Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Z5SW28

Protein Details
Accession A0A1Z5SW28    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
393-418RDSGGDEEKRGRKRRREPGLFDPPEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
400-409EKRGRKRRRE
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto 11, cyto_nucl 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MAMVGVNMKGEDRGIWRDFEQLDVRCVSQGSHCLTVTSVHFGWYMSTPTAAPNFFERSFQNHSFKHFNFLGDIADDAMTEETDGTLLPWDKAMLLLADPPPPKQASIVSSHAGWYHMGPHPEMSMDLHDPEADLTEEGDPLLGHALICKMMFVSGETGDVSPETTSMIEGIVQQQVMEMLKRATDLAARRGVRTISTDDLIFLIRHDKAKVSRLRTFLSWKDVRKSAKDSDEKGGGGADAGGVEDFDLAANDPTLGTAGPSVGTRNSKNKKAKIGLPWDVSSFYSEVVPEREDEEDEEEEEMNAATLQRLKQADERTKGMNAEEYLHFSECRQASFTFRKGKRFREWAGFGVVTDSKPNDDIVDILGFLTYEIVTLLTEEALKVKAAEDALKRDSGGDEEKRGRKRRREPGLFDPPEEARTPVGPKHIQEAYRRLQKPDLKSRYMHHIPKGNWQRPLKLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.25
3 0.25
4 0.31
5 0.31
6 0.34
7 0.36
8 0.31
9 0.33
10 0.32
11 0.32
12 0.27
13 0.27
14 0.23
15 0.2
16 0.24
17 0.25
18 0.28
19 0.27
20 0.26
21 0.27
22 0.29
23 0.27
24 0.26
25 0.22
26 0.19
27 0.19
28 0.19
29 0.2
30 0.19
31 0.2
32 0.14
33 0.15
34 0.14
35 0.17
36 0.21
37 0.19
38 0.19
39 0.2
40 0.25
41 0.25
42 0.28
43 0.26
44 0.29
45 0.37
46 0.42
47 0.46
48 0.42
49 0.47
50 0.53
51 0.52
52 0.53
53 0.46
54 0.41
55 0.35
56 0.33
57 0.28
58 0.2
59 0.2
60 0.13
61 0.11
62 0.1
63 0.09
64 0.08
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.04
72 0.08
73 0.09
74 0.09
75 0.1
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.07
81 0.07
82 0.1
83 0.11
84 0.17
85 0.18
86 0.18
87 0.22
88 0.22
89 0.22
90 0.2
91 0.22
92 0.19
93 0.24
94 0.27
95 0.24
96 0.24
97 0.24
98 0.23
99 0.21
100 0.18
101 0.13
102 0.14
103 0.16
104 0.17
105 0.17
106 0.17
107 0.17
108 0.16
109 0.17
110 0.13
111 0.12
112 0.12
113 0.13
114 0.12
115 0.11
116 0.11
117 0.1
118 0.1
119 0.08
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.05
130 0.04
131 0.05
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.06
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.07
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.1
172 0.12
173 0.15
174 0.22
175 0.23
176 0.23
177 0.24
178 0.24
179 0.21
180 0.22
181 0.2
182 0.15
183 0.15
184 0.15
185 0.13
186 0.14
187 0.14
188 0.11
189 0.08
190 0.09
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.13
195 0.15
196 0.23
197 0.29
198 0.32
199 0.37
200 0.38
201 0.4
202 0.39
203 0.42
204 0.36
205 0.39
206 0.38
207 0.35
208 0.36
209 0.39
210 0.39
211 0.38
212 0.4
213 0.37
214 0.41
215 0.43
216 0.42
217 0.4
218 0.39
219 0.36
220 0.3
221 0.25
222 0.16
223 0.12
224 0.08
225 0.05
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.02
230 0.02
231 0.02
232 0.02
233 0.02
234 0.02
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.04
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.07
250 0.11
251 0.14
252 0.23
253 0.29
254 0.38
255 0.46
256 0.5
257 0.56
258 0.58
259 0.62
260 0.6
261 0.63
262 0.6
263 0.55
264 0.51
265 0.44
266 0.4
267 0.34
268 0.27
269 0.19
270 0.13
271 0.1
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.11
281 0.13
282 0.12
283 0.12
284 0.13
285 0.11
286 0.1
287 0.1
288 0.09
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.07
294 0.08
295 0.13
296 0.14
297 0.16
298 0.21
299 0.3
300 0.37
301 0.38
302 0.41
303 0.38
304 0.4
305 0.39
306 0.34
307 0.29
308 0.22
309 0.21
310 0.19
311 0.21
312 0.21
313 0.21
314 0.2
315 0.16
316 0.23
317 0.19
318 0.2
319 0.19
320 0.18
321 0.24
322 0.3
323 0.37
324 0.41
325 0.44
326 0.53
327 0.57
328 0.65
329 0.67
330 0.68
331 0.67
332 0.66
333 0.66
334 0.58
335 0.57
336 0.49
337 0.39
338 0.35
339 0.31
340 0.21
341 0.2
342 0.18
343 0.13
344 0.14
345 0.14
346 0.11
347 0.1
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.09
352 0.08
353 0.08
354 0.07
355 0.06
356 0.07
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.07
368 0.07
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.1
373 0.11
374 0.16
375 0.18
376 0.23
377 0.26
378 0.26
379 0.26
380 0.25
381 0.24
382 0.23
383 0.27
384 0.25
385 0.3
386 0.38
387 0.46
388 0.55
389 0.64
390 0.7
391 0.73
392 0.8
393 0.83
394 0.86
395 0.88
396 0.86
397 0.87
398 0.89
399 0.81
400 0.72
401 0.66
402 0.56
403 0.49
404 0.42
405 0.33
406 0.24
407 0.24
408 0.26
409 0.25
410 0.31
411 0.33
412 0.33
413 0.38
414 0.42
415 0.43
416 0.46
417 0.52
418 0.53
419 0.59
420 0.61
421 0.59
422 0.62
423 0.65
424 0.68
425 0.7
426 0.7
427 0.64
428 0.65
429 0.66
430 0.67
431 0.69
432 0.66
433 0.63
434 0.64
435 0.6
436 0.68
437 0.75
438 0.71
439 0.71
440 0.68