Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2V4Q1

Protein Details
Accession A0A1Y2V4Q1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
443-471LRSWKANRRGTYHRKRRRWAKIRHIVDTTHydrophilic
605-627EGKVEARGKARTKKRKVDEAMKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
447-465KANRRGTYHRKRRRWAKIR
604-620AEGKVEARGKARTKKRK
Subcellular Location(s) mito 15.5, cyto_mito 11, cyto 5.5, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHSLVQPHAWVALKLPSGNLRVLQVTPNTTISLGKYGSFPSNLIIHRPFHLTYELQDKKPGENFNRLRIVPASELYSDILSSSASTSSPEGATPITNDGEDAENAPPTGIEYSLVDPESGAVVARTDRAELDASARQTLSTEEIEALKKDGTDAGRDLIAKLLLSHTAIDQKTEYSLAKYKLLKTKKYIRRFSVLPMDIPMLTHWQLEAKDASKILDMREEMLGLLGCWANVHFGGEDRCENEGAQEVESSEQVSAQHTAGRWLVVDDTGGLLVAAMAERMGILYPQENGPVQGKTEPTSPSAPRKEFSNHQEAASIAANPLSNTGSEPDKTNADTTSQSQGITEPKPSFQVTRRTSHGEGKPRLDDLKVPFVHSNTLTVVHANQQPNLTFLREYGFDITNPTQAPDHPLASHLMTISWLQLVEPELDPTYTSEIPTISPEILRSWKANRRGTYHRKRRRWAKIRHIVDTTRKGEFSGLVVASTMDPISIMRYVVPLLAGGAPIAIYSQSIEPLTALVDCYSIARRAAWVSNPPEEVAGKSLEELEHWPGNEDFPLNPSLVLGASLQTSRVRKWQVLPGRTHPLMTGRGGAEGYVFTAWRVKPAEGKVEARGKARTKKRKVDEAMKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.25
3 0.26
4 0.28
5 0.29
6 0.29
7 0.25
8 0.25
9 0.26
10 0.28
11 0.26
12 0.27
13 0.28
14 0.28
15 0.26
16 0.24
17 0.24
18 0.22
19 0.23
20 0.2
21 0.18
22 0.18
23 0.21
24 0.24
25 0.23
26 0.22
27 0.2
28 0.25
29 0.25
30 0.3
31 0.31
32 0.29
33 0.3
34 0.34
35 0.32
36 0.28
37 0.31
38 0.26
39 0.26
40 0.34
41 0.38
42 0.35
43 0.41
44 0.4
45 0.41
46 0.46
47 0.51
48 0.46
49 0.51
50 0.54
51 0.56
52 0.63
53 0.57
54 0.55
55 0.48
56 0.46
57 0.38
58 0.35
59 0.3
60 0.23
61 0.24
62 0.22
63 0.2
64 0.15
65 0.13
66 0.11
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.07
71 0.07
72 0.09
73 0.1
74 0.11
75 0.12
76 0.11
77 0.11
78 0.12
79 0.12
80 0.12
81 0.14
82 0.13
83 0.13
84 0.13
85 0.13
86 0.14
87 0.14
88 0.14
89 0.12
90 0.12
91 0.12
92 0.12
93 0.1
94 0.09
95 0.1
96 0.08
97 0.08
98 0.09
99 0.11
100 0.13
101 0.14
102 0.12
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.09
107 0.07
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.11
116 0.12
117 0.11
118 0.15
119 0.17
120 0.18
121 0.19
122 0.19
123 0.17
124 0.16
125 0.17
126 0.16
127 0.12
128 0.12
129 0.12
130 0.14
131 0.16
132 0.16
133 0.16
134 0.13
135 0.12
136 0.12
137 0.15
138 0.13
139 0.15
140 0.15
141 0.15
142 0.17
143 0.17
144 0.17
145 0.15
146 0.14
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.15
155 0.15
156 0.16
157 0.16
158 0.15
159 0.16
160 0.17
161 0.17
162 0.14
163 0.2
164 0.21
165 0.26
166 0.29
167 0.34
168 0.41
169 0.48
170 0.49
171 0.51
172 0.6
173 0.64
174 0.71
175 0.73
176 0.69
177 0.68
178 0.65
179 0.63
180 0.62
181 0.54
182 0.44
183 0.37
184 0.34
185 0.27
186 0.26
187 0.2
188 0.14
189 0.13
190 0.13
191 0.11
192 0.12
193 0.12
194 0.14
195 0.16
196 0.13
197 0.14
198 0.14
199 0.15
200 0.14
201 0.15
202 0.14
203 0.16
204 0.15
205 0.15
206 0.15
207 0.14
208 0.11
209 0.11
210 0.1
211 0.06
212 0.07
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.05
221 0.06
222 0.08
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.12
227 0.12
228 0.12
229 0.11
230 0.13
231 0.12
232 0.11
233 0.1
234 0.09
235 0.09
236 0.1
237 0.1
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.08
243 0.08
244 0.1
245 0.09
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.09
250 0.08
251 0.09
252 0.07
253 0.07
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.02
263 0.02
264 0.02
265 0.02
266 0.02
267 0.02
268 0.02
269 0.02
270 0.03
271 0.04
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.08
277 0.1
278 0.09
279 0.1
280 0.11
281 0.11
282 0.12
283 0.15
284 0.15
285 0.16
286 0.2
287 0.22
288 0.28
289 0.33
290 0.33
291 0.31
292 0.33
293 0.34
294 0.36
295 0.38
296 0.38
297 0.33
298 0.32
299 0.32
300 0.29
301 0.27
302 0.22
303 0.17
304 0.09
305 0.09
306 0.08
307 0.07
308 0.08
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.08
313 0.08
314 0.09
315 0.11
316 0.11
317 0.12
318 0.13
319 0.13
320 0.12
321 0.13
322 0.13
323 0.14
324 0.16
325 0.15
326 0.15
327 0.14
328 0.15
329 0.17
330 0.17
331 0.18
332 0.15
333 0.15
334 0.18
335 0.19
336 0.2
337 0.22
338 0.31
339 0.31
340 0.35
341 0.37
342 0.41
343 0.43
344 0.48
345 0.48
346 0.48
347 0.48
348 0.47
349 0.45
350 0.41
351 0.4
352 0.32
353 0.3
354 0.25
355 0.3
356 0.27
357 0.28
358 0.27
359 0.27
360 0.29
361 0.24
362 0.22
363 0.13
364 0.14
365 0.12
366 0.11
367 0.11
368 0.14
369 0.19
370 0.18
371 0.19
372 0.19
373 0.19
374 0.21
375 0.21
376 0.18
377 0.12
378 0.12
379 0.12
380 0.11
381 0.12
382 0.14
383 0.13
384 0.12
385 0.17
386 0.17
387 0.18
388 0.17
389 0.17
390 0.15
391 0.14
392 0.19
393 0.17
394 0.17
395 0.15
396 0.16
397 0.16
398 0.16
399 0.17
400 0.11
401 0.09
402 0.09
403 0.09
404 0.08
405 0.07
406 0.06
407 0.05
408 0.06
409 0.08
410 0.09
411 0.09
412 0.1
413 0.1
414 0.1
415 0.1
416 0.1
417 0.14
418 0.12
419 0.12
420 0.11
421 0.11
422 0.12
423 0.13
424 0.14
425 0.1
426 0.1
427 0.11
428 0.13
429 0.15
430 0.17
431 0.18
432 0.24
433 0.31
434 0.4
435 0.46
436 0.48
437 0.51
438 0.6
439 0.69
440 0.72
441 0.77
442 0.78
443 0.81
444 0.86
445 0.9
446 0.91
447 0.91
448 0.9
449 0.9
450 0.9
451 0.86
452 0.82
453 0.77
454 0.71
455 0.69
456 0.67
457 0.59
458 0.51
459 0.45
460 0.4
461 0.35
462 0.3
463 0.23
464 0.19
465 0.16
466 0.13
467 0.13
468 0.13
469 0.12
470 0.12
471 0.1
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.08
480 0.08
481 0.08
482 0.08
483 0.06
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.06
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.04
493 0.03
494 0.05
495 0.06
496 0.07
497 0.08
498 0.08
499 0.08
500 0.08
501 0.09
502 0.07
503 0.08
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.08
508 0.1
509 0.11
510 0.12
511 0.12
512 0.13
513 0.16
514 0.19
515 0.22
516 0.27
517 0.3
518 0.34
519 0.35
520 0.33
521 0.32
522 0.3
523 0.27
524 0.21
525 0.18
526 0.14
527 0.13
528 0.14
529 0.12
530 0.13
531 0.14
532 0.17
533 0.19
534 0.19
535 0.21
536 0.2
537 0.21
538 0.21
539 0.2
540 0.15
541 0.15
542 0.16
543 0.14
544 0.13
545 0.12
546 0.11
547 0.1
548 0.1
549 0.08
550 0.07
551 0.09
552 0.09
553 0.11
554 0.16
555 0.18
556 0.2
557 0.27
558 0.32
559 0.35
560 0.4
561 0.48
562 0.53
563 0.58
564 0.63
565 0.62
566 0.66
567 0.62
568 0.58
569 0.5
570 0.45
571 0.41
572 0.36
573 0.33
574 0.24
575 0.25
576 0.24
577 0.22
578 0.18
579 0.14
580 0.14
581 0.1
582 0.09
583 0.08
584 0.15
585 0.15
586 0.2
587 0.23
588 0.24
589 0.3
590 0.34
591 0.43
592 0.42
593 0.45
594 0.47
595 0.52
596 0.54
597 0.51
598 0.55
599 0.55
600 0.59
601 0.67
602 0.7
603 0.72
604 0.79
605 0.85
606 0.87
607 0.88