Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2VFC6

Protein Details
Accession A0A1Y2VFC6    Localization Confidence High Confidence Score 21.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-32SGNLAQSKSNKRKDPTGQNAASHydrophilic
39-58SESSNRAPKRPKMHEVRSIAHydrophilic
105-163RVPFRMRRRAAAHNYKKVPRRLRRRAKREMAEDNTPTVNSKTRKPKSTRARLRAETARKHydrophilic
204-223VMTARKFRRRQLSKTWLPTHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
109-134RMRRRAAAHNYKKVPRRLRRRAKREM
144-179SKTRKPKSTRARLRAETARKLEILAKRKRLQKLKSS
191-196ARPKIR
511-513RRR
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 8, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences MNKPTPRPETSGNLAQSKSNKRKDPTGQNAASSSSNRGSESSNRAPKRPKMHEVRSIAAQKSHAALKDGELNIQSFVGSLSYEINALDESMRRTRTSQTSRAFQRVPFRMRRRAAAHNYKKVPRRLRRRAKREMAEDNTPTVNSKTRKPKSTRARLRAETARKLEILAKRKRLQKLKSSGANQETISIRAARPKIRRNVLNNPVMTARKFRRRQLSKTWLPTHLWHAKRARMTPPKEPLWRFAIPLTPTQKVYRPTHRIQWEKGAMAWDMSYMSTIGLSGAENSIQNVLQSLGLTQEALWNDKARRWRSGAMHWTGTLSRKTKDAIHVIGPATIIWNPEGKLEDVEQRKRFRQLYIRIHPSSFLETFNEVLRLARGQNPRPYVEDLRFEIGSIDITGPDSTEALLGVLKPYLSKTESKDPHASKFESLAGLKDPGALPLGCLLAFSVADPRLRYPPRQVALPKTTDQNAQVALLEVISALRREEATKPHQLFDRDARFKASKLPSQRSLNRRRGKGAPGTLLEPTMVDPPIPIILLASRHSVDSQSSGTWTIMLPWKCVLPIWYSLMHYPLSTGGNPWFGGLDEIRHVTFERGLPWFPGDFPGTHAGVAWELEERKVRHVAWDRMPKGKRVNWESLDLGAGRKGEVGVGWACDYEKLLALNKSNGRDEMVVDAKDGDEEPISASQTEEQAALVNPLESITQLSKSAFIAYQSPTSEQLSPTSLVTANIKILGRGVPTTCARIYRLPDIKPVAGSTQAEVPATNPPPHSKVEGKLPFNIRDQWLSRIPSKGNTQKKAIMKRDLDLETRQQLLAQQLLAPPAPFPPLPPNSENINGHPLCPNEEDLIGFVTTGSFNLRDGRGDAIGSLSARKALEELKRYKNQKDPAARLCVVRNAGQNIGWLAKWEVI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.5
3 0.53
4 0.57
5 0.6
6 0.61
7 0.64
8 0.64
9 0.73
10 0.79
11 0.81
12 0.8
13 0.81
14 0.75
15 0.69
16 0.66
17 0.59
18 0.52
19 0.43
20 0.38
21 0.31
22 0.3
23 0.27
24 0.27
25 0.29
26 0.32
27 0.4
28 0.45
29 0.51
30 0.53
31 0.59
32 0.66
33 0.7
34 0.74
35 0.74
36 0.74
37 0.74
38 0.8
39 0.82
40 0.8
41 0.76
42 0.74
43 0.71
44 0.63
45 0.56
46 0.48
47 0.4
48 0.37
49 0.37
50 0.3
51 0.26
52 0.25
53 0.24
54 0.31
55 0.3
56 0.29
57 0.26
58 0.25
59 0.23
60 0.22
61 0.19
62 0.1
63 0.1
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.09
75 0.1
76 0.15
77 0.2
78 0.22
79 0.23
80 0.25
81 0.32
82 0.41
83 0.47
84 0.52
85 0.53
86 0.6
87 0.65
88 0.71
89 0.67
90 0.61
91 0.63
92 0.62
93 0.64
94 0.65
95 0.67
96 0.69
97 0.7
98 0.74
99 0.7
100 0.71
101 0.73
102 0.74
103 0.76
104 0.76
105 0.81
106 0.81
107 0.83
108 0.82
109 0.82
110 0.81
111 0.83
112 0.84
113 0.87
114 0.9
115 0.92
116 0.93
117 0.93
118 0.91
119 0.89
120 0.87
121 0.82
122 0.79
123 0.71
124 0.62
125 0.53
126 0.44
127 0.38
128 0.3
129 0.31
130 0.26
131 0.33
132 0.41
133 0.48
134 0.58
135 0.63
136 0.72
137 0.75
138 0.84
139 0.86
140 0.84
141 0.86
142 0.8
143 0.81
144 0.8
145 0.77
146 0.75
147 0.68
148 0.62
149 0.52
150 0.49
151 0.48
152 0.45
153 0.47
154 0.47
155 0.52
156 0.56
157 0.63
158 0.71
159 0.74
160 0.74
161 0.75
162 0.76
163 0.76
164 0.78
165 0.75
166 0.73
167 0.68
168 0.63
169 0.52
170 0.47
171 0.39
172 0.32
173 0.29
174 0.23
175 0.2
176 0.24
177 0.28
178 0.31
179 0.39
180 0.47
181 0.54
182 0.61
183 0.68
184 0.68
185 0.75
186 0.76
187 0.74
188 0.65
189 0.58
190 0.54
191 0.48
192 0.42
193 0.4
194 0.39
195 0.42
196 0.48
197 0.53
198 0.6
199 0.66
200 0.72
201 0.74
202 0.77
203 0.76
204 0.8
205 0.78
206 0.71
207 0.66
208 0.61
209 0.59
210 0.57
211 0.5
212 0.48
213 0.48
214 0.49
215 0.52
216 0.54
217 0.55
218 0.55
219 0.58
220 0.6
221 0.62
222 0.64
223 0.67
224 0.65
225 0.59
226 0.56
227 0.52
228 0.45
229 0.38
230 0.37
231 0.3
232 0.35
233 0.35
234 0.31
235 0.32
236 0.33
237 0.36
238 0.37
239 0.42
240 0.46
241 0.49
242 0.51
243 0.57
244 0.64
245 0.65
246 0.61
247 0.63
248 0.57
249 0.5
250 0.47
251 0.4
252 0.31
253 0.25
254 0.22
255 0.13
256 0.09
257 0.09
258 0.08
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.08
284 0.09
285 0.11
286 0.12
287 0.14
288 0.15
289 0.19
290 0.27
291 0.27
292 0.31
293 0.33
294 0.39
295 0.39
296 0.47
297 0.52
298 0.48
299 0.46
300 0.42
301 0.39
302 0.34
303 0.33
304 0.3
305 0.25
306 0.21
307 0.22
308 0.23
309 0.25
310 0.29
311 0.31
312 0.28
313 0.27
314 0.3
315 0.28
316 0.27
317 0.23
318 0.18
319 0.14
320 0.12
321 0.1
322 0.08
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.11
327 0.11
328 0.11
329 0.12
330 0.19
331 0.24
332 0.31
333 0.36
334 0.39
335 0.41
336 0.46
337 0.47
338 0.45
339 0.48
340 0.5
341 0.55
342 0.6
343 0.65
344 0.6
345 0.58
346 0.54
347 0.46
348 0.4
349 0.3
350 0.23
351 0.16
352 0.15
353 0.16
354 0.16
355 0.15
356 0.1
357 0.1
358 0.09
359 0.09
360 0.09
361 0.15
362 0.2
363 0.25
364 0.3
365 0.33
366 0.34
367 0.36
368 0.39
369 0.36
370 0.33
371 0.32
372 0.28
373 0.27
374 0.26
375 0.23
376 0.18
377 0.14
378 0.12
379 0.09
380 0.07
381 0.05
382 0.06
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.05
398 0.07
399 0.09
400 0.12
401 0.15
402 0.25
403 0.28
404 0.33
405 0.41
406 0.4
407 0.44
408 0.45
409 0.43
410 0.34
411 0.32
412 0.28
413 0.22
414 0.2
415 0.16
416 0.12
417 0.12
418 0.11
419 0.11
420 0.1
421 0.08
422 0.09
423 0.08
424 0.07
425 0.07
426 0.08
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.04
431 0.05
432 0.05
433 0.06
434 0.07
435 0.08
436 0.09
437 0.1
438 0.17
439 0.19
440 0.21
441 0.24
442 0.3
443 0.31
444 0.35
445 0.36
446 0.36
447 0.39
448 0.4
449 0.36
450 0.3
451 0.31
452 0.28
453 0.26
454 0.2
455 0.16
456 0.13
457 0.12
458 0.1
459 0.09
460 0.07
461 0.06
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.03
467 0.04
468 0.04
469 0.06
470 0.09
471 0.15
472 0.19
473 0.27
474 0.28
475 0.3
476 0.33
477 0.33
478 0.34
479 0.36
480 0.41
481 0.36
482 0.35
483 0.38
484 0.35
485 0.34
486 0.4
487 0.37
488 0.32
489 0.36
490 0.42
491 0.44
492 0.51
493 0.58
494 0.59
495 0.65
496 0.7
497 0.7
498 0.67
499 0.65
500 0.62
501 0.6
502 0.57
503 0.51
504 0.45
505 0.38
506 0.37
507 0.32
508 0.28
509 0.22
510 0.15
511 0.12
512 0.1
513 0.08
514 0.07
515 0.06
516 0.07
517 0.07
518 0.07
519 0.05
520 0.04
521 0.05
522 0.07
523 0.08
524 0.09
525 0.09
526 0.1
527 0.1
528 0.11
529 0.1
530 0.11
531 0.11
532 0.09
533 0.1
534 0.1
535 0.1
536 0.1
537 0.09
538 0.1
539 0.15
540 0.15
541 0.15
542 0.15
543 0.15
544 0.15
545 0.15
546 0.14
547 0.1
548 0.12
549 0.14
550 0.15
551 0.16
552 0.16
553 0.18
554 0.17
555 0.14
556 0.12
557 0.11
558 0.11
559 0.1
560 0.11
561 0.11
562 0.12
563 0.12
564 0.12
565 0.1
566 0.08
567 0.1
568 0.09
569 0.08
570 0.08
571 0.09
572 0.09
573 0.1
574 0.1
575 0.1
576 0.12
577 0.12
578 0.13
579 0.14
580 0.14
581 0.15
582 0.16
583 0.15
584 0.13
585 0.15
586 0.13
587 0.12
588 0.14
589 0.17
590 0.15
591 0.15
592 0.15
593 0.12
594 0.11
595 0.11
596 0.09
597 0.08
598 0.08
599 0.09
600 0.14
601 0.15
602 0.18
603 0.21
604 0.21
605 0.27
606 0.35
607 0.41
608 0.45
609 0.54
610 0.54
611 0.6
612 0.61
613 0.58
614 0.57
615 0.54
616 0.54
617 0.51
618 0.56
619 0.5
620 0.52
621 0.47
622 0.4
623 0.38
624 0.29
625 0.23
626 0.16
627 0.14
628 0.1
629 0.09
630 0.08
631 0.07
632 0.06
633 0.08
634 0.08
635 0.08
636 0.09
637 0.08
638 0.09
639 0.09
640 0.1
641 0.08
642 0.08
643 0.09
644 0.12
645 0.15
646 0.17
647 0.23
648 0.26
649 0.29
650 0.29
651 0.28
652 0.27
653 0.25
654 0.23
655 0.22
656 0.22
657 0.19
658 0.18
659 0.17
660 0.15
661 0.15
662 0.14
663 0.1
664 0.07
665 0.07
666 0.08
667 0.09
668 0.1
669 0.09
670 0.1
671 0.1
672 0.11
673 0.11
674 0.1
675 0.08
676 0.09
677 0.09
678 0.1
679 0.09
680 0.08
681 0.07
682 0.07
683 0.07
684 0.06
685 0.08
686 0.08
687 0.09
688 0.11
689 0.11
690 0.12
691 0.12
692 0.14
693 0.12
694 0.12
695 0.15
696 0.15
697 0.19
698 0.19
699 0.2
700 0.21
701 0.23
702 0.23
703 0.21
704 0.21
705 0.2
706 0.19
707 0.18
708 0.18
709 0.16
710 0.15
711 0.17
712 0.16
713 0.14
714 0.17
715 0.16
716 0.14
717 0.15
718 0.15
719 0.14
720 0.15
721 0.15
722 0.17
723 0.18
724 0.22
725 0.22
726 0.23
727 0.24
728 0.27
729 0.31
730 0.36
731 0.41
732 0.39
733 0.45
734 0.47
735 0.45
736 0.41
737 0.38
738 0.3
739 0.28
740 0.27
741 0.21
742 0.21
743 0.2
744 0.19
745 0.18
746 0.17
747 0.21
748 0.24
749 0.25
750 0.23
751 0.27
752 0.3
753 0.32
754 0.37
755 0.33
756 0.34
757 0.41
758 0.48
759 0.46
760 0.51
761 0.54
762 0.52
763 0.51
764 0.53
765 0.45
766 0.43
767 0.43
768 0.42
769 0.42
770 0.43
771 0.42
772 0.43
773 0.42
774 0.41
775 0.48
776 0.52
777 0.56
778 0.57
779 0.58
780 0.61
781 0.68
782 0.72
783 0.7
784 0.7
785 0.63
786 0.61
787 0.63
788 0.59
789 0.54
790 0.48
791 0.47
792 0.41
793 0.4
794 0.37
795 0.3
796 0.29
797 0.28
798 0.26
799 0.2
800 0.18
801 0.17
802 0.2
803 0.2
804 0.17
805 0.14
806 0.14
807 0.17
808 0.14
809 0.16
810 0.23
811 0.27
812 0.33
813 0.34
814 0.36
815 0.38
816 0.45
817 0.45
818 0.39
819 0.44
820 0.39
821 0.38
822 0.39
823 0.35
824 0.32
825 0.32
826 0.31
827 0.23
828 0.23
829 0.22
830 0.19
831 0.2
832 0.15
833 0.13
834 0.1
835 0.09
836 0.09
837 0.09
838 0.1
839 0.09
840 0.1
841 0.15
842 0.16
843 0.17
844 0.18
845 0.21
846 0.2
847 0.19
848 0.18
849 0.15
850 0.16
851 0.15
852 0.15
853 0.13
854 0.14
855 0.14
856 0.14
857 0.15
858 0.2
859 0.27
860 0.35
861 0.42
862 0.49
863 0.59
864 0.64
865 0.7
866 0.72
867 0.73
868 0.74
869 0.76
870 0.76
871 0.74
872 0.78
873 0.72
874 0.67
875 0.62
876 0.59
877 0.51
878 0.47
879 0.45
880 0.4
881 0.4
882 0.37
883 0.35
884 0.31
885 0.3
886 0.25
887 0.21