Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2UBK4

Protein Details
Accession A0A1Y2UBK4    Localization Confidence High Confidence Score 25.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-53EPTTTSKSLPDKKDKSHKKHKRHRETDGTESSERKHKKSKSSANAPVAGPHydrophilic
73-103ANGEESKQEKKGKRRKHKKHSTDKVDENQAABasic
107-136DGAAEERKSKEKKKSKEHKRKHEKAEVDEEBasic
422-444MEVLRRRRLRHGGVLRKEHKRLPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-44KKDKSHKKHKRHRETDGTESSERKHKKSKS
79-92KQEKKGKRRKHKKH
113-130RKSKEKKKSKEHKRKHEK
427-441RRRLRHGGVLRKEHK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MADEPTTTSKSLPDKKDKSHKKHKRHRETDGTESSERKHKKSKSSANAPVAGPVAPAKVEPQRPEVPILEAEANGEESKQEKKGKRRKHKKHSTDKVDENQAAPTQDGAAEERKSKEKKKSKEHKRKHEKAEVDEEIIPDSQEAPKTTERGEEALDPDSMDIDSAPAEIIGSEEFGQKPSEKDYPFFTQTVSQYLPLFPSGLIEPIEGFADQHLRPLLKRYVPSFRGVLLAYRNPRIGEAPGKASLTEESPMEDVVLLESINEYAVTFGWLTVDVDVFRPTRGAWMEGIVNLQGEGHIGVVCWDMFNASIEAGRLPHGWRWVDLLSKGKDKGKDRSNDREKTAEEAKLPTPDPFDDPESDKTQIHTTGYWVDENGTRIRGGAKLYFRIKHYEVGVSGDYGYLSIEGTMLDEEEEKTKYTEEMEVLRRRRLRHGGVLRKEHKRLPEFSMTKFGVNEAEDNETQRAPVKWVASRPGSDTE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.69
3 0.8
4 0.85
5 0.86
6 0.88
7 0.9
8 0.9
9 0.93
10 0.95
11 0.95
12 0.93
13 0.93
14 0.93
15 0.9
16 0.88
17 0.85
18 0.81
19 0.73
20 0.65
21 0.59
22 0.57
23 0.55
24 0.51
25 0.53
26 0.54
27 0.61
28 0.7
29 0.77
30 0.78
31 0.84
32 0.87
33 0.84
34 0.82
35 0.71
36 0.63
37 0.53
38 0.42
39 0.32
40 0.23
41 0.17
42 0.12
43 0.12
44 0.13
45 0.2
46 0.26
47 0.28
48 0.34
49 0.38
50 0.4
51 0.44
52 0.41
53 0.36
54 0.32
55 0.32
56 0.26
57 0.2
58 0.19
59 0.16
60 0.16
61 0.13
62 0.12
63 0.09
64 0.1
65 0.14
66 0.19
67 0.28
68 0.34
69 0.45
70 0.55
71 0.66
72 0.75
73 0.83
74 0.88
75 0.91
76 0.95
77 0.95
78 0.96
79 0.96
80 0.95
81 0.93
82 0.9
83 0.86
84 0.83
85 0.74
86 0.63
87 0.54
88 0.46
89 0.37
90 0.29
91 0.22
92 0.14
93 0.13
94 0.13
95 0.12
96 0.14
97 0.16
98 0.19
99 0.22
100 0.29
101 0.35
102 0.42
103 0.51
104 0.56
105 0.64
106 0.72
107 0.8
108 0.84
109 0.89
110 0.92
111 0.93
112 0.94
113 0.94
114 0.93
115 0.91
116 0.86
117 0.81
118 0.79
119 0.7
120 0.62
121 0.54
122 0.44
123 0.36
124 0.29
125 0.23
126 0.13
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.12
131 0.15
132 0.17
133 0.19
134 0.2
135 0.22
136 0.21
137 0.2
138 0.21
139 0.19
140 0.18
141 0.18
142 0.17
143 0.14
144 0.13
145 0.12
146 0.1
147 0.08
148 0.06
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.04
157 0.03
158 0.04
159 0.05
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.15
167 0.2
168 0.2
169 0.21
170 0.25
171 0.29
172 0.31
173 0.31
174 0.27
175 0.25
176 0.25
177 0.28
178 0.24
179 0.19
180 0.17
181 0.17
182 0.17
183 0.13
184 0.12
185 0.08
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.09
198 0.08
199 0.1
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.17
204 0.2
205 0.2
206 0.22
207 0.24
208 0.31
209 0.33
210 0.35
211 0.3
212 0.26
213 0.25
214 0.23
215 0.21
216 0.16
217 0.18
218 0.18
219 0.19
220 0.2
221 0.18
222 0.18
223 0.17
224 0.17
225 0.16
226 0.15
227 0.16
228 0.17
229 0.17
230 0.16
231 0.16
232 0.14
233 0.11
234 0.1
235 0.08
236 0.07
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.06
241 0.05
242 0.04
243 0.05
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.11
269 0.12
270 0.12
271 0.1
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.13
276 0.09
277 0.08
278 0.07
279 0.06
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.03
285 0.03
286 0.04
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.11
304 0.16
305 0.16
306 0.16
307 0.19
308 0.19
309 0.21
310 0.22
311 0.27
312 0.25
313 0.29
314 0.32
315 0.33
316 0.38
317 0.41
318 0.47
319 0.48
320 0.54
321 0.57
322 0.65
323 0.7
324 0.7
325 0.68
326 0.64
327 0.57
328 0.54
329 0.51
330 0.43
331 0.35
332 0.33
333 0.32
334 0.3
335 0.3
336 0.26
337 0.24
338 0.22
339 0.23
340 0.23
341 0.24
342 0.23
343 0.26
344 0.29
345 0.3
346 0.31
347 0.28
348 0.27
349 0.27
350 0.26
351 0.24
352 0.2
353 0.18
354 0.2
355 0.21
356 0.2
357 0.17
358 0.17
359 0.18
360 0.2
361 0.2
362 0.17
363 0.15
364 0.15
365 0.16
366 0.17
367 0.17
368 0.2
369 0.23
370 0.29
371 0.35
372 0.38
373 0.39
374 0.44
375 0.43
376 0.41
377 0.39
378 0.35
379 0.3
380 0.31
381 0.29
382 0.23
383 0.21
384 0.17
385 0.14
386 0.11
387 0.1
388 0.06
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.04
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.07
398 0.08
399 0.1
400 0.12
401 0.12
402 0.13
403 0.13
404 0.14
405 0.15
406 0.17
407 0.17
408 0.23
409 0.31
410 0.39
411 0.42
412 0.49
413 0.52
414 0.52
415 0.58
416 0.61
417 0.59
418 0.61
419 0.68
420 0.71
421 0.75
422 0.83
423 0.82
424 0.82
425 0.8
426 0.75
427 0.74
428 0.7
429 0.65
430 0.62
431 0.64
432 0.59
433 0.57
434 0.61
435 0.53
436 0.48
437 0.43
438 0.37
439 0.3
440 0.28
441 0.27
442 0.2
443 0.24
444 0.23
445 0.26
446 0.27
447 0.23
448 0.23
449 0.25
450 0.24
451 0.22
452 0.26
453 0.29
454 0.32
455 0.38
456 0.45
457 0.46
458 0.47