Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2VDM3

Protein Details
Accession A0A1Y2VDM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MPSHHHDRLHRRQSNNGWDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
497-521PRPAGGPPNGRNGPPVNPSGPRGPR
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 6, cyto 4, plas 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036028  SH3-like_dom_sf  
IPR001452  SH3_domain  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF14604  SH3_9  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50002  SH3  
Amino Acid Sequences MPSHHHDRLHRRQSNNGWDELVNNIESVANDINPFKASPTIQAKAAQPSTVYLTVYQTMSKTFDGPIAGYSTVGQKNDDPETEVAATPTAIAQASPSQAKAQDASAISVAQAENTSEPKNTKTAEKSTEVLPGSIVPTSSVDMSEHSTLALATSTPTTLTQATKNVETSQAASATSAAASTSPTADSTSSGVNTGGAAKAGIAIGVLGGVLVVGLIIFFLFSKRRKQLAKQQIQDDEKVNGAFGGRPASVLSTQTSATAPQLSLRPVTQFNPTFGERRSSKGAALALATGAASATPRDTPRSPWERPSPSNANDPENPFGSSAERAYTPTGNDRPTNPFENPDNVVGVAQTTNSPPKLSPIAGAAAAGAGGVAGAALTRKASTRKDAPPPLDLTIPPSPPSPAGTEFSVHSVAPGQSPGPSRSAAAIAAAGGPASTAVHRVQLDFKPTLDDEMELRAGQLVRLLHEYDDGWSLCIRLDRSQQGVVPRTCLSTRPVKPRPAGGPPNGRNGPPVNPSGPRGPRGPGPNYPPGSRPMTPQSGRPESPMMRPMTAGRPQSPAMMRPNSPATGRPMSPYGSRPASPANGRPMSPGPRAQSPGPRQQRRMSPPGPSPMNPNGGAPSQQQYRGPPQGPVGRKPVPGQAY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.75
3 0.66
4 0.58
5 0.5
6 0.47
7 0.4
8 0.33
9 0.22
10 0.17
11 0.15
12 0.13
13 0.13
14 0.15
15 0.14
16 0.12
17 0.14
18 0.15
19 0.16
20 0.16
21 0.16
22 0.14
23 0.17
24 0.17
25 0.24
26 0.32
27 0.33
28 0.34
29 0.38
30 0.4
31 0.44
32 0.45
33 0.37
34 0.3
35 0.29
36 0.32
37 0.29
38 0.27
39 0.19
40 0.21
41 0.22
42 0.23
43 0.22
44 0.17
45 0.18
46 0.2
47 0.2
48 0.18
49 0.16
50 0.18
51 0.18
52 0.17
53 0.17
54 0.17
55 0.16
56 0.15
57 0.15
58 0.19
59 0.21
60 0.22
61 0.22
62 0.21
63 0.25
64 0.29
65 0.29
66 0.25
67 0.23
68 0.26
69 0.26
70 0.24
71 0.2
72 0.17
73 0.16
74 0.12
75 0.12
76 0.09
77 0.07
78 0.06
79 0.07
80 0.09
81 0.13
82 0.14
83 0.15
84 0.16
85 0.18
86 0.19
87 0.19
88 0.17
89 0.19
90 0.19
91 0.2
92 0.18
93 0.16
94 0.15
95 0.16
96 0.14
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.1
101 0.13
102 0.14
103 0.15
104 0.17
105 0.18
106 0.22
107 0.23
108 0.29
109 0.32
110 0.38
111 0.41
112 0.43
113 0.42
114 0.4
115 0.44
116 0.38
117 0.32
118 0.25
119 0.2
120 0.18
121 0.16
122 0.15
123 0.09
124 0.09
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.1
130 0.13
131 0.13
132 0.12
133 0.11
134 0.11
135 0.1
136 0.1
137 0.09
138 0.05
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.09
145 0.11
146 0.13
147 0.15
148 0.19
149 0.22
150 0.23
151 0.24
152 0.24
153 0.24
154 0.23
155 0.22
156 0.19
157 0.17
158 0.15
159 0.14
160 0.13
161 0.11
162 0.1
163 0.07
164 0.05
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.1
175 0.11
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.06
184 0.06
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.02
195 0.02
196 0.02
197 0.01
198 0.01
199 0.01
200 0.01
201 0.01
202 0.01
203 0.01
204 0.02
205 0.02
206 0.04
207 0.08
208 0.11
209 0.19
210 0.24
211 0.3
212 0.35
213 0.42
214 0.52
215 0.59
216 0.66
217 0.65
218 0.66
219 0.68
220 0.66
221 0.62
222 0.53
223 0.43
224 0.34
225 0.28
226 0.22
227 0.14
228 0.12
229 0.1
230 0.08
231 0.1
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.1
236 0.1
237 0.11
238 0.11
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.11
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.09
247 0.09
248 0.11
249 0.11
250 0.12
251 0.12
252 0.13
253 0.14
254 0.16
255 0.21
256 0.2
257 0.21
258 0.24
259 0.25
260 0.25
261 0.24
262 0.29
263 0.23
264 0.26
265 0.29
266 0.26
267 0.25
268 0.25
269 0.25
270 0.19
271 0.18
272 0.14
273 0.09
274 0.08
275 0.07
276 0.04
277 0.04
278 0.03
279 0.03
280 0.03
281 0.04
282 0.05
283 0.06
284 0.11
285 0.12
286 0.16
287 0.24
288 0.32
289 0.33
290 0.37
291 0.45
292 0.48
293 0.49
294 0.52
295 0.5
296 0.45
297 0.5
298 0.46
299 0.42
300 0.38
301 0.39
302 0.33
303 0.28
304 0.26
305 0.19
306 0.18
307 0.15
308 0.13
309 0.11
310 0.1
311 0.09
312 0.09
313 0.1
314 0.11
315 0.1
316 0.15
317 0.18
318 0.19
319 0.2
320 0.21
321 0.25
322 0.28
323 0.31
324 0.26
325 0.26
326 0.26
327 0.28
328 0.27
329 0.22
330 0.19
331 0.16
332 0.15
333 0.11
334 0.1
335 0.07
336 0.05
337 0.05
338 0.06
339 0.08
340 0.09
341 0.1
342 0.09
343 0.12
344 0.14
345 0.14
346 0.13
347 0.12
348 0.13
349 0.12
350 0.12
351 0.09
352 0.06
353 0.06
354 0.05
355 0.03
356 0.02
357 0.02
358 0.01
359 0.01
360 0.01
361 0.01
362 0.02
363 0.02
364 0.03
365 0.03
366 0.05
367 0.09
368 0.12
369 0.17
370 0.25
371 0.31
372 0.4
373 0.46
374 0.47
375 0.47
376 0.48
377 0.44
378 0.38
379 0.32
380 0.28
381 0.26
382 0.25
383 0.22
384 0.2
385 0.19
386 0.18
387 0.19
388 0.17
389 0.15
390 0.16
391 0.16
392 0.17
393 0.16
394 0.18
395 0.17
396 0.14
397 0.12
398 0.12
399 0.11
400 0.11
401 0.11
402 0.09
403 0.11
404 0.14
405 0.15
406 0.15
407 0.15
408 0.15
409 0.15
410 0.16
411 0.13
412 0.1
413 0.09
414 0.07
415 0.07
416 0.06
417 0.05
418 0.04
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.05
424 0.06
425 0.1
426 0.11
427 0.12
428 0.17
429 0.19
430 0.24
431 0.23
432 0.23
433 0.22
434 0.22
435 0.23
436 0.18
437 0.17
438 0.13
439 0.15
440 0.15
441 0.12
442 0.11
443 0.12
444 0.11
445 0.1
446 0.12
447 0.1
448 0.11
449 0.13
450 0.14
451 0.12
452 0.13
453 0.13
454 0.12
455 0.15
456 0.13
457 0.12
458 0.11
459 0.11
460 0.11
461 0.14
462 0.14
463 0.15
464 0.21
465 0.24
466 0.27
467 0.29
468 0.31
469 0.34
470 0.4
471 0.37
472 0.34
473 0.31
474 0.31
475 0.3
476 0.29
477 0.27
478 0.29
479 0.36
480 0.43
481 0.5
482 0.54
483 0.56
484 0.61
485 0.63
486 0.63
487 0.63
488 0.6
489 0.64
490 0.6
491 0.67
492 0.62
493 0.56
494 0.5
495 0.45
496 0.42
497 0.35
498 0.36
499 0.3
500 0.3
501 0.33
502 0.39
503 0.4
504 0.38
505 0.37
506 0.36
507 0.38
508 0.43
509 0.45
510 0.43
511 0.46
512 0.52
513 0.53
514 0.52
515 0.48
516 0.46
517 0.47
518 0.41
519 0.4
520 0.38
521 0.44
522 0.43
523 0.47
524 0.51
525 0.52
526 0.52
527 0.5
528 0.5
529 0.43
530 0.48
531 0.48
532 0.42
533 0.35
534 0.36
535 0.36
536 0.36
537 0.4
538 0.39
539 0.35
540 0.36
541 0.36
542 0.41
543 0.4
544 0.38
545 0.39
546 0.4
547 0.39
548 0.4
549 0.43
550 0.39
551 0.38
552 0.36
553 0.36
554 0.36
555 0.36
556 0.34
557 0.33
558 0.33
559 0.35
560 0.35
561 0.35
562 0.34
563 0.34
564 0.32
565 0.35
566 0.39
567 0.4
568 0.43
569 0.45
570 0.44
571 0.44
572 0.46
573 0.47
574 0.47
575 0.47
576 0.47
577 0.43
578 0.46
579 0.5
580 0.5
581 0.54
582 0.55
583 0.61
584 0.66
585 0.7
586 0.69
587 0.73
588 0.78
589 0.77
590 0.79
591 0.73
592 0.7
593 0.68
594 0.72
595 0.69
596 0.6
597 0.59
598 0.56
599 0.57
600 0.49
601 0.44
602 0.38
603 0.34
604 0.36
605 0.31
606 0.32
607 0.31
608 0.34
609 0.36
610 0.38
611 0.46
612 0.52
613 0.51
614 0.47
615 0.5
616 0.55
617 0.58
618 0.58
619 0.57
620 0.54
621 0.56
622 0.55