FuNGI

A0A1Y2VFD6

Protein Details

Accession

A0A1Y2VFD6

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
258-294	SIEINKKTKKSKKALERAVDRVKKQERKKNAPHPLNF	Hydrophilic
495-518	ELLAKWKEEQKKRKRAERGLPEEG	Basic
687-725	EGKSTTNKEKARKKNFMMTLGKAKSKQKRSLVATRNILK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
257-287	HSIEINKKTKKSKKALERAVDRVKKQERKKN
503-512	EQKKRKRAER
652-743	RKTTKEERVALAKEGKPDREEHKSTQAIRKAKKEAEGKSTTNKEKARKKNFMMTLGKAKSKQKRSLVATRNILKNHIERSKSGGRRRNGISR

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, mito_nucl 12.833, mito 5, cyto_mito 4.333

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR027312 Sda1 IPR007949 SDA1_C IPR012977 SDA1_N
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0015031 P:protein transport GO:0042273 P:ribosomal large subunit biogenesis GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF08158 NUC130_3NT PF05285 SDA1

Amino Acid Sequences

MGKRKVAALEKIEADLAGLQYKIRKDPEAYEKEFIENWQQFDAAHEKFLAAPVGADSNSLITFREQIDLIAHCAELYPQITATFPDSLKDVLTKHHAVLEPTLREKIVSSLTLLRRKDVIDSNYLLTTLFPILISTPSKSLRMILYQKILSDIRNTNTKSTNHRVNRTMQTVLYNLVTSDRTSPKALWAVKLVRELWRRQIWADAKTVDIMRQACLADNEKVIVGGVRFFLGGDKEREEFEDESSDEENIDIKKVKHSIEINKKTKKSKKALERAVDRVKKQERKKNAPHPLNFSALHLLQDPQGFSENLFEKHLQNSKSKLALESKLLVLQLVTRLVGLHKLTVISLYSWFIKHLTPRQQSASSFLASLAQGTHNLVPPDAIEPLIQKIANEFVSEASASEVCSAGLNAIREICARQPLAMNETLLQDLVEYRKSKDKGVMMAAKGLLSLYREQGADMLRKKDRGKEATIGLKSGDLKKLRYGEEQVGEIEGLELLAKWKEEQKKRKRAERGLPEEGGDGEKTDDKDEEDGWNSSDWEVASTDSDESGEWIRVSDSEDEAEPEPDTKRQKVDSEDPNEDNGENAGSETVDFIKLATTQILTPADLAKLRELRMEANIDKAMGSRKRKQELEARNVDEGLTAEQIEAPAKLRKTTKEERVALAKEGKPDREEHKSTQAIRKAKKEAEGKSTTNKEKARKKNFMMTLGKAKSKQKRSLVATRNILKNHIERSKSGGRRRNGISR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.21
3	0.17
4	0.13
5	0.12
6	0.12
7	0.16
8	0.2
9	0.25
10	0.27
11	0.3
12	0.32
13	0.4
14	0.5
15	0.54
16	0.56
17	0.55
18	0.52
19	0.51
20	0.48
21	0.42
22	0.41
23	0.36
24	0.33
25	0.3
26	0.28
27	0.25
28	0.28
29	0.33
30	0.24
31	0.22
32	0.2
33	0.19
34	0.19
35	0.21
36	0.18
37	0.11
38	0.11
39	0.1
40	0.13
41	0.12
42	0.12
43	0.1
44	0.11
45	0.11
46	0.11
47	0.11
48	0.09
49	0.13
50	0.13
51	0.15
52	0.14
53	0.14
54	0.17
55	0.17
56	0.18
57	0.16
58	0.15
59	0.13
60	0.13
61	0.12
62	0.12
63	0.12
64	0.1
65	0.1
66	0.11
67	0.11
68	0.12
69	0.15
70	0.16
71	0.15
72	0.15
73	0.16
74	0.16
75	0.17
76	0.18
77	0.16
78	0.17
79	0.24
80	0.25
81	0.24
82	0.29
83	0.3
84	0.3
85	0.35
86	0.37
87	0.35
88	0.36
89	0.37
90	0.31
91	0.29
92	0.28
93	0.25
94	0.22
95	0.18
96	0.18
97	0.24
98	0.32
99	0.39
100	0.38
101	0.37
102	0.36
103	0.36
104	0.39
105	0.38
106	0.34
107	0.32
108	0.34
109	0.35
110	0.33
111	0.32
112	0.26
113	0.19
114	0.17
115	0.12
116	0.09
117	0.07
118	0.07
119	0.08
120	0.11
121	0.13
122	0.13
123	0.16
124	0.18
125	0.2
126	0.2
127	0.21
128	0.21
129	0.27
130	0.31
131	0.32
132	0.35
133	0.35
134	0.35
135	0.37
136	0.35
137	0.28
138	0.29
139	0.29
140	0.26
141	0.33
142	0.35
143	0.35
144	0.4
145	0.43
146	0.45
147	0.48
148	0.56
149	0.56
150	0.61
151	0.61
152	0.62
153	0.66
154	0.61
155	0.56
156	0.46
157	0.41
158	0.35
159	0.33
160	0.26
161	0.18
162	0.14
163	0.14
164	0.13
165	0.12
166	0.17
167	0.18
168	0.2
169	0.22
170	0.22
171	0.24
172	0.31
173	0.32
174	0.28
175	0.31
176	0.33
177	0.34
178	0.37
179	0.34
180	0.35
181	0.39
182	0.4
183	0.42
184	0.43
185	0.42
186	0.38
187	0.45
188	0.42
189	0.4
190	0.41
191	0.33
192	0.28
193	0.29
194	0.29
195	0.21
196	0.21
197	0.18
198	0.15
199	0.16
200	0.16
201	0.15
202	0.17
203	0.19
204	0.17
205	0.16
206	0.16
207	0.14
208	0.14
209	0.12
210	0.11
211	0.07
212	0.07
213	0.07
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.07
218	0.09
219	0.11
220	0.13
221	0.15
222	0.15
223	0.16
224	0.17
225	0.2
226	0.18
227	0.17
228	0.18
229	0.15
230	0.17
231	0.17
232	0.16
233	0.12
234	0.11
235	0.12
236	0.09
237	0.11
238	0.12
239	0.12
240	0.17
241	0.2
242	0.21
243	0.24
244	0.3
245	0.38
246	0.46
247	0.57
248	0.61
249	0.66
250	0.71
251	0.75
252	0.77
253	0.77
254	0.75
255	0.73
256	0.75
257	0.78
258	0.81
259	0.8
260	0.78
261	0.76
262	0.77
263	0.73
264	0.63
265	0.62
266	0.62
267	0.62
268	0.65
269	0.66
270	0.66
271	0.71
272	0.8
273	0.82
274	0.83
275	0.83
276	0.79
277	0.78
278	0.71
279	0.65
280	0.55
281	0.45
282	0.37
283	0.29
284	0.25
285	0.18
286	0.15
287	0.13
288	0.13
289	0.12
290	0.1
291	0.11
292	0.11
293	0.1
294	0.14
295	0.14
296	0.14
297	0.16
298	0.17
299	0.16
300	0.21
301	0.26
302	0.24
303	0.25
304	0.27
305	0.29
306	0.3
307	0.3
308	0.28
309	0.27
310	0.26
311	0.25
312	0.23
313	0.21
314	0.19
315	0.18
316	0.15
317	0.11
318	0.09
319	0.08
320	0.07
321	0.06
322	0.05
323	0.06
324	0.06
325	0.09
326	0.08
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.07
331	0.08
332	0.08
333	0.06
334	0.06
335	0.07
336	0.08
337	0.08
338	0.08
339	0.09
340	0.1
341	0.13
342	0.19
343	0.28
344	0.3
345	0.32
346	0.36
347	0.37
348	0.36
349	0.37
350	0.32
351	0.23
352	0.2
353	0.17
354	0.15
355	0.12
356	0.12
357	0.08
358	0.06
359	0.06
360	0.07
361	0.08
362	0.09
363	0.09
364	0.09
365	0.08
366	0.08
367	0.09
368	0.08
369	0.07
370	0.06
371	0.06
372	0.07
373	0.09
374	0.08
375	0.07
376	0.07
377	0.09
378	0.09
379	0.09
380	0.08
381	0.07
382	0.08
383	0.08
384	0.07
385	0.06
386	0.06
387	0.06
388	0.06
389	0.06
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.06
395	0.07
396	0.06
397	0.06
398	0.07
399	0.07
400	0.08
401	0.09
402	0.1
403	0.1
404	0.11
405	0.13
406	0.14
407	0.16
408	0.16
409	0.16
410	0.13
411	0.14
412	0.13
413	0.11
414	0.1
415	0.06
416	0.07
417	0.08
418	0.1
419	0.11
420	0.12
421	0.2
422	0.21
423	0.23
424	0.27
425	0.28
426	0.28
427	0.33
428	0.36
429	0.29
430	0.3
431	0.29
432	0.24
433	0.21
434	0.17
435	0.11
436	0.08
437	0.09
438	0.07
439	0.09
440	0.09
441	0.09
442	0.11
443	0.13
444	0.17
445	0.2
446	0.25
447	0.25
448	0.3
449	0.32
450	0.37
451	0.43
452	0.42
453	0.42
454	0.41
455	0.44
456	0.47
457	0.46
458	0.4
459	0.32
460	0.29
461	0.27
462	0.25
463	0.27
464	0.21
465	0.21
466	0.26
467	0.3
468	0.3
469	0.32
470	0.33
471	0.31
472	0.31
473	0.3
474	0.26
475	0.22
476	0.19
477	0.15
478	0.12
479	0.07
480	0.05
481	0.04
482	0.03
483	0.04
484	0.05
485	0.05
486	0.06
487	0.13
488	0.22
489	0.32
490	0.43
491	0.53
492	0.63
493	0.71
494	0.8
495	0.84
496	0.84
497	0.85
498	0.85
499	0.83
500	0.79
501	0.71
502	0.62
503	0.53
504	0.43
505	0.34
506	0.23
507	0.15
508	0.1
509	0.12
510	0.12
511	0.12
512	0.12
513	0.12
514	0.14
515	0.14
516	0.16
517	0.16
518	0.16
519	0.16
520	0.16
521	0.15
522	0.14
523	0.14
524	0.11
525	0.09
526	0.09
527	0.09
528	0.09
529	0.1
530	0.1
531	0.08
532	0.09
533	0.07
534	0.09
535	0.1
536	0.1
537	0.09
538	0.09
539	0.09
540	0.09
541	0.12
542	0.12
543	0.12
544	0.12
545	0.12
546	0.14
547	0.15
548	0.15
549	0.13
550	0.13
551	0.14
552	0.18
553	0.23
554	0.23
555	0.27
556	0.29
557	0.34
558	0.39
559	0.46
560	0.5
561	0.52
562	0.55
563	0.53
564	0.51
565	0.48
566	0.41
567	0.32
568	0.23
569	0.16
570	0.1
571	0.09
572	0.07
573	0.06
574	0.06
575	0.06
576	0.07
577	0.07
578	0.07
579	0.07
580	0.07
581	0.08
582	0.09
583	0.09
584	0.09
585	0.09
586	0.13
587	0.14
588	0.13
589	0.13
590	0.14
591	0.15
592	0.16
593	0.17
594	0.18
595	0.21
596	0.21
597	0.23
598	0.23
599	0.24
600	0.25
601	0.3
602	0.25
603	0.26
604	0.26
605	0.23
606	0.22
607	0.22
608	0.26
609	0.28
610	0.35
611	0.39
612	0.48
613	0.56
614	0.58
615	0.63
616	0.64
617	0.67
618	0.7
619	0.7
620	0.65
621	0.58
622	0.56
623	0.5
624	0.41
625	0.31
626	0.23
627	0.15
628	0.11
629	0.09
630	0.1
631	0.1
632	0.1
633	0.1
634	0.11
635	0.16
636	0.17
637	0.22
638	0.27
639	0.33
640	0.41
641	0.5
642	0.57
643	0.61
644	0.64
645	0.64
646	0.68
647	0.63
648	0.6
649	0.59
650	0.51
651	0.49
652	0.51
653	0.49
654	0.43
655	0.45
656	0.46
657	0.48
658	0.51
659	0.48
660	0.52
661	0.56
662	0.6
663	0.65
664	0.66
665	0.66
666	0.67
667	0.7
668	0.69
669	0.66
670	0.69
671	0.68
672	0.66
673	0.66
674	0.66
675	0.62
676	0.63
677	0.68
678	0.66
679	0.66
680	0.66
681	0.67
682	0.7
683	0.77
684	0.78
685	0.79
686	0.8
687	0.81
688	0.81
689	0.81
690	0.77
691	0.73
692	0.72
693	0.68
694	0.67
695	0.63
696	0.65
697	0.66
698	0.69
699	0.72
700	0.7
701	0.74
702	0.77
703	0.81
704	0.82
705	0.81
706	0.81
707	0.8
708	0.78
709	0.7
710	0.65
711	0.6
712	0.56
713	0.56
714	0.55
715	0.5
716	0.45
717	0.51
718	0.58
719	0.61
720	0.66
721	0.65
722	0.62
723	0.68

A0A1Y2VFD6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer