FuNGI

A0A1Z5TV88

Protein Details

Accession

A0A1Z5TV88

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-26	MVKTKEKKAKTSKDKAAPDQNSKQSS	Hydrophilic
135-157	EEQRQPKKAKTDRQPLPKSRPES	Hydrophilic
373-398	HSEAESGKKSKKKRKEKQLVDPIADT	Hydrophilic
443-472	GKDGASKDEKARRKEEKRKKKEAKVKDTAA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
379-389	GKKSKKKRKEK
446-468	GASKDEKARRKEEKRKKKEAKVK

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 13.333

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MVKTKEKKAKTSKDKAAPDQNSKQSSASQPAQAKSAHLSQEYVADSGDEDAPAESSRAKKVNSEPASQAQKMDTAKASTESSSESSEEDDSESEEELAKDPVELDSKQNKAKTNGVKRKSDESSSSDEESEEEAEEQRQPKKAKTDRQPLPKSRPESATQQPPSEIAAQPFQPPSGYNPVSTSNSANGVPLSEQSLRGKQIWHITAPSDVPLSSITEVASDAIQSARTVVSHGGAEYMLSEDNLGMENNFVMLPGREGYKPVQQRLDRTLHLQQKITLPELSSLQASEVTGSAAAGDVAEAAVRTTRPQPKGLRMRYKPSGYGAGEPGMIGASDSETEEHKSGAAKKGFQFPKSLGAHGTSEHATKEGHTNQHSEAESGKKSKKKRKEKQLVDPIADTVMKDDEAGKTNAGAEAGHEGGVTETAAMTPAQKVVAPKGAETAAGKDGASKDEKARRKEEKRKKKEAKVKDTAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.89
2	0.88
3	0.88
4	0.85
5	0.84
6	0.82
7	0.81
8	0.75
9	0.68
10	0.6
11	0.55
12	0.52
13	0.51
14	0.46
15	0.45
16	0.47
17	0.46
18	0.48
19	0.43
20	0.39
21	0.35
22	0.37
23	0.33
24	0.28
25	0.28
26	0.25
27	0.3
28	0.29
29	0.25
30	0.19
31	0.15
32	0.14
33	0.15
34	0.15
35	0.1
36	0.09
37	0.08
38	0.09
39	0.1
40	0.1
41	0.11
42	0.13
43	0.2
44	0.24
45	0.25
46	0.3
47	0.37
48	0.47
49	0.49
50	0.51
51	0.49
52	0.53
53	0.59
54	0.54
55	0.48
56	0.38
57	0.38
58	0.35
59	0.34
60	0.28
61	0.22
62	0.23
63	0.24
64	0.25
65	0.2
66	0.2
67	0.19
68	0.18
69	0.19
70	0.18
71	0.16
72	0.16
73	0.16
74	0.16
75	0.14
76	0.12
77	0.11
78	0.12
79	0.12
80	0.1
81	0.11
82	0.11
83	0.11
84	0.11
85	0.1
86	0.09
87	0.09
88	0.1
89	0.13
90	0.13
91	0.19
92	0.25
93	0.3
94	0.35
95	0.38
96	0.41
97	0.42
98	0.5
99	0.53
100	0.58
101	0.63
102	0.65
103	0.69
104	0.67
105	0.71
106	0.67
107	0.61
108	0.54
109	0.49
110	0.49
111	0.46
112	0.44
113	0.36
114	0.32
115	0.28
116	0.25
117	0.21
118	0.14
119	0.11
120	0.1
121	0.11
122	0.14
123	0.17
124	0.19
125	0.25
126	0.27
127	0.31
128	0.41
129	0.48
130	0.54
131	0.61
132	0.68
133	0.7
134	0.79
135	0.84
136	0.82
137	0.83
138	0.8
139	0.75
140	0.69
141	0.64
142	0.56
143	0.54
144	0.52
145	0.54
146	0.49
147	0.45
148	0.41
149	0.37
150	0.36
151	0.32
152	0.26
153	0.18
154	0.17
155	0.17
156	0.19
157	0.19
158	0.17
159	0.14
160	0.13
161	0.15
162	0.21
163	0.21
164	0.19
165	0.21
166	0.25
167	0.27
168	0.27
169	0.25
170	0.17
171	0.18
172	0.18
173	0.16
174	0.12
175	0.1
176	0.09
177	0.08
178	0.11
179	0.1
180	0.12
181	0.13
182	0.16
183	0.18
184	0.18
185	0.19
186	0.18
187	0.24
188	0.24
189	0.23
190	0.21
191	0.2
192	0.2
193	0.19
194	0.17
195	0.11
196	0.09
197	0.09
198	0.08
199	0.09
200	0.08
201	0.08
202	0.07
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.06
207	0.05
208	0.04
209	0.04
210	0.05
211	0.04
212	0.05
213	0.04
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.06
221	0.06
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.04
226	0.04
227	0.04
228	0.03
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.03
233	0.04
234	0.03
235	0.04
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.04
240	0.05
241	0.05
242	0.07
243	0.07
244	0.09
245	0.11
246	0.18
247	0.22
248	0.24
249	0.31
250	0.31
251	0.34
252	0.39
253	0.41
254	0.35
255	0.35
256	0.41
257	0.4
258	0.41
259	0.38
260	0.34
261	0.34
262	0.35
263	0.33
264	0.25
265	0.19
266	0.18
267	0.18
268	0.17
269	0.12
270	0.1
271	0.09
272	0.08
273	0.08
274	0.07
275	0.06
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.03
283	0.03
284	0.02
285	0.02
286	0.02
287	0.02
288	0.03
289	0.04
290	0.04
291	0.06
292	0.14
293	0.21
294	0.24
295	0.31
296	0.36
297	0.45
298	0.55
299	0.63
300	0.66
301	0.64
302	0.7
303	0.7
304	0.69
305	0.61
306	0.53
307	0.51
308	0.42
309	0.4
310	0.33
311	0.27
312	0.23
313	0.21
314	0.18
315	0.11
316	0.09
317	0.06
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.05
322	0.05
323	0.07
324	0.09
325	0.1
326	0.1
327	0.1
328	0.13
329	0.17
330	0.25
331	0.26
332	0.29
333	0.31
334	0.42
335	0.45
336	0.43
337	0.42
338	0.36
339	0.42
340	0.4
341	0.38
342	0.29
343	0.27
344	0.27
345	0.24
346	0.25
347	0.17
348	0.16
349	0.15
350	0.15
351	0.13
352	0.13
353	0.2
354	0.23
355	0.28
356	0.29
357	0.31
358	0.32
359	0.38
360	0.37
361	0.31
362	0.29
363	0.28
364	0.3
365	0.34
366	0.39
367	0.4
368	0.49
369	0.59
370	0.66
371	0.72
372	0.79
373	0.84
374	0.88
375	0.92
376	0.93
377	0.94
378	0.9
379	0.83
380	0.73
381	0.62
382	0.53
383	0.43
384	0.31
385	0.22
386	0.16
387	0.12
388	0.11
389	0.12
390	0.13
391	0.16
392	0.18
393	0.16
394	0.15
395	0.16
396	0.17
397	0.15
398	0.12
399	0.09
400	0.11
401	0.11
402	0.11
403	0.1
404	0.09
405	0.09
406	0.1
407	0.09
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.06
412	0.06
413	0.07
414	0.07
415	0.08
416	0.09
417	0.11
418	0.13
419	0.17
420	0.24
421	0.24
422	0.23
423	0.26
424	0.25
425	0.26
426	0.25
427	0.24
428	0.19
429	0.19
430	0.18
431	0.19
432	0.2
433	0.23
434	0.25
435	0.24
436	0.31
437	0.39
438	0.48
439	0.51
440	0.59
441	0.66
442	0.73
443	0.82
444	0.85
445	0.87
446	0.89
447	0.94
448	0.95
449	0.95
450	0.94
451	0.94
452	0.94

A0A1Z5TV88

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer