Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Z5TRZ1

Protein Details
Accession A0A1Z5TRZ1    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
131-156ASGTEEPRKKRPYKPRDPNAPKRPLTBasic
281-304AAAPMKEKTPKSKKNKNAAPPTPAHydrophilic
335-355TGESGKKSKKGRKTATAGAETHydrophilic
363-385QMQPEAPDTEKKKKKKKKGGDSSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
137-153PRKKRPYKPRDPNAPKR
290-294PKSKK
327-347KKRKTADETGESGKKSKKGRK
373-382KKKKKKKKGG
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSNQFSSYDVPSYLRENAGAGGDAFMQGNGSNNFSAPQGEKRMVAVDVEQFVRTRDALSSAYMSLSSSIDKAVKAYIDHTNVILAGDASLNMSYLQQPFDQLAHASHIAQQAFNLASGQGNGVSAASGAGASGTEEPRKKRPYKPRDPNAPKRPLTAYFRYLQEMRGPLGEEMKQAAGGVPQKPGDLSKEATERWNKLSKQEQQPYRDAYQHALKDYEREVKKYKAEKNGGQQEEGAEDEDDDDDDDGEGQGARDGEVDAAHTKDEQDSDDDDESTGSSTAAAPMKEKTPKSKKNKNAAPPTPAADSNIDPVLTAQSQQQASSSPSKKRKTADETGESGKKSKKGRKTATAGAETPAPAPVAQMQPEAPDTEKKKKKKKKGGDSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.22
3 0.2
4 0.2
5 0.19
6 0.18
7 0.14
8 0.12
9 0.11
10 0.11
11 0.1
12 0.09
13 0.08
14 0.07
15 0.12
16 0.12
17 0.14
18 0.14
19 0.14
20 0.15
21 0.15
22 0.18
23 0.16
24 0.22
25 0.25
26 0.27
27 0.27
28 0.27
29 0.29
30 0.26
31 0.24
32 0.2
33 0.18
34 0.19
35 0.2
36 0.2
37 0.17
38 0.18
39 0.19
40 0.17
41 0.15
42 0.13
43 0.15
44 0.15
45 0.16
46 0.17
47 0.15
48 0.16
49 0.14
50 0.14
51 0.12
52 0.12
53 0.1
54 0.09
55 0.1
56 0.11
57 0.11
58 0.12
59 0.12
60 0.13
61 0.13
62 0.16
63 0.2
64 0.22
65 0.23
66 0.22
67 0.21
68 0.19
69 0.19
70 0.15
71 0.09
72 0.06
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.06
80 0.08
81 0.09
82 0.11
83 0.1
84 0.12
85 0.12
86 0.13
87 0.13
88 0.11
89 0.11
90 0.13
91 0.13
92 0.13
93 0.15
94 0.19
95 0.18
96 0.17
97 0.16
98 0.15
99 0.15
100 0.15
101 0.11
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.05
120 0.07
121 0.11
122 0.15
123 0.19
124 0.27
125 0.36
126 0.41
127 0.49
128 0.59
129 0.65
130 0.74
131 0.81
132 0.83
133 0.87
134 0.91
135 0.92
136 0.91
137 0.9
138 0.79
139 0.72
140 0.65
141 0.59
142 0.56
143 0.5
144 0.43
145 0.37
146 0.37
147 0.37
148 0.33
149 0.29
150 0.26
151 0.22
152 0.19
153 0.17
154 0.17
155 0.14
156 0.16
157 0.15
158 0.12
159 0.11
160 0.1
161 0.09
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.11
166 0.11
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.13
171 0.13
172 0.13
173 0.12
174 0.12
175 0.13
176 0.16
177 0.16
178 0.21
179 0.24
180 0.23
181 0.25
182 0.31
183 0.29
184 0.32
185 0.39
186 0.43
187 0.5
188 0.56
189 0.58
190 0.55
191 0.59
192 0.59
193 0.52
194 0.47
195 0.38
196 0.33
197 0.33
198 0.3
199 0.27
200 0.24
201 0.22
202 0.21
203 0.23
204 0.29
205 0.24
206 0.26
207 0.29
208 0.31
209 0.39
210 0.45
211 0.49
212 0.49
213 0.54
214 0.55
215 0.61
216 0.66
217 0.6
218 0.53
219 0.46
220 0.37
221 0.32
222 0.27
223 0.18
224 0.09
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.05
231 0.04
232 0.04
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.1
253 0.09
254 0.11
255 0.12
256 0.15
257 0.16
258 0.16
259 0.15
260 0.14
261 0.13
262 0.12
263 0.1
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.09
268 0.12
269 0.12
270 0.12
271 0.14
272 0.19
273 0.26
274 0.28
275 0.35
276 0.44
277 0.54
278 0.63
279 0.72
280 0.76
281 0.81
282 0.88
283 0.87
284 0.88
285 0.84
286 0.8
287 0.73
288 0.66
289 0.58
290 0.49
291 0.42
292 0.33
293 0.28
294 0.24
295 0.22
296 0.18
297 0.15
298 0.15
299 0.16
300 0.13
301 0.13
302 0.12
303 0.17
304 0.18
305 0.18
306 0.18
307 0.17
308 0.21
309 0.3
310 0.34
311 0.38
312 0.47
313 0.53
314 0.58
315 0.61
316 0.67
317 0.66
318 0.7
319 0.7
320 0.67
321 0.66
322 0.67
323 0.67
324 0.58
325 0.54
326 0.5
327 0.47
328 0.5
329 0.54
330 0.57
331 0.63
332 0.71
333 0.76
334 0.79
335 0.81
336 0.81
337 0.78
338 0.69
339 0.6
340 0.53
341 0.43
342 0.36
343 0.28
344 0.2
345 0.13
346 0.14
347 0.17
348 0.18
349 0.19
350 0.21
351 0.2
352 0.22
353 0.23
354 0.24
355 0.22
356 0.27
357 0.32
358 0.41
359 0.5
360 0.58
361 0.68
362 0.76
363 0.85
364 0.88
365 0.92