Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2VGX4

Protein Details
Accession A0A1Y2VGX4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-93EPAVEQPKTAKKRKAAKAKTEDLMHydrophilic
429-456DRKSAKGAKKGAAKKRGKKKAEASSDEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
77-88KTAKKRKAAKAK
430-449RKSAKGAKKGAAKKRGKKKA
Subcellular Location(s) mito 18.5, mito_nucl 12.666, cyto_mito 11.833, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001719  AP_endonuc_2  
IPR018246  AP_endonuc_F2_Zn_BS  
IPR036237  Xyl_isomerase-like_sf  
IPR013022  Xyl_isomerase-like_TIM-brl  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01261  AP_endonuc_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00730  AP_NUCLEASE_F2_2  
PS00731  AP_NUCLEASE_F2_3  
PS51432  AP_NUCLEASE_F2_4  
CDD cd00019  AP2Ec  
Amino Acid Sequences MPRQSSRVKKAIVETAAAAAAKTVSPSSSTPKSKAAKRKAVEEAADDEPLTVIEEPKTAKKRKADEDDEEPAVEQPKTAKKRKAAKAKTEDLMALAKRTVINTLKKSMYIGAHVSSAGGVQNSINNAVHIGANAFALFLKSQRKWVNPPIAPEALNGFLSLSKEHKFEVHKHCLPHGSYLVNLAQAEKDKAEQAYNSFLDDLKRCESLGVKLYNFHPGNSNGEERAEAIGRIAKQLNKAHKATSTVITVLENMAGQGNVIGSTFEDLRDIIELVEDKSRVGVCIDTCHAFAAGYDLRSPEAFSDTMSKFNSIVGPSYLKAFHINDSKAPLNSHRDLHANIGTGFLGLRAFHNVVNHGAFEGMPMVLETPIDRKGPDGKTFEDKQIWADEIKLLESLIGMDAESEEFKALDERLQAQGAAERSKIQDQVDRKSAKGAKKGAAKKRGKKKAEASSDEDSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.35
3 0.33
4 0.28
5 0.22
6 0.14
7 0.12
8 0.1
9 0.1
10 0.09
11 0.08
12 0.11
13 0.14
14 0.21
15 0.29
16 0.34
17 0.37
18 0.45
19 0.53
20 0.59
21 0.67
22 0.71
23 0.72
24 0.7
25 0.75
26 0.74
27 0.73
28 0.66
29 0.59
30 0.53
31 0.45
32 0.43
33 0.34
34 0.26
35 0.19
36 0.17
37 0.15
38 0.11
39 0.09
40 0.09
41 0.12
42 0.14
43 0.23
44 0.33
45 0.37
46 0.43
47 0.5
48 0.58
49 0.66
50 0.74
51 0.73
52 0.7
53 0.72
54 0.71
55 0.64
56 0.55
57 0.46
58 0.37
59 0.32
60 0.25
61 0.18
62 0.18
63 0.26
64 0.35
65 0.43
66 0.48
67 0.54
68 0.65
69 0.74
70 0.8
71 0.8
72 0.82
73 0.83
74 0.83
75 0.76
76 0.68
77 0.58
78 0.48
79 0.44
80 0.34
81 0.25
82 0.18
83 0.18
84 0.16
85 0.17
86 0.2
87 0.22
88 0.29
89 0.31
90 0.37
91 0.37
92 0.36
93 0.37
94 0.35
95 0.3
96 0.26
97 0.24
98 0.19
99 0.18
100 0.18
101 0.16
102 0.12
103 0.11
104 0.09
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.08
109 0.08
110 0.11
111 0.1
112 0.09
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.08
117 0.08
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.08
126 0.14
127 0.15
128 0.23
129 0.28
130 0.32
131 0.38
132 0.47
133 0.54
134 0.5
135 0.54
136 0.52
137 0.49
138 0.45
139 0.39
140 0.32
141 0.23
142 0.21
143 0.16
144 0.11
145 0.09
146 0.1
147 0.1
148 0.11
149 0.12
150 0.12
151 0.13
152 0.17
153 0.19
154 0.28
155 0.36
156 0.43
157 0.45
158 0.45
159 0.47
160 0.48
161 0.45
162 0.4
163 0.33
164 0.24
165 0.2
166 0.22
167 0.2
168 0.16
169 0.15
170 0.12
171 0.1
172 0.11
173 0.12
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.15
182 0.15
183 0.15
184 0.14
185 0.13
186 0.15
187 0.15
188 0.17
189 0.14
190 0.14
191 0.13
192 0.14
193 0.15
194 0.15
195 0.2
196 0.2
197 0.18
198 0.2
199 0.2
200 0.28
201 0.27
202 0.25
203 0.22
204 0.21
205 0.25
206 0.25
207 0.25
208 0.17
209 0.17
210 0.17
211 0.14
212 0.14
213 0.1
214 0.07
215 0.07
216 0.09
217 0.09
218 0.1
219 0.12
220 0.12
221 0.17
222 0.23
223 0.29
224 0.32
225 0.33
226 0.33
227 0.32
228 0.35
229 0.31
230 0.28
231 0.22
232 0.18
233 0.17
234 0.16
235 0.14
236 0.11
237 0.09
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.1
269 0.08
270 0.11
271 0.13
272 0.12
273 0.13
274 0.13
275 0.12
276 0.1
277 0.1
278 0.12
279 0.11
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.12
284 0.12
285 0.12
286 0.08
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.16
291 0.16
292 0.2
293 0.2
294 0.2
295 0.18
296 0.19
297 0.2
298 0.14
299 0.15
300 0.13
301 0.15
302 0.14
303 0.16
304 0.15
305 0.13
306 0.16
307 0.16
308 0.19
309 0.24
310 0.25
311 0.25
312 0.29
313 0.31
314 0.29
315 0.3
316 0.3
317 0.3
318 0.32
319 0.32
320 0.3
321 0.3
322 0.3
323 0.33
324 0.3
325 0.25
326 0.22
327 0.21
328 0.18
329 0.15
330 0.14
331 0.1
332 0.08
333 0.06
334 0.07
335 0.1
336 0.11
337 0.12
338 0.13
339 0.15
340 0.17
341 0.17
342 0.16
343 0.13
344 0.12
345 0.11
346 0.1
347 0.09
348 0.06
349 0.05
350 0.05
351 0.06
352 0.05
353 0.06
354 0.06
355 0.08
356 0.11
357 0.12
358 0.12
359 0.14
360 0.22
361 0.28
362 0.34
363 0.35
364 0.36
365 0.43
366 0.46
367 0.49
368 0.45
369 0.4
370 0.36
371 0.35
372 0.33
373 0.26
374 0.24
375 0.21
376 0.17
377 0.17
378 0.15
379 0.12
380 0.1
381 0.09
382 0.09
383 0.07
384 0.06
385 0.05
386 0.05
387 0.06
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.1
395 0.1
396 0.11
397 0.14
398 0.16
399 0.19
400 0.2
401 0.19
402 0.18
403 0.22
404 0.22
405 0.22
406 0.2
407 0.2
408 0.23
409 0.27
410 0.3
411 0.28
412 0.32
413 0.35
414 0.43
415 0.49
416 0.48
417 0.45
418 0.51
419 0.55
420 0.56
421 0.59
422 0.57
423 0.56
424 0.63
425 0.72
426 0.73
427 0.77
428 0.8
429 0.81
430 0.86
431 0.89
432 0.86
433 0.86
434 0.86
435 0.86
436 0.86
437 0.82
438 0.78