Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Z5TRM5

Protein Details
Accession A0A1Z5TRM5    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
353-379HSEAESGKKSKKKRKEKQPVDPIADTVHydrophilic
399-428GKDGASKDEKARRKEEKRKKKQAKVKDTAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-8K
359-369GKKSKKKRKEK
403-424ASKDEKARRKEEKRKKKQAKVK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MAKTKEKKAKAPKDSAAPAQNGKQSNASQPAQAKSAHLSQEYVADSGDEDAPAESSRTKKVNSEPASQAQKMDTAKASTESSSESSEEDDSESEEELAKDPVESNSKHNKATTNGVKRKSDESSSSDEESEEEAEEQRQPKKAKTDSQPLPKSRPELQSRQYIESRDWRPLSEQSLRGKQIWHITAPSDVPLSSITEVASDAIQSARTVVSHGGAEYMLSEDNLGMGNNFVMLPGREGYRPVQQRLDRTLHLQQKITLPELSSLQASEATGSAAAGDVAEAAVSTTRPQPKGLRMRYKPSGYGAGEPGMIGASDSETEGHKSGAGKKGFQFPKSLGAHGTSEHATKEGNIKQHSEAESGKKSKKKRKEKQPVDPIADTVMKDDEASKTNAGAEAEAAAGKDGASKDEKARRKEEKRKKKQAKVKDTAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.77
3 0.72
4 0.66
5 0.61
6 0.57
7 0.57
8 0.5
9 0.47
10 0.45
11 0.4
12 0.43
13 0.46
14 0.42
15 0.41
16 0.44
17 0.44
18 0.41
19 0.39
20 0.34
21 0.3
22 0.35
23 0.33
24 0.29
25 0.27
26 0.25
27 0.29
28 0.29
29 0.25
30 0.19
31 0.15
32 0.14
33 0.15
34 0.15
35 0.09
36 0.08
37 0.08
38 0.09
39 0.1
40 0.11
41 0.12
42 0.14
43 0.2
44 0.23
45 0.25
46 0.3
47 0.38
48 0.47
49 0.49
50 0.54
51 0.54
52 0.58
53 0.64
54 0.58
55 0.52
56 0.42
57 0.42
58 0.35
59 0.33
60 0.27
61 0.22
62 0.22
63 0.24
64 0.24
65 0.19
66 0.19
67 0.19
68 0.18
69 0.18
70 0.17
71 0.15
72 0.16
73 0.16
74 0.15
75 0.13
76 0.12
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.11
85 0.1
86 0.09
87 0.1
88 0.13
89 0.17
90 0.18
91 0.24
92 0.34
93 0.37
94 0.38
95 0.39
96 0.4
97 0.38
98 0.47
99 0.5
100 0.5
101 0.54
102 0.59
103 0.6
104 0.59
105 0.6
106 0.54
107 0.48
108 0.42
109 0.39
110 0.4
111 0.4
112 0.39
113 0.35
114 0.31
115 0.27
116 0.24
117 0.2
118 0.14
119 0.1
120 0.09
121 0.1
122 0.14
123 0.16
124 0.19
125 0.24
126 0.26
127 0.3
128 0.38
129 0.43
130 0.48
131 0.52
132 0.59
133 0.61
134 0.7
135 0.74
136 0.69
137 0.69
138 0.63
139 0.6
140 0.57
141 0.57
142 0.53
143 0.52
144 0.52
145 0.56
146 0.56
147 0.56
148 0.51
149 0.44
150 0.41
151 0.42
152 0.4
153 0.37
154 0.35
155 0.31
156 0.31
157 0.33
158 0.35
159 0.32
160 0.35
161 0.34
162 0.4
163 0.41
164 0.39
165 0.37
166 0.34
167 0.35
168 0.31
169 0.26
170 0.21
171 0.2
172 0.2
173 0.2
174 0.17
175 0.11
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.09
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.06
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.04
192 0.05
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.03
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.09
225 0.11
226 0.19
227 0.23
228 0.24
229 0.3
230 0.32
231 0.36
232 0.4
233 0.42
234 0.35
235 0.36
236 0.41
237 0.41
238 0.41
239 0.38
240 0.34
241 0.35
242 0.36
243 0.33
244 0.26
245 0.2
246 0.18
247 0.19
248 0.17
249 0.12
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.08
254 0.07
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.03
263 0.03
264 0.02
265 0.02
266 0.02
267 0.02
268 0.02
269 0.03
270 0.03
271 0.05
272 0.11
273 0.16
274 0.17
275 0.21
276 0.25
277 0.34
278 0.44
279 0.53
280 0.58
281 0.58
282 0.65
283 0.7
284 0.69
285 0.62
286 0.55
287 0.52
288 0.43
289 0.41
290 0.35
291 0.28
292 0.24
293 0.22
294 0.18
295 0.11
296 0.09
297 0.06
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.06
304 0.08
305 0.09
306 0.09
307 0.1
308 0.13
309 0.19
310 0.26
311 0.27
312 0.29
313 0.31
314 0.42
315 0.44
316 0.43
317 0.41
318 0.34
319 0.42
320 0.41
321 0.39
322 0.3
323 0.28
324 0.28
325 0.25
326 0.26
327 0.18
328 0.17
329 0.16
330 0.15
331 0.13
332 0.13
333 0.2
334 0.21
335 0.27
336 0.28
337 0.31
338 0.33
339 0.39
340 0.4
341 0.36
342 0.36
343 0.36
344 0.42
345 0.46
346 0.51
347 0.52
348 0.6
349 0.67
350 0.73
351 0.78
352 0.8
353 0.85
354 0.89
355 0.93
356 0.94
357 0.95
358 0.94
359 0.9
360 0.8
361 0.69
362 0.62
363 0.54
364 0.42
365 0.33
366 0.25
367 0.17
368 0.16
369 0.17
370 0.16
371 0.17
372 0.19
373 0.18
374 0.18
375 0.19
376 0.21
377 0.19
378 0.16
379 0.13
380 0.11
381 0.11
382 0.11
383 0.1
384 0.08
385 0.07
386 0.07
387 0.1
388 0.1
389 0.13
390 0.16
391 0.19
392 0.27
393 0.37
394 0.45
395 0.49
396 0.58
397 0.65
398 0.73
399 0.82
400 0.84
401 0.87
402 0.9
403 0.94
404 0.96
405 0.96
406 0.95
407 0.95
408 0.95