Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2UHD0

Protein Details
Accession A0A1Y2UHD0    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MAERKEKKRKRDEDGGSRPKKKVABasic
68-89YTTPRPAGSKRNKRANSHTPNLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-22RKEKKRKRDEDGGSRPKKK
324-340KPGKERGTKRILPRDKL
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009668  RNA_pol-assoc_fac_A49-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06870  RNA_pol_I_A49  
Amino Acid Sequences MAERKEKKRKRDEDGGSRPKKKVAIQTPQPTQSDIVKLSSIRNAGTCPPVIATAPGLCVSNSVNFQVYTTPRPAGSKRNKRANSHTPNLLLHSSSHSKLDYTAKEDGSGGRESHLTHYIMVFDPQTGQIEAMEAKKMTIRGLVRAQKAPEEDVAERQASKTMMELKNNLGEAFGTKKAKKALAAITENAIAPGKAISDAGGKPEKLNDSSLALMESINNVTMGMASKEDLQAQADAAKPVPPYNPDAQEIQDVYTPESLIGGEILNAIPIRDWQEQVKKGVNIPMTGAFVANRLVAVAEGPNPVHRLRTLRYLDFLIKFVKNTKPGKERGTKRILPRDKLRELLKPAPEPVVENIRRKFSVNGEMRKFHVDLANTYCCALAAILSNYSFDTSKIRFDLGLDEKQFGQYFREIGGKVKNMKGTDKGTHIQVAVLALPLEFPKVAMYRSRGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.91
3 0.9
4 0.87
5 0.8
6 0.75
7 0.7
8 0.66
9 0.65
10 0.64
11 0.65
12 0.68
13 0.76
14 0.78
15 0.79
16 0.74
17 0.65
18 0.57
19 0.5
20 0.46
21 0.38
22 0.32
23 0.28
24 0.28
25 0.29
26 0.31
27 0.28
28 0.24
29 0.23
30 0.23
31 0.24
32 0.27
33 0.25
34 0.21
35 0.2
36 0.2
37 0.2
38 0.18
39 0.17
40 0.13
41 0.14
42 0.14
43 0.14
44 0.12
45 0.13
46 0.13
47 0.15
48 0.15
49 0.15
50 0.16
51 0.16
52 0.17
53 0.21
54 0.23
55 0.24
56 0.25
57 0.25
58 0.25
59 0.3
60 0.33
61 0.38
62 0.46
63 0.53
64 0.6
65 0.69
66 0.75
67 0.77
68 0.83
69 0.84
70 0.82
71 0.77
72 0.73
73 0.66
74 0.6
75 0.57
76 0.48
77 0.38
78 0.29
79 0.29
80 0.27
81 0.24
82 0.25
83 0.22
84 0.21
85 0.24
86 0.3
87 0.27
88 0.27
89 0.31
90 0.29
91 0.3
92 0.3
93 0.28
94 0.24
95 0.23
96 0.19
97 0.15
98 0.16
99 0.16
100 0.19
101 0.21
102 0.19
103 0.17
104 0.17
105 0.18
106 0.17
107 0.17
108 0.14
109 0.1
110 0.11
111 0.11
112 0.12
113 0.1
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.11
118 0.11
119 0.12
120 0.1
121 0.1
122 0.12
123 0.13
124 0.12
125 0.16
126 0.16
127 0.19
128 0.27
129 0.33
130 0.35
131 0.38
132 0.39
133 0.37
134 0.37
135 0.34
136 0.28
137 0.25
138 0.22
139 0.21
140 0.22
141 0.2
142 0.19
143 0.17
144 0.18
145 0.14
146 0.13
147 0.13
148 0.2
149 0.22
150 0.24
151 0.26
152 0.25
153 0.28
154 0.28
155 0.26
156 0.16
157 0.13
158 0.12
159 0.14
160 0.16
161 0.18
162 0.18
163 0.21
164 0.25
165 0.26
166 0.26
167 0.27
168 0.28
169 0.31
170 0.33
171 0.3
172 0.28
173 0.28
174 0.26
175 0.22
176 0.16
177 0.09
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.05
184 0.07
185 0.08
186 0.11
187 0.14
188 0.13
189 0.13
190 0.16
191 0.17
192 0.15
193 0.17
194 0.14
195 0.13
196 0.14
197 0.13
198 0.11
199 0.1
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.1
225 0.09
226 0.1
227 0.12
228 0.11
229 0.15
230 0.18
231 0.2
232 0.2
233 0.21
234 0.2
235 0.21
236 0.2
237 0.17
238 0.15
239 0.13
240 0.13
241 0.12
242 0.11
243 0.09
244 0.08
245 0.07
246 0.05
247 0.05
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.11
258 0.12
259 0.13
260 0.17
261 0.25
262 0.28
263 0.31
264 0.35
265 0.31
266 0.31
267 0.35
268 0.32
269 0.24
270 0.23
271 0.21
272 0.18
273 0.17
274 0.15
275 0.1
276 0.09
277 0.1
278 0.08
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.07
287 0.08
288 0.09
289 0.11
290 0.11
291 0.12
292 0.14
293 0.17
294 0.18
295 0.28
296 0.31
297 0.3
298 0.32
299 0.34
300 0.37
301 0.33
302 0.32
303 0.27
304 0.24
305 0.23
306 0.26
307 0.29
308 0.32
309 0.36
310 0.43
311 0.46
312 0.51
313 0.58
314 0.64
315 0.66
316 0.67
317 0.71
318 0.69
319 0.71
320 0.76
321 0.75
322 0.73
323 0.75
324 0.75
325 0.7
326 0.7
327 0.64
328 0.61
329 0.6
330 0.6
331 0.56
332 0.5
333 0.47
334 0.44
335 0.41
336 0.36
337 0.32
338 0.35
339 0.34
340 0.39
341 0.4
342 0.42
343 0.43
344 0.43
345 0.42
346 0.37
347 0.42
348 0.44
349 0.5
350 0.5
351 0.52
352 0.52
353 0.53
354 0.48
355 0.4
356 0.36
357 0.28
358 0.27
359 0.31
360 0.32
361 0.28
362 0.28
363 0.26
364 0.21
365 0.19
366 0.15
367 0.1
368 0.1
369 0.11
370 0.12
371 0.12
372 0.13
373 0.13
374 0.15
375 0.14
376 0.11
377 0.16
378 0.16
379 0.2
380 0.21
381 0.22
382 0.21
383 0.22
384 0.29
385 0.29
386 0.35
387 0.32
388 0.33
389 0.32
390 0.35
391 0.36
392 0.28
393 0.26
394 0.2
395 0.2
396 0.2
397 0.25
398 0.22
399 0.25
400 0.32
401 0.35
402 0.38
403 0.42
404 0.46
405 0.43
406 0.47
407 0.5
408 0.49
409 0.48
410 0.48
411 0.47
412 0.45
413 0.45
414 0.41
415 0.34
416 0.29
417 0.25
418 0.19
419 0.16
420 0.13
421 0.09
422 0.1
423 0.1
424 0.1
425 0.09
426 0.08
427 0.12
428 0.14
429 0.16
430 0.22