Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Z5SNH5

Protein Details
Accession A0A1Z5SNH5    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-63STSRNPSPSRSPSRSRSRSRSNSRGRPNRRTRSLTRSPTHHydrophilic
152-172LPRRRFSRSPPAKRPPPNRFGBasic
302-323YSSYGSRSRSRSPSRDRGGRRRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-59SPTRSATPRSTSRNPSPSRSPSRSRSRSRSNSRGRPNRRTRSLTR
154-223RRRFSRSPPAKRPPPNRFGEPHRLRDGPGGGGGGGGRGPPPMSSDRVYRPGNGAGPPPGGRRGGRGGGGG
243-323SPPPPRRRGGGGGGRSPSYDSRDRSLSRSPPPPPASSSRRRYDSPPPRSGGGRGRRSPSYSSYGSRSRSRSPSRDRGGRRR
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MADTEMADRPNGRRSPTRSATPRSTSRNPSPSRSPSRSRSRSRSNSRGRPNRRTRSLTRSPTHSRSPSSPPHRSTKIVIEKLTKNVHPAHLHEIFAHYGPIADLEMPMNRQFLMNKGIAYILYTSAKDAEEAIACMHEAQLDGACINVSIVLPRRRFSRSPPAKRPPPNRFGEPHRLRDGPGGGGGGGGRGPPPMSSDRVYRPGNGAGPPPGGRRGGRGGGGGGYRDRYDDRDSYRPRSYSASPPPPRRRGGGGGGRSPSYDSRDRSLSRSPPPPPASSSRRRYDSPPPRSGGGRGRRSPSYSSYGSRSRSRSPSRDRGGRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.55
3 0.59
4 0.66
5 0.66
6 0.7
7 0.73
8 0.73
9 0.74
10 0.72
11 0.74
12 0.73
13 0.74
14 0.76
15 0.72
16 0.71
17 0.72
18 0.74
19 0.75
20 0.74
21 0.72
22 0.72
23 0.78
24 0.81
25 0.82
26 0.81
27 0.82
28 0.85
29 0.88
30 0.89
31 0.88
32 0.89
33 0.9
34 0.91
35 0.9
36 0.9
37 0.91
38 0.91
39 0.89
40 0.87
41 0.83
42 0.82
43 0.83
44 0.82
45 0.76
46 0.74
47 0.73
48 0.71
49 0.72
50 0.67
51 0.61
52 0.56
53 0.59
54 0.61
55 0.62
56 0.64
57 0.6
58 0.64
59 0.64
60 0.61
61 0.57
62 0.57
63 0.58
64 0.55
65 0.54
66 0.52
67 0.51
68 0.55
69 0.56
70 0.46
71 0.4
72 0.38
73 0.41
74 0.37
75 0.36
76 0.37
77 0.34
78 0.34
79 0.3
80 0.29
81 0.24
82 0.21
83 0.18
84 0.11
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.06
89 0.05
90 0.05
91 0.06
92 0.07
93 0.08
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.1
98 0.1
99 0.12
100 0.15
101 0.14
102 0.14
103 0.14
104 0.14
105 0.13
106 0.13
107 0.11
108 0.08
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.09
115 0.09
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.04
137 0.1
138 0.17
139 0.18
140 0.19
141 0.22
142 0.27
143 0.28
144 0.33
145 0.39
146 0.44
147 0.53
148 0.62
149 0.68
150 0.72
151 0.8
152 0.83
153 0.8
154 0.78
155 0.72
156 0.66
157 0.62
158 0.6
159 0.62
160 0.58
161 0.55
162 0.51
163 0.47
164 0.43
165 0.42
166 0.36
167 0.25
168 0.2
169 0.15
170 0.1
171 0.1
172 0.09
173 0.06
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.07
181 0.1
182 0.13
183 0.15
184 0.18
185 0.22
186 0.29
187 0.3
188 0.28
189 0.28
190 0.28
191 0.29
192 0.26
193 0.24
194 0.19
195 0.2
196 0.2
197 0.2
198 0.2
199 0.2
200 0.19
201 0.2
202 0.23
203 0.23
204 0.22
205 0.21
206 0.19
207 0.18
208 0.19
209 0.17
210 0.13
211 0.13
212 0.12
213 0.13
214 0.13
215 0.15
216 0.18
217 0.22
218 0.27
219 0.35
220 0.4
221 0.45
222 0.5
223 0.48
224 0.46
225 0.46
226 0.44
227 0.44
228 0.5
229 0.54
230 0.56
231 0.66
232 0.74
233 0.76
234 0.75
235 0.68
236 0.64
237 0.58
238 0.59
239 0.57
240 0.53
241 0.52
242 0.51
243 0.48
244 0.43
245 0.4
246 0.34
247 0.3
248 0.31
249 0.29
250 0.3
251 0.37
252 0.39
253 0.41
254 0.46
255 0.48
256 0.49
257 0.54
258 0.53
259 0.56
260 0.59
261 0.57
262 0.54
263 0.56
264 0.57
265 0.59
266 0.64
267 0.62
268 0.63
269 0.63
270 0.64
271 0.66
272 0.68
273 0.68
274 0.68
275 0.63
276 0.61
277 0.6
278 0.61
279 0.59
280 0.59
281 0.59
282 0.58
283 0.6
284 0.62
285 0.63
286 0.61
287 0.57
288 0.54
289 0.48
290 0.46
291 0.47
292 0.49
293 0.51
294 0.54
295 0.54
296 0.55
297 0.61
298 0.66
299 0.7
300 0.73
301 0.78
302 0.8
303 0.85