FuNGI

A0A1Z5TJ52

Protein Details

Accession

A0A1Z5TJ52

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-20	MTKRRRERDRPKSGPESIYN	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
5-8	RRER

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto_nucl 9.5, mito 8, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MTKRRRERDRPKSGPESIYNPNKRVLLSYGSDEEQDDDNVEQPTGTGHPGAVDANVANYQIPAYDEDEEEAEPADQIEEKTAAGVNGSSEPVAQKEKGRSNRNVRRNELTGQMPAIGSLSYQWEEDEDGEIDDDYDSTEEEAMAYLRATLPTILTAPQSTDNAELYESGLGDTRGHLADGTFTAQRPIGPSVPEMAETAIDAQNAYTKVLTQRFLRQREEMHRPPNQGAIASLDDDHPITCPAHSPKARAEWTRLLTSTSPQTAQVKAMDRDTVYSILSIVQEIHMKRSTEIATCTGAWIWALISRLDDVGTMDNDQVSSLRELGKKAVLVQLSFRDSDAAQQLEAVGADEKKAVSDEKDLKPEDDCKPANSSNGSSIVEGHHEVDGNLSRETTLATLDMIISIVGDVFGQRDLLEFRHQWQPEQAMSRGAEAG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.81
2	0.75
3	0.7
4	0.68
5	0.7
6	0.67
7	0.61
8	0.58
9	0.53
10	0.48
11	0.45
12	0.4
13	0.34
14	0.31
15	0.33
16	0.32
17	0.31
18	0.31
19	0.28
20	0.27
21	0.22
22	0.2
23	0.17
24	0.14
25	0.16
26	0.16
27	0.15
28	0.12
29	0.11
30	0.12
31	0.12
32	0.12
33	0.1
34	0.09
35	0.1
36	0.11
37	0.11
38	0.1
39	0.09
40	0.08
41	0.09
42	0.1
43	0.1
44	0.09
45	0.08
46	0.08
47	0.08
48	0.09
49	0.09
50	0.11
51	0.13
52	0.13
53	0.14
54	0.15
55	0.15
56	0.14
57	0.12
58	0.1
59	0.08
60	0.08
61	0.07
62	0.07
63	0.07
64	0.09
65	0.09
66	0.09
67	0.09
68	0.1
69	0.09
70	0.09
71	0.09
72	0.08
73	0.09
74	0.1
75	0.09
76	0.09
77	0.09
78	0.12
79	0.15
80	0.16
81	0.19
82	0.27
83	0.36
84	0.45
85	0.52
86	0.59
87	0.67
88	0.75
89	0.79
90	0.8
91	0.77
92	0.74
93	0.7
94	0.63
95	0.57
96	0.5
97	0.42
98	0.34
99	0.29
100	0.22
101	0.18
102	0.16
103	0.1
104	0.07
105	0.06
106	0.09
107	0.08
108	0.08
109	0.08
110	0.08
111	0.1
112	0.1
113	0.11
114	0.09
115	0.09
116	0.09
117	0.09
118	0.08
119	0.07
120	0.07
121	0.05
122	0.05
123	0.05
124	0.05
125	0.05
126	0.04
127	0.04
128	0.05
129	0.05
130	0.05
131	0.05
132	0.05
133	0.05
134	0.05
135	0.06
136	0.06
137	0.06
138	0.06
139	0.07
140	0.07
141	0.08
142	0.08
143	0.09
144	0.11
145	0.11
146	0.11
147	0.12
148	0.11
149	0.11
150	0.11
151	0.1
152	0.08
153	0.08
154	0.07
155	0.06
156	0.06
157	0.06
158	0.06
159	0.07
160	0.07
161	0.07
162	0.07
163	0.07
164	0.06
165	0.07
166	0.07
167	0.09
168	0.08
169	0.08
170	0.09
171	0.09
172	0.1
173	0.11
174	0.13
175	0.12
176	0.12
177	0.13
178	0.14
179	0.14
180	0.14
181	0.12
182	0.1
183	0.08
184	0.07
185	0.09
186	0.08
187	0.07
188	0.06
189	0.06
190	0.09
191	0.09
192	0.1
193	0.07
194	0.08
195	0.12
196	0.15
197	0.17
198	0.16
199	0.25
200	0.32
201	0.37
202	0.39
203	0.37
204	0.39
205	0.44
206	0.51
207	0.48
208	0.46
209	0.47
210	0.46
211	0.45
212	0.43
213	0.36
214	0.27
215	0.22
216	0.18
217	0.14
218	0.12
219	0.11
220	0.09
221	0.09
222	0.09
223	0.08
224	0.06
225	0.07
226	0.07
227	0.06
228	0.1
229	0.12
230	0.21
231	0.22
232	0.24
233	0.26
234	0.33
235	0.38
236	0.36
237	0.39
238	0.37
239	0.39
240	0.39
241	0.36
242	0.3
243	0.26
244	0.27
245	0.25
246	0.19
247	0.17
248	0.17
249	0.19
250	0.18
251	0.19
252	0.21
253	0.22
254	0.22
255	0.22
256	0.22
257	0.19
258	0.2
259	0.2
260	0.17
261	0.12
262	0.11
263	0.1
264	0.1
265	0.09
266	0.08
267	0.07
268	0.07
269	0.11
270	0.11
271	0.15
272	0.18
273	0.18
274	0.18
275	0.22
276	0.23
277	0.21
278	0.23
279	0.21
280	0.19
281	0.18
282	0.19
283	0.15
284	0.13
285	0.11
286	0.09
287	0.07
288	0.07
289	0.08
290	0.07
291	0.08
292	0.08
293	0.09
294	0.08
295	0.08
296	0.07
297	0.09
298	0.09
299	0.1
300	0.09
301	0.09
302	0.09
303	0.09
304	0.09
305	0.08
306	0.09
307	0.09
308	0.14
309	0.15
310	0.17
311	0.19
312	0.21
313	0.19
314	0.2
315	0.23
316	0.2
317	0.19
318	0.2
319	0.23
320	0.23
321	0.23
322	0.21
323	0.18
324	0.17
325	0.2
326	0.22
327	0.18
328	0.15
329	0.15
330	0.15
331	0.14
332	0.14
333	0.1
334	0.08
335	0.07
336	0.08
337	0.09
338	0.09
339	0.09
340	0.1
341	0.11
342	0.11
343	0.19
344	0.27
345	0.31
346	0.39
347	0.4
348	0.4
349	0.42
350	0.46
351	0.42
352	0.42
353	0.39
354	0.34
355	0.4
356	0.4
357	0.42
358	0.39
359	0.37
360	0.32
361	0.34
362	0.33
363	0.27
364	0.26
365	0.22
366	0.22
367	0.2
368	0.18
369	0.15
370	0.14
371	0.14
372	0.17
373	0.2
374	0.2
375	0.19
376	0.18
377	0.16
378	0.16
379	0.17
380	0.14
381	0.1
382	0.08
383	0.08
384	0.08
385	0.08
386	0.08
387	0.07
388	0.06
389	0.05
390	0.05
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.05
396	0.05
397	0.06
398	0.06
399	0.08
400	0.1
401	0.13
402	0.2
403	0.2
404	0.24
405	0.33
406	0.34
407	0.35
408	0.4
409	0.42
410	0.41
411	0.45
412	0.43
413	0.4
414	0.4

A0A1Z5TJ52

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer