Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Z5TDJ3

Protein Details
Accession A0A1Z5TDJ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
65-86ISSRAGPRSKKTRQRGDLEEEFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPKAKWIDKKNATTFSLVHRAQNDPLIHDQDAPSMVFAEKQQPRRPVDDVDDEDDYPYSSAGSVISSRAGPRSKKTRQRGDLEEEFGLSFKPHEGEAAQHGVFYDDTKYDYMQHMRDLGSGEGPVTWVEASAPADKKKGKQKLEDALRDMDIGRGAETQSVGGSSMASDAKSLLPEEVLPSEFVKKRSYQDQQDVPDDIAGFQPDMDPRLREVLEALDDEEYVDDEEDIFAELTKDGHEVERDEWEYLGEQQAFDEGESQLGDNGWESDDTIRAASPPPNLQPADFVPQDGEDAKPPEDPQAQLPADPTGGAWIEEMKKFKAEDKAAKAQNKGHAAAAPSAIESSALSSLASGMQKKRKGAKTSTDNYSMTSSALARTDQQTLLDARFDKIIEEEDEMDEMADDEASGLGDNASMASGLTGMSKASKASKYSNMSGLSGVSGISSYSRATDSEAPQLQRSDFNSIMDDFLGNYSTTGKAARRVKRGGPQSGMEQLDEIRSNLGPARLRGKGAARAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.56
3 0.56
4 0.47
5 0.44
6 0.4
7 0.41
8 0.4
9 0.45
10 0.39
11 0.33
12 0.38
13 0.38
14 0.35
15 0.34
16 0.32
17 0.28
18 0.28
19 0.24
20 0.19
21 0.15
22 0.14
23 0.14
24 0.15
25 0.22
26 0.28
27 0.36
28 0.44
29 0.5
30 0.55
31 0.58
32 0.6
33 0.56
34 0.55
35 0.56
36 0.53
37 0.49
38 0.47
39 0.42
40 0.4
41 0.34
42 0.28
43 0.19
44 0.14
45 0.1
46 0.07
47 0.07
48 0.06
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.1
53 0.11
54 0.13
55 0.19
56 0.25
57 0.27
58 0.35
59 0.45
60 0.53
61 0.63
62 0.72
63 0.77
64 0.79
65 0.83
66 0.82
67 0.8
68 0.76
69 0.7
70 0.6
71 0.5
72 0.41
73 0.33
74 0.26
75 0.17
76 0.12
77 0.09
78 0.09
79 0.08
80 0.1
81 0.1
82 0.12
83 0.16
84 0.21
85 0.19
86 0.18
87 0.18
88 0.18
89 0.17
90 0.16
91 0.14
92 0.09
93 0.11
94 0.12
95 0.12
96 0.14
97 0.18
98 0.22
99 0.22
100 0.23
101 0.24
102 0.24
103 0.25
104 0.24
105 0.2
106 0.16
107 0.15
108 0.13
109 0.1
110 0.1
111 0.08
112 0.07
113 0.06
114 0.05
115 0.05
116 0.07
117 0.09
118 0.14
119 0.18
120 0.19
121 0.24
122 0.27
123 0.33
124 0.42
125 0.49
126 0.5
127 0.55
128 0.61
129 0.67
130 0.74
131 0.73
132 0.66
133 0.6
134 0.53
135 0.45
136 0.37
137 0.28
138 0.2
139 0.14
140 0.11
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.1
168 0.16
169 0.18
170 0.2
171 0.22
172 0.23
173 0.26
174 0.34
175 0.41
176 0.41
177 0.46
178 0.51
179 0.51
180 0.51
181 0.49
182 0.4
183 0.34
184 0.27
185 0.2
186 0.14
187 0.1
188 0.07
189 0.06
190 0.07
191 0.07
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.1
196 0.14
197 0.14
198 0.12
199 0.12
200 0.11
201 0.12
202 0.11
203 0.11
204 0.08
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.05
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.07
226 0.08
227 0.09
228 0.12
229 0.13
230 0.12
231 0.12
232 0.11
233 0.11
234 0.1
235 0.12
236 0.09
237 0.08
238 0.07
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.08
243 0.05
244 0.05
245 0.06
246 0.06
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.05
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.08
262 0.09
263 0.11
264 0.13
265 0.14
266 0.18
267 0.18
268 0.18
269 0.18
270 0.18
271 0.21
272 0.19
273 0.17
274 0.13
275 0.13
276 0.14
277 0.12
278 0.11
279 0.08
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.12
284 0.15
285 0.16
286 0.17
287 0.16
288 0.22
289 0.22
290 0.21
291 0.22
292 0.18
293 0.16
294 0.15
295 0.13
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.06
300 0.07
301 0.1
302 0.12
303 0.14
304 0.13
305 0.15
306 0.15
307 0.19
308 0.25
309 0.28
310 0.34
311 0.39
312 0.47
313 0.52
314 0.55
315 0.54
316 0.5
317 0.51
318 0.47
319 0.41
320 0.33
321 0.29
322 0.27
323 0.25
324 0.22
325 0.16
326 0.12
327 0.11
328 0.1
329 0.08
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.08
338 0.1
339 0.12
340 0.17
341 0.24
342 0.28
343 0.33
344 0.42
345 0.48
346 0.53
347 0.57
348 0.61
349 0.63
350 0.67
351 0.67
352 0.63
353 0.56
354 0.5
355 0.46
356 0.36
357 0.27
358 0.21
359 0.16
360 0.12
361 0.13
362 0.12
363 0.12
364 0.14
365 0.16
366 0.15
367 0.15
368 0.17
369 0.17
370 0.18
371 0.19
372 0.18
373 0.15
374 0.17
375 0.16
376 0.14
377 0.13
378 0.15
379 0.13
380 0.14
381 0.15
382 0.14
383 0.14
384 0.13
385 0.12
386 0.09
387 0.08
388 0.06
389 0.05
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.05
409 0.06
410 0.07
411 0.09
412 0.14
413 0.17
414 0.2
415 0.26
416 0.34
417 0.39
418 0.42
419 0.46
420 0.43
421 0.4
422 0.37
423 0.32
424 0.24
425 0.18
426 0.15
427 0.08
428 0.07
429 0.06
430 0.06
431 0.07
432 0.06
433 0.08
434 0.09
435 0.09
436 0.14
437 0.2
438 0.22
439 0.3
440 0.36
441 0.36
442 0.38
443 0.4
444 0.37
445 0.36
446 0.36
447 0.34
448 0.3
449 0.29
450 0.29
451 0.27
452 0.27
453 0.22
454 0.19
455 0.13
456 0.12
457 0.12
458 0.1
459 0.09
460 0.1
461 0.1
462 0.11
463 0.15
464 0.16
465 0.23
466 0.33
467 0.41
468 0.47
469 0.53
470 0.6
471 0.65
472 0.72
473 0.72
474 0.68
475 0.63
476 0.59
477 0.6
478 0.54
479 0.45
480 0.37
481 0.29
482 0.29
483 0.27
484 0.22
485 0.17
486 0.15
487 0.17
488 0.19
489 0.24
490 0.23
491 0.26
492 0.32
493 0.33
494 0.35
495 0.38
496 0.41