Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H8Z9V0

Protein Details
Accession H8Z9V0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
87-106AEEPERKKKRKIEEVPEKLPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
91-97ERKKKRK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.333, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045154  PCF11-like  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000993  F:RNA polymerase II complex binding  
GO:0006379  P:mRNA cleavage  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
GO:0006369  P:termination of RNA polymerase II transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MAAAQQEYGVLIQKCTLTNKYAVKALQIIAETNDQHAQEIVTAIKAEISKEKEENKEALLSLLSFLGQHPSYSFLKASYPEKRSLSAEEPERKKKRKIEEVPEKLPEKLPEPEEDTAFLPFPPEYFLFKLVDKATYTASYIYYTEGNTSSKTDPDDLPKLTHEYLTTPHLESAIKLLYTSATQCKVCGMRFDSVSAYTAHAEMHQKKSHLVRGSDIHTWQGWLMEPVQWTKTETKVSVNLKPSFQEKVPTVPVRGDRDQKCTICGEAFEVIWSDESECWSFNDALIIRTMPREISHKRCVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.24
3 0.27
4 0.24
5 0.3
6 0.36
7 0.37
8 0.4
9 0.38
10 0.36
11 0.36
12 0.34
13 0.3
14 0.25
15 0.23
16 0.2
17 0.23
18 0.21
19 0.2
20 0.22
21 0.19
22 0.19
23 0.18
24 0.16
25 0.13
26 0.14
27 0.11
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.11
32 0.11
33 0.12
34 0.17
35 0.21
36 0.24
37 0.28
38 0.35
39 0.38
40 0.41
41 0.41
42 0.37
43 0.35
44 0.31
45 0.27
46 0.21
47 0.16
48 0.13
49 0.11
50 0.09
51 0.07
52 0.07
53 0.11
54 0.1
55 0.1
56 0.1
57 0.15
58 0.16
59 0.18
60 0.18
61 0.14
62 0.16
63 0.19
64 0.25
65 0.3
66 0.32
67 0.36
68 0.37
69 0.39
70 0.39
71 0.4
72 0.38
73 0.35
74 0.4
75 0.44
76 0.49
77 0.57
78 0.64
79 0.65
80 0.68
81 0.7
82 0.71
83 0.73
84 0.76
85 0.77
86 0.79
87 0.82
88 0.79
89 0.78
90 0.69
91 0.59
92 0.52
93 0.43
94 0.35
95 0.31
96 0.27
97 0.23
98 0.27
99 0.27
100 0.24
101 0.24
102 0.21
103 0.18
104 0.17
105 0.14
106 0.1
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.1
111 0.12
112 0.13
113 0.15
114 0.15
115 0.15
116 0.19
117 0.17
118 0.17
119 0.15
120 0.14
121 0.14
122 0.13
123 0.13
124 0.11
125 0.1
126 0.1
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.08
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.12
136 0.11
137 0.12
138 0.13
139 0.14
140 0.14
141 0.18
142 0.21
143 0.19
144 0.2
145 0.2
146 0.21
147 0.2
148 0.19
149 0.15
150 0.12
151 0.13
152 0.15
153 0.15
154 0.13
155 0.12
156 0.13
157 0.12
158 0.11
159 0.12
160 0.1
161 0.09
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.08
166 0.1
167 0.11
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.16
172 0.18
173 0.18
174 0.21
175 0.21
176 0.21
177 0.22
178 0.23
179 0.21
180 0.19
181 0.2
182 0.16
183 0.14
184 0.11
185 0.11
186 0.1
187 0.11
188 0.17
189 0.2
190 0.26
191 0.28
192 0.28
193 0.32
194 0.36
195 0.41
196 0.4
197 0.36
198 0.34
199 0.35
200 0.38
201 0.38
202 0.34
203 0.29
204 0.23
205 0.23
206 0.19
207 0.16
208 0.12
209 0.1
210 0.1
211 0.11
212 0.12
213 0.14
214 0.15
215 0.14
216 0.17
217 0.18
218 0.22
219 0.23
220 0.23
221 0.25
222 0.32
223 0.36
224 0.4
225 0.45
226 0.44
227 0.41
228 0.42
229 0.41
230 0.38
231 0.34
232 0.33
233 0.27
234 0.31
235 0.37
236 0.38
237 0.37
238 0.37
239 0.43
240 0.44
241 0.48
242 0.52
243 0.47
244 0.52
245 0.58
246 0.54
247 0.5
248 0.45
249 0.41
250 0.33
251 0.3
252 0.26
253 0.2
254 0.19
255 0.17
256 0.15
257 0.13
258 0.13
259 0.13
260 0.11
261 0.1
262 0.14
263 0.14
264 0.14
265 0.15
266 0.18
267 0.18
268 0.16
269 0.22
270 0.19
271 0.19
272 0.21
273 0.2
274 0.17
275 0.19
276 0.2
277 0.14
278 0.16
279 0.24
280 0.3
281 0.38