Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Z5TCH1

Protein Details
Accession A0A1Z5TCH1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-39EHLSIQPRRHARENEKNRFQNGHydrophilic
208-232FSRKGSKVVRERRQQKERQKQAQEAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR002464  DNA/RNA_helicase_DEAH_CS  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0032991  C:protein-containing complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00690  DEAH_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
Amino Acid Sequences MSDDDRSAKRRRLESGEEHLSIQPRRHARENEKNRFQNGARQPVTTTRYGNDETPRPRQEFDGPEPGVSAEDAAALDRDWYNTGEEGGAVLGDDMHNPFGGTEDVSWADQAREQELLEKKMLARQKVNPRFMQRQRDNDAWEANRMLASSVAQTRDQAGGFEDDNEDVRVHLLVHDLKPPFLDGKTVFTKQVDPVSAVRDPQSDMAVFSRKGSKVVRERRQQKERQKQAQEATGVAGTALGNVMGVKEEDTDSAAPTAQPEKNGEDARPTSKFFKDDEKKPKDTGQSDFSRTKSLREQREYLPAFAVREELLRVVRDNQVTVIVGQTGSGKTTQLTQFLMEDGYAASGLIGCTQPRRVAAMSVAKRVADEMEVPLGGEVGYAIRFEDCTSKETKIKYMTDGVLLRESLTNPDLDQYSCIIMDEAHERALNTDVLMGLIKKVLARRRDLKLIVTSATMNAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.69
3 0.69
4 0.63
5 0.59
6 0.55
7 0.53
8 0.48
9 0.43
10 0.42
11 0.42
12 0.47
13 0.53
14 0.6
15 0.64
16 0.72
17 0.79
18 0.82
19 0.85
20 0.85
21 0.79
22 0.77
23 0.68
24 0.67
25 0.64
26 0.64
27 0.55
28 0.51
29 0.5
30 0.51
31 0.53
32 0.47
33 0.4
34 0.31
35 0.35
36 0.36
37 0.39
38 0.38
39 0.42
40 0.44
41 0.51
42 0.56
43 0.53
44 0.52
45 0.51
46 0.52
47 0.52
48 0.52
49 0.52
50 0.47
51 0.44
52 0.43
53 0.39
54 0.31
55 0.23
56 0.17
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.06
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.1
67 0.11
68 0.12
69 0.12
70 0.13
71 0.11
72 0.1
73 0.09
74 0.08
75 0.07
76 0.05
77 0.04
78 0.04
79 0.04
80 0.05
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.07
90 0.09
91 0.1
92 0.1
93 0.11
94 0.1
95 0.1
96 0.12
97 0.12
98 0.12
99 0.11
100 0.11
101 0.18
102 0.22
103 0.24
104 0.23
105 0.23
106 0.22
107 0.27
108 0.31
109 0.29
110 0.31
111 0.37
112 0.47
113 0.55
114 0.61
115 0.62
116 0.65
117 0.7
118 0.73
119 0.75
120 0.71
121 0.7
122 0.7
123 0.68
124 0.64
125 0.57
126 0.55
127 0.45
128 0.4
129 0.32
130 0.26
131 0.22
132 0.18
133 0.15
134 0.1
135 0.09
136 0.09
137 0.11
138 0.13
139 0.13
140 0.13
141 0.15
142 0.16
143 0.16
144 0.13
145 0.12
146 0.12
147 0.12
148 0.12
149 0.11
150 0.1
151 0.1
152 0.11
153 0.1
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.09
160 0.11
161 0.12
162 0.17
163 0.17
164 0.17
165 0.17
166 0.18
167 0.16
168 0.13
169 0.16
170 0.11
171 0.16
172 0.21
173 0.22
174 0.22
175 0.21
176 0.23
177 0.21
178 0.24
179 0.19
180 0.17
181 0.17
182 0.2
183 0.19
184 0.18
185 0.17
186 0.15
187 0.15
188 0.14
189 0.14
190 0.1
191 0.1
192 0.12
193 0.14
194 0.13
195 0.13
196 0.18
197 0.17
198 0.2
199 0.21
200 0.26
201 0.33
202 0.43
203 0.51
204 0.56
205 0.65
206 0.72
207 0.8
208 0.81
209 0.82
210 0.83
211 0.84
212 0.84
213 0.8
214 0.76
215 0.69
216 0.64
217 0.54
218 0.43
219 0.34
220 0.24
221 0.19
222 0.13
223 0.1
224 0.05
225 0.04
226 0.04
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.06
243 0.07
244 0.12
245 0.11
246 0.12
247 0.14
248 0.16
249 0.21
250 0.22
251 0.21
252 0.21
253 0.22
254 0.25
255 0.25
256 0.25
257 0.25
258 0.26
259 0.28
260 0.24
261 0.33
262 0.37
263 0.44
264 0.53
265 0.57
266 0.58
267 0.58
268 0.62
269 0.59
270 0.55
271 0.49
272 0.46
273 0.43
274 0.45
275 0.47
276 0.42
277 0.42
278 0.39
279 0.38
280 0.4
281 0.43
282 0.47
283 0.49
284 0.52
285 0.48
286 0.58
287 0.56
288 0.47
289 0.42
290 0.34
291 0.29
292 0.24
293 0.22
294 0.13
295 0.11
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.13
302 0.17
303 0.17
304 0.17
305 0.16
306 0.16
307 0.16
308 0.14
309 0.12
310 0.08
311 0.07
312 0.07
313 0.09
314 0.07
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.13
320 0.15
321 0.15
322 0.16
323 0.16
324 0.16
325 0.16
326 0.16
327 0.11
328 0.09
329 0.07
330 0.06
331 0.05
332 0.05
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.06
338 0.07
339 0.09
340 0.12
341 0.14
342 0.14
343 0.18
344 0.17
345 0.18
346 0.23
347 0.31
348 0.32
349 0.35
350 0.36
351 0.32
352 0.31
353 0.3
354 0.25
355 0.16
356 0.14
357 0.11
358 0.12
359 0.12
360 0.12
361 0.11
362 0.1
363 0.08
364 0.07
365 0.05
366 0.04
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.06
372 0.07
373 0.13
374 0.14
375 0.17
376 0.2
377 0.24
378 0.28
379 0.3
380 0.36
381 0.37
382 0.38
383 0.4
384 0.42
385 0.39
386 0.41
387 0.41
388 0.36
389 0.32
390 0.29
391 0.27
392 0.23
393 0.22
394 0.19
395 0.18
396 0.17
397 0.14
398 0.17
399 0.18
400 0.16
401 0.17
402 0.15
403 0.15
404 0.14
405 0.15
406 0.12
407 0.1
408 0.12
409 0.14
410 0.14
411 0.14
412 0.15
413 0.14
414 0.16
415 0.18
416 0.16
417 0.13
418 0.13
419 0.11
420 0.11
421 0.12
422 0.11
423 0.09
424 0.1
425 0.1
426 0.12
427 0.19
428 0.25
429 0.3
430 0.39
431 0.46
432 0.53
433 0.61
434 0.61
435 0.61
436 0.6
437 0.58
438 0.5
439 0.44
440 0.38