Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Z5ST40

Protein Details
Accession A0A1Z5ST40    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
142-162EERRAKMRKVLKKIGTRKGKVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
143-161ERRAKMRKVLKKIGTRKGK
Subcellular Location(s) nucl 9, mito 8, cyto_nucl 8, cyto 5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019680  Mediator_Med1  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF10744  Med1  
Amino Acid Sequences MATPTPSHPSNPTSASKKHGQHAATPMNFSSPAPRSVPSPAATRKEQAGKTPVNHPTTGSTGSKTLGGTPMVQNLSQSGNATGISPNTNLMGFGTPVGLGVEGLTPSQLNMPTPAMGGVPMNMTMSDLGITASGGQKRNEDEERRAKMRKVLKKIGTRKGKVSEDGIARIGRRVGFDNDIDQETLSPDELARRAGNRTISTAGQKLVIDIHMKDHVPQKVQIAFDTENQHLEAQADTAAKVLFNDLCPPDGVPLTGSLDKYATNLGRLAKIDKLCHNQVNCFEALSGVYVSLRRLFEQEAKIADDIQVMRTRSGRPTMNANGRLGLNLEYWQSAPAKSRDDSEMEVDGRGENNEAEGDDIYKLRIAIEPSHAGLYPPIRLSDKWLPDPLELPSTDSESPAQIPWLDPEATLIAANSDGNAMAIDSNQKTPDLRFVAKVEPPIILPYQIACNVLSTVGVPQPQVFIPQAWHSMLLDPSSSLPFDAGRDNKTLHAEKRVLNMTSDGAEDETTHHYTLDIIKSDIGFKLEELPFSHPCQLVEILPVLRQWACFGSLIQDAMGKGHQSPKAEMTSEQQPPLTLADILTPPATPAEPTADTLPVSLTAATPGVPTLSLSFPSASSTAVVTVTAQVLPNAELVVTGQQGLPEKLDNHKISKALGLVGGDLGVWVEWLRSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.5
3 0.54
4 0.57
5 0.58
6 0.6
7 0.54
8 0.54
9 0.6
10 0.64
11 0.57
12 0.53
13 0.47
14 0.42
15 0.41
16 0.34
17 0.33
18 0.26
19 0.28
20 0.28
21 0.29
22 0.28
23 0.33
24 0.38
25 0.33
26 0.38
27 0.41
28 0.45
29 0.48
30 0.48
31 0.5
32 0.53
33 0.53
34 0.52
35 0.53
36 0.53
37 0.53
38 0.59
39 0.6
40 0.55
41 0.53
42 0.47
43 0.43
44 0.4
45 0.42
46 0.35
47 0.29
48 0.26
49 0.27
50 0.27
51 0.24
52 0.21
53 0.2
54 0.19
55 0.2
56 0.2
57 0.25
58 0.25
59 0.25
60 0.23
61 0.21
62 0.22
63 0.2
64 0.19
65 0.14
66 0.13
67 0.13
68 0.14
69 0.14
70 0.13
71 0.14
72 0.13
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.12
77 0.12
78 0.12
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.08
83 0.09
84 0.09
85 0.07
86 0.05
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.12
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.14
102 0.11
103 0.11
104 0.1
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.07
110 0.08
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.06
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.06
119 0.1
120 0.15
121 0.17
122 0.18
123 0.21
124 0.24
125 0.3
126 0.36
127 0.37
128 0.42
129 0.49
130 0.55
131 0.59
132 0.61
133 0.57
134 0.57
135 0.62
136 0.62
137 0.62
138 0.64
139 0.67
140 0.73
141 0.8
142 0.82
143 0.83
144 0.77
145 0.74
146 0.73
147 0.68
148 0.6
149 0.54
150 0.5
151 0.42
152 0.41
153 0.36
154 0.3
155 0.26
156 0.25
157 0.25
158 0.19
159 0.18
160 0.19
161 0.2
162 0.21
163 0.22
164 0.23
165 0.23
166 0.23
167 0.22
168 0.18
169 0.15
170 0.13
171 0.13
172 0.1
173 0.08
174 0.07
175 0.1
176 0.1
177 0.13
178 0.13
179 0.14
180 0.16
181 0.2
182 0.24
183 0.22
184 0.24
185 0.24
186 0.25
187 0.26
188 0.25
189 0.23
190 0.2
191 0.19
192 0.17
193 0.15
194 0.15
195 0.14
196 0.12
197 0.14
198 0.15
199 0.15
200 0.18
201 0.23
202 0.24
203 0.25
204 0.26
205 0.28
206 0.29
207 0.29
208 0.27
209 0.26
210 0.24
211 0.26
212 0.28
213 0.24
214 0.22
215 0.22
216 0.21
217 0.17
218 0.16
219 0.11
220 0.08
221 0.09
222 0.08
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.11
232 0.11
233 0.12
234 0.12
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.07
240 0.08
241 0.11
242 0.12
243 0.12
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.12
248 0.14
249 0.11
250 0.1
251 0.12
252 0.13
253 0.15
254 0.16
255 0.17
256 0.18
257 0.2
258 0.22
259 0.25
260 0.3
261 0.32
262 0.35
263 0.35
264 0.33
265 0.33
266 0.33
267 0.27
268 0.22
269 0.18
270 0.13
271 0.12
272 0.1
273 0.08
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.06
278 0.09
279 0.1
280 0.09
281 0.11
282 0.13
283 0.18
284 0.19
285 0.21
286 0.19
287 0.2
288 0.19
289 0.18
290 0.16
291 0.13
292 0.11
293 0.11
294 0.14
295 0.13
296 0.14
297 0.15
298 0.17
299 0.17
300 0.21
301 0.21
302 0.18
303 0.24
304 0.3
305 0.36
306 0.37
307 0.35
308 0.32
309 0.3
310 0.28
311 0.23
312 0.18
313 0.11
314 0.09
315 0.09
316 0.08
317 0.08
318 0.09
319 0.09
320 0.08
321 0.11
322 0.12
323 0.15
324 0.15
325 0.17
326 0.17
327 0.18
328 0.19
329 0.18
330 0.18
331 0.15
332 0.15
333 0.13
334 0.12
335 0.1
336 0.09
337 0.08
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.08
352 0.09
353 0.1
354 0.12
355 0.14
356 0.14
357 0.15
358 0.14
359 0.12
360 0.12
361 0.12
362 0.1
363 0.1
364 0.11
365 0.11
366 0.11
367 0.18
368 0.24
369 0.27
370 0.28
371 0.3
372 0.31
373 0.3
374 0.31
375 0.25
376 0.21
377 0.17
378 0.16
379 0.14
380 0.16
381 0.15
382 0.15
383 0.14
384 0.12
385 0.13
386 0.11
387 0.11
388 0.08
389 0.08
390 0.09
391 0.11
392 0.1
393 0.09
394 0.1
395 0.1
396 0.1
397 0.09
398 0.08
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.03
409 0.04
410 0.07
411 0.08
412 0.09
413 0.1
414 0.11
415 0.11
416 0.12
417 0.19
418 0.2
419 0.2
420 0.21
421 0.23
422 0.27
423 0.28
424 0.3
425 0.24
426 0.2
427 0.19
428 0.19
429 0.16
430 0.13
431 0.11
432 0.1
433 0.11
434 0.12
435 0.12
436 0.1
437 0.1
438 0.1
439 0.1
440 0.09
441 0.07
442 0.08
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.1
448 0.1
449 0.12
450 0.12
451 0.1
452 0.12
453 0.14
454 0.16
455 0.15
456 0.16
457 0.14
458 0.15
459 0.15
460 0.14
461 0.12
462 0.1
463 0.1
464 0.11
465 0.1
466 0.08
467 0.08
468 0.08
469 0.09
470 0.15
471 0.16
472 0.18
473 0.2
474 0.21
475 0.23
476 0.29
477 0.33
478 0.29
479 0.34
480 0.36
481 0.36
482 0.41
483 0.44
484 0.39
485 0.34
486 0.33
487 0.26
488 0.23
489 0.2
490 0.15
491 0.1
492 0.1
493 0.09
494 0.1
495 0.14
496 0.14
497 0.14
498 0.14
499 0.13
500 0.14
501 0.18
502 0.2
503 0.17
504 0.16
505 0.17
506 0.17
507 0.19
508 0.18
509 0.15
510 0.11
511 0.1
512 0.18
513 0.17
514 0.19
515 0.2
516 0.24
517 0.25
518 0.28
519 0.33
520 0.26
521 0.25
522 0.27
523 0.26
524 0.21
525 0.2
526 0.2
527 0.16
528 0.16
529 0.16
530 0.15
531 0.14
532 0.13
533 0.13
534 0.12
535 0.13
536 0.12
537 0.13
538 0.14
539 0.15
540 0.15
541 0.14
542 0.14
543 0.12
544 0.13
545 0.14
546 0.11
547 0.12
548 0.18
549 0.21
550 0.22
551 0.25
552 0.28
553 0.31
554 0.31
555 0.31
556 0.29
557 0.35
558 0.36
559 0.35
560 0.31
561 0.27
562 0.27
563 0.27
564 0.24
565 0.15
566 0.12
567 0.13
568 0.13
569 0.14
570 0.13
571 0.12
572 0.11
573 0.12
574 0.12
575 0.09
576 0.1
577 0.14
578 0.15
579 0.17
580 0.19
581 0.19
582 0.19
583 0.19
584 0.18
585 0.13
586 0.12
587 0.11
588 0.09
589 0.09
590 0.09
591 0.09
592 0.08
593 0.08
594 0.08
595 0.07
596 0.08
597 0.1
598 0.11
599 0.12
600 0.13
601 0.14
602 0.14
603 0.16
604 0.16
605 0.14
606 0.13
607 0.12
608 0.12
609 0.11
610 0.11
611 0.09
612 0.1
613 0.11
614 0.11
615 0.11
616 0.1
617 0.11
618 0.12
619 0.12
620 0.1
621 0.09
622 0.07
623 0.08
624 0.1
625 0.09
626 0.09
627 0.09
628 0.12
629 0.15
630 0.16
631 0.17
632 0.18
633 0.2
634 0.26
635 0.35
636 0.37
637 0.38
638 0.42
639 0.41
640 0.39
641 0.4
642 0.36
643 0.28
644 0.26
645 0.21
646 0.18
647 0.17
648 0.15
649 0.11
650 0.09
651 0.07
652 0.05
653 0.05
654 0.04