Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2V4U2

Protein Details
Accession A0A1Y2V4U2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
284-310EKTPKTPTGMSKLKRKKSKPGATPTSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
278-304KKDLKGEKTPKTPTGMSKLKRKKSKPG
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11, cyto 7.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR016612  Mediator_Med6_fun  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MATMNEPPPDEIQWRHPSEAQRIGGIHSNSVLFYFAESPFFDRTSNNAVIFSQAIFNPNMAHLISTREAFEGRLKQMSGLEFIVAQEPAEMGPGMGTGVWVINKQTRRKRDPDDEIIVHATYYVIGENIYMAPTLADILSFRMVTITDALGKCFTTADNARTWSPSLGHGYKVAPSITNAKEKALESKATTPMPESQGNKAAVEPKKTTQSALDSRLIEHSFMIQMQYGGDYMDENPITGKPGEFHLTSTGRKDKLQALALPNINTSFKKSALSEPDKKDLKGEKTPKTPTGMSKLKRKKSKPGATPTSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.44
3 0.47
4 0.5
5 0.53
6 0.59
7 0.51
8 0.45
9 0.41
10 0.41
11 0.43
12 0.37
13 0.3
14 0.23
15 0.22
16 0.18
17 0.18
18 0.17
19 0.1
20 0.1
21 0.12
22 0.11
23 0.13
24 0.14
25 0.16
26 0.18
27 0.19
28 0.18
29 0.16
30 0.2
31 0.25
32 0.28
33 0.25
34 0.24
35 0.23
36 0.24
37 0.24
38 0.2
39 0.15
40 0.12
41 0.14
42 0.13
43 0.13
44 0.12
45 0.12
46 0.13
47 0.11
48 0.11
49 0.09
50 0.13
51 0.14
52 0.14
53 0.14
54 0.14
55 0.14
56 0.15
57 0.2
58 0.21
59 0.22
60 0.24
61 0.24
62 0.24
63 0.26
64 0.25
65 0.22
66 0.17
67 0.15
68 0.12
69 0.12
70 0.13
71 0.1
72 0.09
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.03
85 0.04
86 0.04
87 0.05
88 0.07
89 0.12
90 0.18
91 0.27
92 0.35
93 0.44
94 0.5
95 0.58
96 0.65
97 0.69
98 0.71
99 0.7
100 0.69
101 0.6
102 0.55
103 0.49
104 0.41
105 0.31
106 0.22
107 0.15
108 0.08
109 0.07
110 0.05
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.04
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.07
133 0.06
134 0.09
135 0.09
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.09
141 0.08
142 0.09
143 0.11
144 0.12
145 0.14
146 0.16
147 0.16
148 0.17
149 0.18
150 0.14
151 0.13
152 0.13
153 0.17
154 0.16
155 0.16
156 0.17
157 0.16
158 0.17
159 0.18
160 0.16
161 0.11
162 0.11
163 0.17
164 0.18
165 0.23
166 0.22
167 0.21
168 0.23
169 0.24
170 0.28
171 0.24
172 0.23
173 0.2
174 0.24
175 0.27
176 0.26
177 0.25
178 0.22
179 0.23
180 0.25
181 0.27
182 0.25
183 0.24
184 0.3
185 0.31
186 0.29
187 0.27
188 0.31
189 0.29
190 0.32
191 0.32
192 0.28
193 0.34
194 0.34
195 0.34
196 0.29
197 0.33
198 0.34
199 0.36
200 0.38
201 0.31
202 0.32
203 0.35
204 0.33
205 0.26
206 0.2
207 0.17
208 0.12
209 0.12
210 0.12
211 0.08
212 0.08
213 0.07
214 0.08
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.1
221 0.1
222 0.09
223 0.1
224 0.1
225 0.13
226 0.13
227 0.12
228 0.09
229 0.13
230 0.17
231 0.16
232 0.17
233 0.21
234 0.24
235 0.26
236 0.32
237 0.35
238 0.34
239 0.34
240 0.36
241 0.36
242 0.39
243 0.42
244 0.4
245 0.38
246 0.43
247 0.46
248 0.43
249 0.38
250 0.33
251 0.31
252 0.26
253 0.28
254 0.23
255 0.21
256 0.24
257 0.25
258 0.31
259 0.39
260 0.47
261 0.5
262 0.53
263 0.61
264 0.62
265 0.6
266 0.6
267 0.58
268 0.57
269 0.58
270 0.61
271 0.61
272 0.67
273 0.73
274 0.7
275 0.68
276 0.65
277 0.61
278 0.61
279 0.62
280 0.59
281 0.64
282 0.7
283 0.74
284 0.8
285 0.8
286 0.82
287 0.84
288 0.88
289 0.87
290 0.87