Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Z5THI1

Protein Details
Accession A0A1Z5THI1    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
67-95EDDDEDAKQRRREKRKRRREQKEEEDEALAcidic
111-135REQGQSKFKRLKRGHREERKGSEARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
74-86KQRRREKRKRRRE
117-131KFKRLKRGHREERKG
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028083  Spt6_acidic_N_dom  
IPR028088  Spt6_HTH_DNA-bd_dom  
IPR023319  Tex-like_HTH_dom_sf  
IPR017072  TF_Spt6  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF14641  HTH_44  
PF14632  SPT6_acidic  
Amino Acid Sequences MEDFFDTRAAEGSDEEEEFDEETGEAVDRPRKKAENGDVGDSSEEEDDDDEEAERQVREGFIVDEEEDDDEDAKQRRREKRKRRREQKEEEDEALDEEDLDLIGIGGGEDREQGQSKFKRLKRGHREERKGSEARGVEDIFSDEEEGEGVAPAARGRGFGGFGQDEMDDFIEQDEFPDEEGGGLDEDLGIRAPTGRANFADIQKLQESGMDEATMEDFRGAFGDGDEFAWALEAEAEHNEENADPDKPLELKDVFEPSQLQEKMLTDEDNEIRMTDVPERLQLARRSHKPLDDLSPEELDERHSEEAAWISSTMFPRTRMENKFREPFEAAVKSVLDMMNRENFEPPFIFQNRKDFLIHSEQVPASPDPEHPNAPPYKVNAEKLLGQDDLWNILEQDLKFRAFLRAP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.15
3 0.14
4 0.14
5 0.14
6 0.13
7 0.11
8 0.09
9 0.09
10 0.08
11 0.08
12 0.08
13 0.12
14 0.19
15 0.23
16 0.27
17 0.35
18 0.38
19 0.42
20 0.51
21 0.57
22 0.6
23 0.59
24 0.6
25 0.54
26 0.5
27 0.47
28 0.37
29 0.29
30 0.19
31 0.15
32 0.1
33 0.09
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.08
38 0.09
39 0.1
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.11
46 0.11
47 0.11
48 0.11
49 0.12
50 0.12
51 0.11
52 0.12
53 0.12
54 0.11
55 0.1
56 0.1
57 0.08
58 0.13
59 0.18
60 0.23
61 0.28
62 0.36
63 0.46
64 0.57
65 0.68
66 0.75
67 0.81
68 0.86
69 0.93
70 0.95
71 0.96
72 0.96
73 0.96
74 0.95
75 0.94
76 0.89
77 0.8
78 0.7
79 0.59
80 0.49
81 0.38
82 0.27
83 0.16
84 0.1
85 0.08
86 0.06
87 0.05
88 0.04
89 0.03
90 0.03
91 0.03
92 0.03
93 0.03
94 0.03
95 0.03
96 0.04
97 0.05
98 0.07
99 0.09
100 0.1
101 0.19
102 0.23
103 0.31
104 0.4
105 0.43
106 0.52
107 0.58
108 0.68
109 0.7
110 0.78
111 0.81
112 0.83
113 0.89
114 0.86
115 0.85
116 0.82
117 0.73
118 0.63
119 0.58
120 0.48
121 0.41
122 0.36
123 0.29
124 0.22
125 0.19
126 0.19
127 0.13
128 0.12
129 0.1
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.07
145 0.08
146 0.08
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.11
151 0.1
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.04
180 0.06
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.12
185 0.15
186 0.16
187 0.19
188 0.17
189 0.19
190 0.18
191 0.18
192 0.15
193 0.13
194 0.14
195 0.11
196 0.11
197 0.08
198 0.08
199 0.07
200 0.08
201 0.07
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.04
222 0.04
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.07
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.1
236 0.13
237 0.12
238 0.12
239 0.15
240 0.19
241 0.18
242 0.18
243 0.19
244 0.16
245 0.24
246 0.23
247 0.22
248 0.19
249 0.19
250 0.21
251 0.21
252 0.2
253 0.12
254 0.17
255 0.17
256 0.17
257 0.16
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.14
262 0.13
263 0.14
264 0.13
265 0.15
266 0.17
267 0.18
268 0.24
269 0.28
270 0.33
271 0.4
272 0.45
273 0.51
274 0.52
275 0.54
276 0.51
277 0.48
278 0.47
279 0.44
280 0.41
281 0.36
282 0.33
283 0.3
284 0.28
285 0.24
286 0.19
287 0.15
288 0.15
289 0.14
290 0.13
291 0.13
292 0.13
293 0.14
294 0.13
295 0.12
296 0.09
297 0.09
298 0.13
299 0.15
300 0.18
301 0.18
302 0.19
303 0.21
304 0.28
305 0.36
306 0.4
307 0.47
308 0.52
309 0.58
310 0.64
311 0.63
312 0.61
313 0.55
314 0.49
315 0.49
316 0.43
317 0.35
318 0.29
319 0.28
320 0.23
321 0.23
322 0.22
323 0.15
324 0.13
325 0.16
326 0.2
327 0.21
328 0.22
329 0.23
330 0.23
331 0.25
332 0.25
333 0.23
334 0.25
335 0.28
336 0.33
337 0.32
338 0.42
339 0.41
340 0.43
341 0.42
342 0.36
343 0.38
344 0.41
345 0.4
346 0.32
347 0.35
348 0.32
349 0.32
350 0.34
351 0.29
352 0.21
353 0.21
354 0.23
355 0.24
356 0.28
357 0.3
358 0.27
359 0.35
360 0.37
361 0.39
362 0.39
363 0.36
364 0.41
365 0.44
366 0.47
367 0.44
368 0.43
369 0.44
370 0.43
371 0.42
372 0.34
373 0.28
374 0.28
375 0.24
376 0.24
377 0.21
378 0.19
379 0.15
380 0.16
381 0.21
382 0.17
383 0.22
384 0.23
385 0.22
386 0.23
387 0.24