315 0.31
316 0.28
317 0.23
318 0.26
319 0.25
320 0.23
321 0.21
322 0.19
323 0.17
324 0.16
325 0.16
326 0.16
327 0.19
328 0.18
329 0.19
330 0.19
331 0.18
332 0.19
333 0.19
334 0.16
335 0.14
336 0.16
337 0.18
338 0.23
339 0.26
340 0.25
341 0.3
342 0.3
343 0.33
344 0.31
345 0.29
346 0.27
347 0.29
348 0.28
349 0.26
350 0.26
351 0.24
352 0.23
353 0.21
354 0.18
355 0.14
356 0.14
357 0.14
358 0.17
359 0.19
360 0.21
361 0.23
362 0.26
363 0.32
364 0.39
365 0.44
366 0.45
367 0.48
368 0.53
369 0.56
370 0.54
371 0.49
372 0.41
373 0.34
374 0.28
375 0.22
376 0.18
377 0.13
378 0.12
379 0.11
380 0.1
381 0.1
382 0.12
383 0.12
384 0.1
385 0.09
386 0.1
387 0.1
388 0.11
389 0.12
390 0.1
391 0.1
392 0.08
393 0.08
394 0.07
395 0.07
396 0.08
397 0.07
398 0.06
399 0.07
400 0.07
401 0.08
402 0.08
403 0.07
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.05
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.03
415 0.03
416 0.04
417 0.05
418 0.05
419 0.07
420 0.11
421 0.11
422 0.12
423 0.13
424 0.14
425 0.19
426 0.28
427 0.32
428 0.31
429 0.36
430 0.45
431 0.52
432 0.54
433 0.53
434 0.48
435 0.48
436 0.49
437 0.5
438 0.43
439 0.35
440 0.31
441 0.28
442 0.24
443 0.19
444 0.15
445 0.09
446 0.08
447 0.08
448 0.09
449 0.08
450 0.09
451 0.09
452 0.09
453 0.08
454 0.09
455 0.09
456 0.11
457 0.12
458 0.13
459 0.13
460 0.15
461 0.15
462 0.17
463 0.17
464 0.15
465 0.14
466 0.15
467 0.16
468 0.14
469 0.13
470 0.13
471 0.16
472 0.17
473 0.18
474 0.16
475 0.17
476 0.18
477 0.18
478 0.17
479 0.19
480 0.2
481 0.2
482 0.2
483 0.18
484 0.17
485 0.17
486 0.15
487 0.09
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.05
494 0.05
495 0.06
496 0.05
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.06
510 0.07
511 0.08
512 0.08
513 0.09
514 0.09
515 0.09
516 0.12
517 0.17
518 0.17
519 0.16
520 0.17
521 0.18
522 0.19
523 0.21
524 0.19
525 0.14
526 0.13
527 0.13
528 0.13
529 0.12
530 0.13
531 0.12
532 0.11
533 0.1
534 0.09
535 0.09
536 0.08
537 0.09
538 0.09
539 0.09
540 0.09
541 0.09
542 0.1
543 0.11
544 0.1
545 0.13
546 0.12
547 0.13
548 0.14
549 0.14
550 0.14
551 0.14
552 0.14
553 0.1
554 0.11
555 0.11
556 0.09
557 0.11
558 0.12
559 0.11
560 0.11
561 0.11
562 0.11
563 0.11
564 0.14
565 0.14
566 0.14
567 0.14
568 0.15
569 0.14
570 0.15
571 0.15
572 0.11
573 0.09
574 0.11
575 0.12
576 0.11
577 0.11
578 0.09
579 0.1
580 0.1
581 0.1
582 0.09
583 0.07
584 0.1
585 0.09
586 0.1
587 0.14
588 0.13
589 0.13
590 0.16
591 0.16
592 0.14
593 0.15
594 0.14
595 0.12
596 0.19
597 0.2
598 0.21
599 0.22
600 0.22
601 0.21
602 0.2
603 0.19
604 0.12
605 0.16
606 0.18
607 0.25
608 0.29
609 0.36
610 0.41
611 0.46
612 0.47
613 0.46
614 0.4
615 0.32
616 0.28
617 0.21
618 0.18
619 0.13
620 0.1
621 0.07
622 0.06
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.05
627 0.06
628 0.07
629 0.08
630 0.09
631 0.09
632 0.09
633 0.09
634 0.1
635 0.09
636 0.08
637 0.08
638 0.08
639 0.11
640 0.12
641 0.16
642 0.21
643 0.21
644 0.24
645 0.27
646 0.31
647 0.3
648 0.34
649 0.3
650 0.26
651 0.27
652 0.25
653 0.22
654 0.23
655 0.24
656 0.24
657 0.25
658 0.24
659 0.24
660 0.24
661 0.24
662 0.19
663 0.17
664 0.12
665 0.1
666 0.09
667 0.08
668 0.06
669 0.05
670 0.04
671 0.04
672 0.04
673 0.03
674 0.04
675 0.04
676 0.05
677 0.05
678 0.05
679 0.04
680 0.06
681 0.07
682 0.08
683 0.08
684 0.09
685 0.1
686 0.14
687 0.15
688 0.16
689 0.16
690 0.16
691 0.19
692 0.2
693 0.22
694 0.2
695 0.23
696 0.22
697 0.22
698 0.21
699 0.19
700 0.2
701 0.17
702 0.17
703 0.16
704 0.18
705 0.18
706 0.18
707 0.17
708 0.15
709 0.18
710 0.18
711 0.15
712 0.17
713 0.17
714 0.18
715 0.19
716 0.2
717 0.19
718 0.19
719 0.22
720 0.2
721 0.22
722 0.21
723 0.24
724 0.24
725 0.23
726 0.23
727 0.2
728 0.21
729 0.26
730 0.29
731 0.28
732 0.31
733 0.32
734 0.35
735 0.38
736 0.37
737 0.3
738 0.34
739 0.39
740 0.4
741 0.41
742 0.39
743 0.41
744 0.44
745 0.44
746 0.41
747 0.35
748 0.29
749 0.3
750 0.29
751 0.24
752 0.22
753 0.25
754 0.2
755 0.2
756 0.19
757 0.24
758 0.29
759 0.31
760 0.35
761 0.36
762 0.43
763 0.51
764 0.53
765 0.55
766 0.55
767 0.53
768 0.5
769 0.46
770 0.41
771 0.34
772 0.35
773 0.28
774 0.24
775 0.22
776 0.21
777 0.25
778 0.25
779 0.24
780 0.27
781 0.28
782 0.33
783 0.35
784 0.34
785 0.31
786 0.33
787 0.38
788 0.38
789 0.38
790 0.32
791 0.31
792 0.31
793 0.3
794 0.29
795 0.26
796 0.23
797 0.28
798 0.37
799 0.47
800 0.57
801 0.64
802 0.71
803 0.76
804 0.81
805 0.81
806 0.82
807 0.78
808 0.74
809 0.72
810 0.69
811 0.62
812 0.58
813 0.49
814 0.41
815 0.35
816 0.28
817 0.2
818 0.14
819 0.12
820 0.09
821 0.08
822 0.06
823 0.06
824 0.06
825 0.06
826 0.06
827 0.06
828 0.08
829 0.14
830 0.17
831 0.2
832 0.27
833 0.32
834 0.38
835 0.42
836 0.51
837 0.56
838 0.6
839 0.62
840 0.56
841 0.52
842 0.51
843 0.49
844 0.45
845 0.37
846 0.31
847 0.29
848 0.3
849 0.31
850 0.26
851 0.25
852 0.19
853 0.18
854 0.17
855 0.2
856 0.19
857 0.16
858 0.17
859 0.19
860 0.2
861 0.2
862 0.24
863 0.19
864 0.23
865 0.29
866 0.34
867 0.32
868 0.33
869 0.33
870 0.29
871 0.28
872 0.28
873 0.24
874 0.26
875 0.28
876 0.27
877 0.27
878 0.3
879 0.34
880 0.34
881 0.4
882 0.38
883 0.4
884 0.4
885 0.39
886 0.38
887 0.33
888 0.36
889 0.33
890 0.28
891 0.27
892 0.35
893 0.38
894 0.45
895 0.52
896 0.55
897 0.55
898 0.58
899 0.61
900 0.59
901 0.61
902 0.61
903 0.61
904 0.55
905 0.51
906 0.49
907 0.45
908 0.37