Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Z5SVV5

Protein Details
Accession A0A1Z5SVV5    Localization Confidence Low Confidence Score 6.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
848-872TADGKTSHSRPSKPCRLPFKTSCGSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 19.5, cyto_mito 11.5, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MATAVARPTGAAVRQRDRLPKLSLSKRGSGLDGDRSSDALPQKKRKLTEPFVRDTAYILRKHKGKPPSIVLHLHNTHFKFHGQEGSYAYDSPMKFVLEHLRKGTVPHEMIEELLVSGVPWYDGCLIVEVRNYKTKEGEDTVGNGKKDGGGPDGKFSMHRYNEHITPSAFAPYPNKAKSAEEQGTKDGSSNSGTPEKEKEKSKEKASKDGGPQIFTTVLHPTALTQHHEIMLLANTPASELRSNNKKKGSTDVTGASEPPTPSVPPTPTATSRGPLSQQQKMCLEEGDIYAFQSDLLLATEPPLLLDPVSTPQDADRVLEILSDPLHCATPPEAKTRKRTTAEMAADDAQAAEQERRMLIMDERLKPLSTSTAAGGLQGDGQGGAAAALGFSRFKTLEMVRAKHEEQERVRKDEEARQAVERKAAEEQNQRQQALLQHQAKQKEMLLQQQRAHAAAQGGGNPNMMAQRNEMLRQQQQQQQQRQQMEQAQQLAAQQATSAQHGHPQQQNTQAMMQQGGQGFQQPQQVSQMGGAQGSPLARQQTPILNSSPMMPQGGFPMQPQGSNQGGAGSPARPTSAMMAGRNVSMARQGSQQQGSTHNTPQIAQGTPSMPQAMPNRQMSQTPRLPPGSPAAGMQMGTPNSAHMASMQPTPHMNGSQNGFTPEQLAMLQRQQSIQQQQQHSASPAPGAGGQGGLPQNMTPEQFQAISVQGQQRMRHQQQQLMMAQRSGNQPLANHWQMQMQQQQNREMQARRIREMHALQQAQQQGMAGGGGGHGHPQQTPGGHPQMQPNQMQNQMQVNQHPQQMQSGQGGNPQQMATPDQMAQAQQRSQQMAFQRNFRTSCQLTRSSTADGKTSHSRPSKPCRLPFKTSCGSRRCGLSNSNSRDR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.5
3 0.57
4 0.59
5 0.61
6 0.59
7 0.61
8 0.65
9 0.68
10 0.71
11 0.68
12 0.68
13 0.66
14 0.62
15 0.55
16 0.5
17 0.45
18 0.44
19 0.4
20 0.37
21 0.34
22 0.33
23 0.31
24 0.31
25 0.34
26 0.33
27 0.41
28 0.48
29 0.57
30 0.62
31 0.65
32 0.69
33 0.73
34 0.74
35 0.75
36 0.73
37 0.71
38 0.68
39 0.66
40 0.58
41 0.5
42 0.49
43 0.45
44 0.43
45 0.4
46 0.44
47 0.48
48 0.53
49 0.58
50 0.59
51 0.6
52 0.62
53 0.67
54 0.68
55 0.68
56 0.7
57 0.65
58 0.65
59 0.61
60 0.56
61 0.54
62 0.47
63 0.44
64 0.4
65 0.38
66 0.32
67 0.31
68 0.36
69 0.3
70 0.32
71 0.32
72 0.35
73 0.35
74 0.31
75 0.29
76 0.27
77 0.25
78 0.23
79 0.22
80 0.18
81 0.17
82 0.2
83 0.29
84 0.3
85 0.35
86 0.35
87 0.37
88 0.37
89 0.39
90 0.38
91 0.36
92 0.31
93 0.27
94 0.27
95 0.24
96 0.24
97 0.22
98 0.2
99 0.11
100 0.1
101 0.08
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.04
107 0.06
108 0.07
109 0.08
110 0.09
111 0.11
112 0.12
113 0.13
114 0.18
115 0.19
116 0.21
117 0.28
118 0.3
119 0.29
120 0.32
121 0.33
122 0.34
123 0.35
124 0.35
125 0.29
126 0.31
127 0.37
128 0.39
129 0.37
130 0.31
131 0.27
132 0.26
133 0.27
134 0.25
135 0.21
136 0.23
137 0.24
138 0.27
139 0.28
140 0.26
141 0.25
142 0.28
143 0.33
144 0.3
145 0.32
146 0.34
147 0.38
148 0.41
149 0.43
150 0.41
151 0.32
152 0.3
153 0.29
154 0.27
155 0.22
156 0.2
157 0.2
158 0.24
159 0.32
160 0.31
161 0.32
162 0.3
163 0.33
164 0.36
165 0.42
166 0.41
167 0.38
168 0.39
169 0.4
170 0.41
171 0.37
172 0.34
173 0.26
174 0.21
175 0.18
176 0.16
177 0.18
178 0.21
179 0.22
180 0.23
181 0.29
182 0.33
183 0.37
184 0.44
185 0.46
186 0.5
187 0.57
188 0.65
189 0.66
190 0.65
191 0.69
192 0.67
193 0.68
194 0.64
195 0.67
196 0.59
197 0.52
198 0.48
199 0.4
200 0.35
201 0.28
202 0.23
203 0.17
204 0.15
205 0.13
206 0.13
207 0.11
208 0.16
209 0.18
210 0.19
211 0.18
212 0.19
213 0.19
214 0.2
215 0.19
216 0.15
217 0.14
218 0.11
219 0.09
220 0.08
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.09
225 0.1
226 0.1
227 0.18
228 0.28
229 0.35
230 0.41
231 0.47
232 0.48
233 0.48
234 0.56
235 0.55
236 0.47
237 0.46
238 0.43
239 0.4
240 0.37
241 0.36
242 0.28
243 0.25
244 0.22
245 0.19
246 0.17
247 0.14
248 0.15
249 0.19
250 0.19
251 0.18
252 0.22
253 0.25
254 0.25
255 0.3
256 0.3
257 0.27
258 0.27
259 0.27
260 0.25
261 0.29
262 0.32
263 0.34
264 0.34
265 0.37
266 0.38
267 0.37
268 0.36
269 0.29
270 0.24
271 0.18
272 0.17
273 0.15
274 0.12
275 0.11
276 0.1
277 0.09
278 0.08
279 0.06
280 0.06
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.04
285 0.06
286 0.07
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.09
295 0.11
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.13
300 0.13
301 0.13
302 0.1
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.08
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.09
316 0.16
317 0.18
318 0.26
319 0.32
320 0.37
321 0.46
322 0.52
323 0.58
324 0.54
325 0.55
326 0.52
327 0.54
328 0.52
329 0.45
330 0.4
331 0.32
332 0.29
333 0.26
334 0.2
335 0.11
336 0.08
337 0.08
338 0.06
339 0.05
340 0.06
341 0.06
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.08
346 0.15
347 0.21
348 0.23
349 0.25
350 0.25
351 0.25
352 0.24
353 0.24
354 0.19
355 0.14
356 0.12
357 0.1
358 0.12
359 0.12
360 0.12
361 0.11
362 0.09
363 0.08
364 0.07
365 0.06
366 0.04
367 0.04
368 0.03
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.02
373 0.02
374 0.02
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.09
382 0.1
383 0.18
384 0.23
385 0.25
386 0.26
387 0.3
388 0.3
389 0.31
390 0.34
391 0.32
392 0.32
393 0.41
394 0.42
395 0.42
396 0.42
397 0.4
398 0.4
399 0.41
400 0.43
401 0.36
402 0.35
403 0.34
404 0.37
405 0.35
406 0.36
407 0.28
408 0.22
409 0.22
410 0.22
411 0.25
412 0.29
413 0.32
414 0.37
415 0.4
416 0.39
417 0.35
418 0.35
419 0.33
420 0.3
421 0.34
422 0.28
423 0.31
424 0.35
425 0.36
426 0.35
427 0.33
428 0.29
429 0.26
430 0.25
431 0.27
432 0.3
433 0.33
434 0.34
435 0.36
436 0.35
437 0.3
438 0.29
439 0.22
440 0.16
441 0.13
442 0.12
443 0.12
444 0.12
445 0.12
446 0.12
447 0.1
448 0.1
449 0.1
450 0.11
451 0.09
452 0.08
453 0.11
454 0.12
455 0.13
456 0.15
457 0.16
458 0.19
459 0.22
460 0.27
461 0.3
462 0.38
463 0.45
464 0.51
465 0.55
466 0.58
467 0.56
468 0.52
469 0.5
470 0.47
471 0.42
472 0.37
473 0.31
474 0.24
475 0.22
476 0.22
477 0.19
478 0.14
479 0.1
480 0.07
481 0.07
482 0.08
483 0.08
484 0.09
485 0.08
486 0.13
487 0.14
488 0.2
489 0.22
490 0.24
491 0.26
492 0.32
493 0.34
494 0.3
495 0.3
496 0.26
497 0.23
498 0.21
499 0.18
500 0.14
501 0.13
502 0.12
503 0.11
504 0.11
505 0.11
506 0.13
507 0.18
508 0.15
509 0.15
510 0.17
511 0.18
512 0.16
513 0.16
514 0.15
515 0.11
516 0.11
517 0.1
518 0.07
519 0.08
520 0.07
521 0.07
522 0.07
523 0.09
524 0.09
525 0.11
526 0.13
527 0.17
528 0.19
529 0.21
530 0.2
531 0.18
532 0.19
533 0.19
534 0.18
535 0.14
536 0.13
537 0.11
538 0.09
539 0.12
540 0.13
541 0.12
542 0.11
543 0.16
544 0.15
545 0.16
546 0.16
547 0.18
548 0.17
549 0.17
550 0.17
551 0.12
552 0.12
553 0.13
554 0.14
555 0.09
556 0.09
557 0.09
558 0.09
559 0.08
560 0.09
561 0.1
562 0.14
563 0.16
564 0.16
565 0.18
566 0.18
567 0.18
568 0.18
569 0.15
570 0.1
571 0.11
572 0.12
573 0.11
574 0.13
575 0.16
576 0.2
577 0.22
578 0.24
579 0.23
580 0.27
581 0.31
582 0.31
583 0.31
584 0.29
585 0.27
586 0.26
587 0.27
588 0.25
589 0.21
590 0.18
591 0.18
592 0.16
593 0.17
594 0.17
595 0.16
596 0.12
597 0.17
598 0.22
599 0.25
600 0.3
601 0.33
602 0.35
603 0.34
604 0.38
605 0.38
606 0.41
607 0.41
608 0.4
609 0.41
610 0.41
611 0.41
612 0.38
613 0.38
614 0.32
615 0.26
616 0.22
617 0.19
618 0.18
619 0.17
620 0.15
621 0.15
622 0.12
623 0.13
624 0.12
625 0.1
626 0.11
627 0.11
628 0.1
629 0.07
630 0.1
631 0.11
632 0.15
633 0.15
634 0.15
635 0.16
636 0.18
637 0.18
638 0.18
639 0.18
640 0.18
641 0.2
642 0.21
643 0.22
644 0.23
645 0.22
646 0.19
647 0.19
648 0.16
649 0.14
650 0.12
651 0.13
652 0.12
653 0.15
654 0.18
655 0.17
656 0.18
657 0.2
658 0.26
659 0.32
660 0.37
661 0.4
662 0.4
663 0.44
664 0.46
665 0.45
666 0.4
667 0.35
668 0.29
669 0.22
670 0.19
671 0.15
672 0.13
673 0.11
674 0.09
675 0.08
676 0.07
677 0.11
678 0.12
679 0.11
680 0.1
681 0.1
682 0.12
683 0.13
684 0.14
685 0.11
686 0.11
687 0.13
688 0.13
689 0.14
690 0.13
691 0.13
692 0.13
693 0.17
694 0.19
695 0.23
696 0.26
697 0.28
698 0.35
699 0.43
700 0.47
701 0.52
702 0.52
703 0.52
704 0.53
705 0.58
706 0.55
707 0.52
708 0.47
709 0.4
710 0.37
711 0.36
712 0.35
713 0.31
714 0.28
715 0.22
716 0.22
717 0.25
718 0.34
719 0.32
720 0.3
721 0.27
722 0.29
723 0.3
724 0.36
725 0.39
726 0.38
727 0.4
728 0.43
729 0.49
730 0.47
731 0.5
732 0.5
733 0.44
734 0.46
735 0.5
736 0.5
737 0.49
738 0.49
739 0.47
740 0.49
741 0.49
742 0.48
743 0.49
744 0.45
745 0.43
746 0.46
747 0.46
748 0.38
749 0.34
750 0.27
751 0.17
752 0.16
753 0.13
754 0.08
755 0.05
756 0.04
757 0.05
758 0.05
759 0.07
760 0.08
761 0.09
762 0.09
763 0.11
764 0.14
765 0.14
766 0.18
767 0.23
768 0.29
769 0.32
770 0.34
771 0.41
772 0.47
773 0.51
774 0.51
775 0.49
776 0.48
777 0.5
778 0.49
779 0.44
780 0.43
781 0.42
782 0.42
783 0.42
784 0.43
785 0.42
786 0.45
787 0.43
788 0.37
789 0.38
790 0.36
791 0.34
792 0.32
793 0.3
794 0.26
795 0.3
796 0.32
797 0.27
798 0.28
799 0.25
800 0.22
801 0.2
802 0.22
803 0.19
804 0.19
805 0.19
806 0.18
807 0.2
808 0.21
809 0.24
810 0.27
811 0.27
812 0.3
813 0.34
814 0.36
815 0.35
816 0.38
817 0.41
818 0.45
819 0.46
820 0.48
821 0.49
822 0.52
823 0.54
824 0.53
825 0.54
826 0.48
827 0.52
828 0.52
829 0.52
830 0.5
831 0.52
832 0.52
833 0.5
834 0.5
835 0.44
836 0.42
837 0.36
838 0.38
839 0.42
840 0.42
841 0.45
842 0.48
843 0.54
844 0.59
845 0.68
846 0.73
847 0.74
848 0.8
849 0.82
850 0.82
851 0.84
852 0.82
853 0.81
854 0.79
855 0.78
856 0.78
857 0.73
858 0.7
859 0.65
860 0.64
861 0.59
862 0.55
863 0.53
864 0.54
865 0.59