Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Z5TJX5

Protein Details
Accession A0A1Z5TJX5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-42ITTQQPMTKRDVRRNRIMERLNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
232-263RHLRHRAGSPAPGDIGADKGGEGNGGKKKRKA
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 10, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MARPHTPALDQSPSPPPAAAITTQQPMTKRDVRRNRIMERLNQMMDSFSSNQHAHYRAQLQAVQVDMTLVLRADPYESGPLADSGDEVEALIEEVTGGGAGLGGEGGEAAERDFAAMAGRRYKEFAGEVNDCLEKRDAELTSLHDHYHASLRSLESLTQHKLHQASEEHAALSATIRQRLIASLTKKRQNLLRDKEQLDIADSNALLLHPSHFSINNPGSPGGTAQQNRKTRHLRHRAGSPAPGDIGADKGGEGNGGKKKRKAGAMEDENGNGNESPAPPHQPFRLPPPPDALGGGRSPFKDARDKSGYAQFEAPAYSLERIFTEKELAMATATAQHATYRYFHTPQAQKDTATEGQTGSGSNGTAVPSVDGQEGMLPDAATTEGQQTGEDGTTGAHPTTENEMERSTSHQVLTRGTARANPLAALSDLAAAAATHSPGGGPSTLARENPFAPVIPSYHAVSRSDKSFAGAPTPSGVGLVEGENDFEMMRRSGHHHVQPNGYHADPEDLPDAGPADLAAEDAAAALGGAEMRRQLLDQALGLPSITQPYRLPLIETGPAVIGKGVDRPNWTGFSDVRVYEQQRMRQQISNFGAGNGKEGGVVGRIAGGVGAGGEAMSRTTSTGGGSEMGEPGTGTATTTRRGGRGRLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.34
3 0.29
4 0.25
5 0.27
6 0.24
7 0.21
8 0.24
9 0.27
10 0.29
11 0.31
12 0.31
13 0.31
14 0.38
15 0.41
16 0.45
17 0.52
18 0.61
19 0.67
20 0.75
21 0.81
22 0.79
23 0.81
24 0.79
25 0.76
26 0.72
27 0.71
28 0.62
29 0.54
30 0.47
31 0.39
32 0.33
33 0.3
34 0.25
35 0.19
36 0.23
37 0.22
38 0.25
39 0.29
40 0.31
41 0.28
42 0.32
43 0.35
44 0.33
45 0.37
46 0.37
47 0.33
48 0.32
49 0.31
50 0.24
51 0.19
52 0.16
53 0.12
54 0.1
55 0.09
56 0.07
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.08
61 0.08
62 0.1
63 0.13
64 0.13
65 0.13
66 0.14
67 0.14
68 0.14
69 0.13
70 0.11
71 0.08
72 0.09
73 0.08
74 0.07
75 0.06
76 0.05
77 0.06
78 0.06
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.03
84 0.03
85 0.02
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.02
90 0.02
91 0.02
92 0.02
93 0.02
94 0.03
95 0.03
96 0.03
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.05
101 0.05
102 0.08
103 0.11
104 0.13
105 0.2
106 0.21
107 0.22
108 0.25
109 0.25
110 0.25
111 0.23
112 0.25
113 0.25
114 0.26
115 0.26
116 0.26
117 0.28
118 0.25
119 0.26
120 0.24
121 0.17
122 0.16
123 0.2
124 0.18
125 0.17
126 0.19
127 0.2
128 0.23
129 0.24
130 0.23
131 0.19
132 0.18
133 0.18
134 0.24
135 0.2
136 0.17
137 0.19
138 0.2
139 0.22
140 0.22
141 0.22
142 0.19
143 0.23
144 0.25
145 0.25
146 0.24
147 0.26
148 0.27
149 0.26
150 0.27
151 0.25
152 0.24
153 0.26
154 0.26
155 0.21
156 0.2
157 0.19
158 0.14
159 0.13
160 0.15
161 0.12
162 0.14
163 0.14
164 0.14
165 0.15
166 0.15
167 0.19
168 0.21
169 0.25
170 0.33
171 0.4
172 0.47
173 0.48
174 0.5
175 0.52
176 0.54
177 0.59
178 0.58
179 0.6
180 0.61
181 0.62
182 0.61
183 0.56
184 0.47
185 0.4
186 0.32
187 0.22
188 0.16
189 0.14
190 0.11
191 0.1
192 0.1
193 0.07
194 0.06
195 0.07
196 0.06
197 0.07
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.17
202 0.19
203 0.19
204 0.2
205 0.2
206 0.18
207 0.18
208 0.18
209 0.13
210 0.16
211 0.18
212 0.23
213 0.32
214 0.39
215 0.42
216 0.49
217 0.56
218 0.59
219 0.67
220 0.72
221 0.7
222 0.68
223 0.72
224 0.71
225 0.65
226 0.6
227 0.5
228 0.4
229 0.33
230 0.28
231 0.21
232 0.14
233 0.12
234 0.08
235 0.07
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.1
242 0.16
243 0.23
244 0.26
245 0.29
246 0.34
247 0.39
248 0.44
249 0.43
250 0.44
251 0.47
252 0.5
253 0.51
254 0.46
255 0.42
256 0.38
257 0.33
258 0.27
259 0.16
260 0.11
261 0.09
262 0.08
263 0.1
264 0.11
265 0.15
266 0.16
267 0.18
268 0.2
269 0.23
270 0.24
271 0.3
272 0.37
273 0.35
274 0.35
275 0.38
276 0.37
277 0.33
278 0.33
279 0.25
280 0.18
281 0.16
282 0.16
283 0.13
284 0.12
285 0.14
286 0.15
287 0.17
288 0.23
289 0.23
290 0.3
291 0.33
292 0.34
293 0.34
294 0.39
295 0.37
296 0.3
297 0.3
298 0.23
299 0.18
300 0.17
301 0.15
302 0.09
303 0.09
304 0.08
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.07
317 0.06
318 0.06
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.08
325 0.09
326 0.1
327 0.11
328 0.15
329 0.16
330 0.18
331 0.25
332 0.3
333 0.32
334 0.39
335 0.36
336 0.33
337 0.32
338 0.36
339 0.31
340 0.27
341 0.24
342 0.16
343 0.15
344 0.15
345 0.15
346 0.1
347 0.08
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.07
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.06
368 0.05
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.06
379 0.05
380 0.06
381 0.07
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.07
386 0.11
387 0.13
388 0.13
389 0.14
390 0.14
391 0.15
392 0.16
393 0.18
394 0.18
395 0.16
396 0.17
397 0.19
398 0.2
399 0.2
400 0.23
401 0.23
402 0.21
403 0.2
404 0.22
405 0.21
406 0.21
407 0.2
408 0.17
409 0.13
410 0.13
411 0.13
412 0.1
413 0.08
414 0.07
415 0.06
416 0.06
417 0.05
418 0.04
419 0.05
420 0.05
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.06
427 0.05
428 0.05
429 0.06
430 0.11
431 0.13
432 0.14
433 0.15
434 0.16
435 0.17
436 0.18
437 0.18
438 0.14
439 0.13
440 0.14
441 0.14
442 0.14
443 0.15
444 0.14
445 0.16
446 0.18
447 0.19
448 0.22
449 0.23
450 0.23
451 0.24
452 0.22
453 0.21
454 0.23
455 0.21
456 0.21
457 0.19
458 0.18
459 0.17
460 0.17
461 0.15
462 0.11
463 0.11
464 0.07
465 0.07
466 0.07
467 0.07
468 0.06
469 0.07
470 0.07
471 0.07
472 0.06
473 0.06
474 0.08
475 0.07
476 0.08
477 0.09
478 0.14
479 0.2
480 0.27
481 0.34
482 0.4
483 0.44
484 0.5
485 0.5
486 0.49
487 0.46
488 0.39
489 0.33
490 0.26
491 0.26
492 0.19
493 0.2
494 0.17
495 0.13
496 0.13
497 0.13
498 0.14
499 0.09
500 0.09
501 0.06
502 0.06
503 0.05
504 0.06
505 0.05
506 0.04
507 0.04
508 0.04
509 0.04
510 0.03
511 0.02
512 0.02
513 0.02
514 0.03
515 0.03
516 0.04
517 0.05
518 0.06
519 0.06
520 0.07
521 0.08
522 0.1
523 0.11
524 0.11
525 0.13
526 0.13
527 0.13
528 0.12
529 0.12
530 0.1
531 0.13
532 0.13
533 0.13
534 0.13
535 0.16
536 0.2
537 0.2
538 0.22
539 0.19
540 0.23
541 0.24
542 0.24
543 0.21
544 0.18
545 0.18
546 0.15
547 0.14
548 0.11
549 0.08
550 0.14
551 0.17
552 0.19
553 0.22
554 0.26
555 0.29
556 0.32
557 0.32
558 0.29
559 0.26
560 0.28
561 0.29
562 0.25
563 0.26
564 0.3
565 0.32
566 0.37
567 0.43
568 0.46
569 0.5
570 0.57
571 0.57
572 0.56
573 0.55
574 0.57
575 0.55
576 0.53
577 0.45
578 0.39
579 0.4
580 0.33
581 0.34
582 0.25
583 0.2
584 0.14
585 0.14
586 0.14
587 0.1
588 0.1
589 0.08
590 0.07
591 0.07
592 0.07
593 0.06
594 0.05
595 0.04
596 0.04
597 0.04
598 0.03
599 0.03
600 0.03
601 0.03
602 0.04
603 0.05
604 0.05
605 0.06
606 0.07
607 0.08
608 0.09
609 0.1
610 0.1
611 0.11
612 0.12
613 0.13
614 0.13
615 0.12
616 0.11
617 0.1
618 0.1
619 0.1
620 0.09
621 0.08
622 0.13
623 0.15
624 0.17
625 0.22
626 0.25
627 0.29
628 0.33