Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Z5SZ62

Protein Details
Accession A0A1Z5SZ62    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
109-135MEEAKAEKKEKKSKKSKKEESSSDSSSHydrophilic
294-317SESSSSPPPKKQKASKKAKEESAGHydrophilic
330-350DPAPSMKSKKEKKAEAKPSEAHydrophilic
426-453LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
113-126KAEKKEKKSKKSKK
191-198KPGQKRKR
302-312PKKQKASKKAK
338-342KKEKK
432-445KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MPSDKKTKAVRGHDEKIPAKLWQPANSDTPAPRLLDVLSQCAHFFDQLGYTKTLTALLDEAKNNGFRVNVSEWDRGCLEEHAAPLLELWEEWYRRNDGFPVVPGDEQVMEEAKAEKKEKKSKKSKKEESSSDSSSSSESDSESDSSSDEDETEGHKAGAVEDEAESTSDDSSDASSDSDSSGSDSEAEKAKPGQKRKRAATPSSSEDESSDSDSSSDESDARPTKRTKVQSKAKDDDSSDASSSSESDSDDEDKAGGVDVNMKDADSSSASSDSDSDSSDSSSSDSESSSSSDSESSSSPPPKKQKASKKAKEESAGSAASSATLDNESDPAPSMKSKKEKKAEAKPSEAQDEILAPTAAVDGEPNTSGIHPDRLRQMPASNETIKQLKKQNVPFSRIPADTKVDPRFSSNDYVPYDYANRAYQDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDLAPKGIKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.7
3 0.65
4 0.58
5 0.49
6 0.43
7 0.45
8 0.45
9 0.43
10 0.45
11 0.44
12 0.46
13 0.46
14 0.47
15 0.41
16 0.4
17 0.36
18 0.32
19 0.28
20 0.25
21 0.23
22 0.24
23 0.24
24 0.24
25 0.22
26 0.21
27 0.21
28 0.22
29 0.21
30 0.15
31 0.15
32 0.12
33 0.16
34 0.2
35 0.23
36 0.23
37 0.23
38 0.23
39 0.23
40 0.24
41 0.18
42 0.15
43 0.14
44 0.15
45 0.19
46 0.19
47 0.21
48 0.21
49 0.23
50 0.22
51 0.21
52 0.18
53 0.14
54 0.2
55 0.21
56 0.25
57 0.29
58 0.34
59 0.33
60 0.36
61 0.36
62 0.31
63 0.29
64 0.24
65 0.21
66 0.18
67 0.18
68 0.16
69 0.16
70 0.15
71 0.13
72 0.12
73 0.09
74 0.07
75 0.1
76 0.14
77 0.15
78 0.17
79 0.2
80 0.23
81 0.23
82 0.25
83 0.24
84 0.22
85 0.23
86 0.24
87 0.25
88 0.23
89 0.23
90 0.21
91 0.21
92 0.17
93 0.15
94 0.14
95 0.1
96 0.08
97 0.09
98 0.12
99 0.14
100 0.18
101 0.22
102 0.27
103 0.36
104 0.46
105 0.55
106 0.63
107 0.72
108 0.78
109 0.85
110 0.91
111 0.92
112 0.92
113 0.92
114 0.89
115 0.85
116 0.82
117 0.74
118 0.65
119 0.55
120 0.45
121 0.36
122 0.28
123 0.21
124 0.14
125 0.11
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.08
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.1
140 0.1
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.09
147 0.08
148 0.07
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.08
172 0.09
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.15
177 0.21
178 0.25
179 0.35
180 0.43
181 0.49
182 0.58
183 0.62
184 0.69
185 0.7
186 0.69
187 0.67
188 0.62
189 0.58
190 0.53
191 0.48
192 0.38
193 0.31
194 0.28
195 0.21
196 0.19
197 0.14
198 0.11
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.06
205 0.07
206 0.11
207 0.15
208 0.17
209 0.21
210 0.22
211 0.27
212 0.34
213 0.42
214 0.46
215 0.51
216 0.6
217 0.64
218 0.71
219 0.7
220 0.66
221 0.61
222 0.53
223 0.46
224 0.39
225 0.32
226 0.24
227 0.19
228 0.16
229 0.13
230 0.12
231 0.1
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.09
237 0.1
238 0.09
239 0.09
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.06
244 0.04
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.11
253 0.07
254 0.08
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.1
282 0.1
283 0.12
284 0.16
285 0.23
286 0.25
287 0.33
288 0.41
289 0.48
290 0.56
291 0.63
292 0.69
293 0.73
294 0.81
295 0.83
296 0.84
297 0.84
298 0.81
299 0.76
300 0.67
301 0.6
302 0.53
303 0.44
304 0.33
305 0.27
306 0.2
307 0.16
308 0.13
309 0.09
310 0.05
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.09
318 0.09
319 0.1
320 0.14
321 0.17
322 0.23
323 0.33
324 0.41
325 0.5
326 0.58
327 0.67
328 0.73
329 0.8
330 0.84
331 0.81
332 0.8
333 0.75
334 0.7
335 0.64
336 0.55
337 0.44
338 0.34
339 0.28
340 0.21
341 0.17
342 0.13
343 0.09
344 0.09
345 0.08
346 0.08
347 0.06
348 0.06
349 0.05
350 0.06
351 0.07
352 0.07
353 0.08
354 0.08
355 0.11
356 0.12
357 0.2
358 0.19
359 0.23
360 0.3
361 0.33
362 0.35
363 0.35
364 0.37
365 0.35
366 0.39
367 0.42
368 0.37
369 0.35
370 0.36
371 0.41
372 0.39
373 0.4
374 0.43
375 0.45
376 0.51
377 0.58
378 0.65
379 0.66
380 0.71
381 0.68
382 0.67
383 0.64
384 0.58
385 0.53
386 0.47
387 0.45
388 0.43
389 0.47
390 0.47
391 0.45
392 0.43
393 0.44
394 0.43
395 0.41
396 0.42
397 0.37
398 0.38
399 0.37
400 0.4
401 0.36
402 0.35
403 0.34
404 0.3
405 0.31
406 0.27
407 0.25
408 0.23
409 0.23
410 0.22
411 0.23
412 0.22
413 0.24
414 0.24
415 0.24
416 0.23
417 0.28
418 0.3
419 0.33
420 0.36
421 0.42
422 0.5
423 0.59
424 0.69
425 0.75
426 0.82
427 0.84
428 0.9
429 0.91
430 0.9
431 0.9
432 0.88
433 0.86
434 0.84
435 0.77
436 0.67
437 0.58
438 0.54
439 0.44
440 0.38
441 0.29
442 0.21