FuNGI

A0A1Z5SMW2

Protein Details

Accession

A0A1Z5SMW2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-38	ARSTTYRSSNRSPRPKEAEM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
552-570	MTRGGRGGRGGGAPRGRGG

Subcellular Location(s)

nucl 10.5, mito 9, cyto_nucl 8, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1 PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM PS50082 WD_REPEATS_2
CDD	cd12306 RRM_II_PABPs

Amino Acid Sequences

MPPPSNHGTNTPAQKTSAARSTTYRSSNRSPRPKEAEMAGLFGGAASSAANTNPTQGDLSKDVAVSDPPEDSISNIAFSPQSEHLAVASWDKKVRIYEIDQNGNSQGKALFDFEGPVLNCAWSKDGSKVFGASADKTAKMLDIQSGSTQQVAQHDQPISCCETIVAGGNQMLVTGGWDKMVKYWDLRSPTPAGQVEAKERIYTMDVRNDMLVVGTADRWIHVVNVNQPGTFYRTLQSPLKWQSRVVSIFSPEPNGFAIGSIEGRCAIQYVEDKDQSGNFSFKCHRQTPPNDRNTSNVFAVNAISFHPQHGTFSTAGSDGTFHFWDKDAKHRLKGYPEVGGSIVATDFNKGGNIFAYAVSYDWSKGYQGNSQQYPNKIMLHPIVGDECDTSSTSKPPQPIDTMADVEDKREDEQLDRAPEEEEAGDEEEIAAMKKRVQEMEAEAAKLREMQAQIDSQQESLRESKEDIDARSVFVGNVDYGASPEEIQAHFQSVGSINRVTILLDKFTGHPKGYAYVEFTEPNLVTQALVLNESMFRGRNIKVVPKRTNLPGMTRGGRGGRGGGAPRGRGGFGGGYGPPMYGGRGGYGPPPHMPRGGYRGGYRGRARGYNPY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.44
3	0.45
4	0.46
5	0.39
6	0.36
7	0.39
8	0.45
9	0.48
10	0.53
11	0.52
12	0.51
13	0.58
14	0.66
15	0.72
16	0.76
17	0.76
18	0.78
19	0.81
20	0.78
21	0.73
22	0.66
23	0.64
24	0.54
25	0.49
26	0.38
27	0.29
28	0.25
29	0.2
30	0.16
31	0.07
32	0.06
33	0.03
34	0.04
35	0.05
36	0.05
37	0.08
38	0.08
39	0.11
40	0.12
41	0.13
42	0.15
43	0.15
44	0.19
45	0.2
46	0.23
47	0.21
48	0.21
49	0.2
50	0.19
51	0.2
52	0.17
53	0.15
54	0.13
55	0.12
56	0.14
57	0.13
58	0.13
59	0.15
60	0.14
61	0.14
62	0.13
63	0.13
64	0.12
65	0.13
66	0.17
67	0.15
68	0.17
69	0.17
70	0.17
71	0.16
72	0.17
73	0.18
74	0.19
75	0.2
76	0.2
77	0.22
78	0.23
79	0.25
80	0.26
81	0.29
82	0.28
83	0.31
84	0.37
85	0.42
86	0.5
87	0.47
88	0.47
89	0.47
90	0.43
91	0.37
92	0.29
93	0.22
94	0.15
95	0.16
96	0.16
97	0.14
98	0.12
99	0.14
100	0.13
101	0.17
102	0.16
103	0.16
104	0.14
105	0.14
106	0.14
107	0.14
108	0.16
109	0.12
110	0.13
111	0.18
112	0.21
113	0.22
114	0.23
115	0.23
116	0.21
117	0.23
118	0.24
119	0.2
120	0.22
121	0.22
122	0.21
123	0.21
124	0.21
125	0.17
126	0.16
127	0.15
128	0.13
129	0.13
130	0.13
131	0.15
132	0.17
133	0.16
134	0.16
135	0.16
136	0.14
137	0.16
138	0.2
139	0.19
140	0.23
141	0.25
142	0.24
143	0.25
144	0.26
145	0.25
146	0.21
147	0.19
148	0.14
149	0.12
150	0.12
151	0.14
152	0.12
153	0.09
154	0.09
155	0.1
156	0.09
157	0.09
158	0.08
159	0.05
160	0.06
161	0.06
162	0.06
163	0.07
164	0.08
165	0.08
166	0.1
167	0.12
168	0.13
169	0.13
170	0.17
171	0.22
172	0.26
173	0.27
174	0.29
175	0.31
176	0.31
177	0.35
178	0.31
179	0.28
180	0.26
181	0.27
182	0.28
183	0.28
184	0.27
185	0.21
186	0.2
187	0.2
188	0.18
189	0.21
190	0.19
191	0.21
192	0.22
193	0.22
194	0.22
195	0.21
196	0.19
197	0.14
198	0.12
199	0.06
200	0.05
201	0.05
202	0.06
203	0.05
204	0.06
205	0.06
206	0.06
207	0.07
208	0.08
209	0.11
210	0.15
211	0.23
212	0.23
213	0.22
214	0.22
215	0.23
216	0.25
217	0.23
218	0.19
219	0.13
220	0.14
221	0.19
222	0.22
223	0.22
224	0.24
225	0.32
226	0.37
227	0.37
228	0.36
229	0.34
230	0.37
231	0.38
232	0.33
233	0.27
234	0.23
235	0.25
236	0.24
237	0.25
238	0.18
239	0.17
240	0.15
241	0.14
242	0.12
243	0.09
244	0.09
245	0.06
246	0.07
247	0.07
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.06
252	0.06
253	0.05
254	0.06
255	0.09
256	0.13
257	0.16
258	0.17
259	0.18
260	0.18
261	0.19
262	0.18
263	0.17
264	0.15
265	0.12
266	0.15
267	0.17
268	0.21
269	0.27
270	0.28
271	0.3
272	0.37
273	0.46
274	0.54
275	0.61
276	0.65
277	0.63
278	0.6
279	0.6
280	0.56
281	0.49
282	0.39
283	0.29
284	0.21
285	0.17
286	0.17
287	0.13
288	0.09
289	0.07
290	0.08
291	0.08
292	0.08
293	0.09
294	0.08
295	0.09
296	0.1
297	0.11
298	0.1
299	0.1
300	0.1
301	0.09
302	0.09
303	0.08
304	0.08
305	0.06
306	0.08
307	0.08
308	0.08
309	0.08
310	0.09
311	0.13
312	0.14
313	0.22
314	0.29
315	0.31
316	0.35
317	0.39
318	0.41
319	0.42
320	0.46
321	0.39
322	0.34
323	0.32
324	0.28
325	0.24
326	0.22
327	0.16
328	0.11
329	0.09
330	0.06
331	0.05
332	0.05
333	0.05
334	0.05
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.07
343	0.06
344	0.06
345	0.07
346	0.07
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.07
351	0.09
352	0.1
353	0.14
354	0.2
355	0.26
356	0.28
357	0.32
358	0.35
359	0.35
360	0.37
361	0.35
362	0.31
363	0.26
364	0.26
365	0.22
366	0.19
367	0.18
368	0.15
369	0.14
370	0.11
371	0.11
372	0.09
373	0.08
374	0.07
375	0.08
376	0.09
377	0.1
378	0.12
379	0.16
380	0.18
381	0.22
382	0.23
383	0.25
384	0.26
385	0.28
386	0.29
387	0.27
388	0.26
389	0.23
390	0.26
391	0.23
392	0.21
393	0.19
394	0.16
395	0.15
396	0.16
397	0.16
398	0.12
399	0.17
400	0.21
401	0.22
402	0.22
403	0.21
404	0.2
405	0.19
406	0.19
407	0.14
408	0.09
409	0.08
410	0.09
411	0.08
412	0.08
413	0.07
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.07
418	0.06
419	0.08
420	0.11
421	0.14
422	0.15
423	0.16
424	0.18
425	0.21
426	0.29
427	0.28
428	0.26
429	0.24
430	0.23
431	0.22
432	0.21
433	0.17
434	0.13
435	0.12
436	0.13
437	0.15
438	0.16
439	0.18
440	0.2
441	0.2
442	0.16
443	0.17
444	0.16
445	0.17
446	0.18
447	0.18
448	0.15
449	0.16
450	0.18
451	0.23
452	0.25
453	0.24
454	0.27
455	0.26
456	0.26
457	0.26
458	0.24
459	0.18
460	0.15
461	0.15
462	0.09
463	0.09
464	0.08
465	0.07
466	0.07
467	0.08
468	0.08
469	0.07
470	0.08
471	0.11
472	0.1
473	0.13
474	0.13
475	0.14
476	0.14
477	0.14
478	0.15
479	0.15
480	0.17
481	0.17
482	0.17
483	0.14
484	0.15
485	0.15
486	0.14
487	0.16
488	0.16
489	0.15
490	0.15
491	0.17
492	0.18
493	0.24
494	0.27
495	0.23
496	0.23
497	0.22
498	0.26
499	0.27
500	0.27
501	0.24
502	0.23
503	0.24
504	0.24
505	0.23
506	0.23
507	0.21
508	0.19
509	0.17
510	0.14
511	0.12
512	0.12
513	0.14
514	0.1
515	0.11
516	0.1
517	0.09
518	0.09
519	0.11
520	0.12
521	0.1
522	0.11
523	0.15
524	0.16
525	0.21
526	0.25
527	0.34
528	0.42
529	0.51
530	0.57
531	0.59
532	0.64
533	0.63
534	0.68
535	0.61
536	0.58
537	0.55
538	0.54
539	0.52
540	0.47
541	0.45
542	0.39
543	0.38
544	0.32
545	0.27
546	0.23
547	0.24
548	0.25
549	0.29
550	0.3
551	0.29
552	0.31
553	0.31
554	0.29
555	0.25
556	0.24
557	0.18
558	0.15
559	0.17
560	0.15
561	0.15
562	0.15
563	0.15
564	0.13
565	0.13
566	0.13
567	0.12
568	0.12
569	0.12
570	0.13
571	0.14
572	0.18
573	0.22
574	0.24
575	0.28
576	0.33
577	0.33
578	0.35
579	0.36
580	0.36
581	0.4
582	0.44
583	0.42
584	0.39
585	0.45
586	0.47
587	0.54
588	0.53
589	0.52
590	0.51
591	0.53

A0A1Z5SMW2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer