Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Z5TIM1

Protein Details
Accession A0A1Z5TIM1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-130YQSVDERMDRRRKARREAREQQEREDBasic
162-184EVGDLTGRNRRNKQNERQRFYAVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
114-120RRRKARR
Subcellular Location(s) mito 8.5cyto_mito 8.5, cyto 7.5, nucl 7, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR036291  NAD(P)-bd_dom_sf  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF14559  TPR_19  
Amino Acid Sequences MSGRKDFLSQKAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEEQLKEALAKRAAALGTSAPTAYGVGKKKDDEAEEEQFQDAENEEGLFATGNYDREDDEADRIYQSVDERMDRRRKARREAREQQEREDYERNNPKIQQQFADLKRALGTVSDEDWANIPEVGDLTGRNRRNKQNERQRFYAVPDTVLAGARDGAQMGTEVQDEGMATEAGGAGAEQADGTMTNFADIGAARNRVMQVRLDAAAQSQQQDTSGAASVAGGGTSTSVDPKGYLTSLTKTEMKASEIPVGDIKRARVLLESVIKRNPRHGPGWIAAARLEEFAGKAQSAQNVIRRGTEMCPKSEDVWLEAIRLSASHGNKANAKILAANAIKSNDRSVKLWVEAMGLEDQPLAKKRVLRKALDHIPQSVAIWKEAVNLEEDPSDAKLMLAKATEIIPLSVELWLALARLETPEEAQKVLNKARKAVPASFEIWIAAARLQEQTGQTQMVAKVMERGVKSLARESAMLKREEWISQAEICEEEGAVLTCQAIIRETLGWGLDEDDDRKQIWLDDAKASTNRGRYETARAIYAYAIRVFYNLKSCPTSEVLWMQLAREKWQAGEIDEARKVLGLAFQANPGNEDIWLAAVKLEAENGETDKARALLAEARGEAGTDRVWIKSVAFERQINKSSDEALALVNEGLQLYPKAAKLWMMKGQIYESRNMLPQAREAFNTGTRACPRSVPLWLLASRLEEKMGVLVKARSILDRARLAVKGSPELWTESVRLEYRAKNLAAANQKMAQALQECPTSGLVWSERIWHLEARTQRKPRILEAIQKADNDPILFVTAARIFWGERKLEKADGWFQKAVVLDPNLGDTWGWYYKFACQHGTEEKREEIVSKCVMNDPKHGEPKPPPGAAIWSNAQDLVDTNAALLRNFLGALDTANITPKRFLLQTGAKNYGVHLGPTRTPHVESDPRVTLDPNFYYPQEDALFEWCKKHPGTHWNVICPAWIIGATTNAAMNALHPLAVYAAVQAWKGESFKYNGDFDAWMGVGEYSSAMLTGYLSEWAVLEDKCKDQKFNASDTSPLPMNRLWPELARWYDCKQFDGPELDESKITTIDPGNVPTPLGYGPSRKMRFNFLLVKWAEQPENKKAWEEIMQKHKLTHNPFEDIESHFSFGDAAAIGAPNILSMNKARCFGWTGHVDTLESLHKAYSELYRVGMLPPMVADARPLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.4
3 0.36
4 0.33
5 0.25
6 0.18
7 0.16
8 0.15
9 0.13
10 0.13
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.21
19 0.23
20 0.25
21 0.3
22 0.31
23 0.29
24 0.31
25 0.33
26 0.31
27 0.36
28 0.39
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.28
37 0.28
38 0.27
39 0.31
40 0.3
41 0.24
42 0.21
43 0.17
44 0.16
45 0.16
46 0.16
47 0.11
48 0.11
49 0.12
50 0.13
51 0.18
52 0.22
53 0.27
54 0.31
55 0.33
56 0.37
57 0.42
58 0.42
59 0.42
60 0.43
61 0.45
62 0.44
63 0.44
64 0.39
65 0.34
66 0.31
67 0.24
68 0.18
69 0.12
70 0.1
71 0.09
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.06
77 0.08
78 0.1
79 0.11
80 0.13
81 0.14
82 0.14
83 0.15
84 0.19
85 0.18
86 0.19
87 0.2
88 0.19
89 0.19
90 0.19
91 0.18
92 0.17
93 0.17
94 0.18
95 0.18
96 0.23
97 0.25
98 0.35
99 0.44
100 0.49
101 0.57
102 0.62
103 0.68
104 0.74
105 0.81
106 0.82
107 0.84
108 0.88
109 0.89
110 0.9
111 0.84
112 0.79
113 0.79
114 0.71
115 0.66
116 0.63
117 0.54
118 0.53
119 0.61
120 0.58
121 0.54
122 0.54
123 0.56
124 0.57
125 0.59
126 0.51
127 0.48
128 0.54
129 0.5
130 0.57
131 0.49
132 0.42
133 0.39
134 0.36
135 0.29
136 0.21
137 0.21
138 0.15
139 0.16
140 0.16
141 0.15
142 0.15
143 0.16
144 0.16
145 0.14
146 0.11
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.1
151 0.09
152 0.09
153 0.13
154 0.21
155 0.27
156 0.35
157 0.43
158 0.51
159 0.62
160 0.71
161 0.78
162 0.81
163 0.86
164 0.85
165 0.82
166 0.79
167 0.7
168 0.66
169 0.64
170 0.53
171 0.43
172 0.36
173 0.33
174 0.28
175 0.27
176 0.21
177 0.12
178 0.12
179 0.11
180 0.1
181 0.09
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.07
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.04
201 0.03
202 0.03
203 0.04
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.04
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.1
217 0.12
218 0.14
219 0.14
220 0.16
221 0.18
222 0.19
223 0.21
224 0.19
225 0.18
226 0.19
227 0.2
228 0.19
229 0.17
230 0.16
231 0.19
232 0.18
233 0.17
234 0.15
235 0.14
236 0.14
237 0.14
238 0.14
239 0.11
240 0.11
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.07
246 0.06
247 0.04
248 0.03
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.09
257 0.1
258 0.1
259 0.12
260 0.13
261 0.16
262 0.18
263 0.21
264 0.23
265 0.21
266 0.26
267 0.25
268 0.26
269 0.26
270 0.26
271 0.28
272 0.26
273 0.27
274 0.27
275 0.26
276 0.25
277 0.25
278 0.23
279 0.21
280 0.21
281 0.21
282 0.18
283 0.18
284 0.21
285 0.27
286 0.3
287 0.3
288 0.35
289 0.4
290 0.39
291 0.44
292 0.46
293 0.42
294 0.41
295 0.41
296 0.41
297 0.38
298 0.45
299 0.39
300 0.33
301 0.29
302 0.27
303 0.24
304 0.18
305 0.17
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.1
310 0.08
311 0.09
312 0.1
313 0.12
314 0.15
315 0.18
316 0.22
317 0.25
318 0.26
319 0.26
320 0.25
321 0.26
322 0.26
323 0.32
324 0.28
325 0.26
326 0.29
327 0.3
328 0.3
329 0.31
330 0.28
331 0.22
332 0.24
333 0.22
334 0.2
335 0.18
336 0.16
337 0.13
338 0.12
339 0.12
340 0.13
341 0.14
342 0.18
343 0.21
344 0.23
345 0.27
346 0.29
347 0.31
348 0.25
349 0.25
350 0.21
351 0.18
352 0.23
353 0.2
354 0.19
355 0.17
356 0.18
357 0.19
358 0.19
359 0.23
360 0.2
361 0.22
362 0.22
363 0.24
364 0.25
365 0.25
366 0.26
367 0.22
368 0.18
369 0.16
370 0.16
371 0.14
372 0.11
373 0.1
374 0.09
375 0.08
376 0.1
377 0.13
378 0.14
379 0.14
380 0.19
381 0.26
382 0.36
383 0.43
384 0.44
385 0.47
386 0.53
387 0.6
388 0.61
389 0.56
390 0.48
391 0.42
392 0.39
393 0.34
394 0.29
395 0.21
396 0.15
397 0.14
398 0.12
399 0.13
400 0.14
401 0.14
402 0.12
403 0.11
404 0.12
405 0.12
406 0.12
407 0.09
408 0.09
409 0.09
410 0.07
411 0.06
412 0.08
413 0.08
414 0.09
415 0.08
416 0.08
417 0.08
418 0.09
419 0.1
420 0.08
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.06
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.05
436 0.05
437 0.06
438 0.09
439 0.1
440 0.11
441 0.11
442 0.14
443 0.18
444 0.24
445 0.28
446 0.25
447 0.29
448 0.32
449 0.38
450 0.38
451 0.37
452 0.33
453 0.32
454 0.33
455 0.3
456 0.25
457 0.19
458 0.16
459 0.13
460 0.11
461 0.08
462 0.06
463 0.07
464 0.07
465 0.07
466 0.09
467 0.1
468 0.1
469 0.1
470 0.1
471 0.1
472 0.12
473 0.12
474 0.11
475 0.11
476 0.09
477 0.12
478 0.12
479 0.16
480 0.14
481 0.15
482 0.15
483 0.17
484 0.18
485 0.17
486 0.18
487 0.15
488 0.16
489 0.17
490 0.21
491 0.24
492 0.24
493 0.21
494 0.21
495 0.22
496 0.22
497 0.21
498 0.16
499 0.13
500 0.13
501 0.14
502 0.12
503 0.11
504 0.1
505 0.09
506 0.07
507 0.05
508 0.04
509 0.05
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.04
518 0.05
519 0.05
520 0.05
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.05
525 0.06
526 0.06
527 0.06
528 0.08
529 0.08
530 0.09
531 0.09
532 0.09
533 0.08
534 0.08
535 0.11
536 0.12
537 0.13
538 0.15
539 0.15
540 0.17
541 0.17
542 0.19
543 0.19
544 0.2
545 0.2
546 0.19
547 0.21
548 0.21
549 0.27
550 0.3
551 0.28
552 0.25
553 0.23
554 0.22
555 0.2
556 0.19
557 0.14
558 0.1
559 0.1
560 0.09
561 0.09
562 0.1
563 0.1
564 0.14
565 0.13
566 0.14
567 0.15
568 0.15
569 0.17
570 0.19
571 0.18
572 0.15
573 0.16
574 0.15
575 0.15
576 0.15
577 0.13
578 0.13
579 0.13
580 0.13
581 0.14
582 0.13
583 0.11
584 0.14
585 0.14
586 0.12
587 0.17
588 0.16
589 0.16
590 0.17
591 0.17
592 0.14
593 0.13
594 0.13
595 0.08
596 0.08
597 0.06
598 0.07
599 0.08
600 0.1
601 0.11
602 0.11
603 0.11
604 0.1
605 0.1
606 0.08
607 0.07
608 0.06
609 0.05
610 0.05
611 0.04
612 0.04
613 0.04
614 0.04
615 0.04
616 0.04
617 0.04
618 0.04
619 0.05
620 0.05
621 0.06
622 0.06
623 0.06
624 0.07
625 0.07
626 0.06
627 0.06
628 0.06
629 0.08
630 0.1
631 0.1
632 0.1
633 0.1
634 0.1
635 0.1
636 0.09
637 0.07
638 0.06
639 0.06
640 0.07
641 0.06
642 0.07
643 0.08
644 0.08
645 0.11
646 0.13
647 0.15
648 0.17
649 0.2
650 0.22
651 0.27
652 0.31
653 0.28
654 0.28
655 0.25
656 0.24
657 0.21
658 0.19
659 0.15
660 0.11
661 0.09
662 0.07
663 0.07
664 0.05
665 0.04
666 0.04
667 0.03
668 0.04
669 0.04
670 0.04
671 0.06
672 0.06
673 0.07
674 0.07
675 0.12
676 0.13
677 0.17
678 0.23
679 0.23
680 0.24
681 0.24
682 0.26
683 0.27
684 0.26
685 0.23
686 0.19
687 0.18
688 0.18
689 0.19
690 0.19
691 0.15
692 0.17
693 0.2
694 0.2
695 0.19
696 0.2
697 0.21
698 0.2
699 0.23
700 0.19
701 0.19
702 0.2
703 0.22
704 0.2
705 0.2
706 0.2
707 0.19
708 0.21
709 0.19
710 0.18
711 0.2
712 0.19
713 0.19
714 0.17
715 0.17
716 0.17
717 0.16
718 0.14
719 0.1
720 0.1
721 0.11
722 0.12
723 0.1
724 0.1
725 0.1
726 0.1
727 0.13
728 0.13
729 0.11
730 0.12
731 0.13
732 0.17
733 0.18
734 0.19
735 0.19
736 0.19
737 0.2
738 0.2
739 0.2
740 0.17
741 0.16
742 0.17
743 0.15
744 0.16
745 0.16
746 0.15
747 0.15
748 0.13
749 0.16
750 0.14
751 0.16
752 0.18
753 0.19
754 0.21
755 0.25
756 0.25
757 0.24
758 0.24
759 0.28
760 0.31
761 0.31
762 0.29
763 0.27
764 0.27
765 0.25
766 0.24
767 0.19
768 0.14
769 0.15
770 0.15
771 0.13
772 0.12
773 0.13
774 0.14
775 0.12
776 0.1
777 0.11
778 0.09
779 0.11
780 0.11
781 0.14
782 0.14
783 0.15
784 0.17
785 0.16
786 0.16
787 0.19
788 0.26
789 0.31
790 0.39
791 0.44
792 0.47
793 0.51
794 0.52
795 0.5
796 0.53
797 0.49
798 0.49
799 0.49
800 0.52
801 0.48
802 0.47
803 0.44
804 0.36
805 0.33
806 0.24
807 0.17
808 0.1
809 0.09
810 0.09
811 0.08
812 0.09
813 0.09
814 0.08
815 0.09
816 0.09
817 0.08
818 0.11
819 0.16
820 0.16
821 0.16
822 0.2
823 0.22
824 0.24
825 0.25
826 0.26
827 0.31
828 0.33
829 0.37
830 0.33
831 0.31
832 0.31
833 0.3
834 0.27
835 0.22
836 0.18
837 0.14
838 0.13
839 0.15
840 0.12
841 0.12
842 0.11
843 0.07
844 0.1
845 0.13
846 0.13
847 0.12
848 0.13
849 0.18
850 0.24
851 0.25
852 0.25
853 0.23
854 0.27
855 0.36
856 0.42
857 0.4
858 0.39
859 0.38
860 0.36
861 0.35
862 0.33
863 0.25
864 0.24
865 0.23
866 0.2
867 0.2
868 0.24
869 0.3
870 0.3
871 0.33
872 0.35
873 0.4
874 0.48
875 0.48
876 0.49
877 0.49
878 0.56
879 0.57
880 0.5
881 0.43
882 0.36
883 0.4
884 0.35
885 0.33
886 0.26
887 0.21
888 0.21
889 0.2
890 0.19
891 0.14
892 0.13
893 0.12
894 0.1
895 0.08
896 0.08
897 0.1
898 0.1
899 0.1
900 0.1
901 0.07
902 0.07
903 0.07
904 0.07
905 0.06
906 0.05
907 0.06
908 0.07
909 0.07
910 0.07
911 0.13
912 0.14
913 0.15
914 0.15
915 0.15
916 0.17
917 0.17
918 0.18
919 0.2
920 0.28
921 0.34
922 0.39
923 0.43
924 0.41
925 0.4
926 0.4
927 0.38
928 0.3
929 0.24
930 0.21
931 0.2
932 0.22
933 0.25
934 0.29
935 0.25
936 0.26
937 0.27
938 0.31
939 0.35
940 0.35
941 0.38
942 0.38
943 0.37
944 0.37
945 0.36
946 0.3
947 0.29
948 0.28
949 0.25
950 0.24
951 0.23
952 0.25
953 0.24
954 0.25
955 0.21
956 0.19
957 0.16
958 0.2
959 0.24
960 0.22
961 0.25
962 0.23
963 0.27
964 0.27
965 0.3
966 0.31
967 0.37
968 0.45
969 0.51
970 0.54
971 0.54
972 0.56
973 0.52
974 0.46
975 0.37
976 0.28
977 0.19
978 0.14
979 0.11
980 0.09
981 0.1
982 0.1
983 0.09
984 0.09
985 0.08
986 0.08
987 0.07
988 0.07
989 0.09
990 0.08
991 0.08
992 0.07
993 0.08
994 0.08
995 0.08
996 0.08
997 0.05
998 0.07
999 0.08
1000 0.08
1001 0.08
1002 0.09
1003 0.1
1004 0.11
1005 0.12
1006 0.14
1007 0.16
1008 0.2
1009 0.23
1010 0.24
1011 0.23
1012 0.24
1013 0.23
1014 0.2
1015 0.2
1016 0.15
1017 0.11
1018 0.11
1019 0.1
1020 0.08
1021 0.07
1022 0.07
1023 0.05
1024 0.05
1025 0.05
1026 0.04
1027 0.04
1028 0.04
1029 0.05
1030 0.05
1031 0.06
1032 0.06
1033 0.06
1034 0.06
1035 0.07
1036 0.1
1037 0.09
1038 0.11
1039 0.14
1040 0.19
1041 0.27
1042 0.29
1043 0.3
1044 0.31
1045 0.41
1046 0.43
1047 0.46
1048 0.47
1049 0.41
1050 0.42
1051 0.41
1052 0.41
1053 0.35
1054 0.31
1055 0.28
1056 0.22
1057 0.26
1058 0.26
1059 0.28
1060 0.26
1061 0.24
1062 0.27
1063 0.32
1064 0.36
1065 0.35
1066 0.36
1067 0.37
1068 0.43
1069 0.42
1070 0.42
1071 0.37
1072 0.35
1073 0.36
1074 0.38
1075 0.35
1076 0.34
1077 0.35
1078 0.33
1079 0.31
1080 0.29
1081 0.25
1082 0.2
1083 0.18
1084 0.14
1085 0.13
1086 0.17
1087 0.19
1088 0.21
1089 0.21
1090 0.21
1091 0.21
1092 0.18
1093 0.18
1094 0.14
1095 0.16
1096 0.15
1097 0.18
1098 0.24
1099 0.34
1100 0.38
1101 0.42
1102 0.43
1103 0.49
1104 0.51
1105 0.54
1106 0.56
1107 0.47
1108 0.53
1109 0.49
1110 0.5
1111 0.46
1112 0.45
1113 0.42
1114 0.39
1115 0.44
1116 0.43
1117 0.49
1118 0.46
1119 0.44
1120 0.41
1121 0.41
1122 0.45
1123 0.46
1124 0.46
1125 0.5
1126 0.55
1127 0.54
1128 0.57
1129 0.59
1130 0.59
1131 0.58
1132 0.59
1133 0.54
1134 0.53
1135 0.53
1136 0.52
1137 0.48
1138 0.44
1139 0.43
1140 0.34
1141 0.31
1142 0.25
1143 0.24
1144 0.21
1145 0.18
1146 0.16
1147 0.09
1148 0.08
1149 0.07
1150 0.07
1151 0.07
1152 0.07
1153 0.07
1154 0.06
1155 0.06
1156 0.06
1157 0.07
1158 0.12
1159 0.19
1160 0.22
1161 0.24
1162 0.24
1163 0.26
1164 0.3
1165 0.3
1166 0.34
1167 0.32
1168 0.34
1169 0.36
1170 0.37
1171 0.35
1172 0.31
1173 0.32
1174 0.28
1175 0.23
1176 0.19
1177 0.15
1178 0.14
1179 0.15
1180 0.17
1181 0.2
1182 0.21
1183 0.21
1184 0.22
1185 0.23
1186 0.23
1187 0.24
1188 0.25
1189 0.2
1190 0.15
1191 0.14
1192 0.16
1193 0.15
1194 0.14