Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Z5T623

Protein Details
Accession A0A1Z5T623    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-128DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
410-439KRRRETEVKKEAAQKRREAEKARRESSKRQ
Subcellular Location(s) mito 13, cyto 11, nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSKKYPKIISPVLEERPEEFENADGSKTKIPVDGRKPNPNGEEMDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPPPANEEEMMIAIFEYTDRVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAAEKDAAAAEYHREMLAKGAITENGGGEDSEKPKKTWDSNSITPGTPFMDLLAQSLRYWVSYKLSTDPAWEKLKVIISDATVPGEGEHKIMNFVRSQRSSPTHDPNTRHVIYGLDADLIMLGIATHEPHFRVLREDVFANDTKPGHCRKCNQPGHIADQCRGAPKKEEGVEKPPKPFIWLHVSILREYLAIEMSVPNQPFRFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIREDGIDTLIAIWRDNIPLMGGYVTKDGHVDLARAQIILEGLAKQEDAIFKRRRETEVKKEAAQKRREAEKARRESSKRQRFSNPGYDGAPAGYDESMIRRGPKGGVIRGEAAPDMNALPTFAPGQAQTRSDPRFGAGLTHADVVGNANQANKSAAAALKEQLMSSSKPADNQKAGLDALFAGAADGSNAGEPQPVLGKRTRDMIDEAAGDNDASSSAPSTPGRNTPNQEIADPITNGPAGRGSSGALGGNSKDKEADAMPEDTVRLWEEGYQGRYYEQKFHVDPNDVEFRHKVARSYVEGLCWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFASDFVDMDKQVVSFEKGKPFRPYEQLMGVMPPASNHTLPAVFHPLMTEDGSPIKEFYPIDFEVDLNGKKFAWQGVALLPFIDEHRLLEAMGTKYPMLTEDERRRNGFGTDALIFSTKHPFYDEVATNFYSKKALSGKLKLNARITEGLAGKAEKEEKYFPNSELAFPLESRSQDQYTGLDQDESATVSYHMPTIPGIHKSMLLPGVKFAEPVLDYSDVQATREMARKSGRAHGGVQLSQNGDRSDGRRMNFSARDNGPPPGNGYAGGGGAGNGYGANGGYGYGQAAQQVFGSLPPQLAQQAAAHGFPPPMPPQGFPPGYGAPSRGPSGGGYGRGGSQDSYRPRGGGGYGGGYGGGYGGGYGGGYGGGGRGGGYQGGRGGGGRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.62
3 0.66
4 0.68
5 0.65
6 0.63
7 0.63
8 0.61
9 0.56
10 0.53
11 0.47
12 0.46
13 0.42
14 0.35
15 0.28
16 0.23
17 0.22
18 0.22
19 0.22
20 0.17
21 0.19
22 0.22
23 0.23
24 0.23
25 0.25
26 0.3
27 0.38
28 0.46
29 0.54
30 0.58
31 0.67
32 0.7
33 0.72
34 0.69
35 0.63
36 0.57
37 0.5
38 0.48
39 0.41
40 0.4
41 0.33
42 0.3
43 0.26
44 0.22
45 0.18
46 0.12
47 0.09
48 0.07
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.1
53 0.12
54 0.18
55 0.21
56 0.23
57 0.31
58 0.39
59 0.45
60 0.53
61 0.53
62 0.53
63 0.53
64 0.53
65 0.44
66 0.38
67 0.32
68 0.24
69 0.21
70 0.15
71 0.11
72 0.09
73 0.08
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.07
79 0.09
80 0.1
81 0.16
82 0.26
83 0.33
84 0.36
85 0.37
86 0.39
87 0.41
88 0.41
89 0.39
90 0.32
91 0.29
92 0.26
93 0.25
94 0.24
95 0.21
96 0.2
97 0.18
98 0.15
99 0.1
100 0.13
101 0.19
102 0.26
103 0.37
104 0.45
105 0.55
106 0.66
107 0.74
108 0.8
109 0.82
110 0.79
111 0.76
112 0.76
113 0.73
114 0.7
115 0.71
116 0.63
117 0.59
118 0.56
119 0.49
120 0.39
121 0.32
122 0.25
123 0.16
124 0.14
125 0.12
126 0.11
127 0.12
128 0.13
129 0.12
130 0.11
131 0.13
132 0.16
133 0.14
134 0.13
135 0.14
136 0.14
137 0.15
138 0.15
139 0.13
140 0.1
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.14
145 0.18
146 0.25
147 0.26
148 0.26
149 0.31
150 0.38
151 0.43
152 0.48
153 0.52
154 0.53
155 0.57
156 0.63
157 0.61
158 0.55
159 0.49
160 0.41
161 0.33
162 0.25
163 0.19
164 0.13
165 0.13
166 0.12
167 0.13
168 0.14
169 0.13
170 0.13
171 0.14
172 0.14
173 0.12
174 0.14
175 0.14
176 0.16
177 0.18
178 0.2
179 0.23
180 0.27
181 0.26
182 0.3
183 0.32
184 0.34
185 0.35
186 0.34
187 0.31
188 0.31
189 0.36
190 0.3
191 0.29
192 0.24
193 0.21
194 0.24
195 0.24
196 0.21
197 0.15
198 0.15
199 0.13
200 0.13
201 0.12
202 0.1
203 0.1
204 0.09
205 0.13
206 0.14
207 0.16
208 0.18
209 0.22
210 0.3
211 0.31
212 0.33
213 0.36
214 0.4
215 0.46
216 0.5
217 0.55
218 0.56
219 0.61
220 0.63
221 0.62
222 0.66
223 0.58
224 0.52
225 0.43
226 0.34
227 0.28
228 0.27
229 0.21
230 0.12
231 0.11
232 0.1
233 0.09
234 0.08
235 0.06
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.04
241 0.05
242 0.07
243 0.08
244 0.11
245 0.13
246 0.14
247 0.18
248 0.2
249 0.21
250 0.23
251 0.23
252 0.21
253 0.23
254 0.23
255 0.2
256 0.2
257 0.19
258 0.18
259 0.22
260 0.29
261 0.32
262 0.37
263 0.43
264 0.5
265 0.6
266 0.67
267 0.66
268 0.67
269 0.64
270 0.66
271 0.65
272 0.57
273 0.48
274 0.44
275 0.41
276 0.39
277 0.37
278 0.31
279 0.29
280 0.3
281 0.36
282 0.36
283 0.42
284 0.39
285 0.47
286 0.55
287 0.54
288 0.55
289 0.51
290 0.47
291 0.44
292 0.4
293 0.36
294 0.34
295 0.33
296 0.33
297 0.33
298 0.34
299 0.3
300 0.3
301 0.25
302 0.16
303 0.14
304 0.11
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.08
310 0.12
311 0.12
312 0.12
313 0.12
314 0.13
315 0.13
316 0.18
317 0.21
318 0.18
319 0.22
320 0.25
321 0.26
322 0.26
323 0.28
324 0.23
325 0.18
326 0.18
327 0.14
328 0.1
329 0.08
330 0.08
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.07
335 0.06
336 0.06
337 0.08
338 0.07
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.07
343 0.08
344 0.11
345 0.12
346 0.12
347 0.11
348 0.12
349 0.11
350 0.11
351 0.11
352 0.07
353 0.05
354 0.05
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.07
359 0.07
360 0.08
361 0.08
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.07
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.12
379 0.12
380 0.11
381 0.11
382 0.09
383 0.09
384 0.08
385 0.08
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.06
390 0.05
391 0.06
392 0.09
393 0.11
394 0.19
395 0.25
396 0.26
397 0.33
398 0.35
399 0.39
400 0.45
401 0.51
402 0.53
403 0.57
404 0.59
405 0.58
406 0.64
407 0.68
408 0.68
409 0.65
410 0.59
411 0.55
412 0.59
413 0.61
414 0.59
415 0.61
416 0.62
417 0.65
418 0.64
419 0.66
420 0.64
421 0.69
422 0.72
423 0.73
424 0.67
425 0.63
426 0.66
427 0.66
428 0.68
429 0.67
430 0.58
431 0.5
432 0.47
433 0.42
434 0.35
435 0.27
436 0.21
437 0.11
438 0.09
439 0.06
440 0.05
441 0.05
442 0.06
443 0.09
444 0.09
445 0.1
446 0.1
447 0.11
448 0.11
449 0.16
450 0.19
451 0.19
452 0.21
453 0.22
454 0.24
455 0.23
456 0.23
457 0.18
458 0.14
459 0.11
460 0.09
461 0.07
462 0.05
463 0.05
464 0.04
465 0.04
466 0.05
467 0.06
468 0.05
469 0.06
470 0.06
471 0.09
472 0.11
473 0.12
474 0.13
475 0.18
476 0.2
477 0.21
478 0.2
479 0.18
480 0.17
481 0.16
482 0.16
483 0.11
484 0.11
485 0.11
486 0.11
487 0.1
488 0.09
489 0.09
490 0.08
491 0.08
492 0.07
493 0.06
494 0.07
495 0.07
496 0.07
497 0.08
498 0.07
499 0.06
500 0.07
501 0.07
502 0.08
503 0.09
504 0.09
505 0.1
506 0.1
507 0.1
508 0.1
509 0.11
510 0.1
511 0.1
512 0.14
513 0.13
514 0.17
515 0.2
516 0.23
517 0.22
518 0.23
519 0.22
520 0.19
521 0.18
522 0.14
523 0.12
524 0.08
525 0.07
526 0.05
527 0.05
528 0.03
529 0.03
530 0.03
531 0.02
532 0.02
533 0.02
534 0.03
535 0.03
536 0.03
537 0.03
538 0.03
539 0.04
540 0.08
541 0.08
542 0.1
543 0.13
544 0.15
545 0.16
546 0.21
547 0.22
548 0.2
549 0.21
550 0.2
551 0.19
552 0.18
553 0.17
554 0.12
555 0.11
556 0.09
557 0.07
558 0.06
559 0.04
560 0.04
561 0.03
562 0.04
563 0.04
564 0.07
565 0.07
566 0.09
567 0.11
568 0.16
569 0.2
570 0.24
571 0.27
572 0.28
573 0.34
574 0.33
575 0.31
576 0.27
577 0.25
578 0.23
579 0.21
580 0.17
581 0.11
582 0.11
583 0.1
584 0.09
585 0.09
586 0.07
587 0.07
588 0.07
589 0.06
590 0.06
591 0.07
592 0.07
593 0.06
594 0.06
595 0.07
596 0.11
597 0.1
598 0.1
599 0.1
600 0.09
601 0.11
602 0.11
603 0.12
604 0.11
605 0.12
606 0.12
607 0.12
608 0.12
609 0.1
610 0.11
611 0.09
612 0.07
613 0.06
614 0.07
615 0.09
616 0.12
617 0.14
618 0.14
619 0.14
620 0.14
621 0.18
622 0.19
623 0.22
624 0.22
625 0.24
626 0.25
627 0.28
628 0.31
629 0.31
630 0.3
631 0.28
632 0.33
633 0.29
634 0.3
635 0.26
636 0.25
637 0.27
638 0.27
639 0.24
640 0.19
641 0.23
642 0.24
643 0.29
644 0.27
645 0.22
646 0.22
647 0.21
648 0.18
649 0.14
650 0.1
651 0.05
652 0.05
653 0.06
654 0.07
655 0.07
656 0.08
657 0.08
658 0.09
659 0.09
660 0.14
661 0.17
662 0.16
663 0.2
664 0.21
665 0.26
666 0.29
667 0.31
668 0.28
669 0.25
670 0.24
671 0.22
672 0.23
673 0.18
674 0.16
675 0.13
676 0.11
677 0.13
678 0.14
679 0.13
680 0.11
681 0.1
682 0.09
683 0.09
684 0.1
685 0.11
686 0.13
687 0.16
688 0.25
689 0.27
690 0.31
691 0.37
692 0.4
693 0.42
694 0.44
695 0.44
696 0.39
697 0.39
698 0.36
699 0.3
700 0.27
701 0.23
702 0.17
703 0.14
704 0.1
705 0.1
706 0.11
707 0.11
708 0.11
709 0.12
710 0.12
711 0.12
712 0.15
713 0.19
714 0.16
715 0.16
716 0.16
717 0.16
718 0.16
719 0.17
720 0.14
721 0.09
722 0.11
723 0.12
724 0.12
725 0.12
726 0.11
727 0.12
728 0.12
729 0.12
730 0.16
731 0.16
732 0.18
733 0.17
734 0.17
735 0.16
736 0.19
737 0.19
738 0.14
739 0.14
740 0.12
741 0.12
742 0.14
743 0.13
744 0.12
745 0.11
746 0.12
747 0.15
748 0.17
749 0.16
750 0.14
751 0.13
752 0.11
753 0.12
754 0.12
755 0.08
756 0.07
757 0.08
758 0.09
759 0.08
760 0.09
761 0.13
762 0.13
763 0.14
764 0.14
765 0.13
766 0.13
767 0.13
768 0.13
769 0.13
770 0.15
771 0.24
772 0.33
773 0.42
774 0.46
775 0.48
776 0.48
777 0.45
778 0.42
779 0.35
780 0.26
781 0.21
782 0.18
783 0.17
784 0.16
785 0.16
786 0.15
787 0.15
788 0.21
789 0.17
790 0.16
791 0.18
792 0.19
793 0.2
794 0.27
795 0.29
796 0.24
797 0.27
798 0.28
799 0.27
800 0.26
801 0.24
802 0.18
803 0.15
804 0.17
805 0.18
806 0.24
807 0.3
808 0.37
809 0.44
810 0.5
811 0.55
812 0.56
813 0.56
814 0.51
815 0.48
816 0.43
817 0.37
818 0.35
819 0.31
820 0.26
821 0.23
822 0.21
823 0.17
824 0.18
825 0.2
826 0.16
827 0.18
828 0.23
829 0.24
830 0.31
831 0.33
832 0.31
833 0.35
834 0.35
835 0.32
836 0.29
837 0.28
838 0.23
839 0.2
840 0.22
841 0.18
842 0.18
843 0.2
844 0.23
845 0.22
846 0.21
847 0.22
848 0.21
849 0.21
850 0.23
851 0.2
852 0.16
853 0.15
854 0.15
855 0.15
856 0.13
857 0.11
858 0.09
859 0.09
860 0.09
861 0.1
862 0.1
863 0.09
864 0.09
865 0.09
866 0.13
867 0.16
868 0.18
869 0.19
870 0.19
871 0.21
872 0.21
873 0.24
874 0.25
875 0.23
876 0.2
877 0.2
878 0.24
879 0.22
880 0.22
881 0.18
882 0.17
883 0.15
884 0.16
885 0.18
886 0.16
887 0.16
888 0.17
889 0.23
890 0.18
891 0.19
892 0.19
893 0.17
894 0.19
895 0.25
896 0.24
897 0.24
898 0.28
899 0.31
900 0.34
901 0.41
902 0.42
903 0.38
904 0.4
905 0.41
906 0.42
907 0.41
908 0.39
909 0.34
910 0.31
911 0.3
912 0.31
913 0.25
914 0.23
915 0.24
916 0.24
917 0.3
918 0.32
919 0.32
920 0.35
921 0.37
922 0.42
923 0.45
924 0.46
925 0.45
926 0.44
927 0.49
928 0.46
929 0.48
930 0.42
931 0.37
932 0.37
933 0.3
934 0.28
935 0.21
936 0.2
937 0.17
938 0.15
939 0.14
940 0.1
941 0.08
942 0.07
943 0.06
944 0.05
945 0.04
946 0.04
947 0.04
948 0.04
949 0.04
950 0.04
951 0.04
952 0.04
953 0.05
954 0.06
955 0.06
956 0.07
957 0.09
958 0.09
959 0.1
960 0.1
961 0.1
962 0.1
963 0.09
964 0.1
965 0.09
966 0.09
967 0.09
968 0.1
969 0.11
970 0.11
971 0.12
972 0.12
973 0.16
974 0.17
975 0.17
976 0.16
977 0.16
978 0.17
979 0.16
980 0.2
981 0.17
982 0.22
983 0.24
984 0.25
985 0.29
986 0.38
987 0.38
988 0.35
989 0.38
990 0.34
991 0.34
992 0.35
993 0.31
994 0.25
995 0.27
996 0.28
997 0.23
998 0.21
999 0.2
1000 0.25
1001 0.25
1002 0.24
1003 0.22
1004 0.22
1005 0.22
1006 0.23
1007 0.23
1008 0.18
1009 0.18
1010 0.24
1011 0.29
1012 0.34
1013 0.34
1014 0.33
1015 0.32
1016 0.33
1017 0.31
1018 0.27
1019 0.22
1020 0.19
1021 0.17
1022 0.17
1023 0.16
1024 0.14
1025 0.12
1026 0.09
1027 0.06
1028 0.04
1029 0.03
1030 0.03
1031 0.03
1032 0.03
1033 0.03
1034 0.03
1035 0.03
1036 0.03
1037 0.03
1038 0.04
1039 0.04
1040 0.04
1041 0.04
1042 0.05
1043 0.06
1044 0.08
1045 0.09
1046 0.1
1047 0.11
1048 0.12
1049 0.12
1050 0.12