Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Z5SSM4

Protein Details
Accession A0A1Z5SSM4    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-42LDSPKNGRLHKRDSNKLTKEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
179-190DRLRKGDPEKKP
Subcellular Location(s) extr 11, plas 9, mito 2, cyto 2, E.R. 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001727  Gdt1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF01169  UPF0016  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01214  UPF0016  
Amino Acid Sequences MRFRHASPLLLLLLPTLAAADLDSPKNGRLHKRDSNKLTKEEIMELNVAKGQTAGRGKPKFAAPADGAQNPKPSTSTRPYVGTEDAPVDGLDGKPHAGPFVDTTPEETTKKGKGAAAKTSSAKPRPTSLEKFKDASNDDGWALDDIPEKNDGVMNDESRVAPKKGTTGTEGGISEKTKDRLRKGDPEKKPQAPNEAPPLPHKEQERIAEHQEKTGEKKKTSAAGKEDKDSENGAETGGKKGDEYGAGGLGMEKPTDLPEKPHNIPHPERKGSSNNGASEAGEPPIANSGQDDWLQDTMPYTEGSTNPLENAKSASAAAGGDTTGGITSPGTAGDTEWHEWFHSFVLSMTMILFSEIGDKTFLVAALMAMRHDRLLVFTAALSALVAMTVLSAVLGHAVPTLLPKKFTTFGAAVLFLVFGARLLKEGLEMPSDSGVGEEMREVEAELEEKEHSSSHRPSSNDPYSLESGRHHHHSSEKRSPSASSSRSPRLPPATPPPALVLSPAWVQTFVMTFLGEWGDRSQIATIAMAAGQDYWWVTLGAICGHSVCTGLAVVGGRALAGKVSMRVVTIGGAVAFLAFGLIYIYECLMETS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.11
3 0.07
4 0.05
5 0.04
6 0.05
7 0.08
8 0.12
9 0.13
10 0.15
11 0.16
12 0.2
13 0.25
14 0.31
15 0.38
16 0.42
17 0.5
18 0.59
19 0.67
20 0.74
21 0.79
22 0.84
23 0.81
24 0.78
25 0.75
26 0.69
27 0.62
28 0.57
29 0.5
30 0.42
31 0.37
32 0.32
33 0.28
34 0.26
35 0.22
36 0.17
37 0.15
38 0.13
39 0.17
40 0.22
41 0.27
42 0.34
43 0.38
44 0.4
45 0.43
46 0.47
47 0.47
48 0.43
49 0.45
50 0.38
51 0.41
52 0.45
53 0.45
54 0.44
55 0.39
56 0.44
57 0.38
58 0.36
59 0.31
60 0.29
61 0.33
62 0.37
63 0.4
64 0.37
65 0.4
66 0.42
67 0.44
68 0.44
69 0.38
70 0.32
71 0.28
72 0.24
73 0.21
74 0.17
75 0.14
76 0.12
77 0.11
78 0.1
79 0.09
80 0.1
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.1
85 0.11
86 0.13
87 0.16
88 0.18
89 0.17
90 0.2
91 0.24
92 0.27
93 0.27
94 0.26
95 0.27
96 0.27
97 0.29
98 0.29
99 0.27
100 0.31
101 0.36
102 0.43
103 0.43
104 0.44
105 0.45
106 0.49
107 0.54
108 0.52
109 0.52
110 0.46
111 0.47
112 0.5
113 0.55
114 0.58
115 0.6
116 0.62
117 0.61
118 0.6
119 0.56
120 0.55
121 0.5
122 0.45
123 0.36
124 0.29
125 0.25
126 0.24
127 0.23
128 0.17
129 0.14
130 0.11
131 0.14
132 0.12
133 0.14
134 0.14
135 0.14
136 0.13
137 0.15
138 0.13
139 0.14
140 0.17
141 0.16
142 0.16
143 0.17
144 0.17
145 0.19
146 0.23
147 0.19
148 0.17
149 0.17
150 0.21
151 0.23
152 0.25
153 0.25
154 0.23
155 0.23
156 0.25
157 0.25
158 0.21
159 0.2
160 0.19
161 0.18
162 0.19
163 0.22
164 0.25
165 0.31
166 0.35
167 0.41
168 0.47
169 0.55
170 0.62
171 0.68
172 0.71
173 0.76
174 0.79
175 0.77
176 0.78
177 0.71
178 0.7
179 0.63
180 0.6
181 0.58
182 0.53
183 0.46
184 0.44
185 0.49
186 0.41
187 0.42
188 0.39
189 0.34
190 0.35
191 0.41
192 0.41
193 0.37
194 0.41
195 0.45
196 0.43
197 0.42
198 0.4
199 0.35
200 0.37
201 0.41
202 0.4
203 0.33
204 0.36
205 0.36
206 0.41
207 0.44
208 0.43
209 0.42
210 0.46
211 0.47
212 0.47
213 0.47
214 0.41
215 0.37
216 0.33
217 0.25
218 0.18
219 0.17
220 0.13
221 0.12
222 0.12
223 0.13
224 0.13
225 0.12
226 0.1
227 0.11
228 0.11
229 0.09
230 0.09
231 0.08
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.09
243 0.09
244 0.12
245 0.18
246 0.25
247 0.26
248 0.32
249 0.34
250 0.38
251 0.44
252 0.5
253 0.52
254 0.49
255 0.49
256 0.48
257 0.49
258 0.46
259 0.48
260 0.42
261 0.34
262 0.33
263 0.32
264 0.28
265 0.24
266 0.21
267 0.14
268 0.1
269 0.09
270 0.07
271 0.08
272 0.08
273 0.06
274 0.06
275 0.07
276 0.08
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.1
291 0.11
292 0.1
293 0.1
294 0.12
295 0.11
296 0.1
297 0.12
298 0.09
299 0.08
300 0.08
301 0.07
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.06
321 0.08
322 0.1
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.1
327 0.11
328 0.09
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.05
339 0.05
340 0.04
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.06
354 0.05
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.07
365 0.08
366 0.08
367 0.07
368 0.06
369 0.04
370 0.03
371 0.03
372 0.03
373 0.02
374 0.02
375 0.02
376 0.02
377 0.02
378 0.02
379 0.02
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.04
385 0.04
386 0.08
387 0.12
388 0.12
389 0.14
390 0.14
391 0.18
392 0.2
393 0.21
394 0.22
395 0.19
396 0.2
397 0.2
398 0.2
399 0.16
400 0.15
401 0.14
402 0.09
403 0.08
404 0.05
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.05
409 0.05
410 0.06
411 0.06
412 0.08
413 0.09
414 0.1
415 0.1
416 0.1
417 0.11
418 0.11
419 0.1
420 0.08
421 0.07
422 0.06
423 0.06
424 0.05
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.07
432 0.07
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.09
437 0.09
438 0.11
439 0.16
440 0.21
441 0.26
442 0.31
443 0.33
444 0.37
445 0.46
446 0.5
447 0.47
448 0.44
449 0.42
450 0.41
451 0.4
452 0.37
453 0.3
454 0.29
455 0.3
456 0.34
457 0.31
458 0.3
459 0.38
460 0.45
461 0.52
462 0.58
463 0.59
464 0.56
465 0.56
466 0.55
467 0.52
468 0.52
469 0.47
470 0.44
471 0.46
472 0.5
473 0.54
474 0.54
475 0.56
476 0.54
477 0.52
478 0.51
479 0.54
480 0.54
481 0.5
482 0.49
483 0.44
484 0.39
485 0.36
486 0.31
487 0.22
488 0.17
489 0.18
490 0.18
491 0.15
492 0.13
493 0.13
494 0.13
495 0.13
496 0.12
497 0.11
498 0.09
499 0.08
500 0.09
501 0.11
502 0.1
503 0.1
504 0.1
505 0.12
506 0.12
507 0.13
508 0.12
509 0.12
510 0.13
511 0.11
512 0.1
513 0.09
514 0.09
515 0.08
516 0.07
517 0.06
518 0.05
519 0.06
520 0.06
521 0.06
522 0.07
523 0.07
524 0.07
525 0.08
526 0.09
527 0.1
528 0.11
529 0.1
530 0.1
531 0.1
532 0.11
533 0.1
534 0.09
535 0.08
536 0.07
537 0.07
538 0.08
539 0.08
540 0.08
541 0.08
542 0.08
543 0.07
544 0.07
545 0.07
546 0.05
547 0.06
548 0.08
549 0.09
550 0.11
551 0.12
552 0.12
553 0.13
554 0.13
555 0.12
556 0.12
557 0.11
558 0.08
559 0.08
560 0.07
561 0.06
562 0.05
563 0.04
564 0.04
565 0.03
566 0.03
567 0.03
568 0.04
569 0.04
570 0.05
571 0.06
572 0.06