FuNGI

A0A1Y2VAD2

Protein Details

Accession

A0A1Y2VAD2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1178-1201	VNKRHVPPAFNRSYRRSRRGREKR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1189-1201	RSYRRSRRGREKR

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, mito 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR003890 MIF4G-like_typ-3 IPR039762 Nmd2/UPF2 IPR007193 Upf2/Nmd2_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF02854 MIF4G PF04050 Upf2

Amino Acid Sequences

MDRSRKRELLSLNQRAWNGEPDIFPVSPSLDSSLKKNTAFIKRLRTAITPATLNTFLQEIRTLSLLKYLSEIISACYEGLSKLKTPGEIDAAIEIVSALHQRFGPEEFTEYLGWLLGKGMATPDKSLLKSLTPEVREKEEKERLVRQRALLRVITELWLVGVLRTLDDVKPDDATRSTNGKNVELKIKSANSTKGGGAEPFPLEVLKDLLGHDREHVNLPLLVIFVKSFGWDILGVKSAGSEGRKTVEEDGATKSSDENLEEANGQEDGGGASSDDPPFASPELRERFRNVLKRYFEDVKAHLVRDQKNIVAQRGRNSEAYVKSGEVFEDRQANFERQLKAQERLVSNAQVIADAIGAEMPDLKETGDGFSTTNGAIGLVKTGEYLRGQSEGAGIWQDEDERRFYENLVDLKGKVPGILLEDGKKKKADTDEQVGRRADSIESTEATKPADANDDQSTAIANKTIGAQVDVLLTRLPELTNKDAVDQAAIDFCFLNSKASRNRLIKALTEVPKGRTDLLPFWSRLVATLGRYMPDVPKGVVEYLDAEFRSLQRRKEKDFLGQVRLSNIRYLAELTKFGIVPEHVVFHCLKVSLDDFSRMNIEIICNLLENCGKYLLRNADTSPRMATFLETLQRKKSVQHIGQPERMLIENAIYYVDPPERASIQQKERTPTELFIRKLIYVDLTKRNYTKVLKQIRRLHWEESEVVAILTKVFSRPAKVKYGSIHILAILLSAIYRYHPDFTVTVIDNVIESIIIGLEQNDFRFNQRRIAEVKYLGELYNYRMLEHPVIFDTMYKIMLFGYSGPPVPGRINPFDLPDDYFRIRLVATMLETCGMFFNRGAAGKKLDYFLSFLQYYIHTKQPLPMDIEFIVQDTFSLTRPQWKLATTLEEAAKAFQLAVAQDQKNAGLDKTADQDEASSGTSSDDDGGEGDGDIVLPEADGDEDSELGEEDDAEDIENQPQSPRDFDSEEEAIVVTRKAEEIDPEDEADFEREYAKMMAESLESRKFDRKPLFDVPLPVRPKTRDISSANNESTNGESAPSTMAFSLLTKKGNRQQTRTVALPSDSTFAVAMKTQQQAEREEQQRIKNLVLNYDLRESEDPDGHEKSSSYHPNRSDKSSKERGGQRVRRLQLSDVDWYDKSQNGQNKAAQKIPDTEDSPTQGDDNDGCAPNRVDGGDVNKRHVPPAFNRSYRRSRRGREKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.59
3	0.54
4	0.49
5	0.41
6	0.35
7	0.3
8	0.29
9	0.33
10	0.3
11	0.27
12	0.23
13	0.21
14	0.19
15	0.19
16	0.2
17	0.2
18	0.21
19	0.25
20	0.33
21	0.36
22	0.36
23	0.39
24	0.44
25	0.49
26	0.55
27	0.57
28	0.59
29	0.59
30	0.63
31	0.62
32	0.56
33	0.52
34	0.51
35	0.49
36	0.4
37	0.36
38	0.37
39	0.35
40	0.32
41	0.27
42	0.22
43	0.18
44	0.17
45	0.19
46	0.15
47	0.15
48	0.17
49	0.17
50	0.15
51	0.21
52	0.2
53	0.18
54	0.18
55	0.18
56	0.17
57	0.17
58	0.17
59	0.14
60	0.15
61	0.15
62	0.13
63	0.12
64	0.12
65	0.11
66	0.14
67	0.15
68	0.15
69	0.2
70	0.23
71	0.25
72	0.26
73	0.28
74	0.29
75	0.27
76	0.26
77	0.21
78	0.19
79	0.17
80	0.15
81	0.11
82	0.06
83	0.07
84	0.08
85	0.08
86	0.09
87	0.1
88	0.11
89	0.13
90	0.15
91	0.18
92	0.17
93	0.2
94	0.2
95	0.22
96	0.21
97	0.2
98	0.18
99	0.15
100	0.14
101	0.1
102	0.09
103	0.09
104	0.08
105	0.08
106	0.12
107	0.15
108	0.16
109	0.18
110	0.22
111	0.25
112	0.25
113	0.28
114	0.26
115	0.25
116	0.27
117	0.32
118	0.35
119	0.34
120	0.39
121	0.4
122	0.46
123	0.48
124	0.49
125	0.53
126	0.54
127	0.56
128	0.57
129	0.63
130	0.64
131	0.68
132	0.69
133	0.65
134	0.64
135	0.63
136	0.61
137	0.54
138	0.46
139	0.39
140	0.36
141	0.31
142	0.23
143	0.18
144	0.13
145	0.12
146	0.1
147	0.08
148	0.09
149	0.08
150	0.08
151	0.09
152	0.11
153	0.11
154	0.14
155	0.16
156	0.15
157	0.18
158	0.18
159	0.2
160	0.19
161	0.22
162	0.23
163	0.27
164	0.27
165	0.29
166	0.31
167	0.33
168	0.37
169	0.38
170	0.42
171	0.37
172	0.38
173	0.41
174	0.41
175	0.4
176	0.4
177	0.41
178	0.35
179	0.36
180	0.34
181	0.31
182	0.3
183	0.27
184	0.23
185	0.21
186	0.19
187	0.17
188	0.16
189	0.13
190	0.12
191	0.11
192	0.11
193	0.09
194	0.09
195	0.1
196	0.15
197	0.17
198	0.17
199	0.19
200	0.19
201	0.2
202	0.23
203	0.23
204	0.19
205	0.18
206	0.18
207	0.16
208	0.14
209	0.13
210	0.1
211	0.09
212	0.07
213	0.07
214	0.07
215	0.07
216	0.06
217	0.07
218	0.08
219	0.09
220	0.1
221	0.12
222	0.11
223	0.11
224	0.11
225	0.1
226	0.12
227	0.13
228	0.13
229	0.12
230	0.15
231	0.17
232	0.19
233	0.21
234	0.21
235	0.21
236	0.21
237	0.25
238	0.23
239	0.23
240	0.21
241	0.19
242	0.17
243	0.18
244	0.16
245	0.13
246	0.12
247	0.13
248	0.13
249	0.13
250	0.11
251	0.1
252	0.09
253	0.07
254	0.07
255	0.06
256	0.06
257	0.05
258	0.04
259	0.05
260	0.08
261	0.08
262	0.08
263	0.08
264	0.08
265	0.1
266	0.11
267	0.11
268	0.1
269	0.19
270	0.26
271	0.29
272	0.31
273	0.33
274	0.4
275	0.47
276	0.55
277	0.52
278	0.53
279	0.55
280	0.57
281	0.6
282	0.58
283	0.53
284	0.49
285	0.45
286	0.46
287	0.43
288	0.39
289	0.36
290	0.38
291	0.38
292	0.39
293	0.39
294	0.31
295	0.34
296	0.37
297	0.39
298	0.39
299	0.38
300	0.4
301	0.43
302	0.44
303	0.39
304	0.38
305	0.39
306	0.34
307	0.34
308	0.28
309	0.24
310	0.21
311	0.21
312	0.19
313	0.15
314	0.14
315	0.14
316	0.2
317	0.19
318	0.22
319	0.24
320	0.25
321	0.28
322	0.32
323	0.33
324	0.27
325	0.35
326	0.36
327	0.36
328	0.38
329	0.4
330	0.35
331	0.37
332	0.38
333	0.31
334	0.27
335	0.25
336	0.21
337	0.15
338	0.14
339	0.1
340	0.07
341	0.06
342	0.05
343	0.04
344	0.04
345	0.03
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.06
352	0.07
353	0.08
354	0.08
355	0.08
356	0.08
357	0.09
358	0.1
359	0.08
360	0.08
361	0.07
362	0.06
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.05
367	0.05
368	0.06
369	0.06
370	0.07
371	0.08
372	0.09
373	0.09
374	0.1
375	0.1
376	0.1
377	0.1
378	0.09
379	0.09
380	0.08
381	0.07
382	0.06
383	0.06
384	0.08
385	0.09
386	0.1
387	0.11
388	0.12
389	0.14
390	0.14
391	0.14
392	0.16
393	0.19
394	0.2
395	0.21
396	0.21
397	0.19
398	0.2
399	0.22
400	0.18
401	0.13
402	0.12
403	0.1
404	0.12
405	0.13
406	0.13
407	0.15
408	0.23
409	0.25
410	0.27
411	0.27
412	0.24
413	0.26
414	0.32
415	0.35
416	0.33
417	0.41
418	0.48
419	0.49
420	0.55
421	0.5
422	0.44
423	0.37
424	0.33
425	0.24
426	0.16
427	0.16
428	0.12
429	0.12
430	0.15
431	0.15
432	0.14
433	0.14
434	0.14
435	0.11
436	0.1
437	0.14
438	0.11
439	0.14
440	0.15
441	0.15
442	0.15
443	0.15
444	0.15
445	0.11
446	0.11
447	0.08
448	0.07
449	0.06
450	0.07
451	0.08
452	0.07
453	0.07
454	0.07
455	0.07
456	0.09
457	0.08
458	0.08
459	0.07
460	0.06
461	0.06
462	0.06
463	0.06
464	0.07
465	0.11
466	0.14
467	0.17
468	0.17
469	0.17
470	0.18
471	0.18
472	0.16
473	0.12
474	0.09
475	0.08
476	0.08
477	0.07
478	0.06
479	0.06
480	0.08
481	0.08
482	0.11
483	0.1
484	0.14
485	0.19
486	0.24
487	0.31
488	0.32
489	0.34
490	0.35
491	0.36
492	0.33
493	0.33
494	0.37
495	0.32
496	0.34
497	0.34
498	0.32
499	0.33
500	0.32
501	0.28
502	0.22
503	0.21
504	0.2
505	0.22
506	0.23
507	0.21
508	0.21
509	0.2
510	0.18
511	0.16
512	0.16
513	0.13
514	0.11
515	0.14
516	0.14
517	0.14
518	0.14
519	0.14
520	0.13
521	0.14
522	0.14
523	0.1
524	0.1
525	0.11
526	0.11
527	0.1
528	0.09
529	0.09
530	0.08
531	0.1
532	0.09
533	0.08
534	0.09
535	0.1
536	0.18
537	0.19
538	0.24
539	0.32
540	0.37
541	0.41
542	0.47
543	0.48
544	0.47
545	0.53
546	0.52
547	0.49
548	0.46
549	0.41
550	0.38
551	0.38
552	0.32
553	0.23
554	0.19
555	0.13
556	0.12
557	0.13
558	0.12
559	0.11
560	0.11
561	0.11
562	0.11
563	0.11
564	0.1
565	0.1
566	0.08
567	0.09
568	0.09
569	0.1
570	0.09
571	0.1
572	0.11
573	0.1
574	0.11
575	0.09
576	0.08
577	0.08
578	0.09
579	0.08
580	0.09
581	0.11
582	0.1
583	0.1
584	0.12
585	0.11
586	0.1
587	0.09
588	0.08
589	0.06
590	0.07
591	0.07
592	0.06
593	0.05
594	0.06
595	0.07
596	0.07
597	0.07
598	0.09
599	0.08
600	0.08
601	0.13
602	0.16
603	0.17
604	0.17
605	0.18
606	0.23
607	0.24
608	0.24
609	0.21
610	0.17
611	0.17
612	0.16
613	0.15
614	0.1
615	0.11
616	0.15
617	0.17
618	0.18
619	0.19
620	0.21
621	0.21
622	0.22
623	0.28
624	0.32
625	0.32
626	0.38
627	0.46
628	0.48
629	0.52
630	0.5
631	0.43
632	0.35
633	0.32
634	0.25
635	0.15
636	0.1
637	0.06
638	0.06
639	0.07
640	0.05
641	0.05
642	0.06
643	0.07
644	0.07
645	0.07
646	0.08
647	0.09
648	0.11
649	0.16
650	0.21
651	0.27
652	0.33
653	0.35
654	0.38
655	0.38
656	0.41
657	0.37
658	0.32
659	0.33
660	0.34
661	0.31
662	0.3
663	0.3
664	0.26
665	0.25
666	0.23
667	0.18
668	0.14
669	0.18
670	0.23
671	0.25
672	0.27
673	0.27
674	0.28
675	0.31
676	0.31
677	0.33
678	0.35
679	0.43
680	0.47
681	0.56
682	0.64
683	0.66
684	0.71
685	0.67
686	0.61
687	0.53
688	0.49
689	0.41
690	0.33
691	0.26
692	0.18
693	0.15
694	0.11
695	0.09
696	0.07
697	0.06
698	0.05
699	0.04
700	0.07
701	0.08
702	0.11
703	0.16
704	0.2
705	0.27
706	0.29
707	0.31
708	0.31
709	0.36
710	0.35
711	0.31
712	0.27
713	0.2
714	0.18
715	0.15
716	0.13
717	0.07
718	0.04
719	0.03
720	0.03
721	0.03
722	0.03
723	0.05
724	0.06
725	0.08
726	0.08
727	0.11
728	0.11
729	0.12
730	0.16
731	0.15
732	0.15
733	0.13
734	0.13
735	0.11
736	0.11
737	0.09
738	0.04
739	0.03
740	0.03
741	0.02
742	0.03
743	0.03
744	0.03
745	0.05
746	0.05
747	0.06
748	0.07
749	0.08
750	0.12
751	0.19
752	0.2
753	0.26
754	0.27
755	0.3
756	0.31
757	0.36
758	0.36
759	0.31
760	0.31
761	0.25
762	0.25
763	0.21
764	0.2
765	0.16
766	0.15
767	0.18
768	0.17
769	0.17
770	0.16
771	0.18
772	0.2
773	0.19
774	0.18
775	0.12
776	0.13
777	0.12
778	0.12
779	0.12
780	0.1
781	0.1
782	0.09
783	0.08
784	0.07
785	0.07
786	0.07
787	0.07
788	0.08
789	0.09
790	0.09
791	0.1
792	0.1
793	0.12
794	0.13
795	0.15
796	0.18
797	0.19
798	0.24
799	0.24
800	0.26
801	0.26
802	0.26
803	0.25
804	0.23
805	0.24
806	0.21
807	0.21
808	0.18
809	0.17
810	0.16
811	0.14
812	0.13
813	0.09
814	0.09
815	0.09
816	0.1
817	0.09
818	0.09
819	0.09
820	0.09
821	0.09
822	0.08
823	0.07
824	0.09
825	0.1
826	0.13
827	0.15
828	0.15
829	0.18
830	0.19
831	0.2
832	0.2
833	0.19
834	0.17
835	0.18
836	0.16
837	0.18
838	0.17
839	0.15
840	0.15
841	0.16
842	0.2
843	0.2
844	0.24
845	0.21
846	0.22
847	0.26
848	0.29
849	0.3
850	0.3
851	0.28
852	0.26
853	0.25
854	0.26
855	0.21
856	0.18
857	0.14
858	0.1
859	0.09
860	0.07
861	0.08
862	0.07
863	0.1
864	0.1
865	0.19
866	0.21
867	0.24
868	0.25
869	0.25
870	0.27
871	0.27
872	0.32
873	0.25
874	0.28
875	0.25
876	0.24
877	0.23
878	0.21
879	0.19
880	0.14
881	0.12
882	0.08
883	0.08
884	0.07
885	0.11
886	0.18
887	0.18
888	0.19
889	0.19
890	0.19
891	0.2
892	0.21
893	0.16
894	0.11
895	0.12
896	0.13
897	0.17
898	0.17
899	0.16
900	0.14
901	0.15
902	0.14
903	0.14
904	0.13
905	0.09
906	0.08
907	0.09
908	0.09
909	0.09
910	0.09
911	0.07
912	0.06
913	0.06
914	0.07
915	0.06
916	0.06
917	0.06
918	0.05
919	0.05
920	0.04
921	0.04
922	0.03
923	0.03
924	0.03
925	0.03
926	0.03
927	0.04
928	0.04
929	0.05
930	0.05
931	0.05
932	0.05
933	0.05
934	0.05
935	0.05
936	0.04
937	0.04
938	0.05
939	0.05
940	0.05
941	0.06
942	0.07
943	0.09
944	0.1
945	0.1
946	0.11
947	0.14
948	0.16
949	0.18
950	0.19
951	0.21
952	0.22
953	0.23
954	0.28
955	0.25
956	0.24
957	0.22
958	0.19
959	0.15
960	0.14
961	0.13
962	0.07
963	0.07
964	0.07
965	0.08
966	0.09
967	0.12
968	0.15
969	0.18
970	0.18
971	0.19
972	0.19
973	0.18
974	0.18
975	0.17
976	0.13
977	0.1
978	0.1
979	0.09
980	0.11
981	0.11
982	0.11
983	0.09
984	0.09
985	0.1
986	0.11
987	0.13
988	0.16
989	0.22
990	0.22
991	0.25
992	0.32
993	0.33
994	0.4
995	0.47
996	0.46
997	0.48
998	0.54
999	0.57
1000	0.53
1001	0.58
1002	0.54
1003	0.54
1004	0.54
1005	0.49
1006	0.47
1007	0.43
1008	0.46
1009	0.43
1010	0.43
1011	0.43
1012	0.43
1013	0.51
1014	0.53
1015	0.58
1016	0.54
1017	0.5
1018	0.46
1019	0.39
1020	0.37
1021	0.29
1022	0.22
1023	0.15
1024	0.13
1025	0.12
1026	0.14
1027	0.13
1028	0.11
1029	0.09
1030	0.09
1031	0.09
1032	0.1
1033	0.16
1034	0.17
1035	0.22
1036	0.23
1037	0.31
1038	0.39
1039	0.49
1040	0.55
1041	0.56
1042	0.62
1043	0.65
1044	0.69
1045	0.65
1046	0.61
1047	0.53
1048	0.47
1049	0.43
1050	0.35
1051	0.29
1052	0.22
1053	0.2
1054	0.16
1055	0.14
1056	0.13
1057	0.12
1058	0.13
1059	0.16
1060	0.2
1061	0.22
1062	0.25
1063	0.28
1064	0.32
1065	0.37
1066	0.44
1067	0.43
1068	0.48
1069	0.51
1070	0.53
1071	0.58
1072	0.56
1073	0.53
1074	0.48
1075	0.45
1076	0.41
1077	0.41
1078	0.38
1079	0.33
1080	0.35
1081	0.32
1082	0.31
1083	0.31
1084	0.3
1085	0.28
1086	0.28
1087	0.28
1088	0.28
1089	0.31
1090	0.28
1091	0.27
1092	0.25
1093	0.24
1094	0.3
1095	0.38
1096	0.39
1097	0.44
1098	0.51
1099	0.6
1100	0.64
1101	0.69
1102	0.68
1103	0.65
1104	0.68
1105	0.71
1106	0.69
1107	0.68
1108	0.72
1109	0.74
1110	0.77
1111	0.79
1112	0.8
1113	0.79
1114	0.79
1115	0.76
1116	0.71
1117	0.64
1118	0.6
1119	0.55
1120	0.52
1121	0.45
1122	0.44
1123	0.38
1124	0.38
1125	0.37
1126	0.32
1127	0.31
1128	0.31
1129	0.35
1130	0.37
1131	0.43
1132	0.46
1133	0.51
1134	0.53
1135	0.55
1136	0.51
1137	0.47
1138	0.47
1139	0.46
1140	0.47
1141	0.42
1142	0.41
1143	0.4
1144	0.41
1145	0.39
1146	0.34
1147	0.3
1148	0.23
1149	0.24
1150	0.21
1151	0.2
1152	0.22
1153	0.23
1154	0.22
1155	0.25
1156	0.26
1157	0.25
1158	0.26
1159	0.22
1160	0.18
1161	0.18
1162	0.26
1163	0.32
1164	0.33
1165	0.37
1166	0.42
1167	0.42
1168	0.45
1169	0.46
1170	0.44
1171	0.43
1172	0.52
1173	0.56
1174	0.58
1175	0.65
1176	0.69
1177	0.76
1178	0.8
1179	0.81
1180	0.81
1181	0.82

A0A1Y2VAD2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer