FuNGI

A0A1Z5SRL3

Protein Details

Accession

A0A1Z5SRL3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
7-26	CNSPRFRRFMRKTYFEKLVF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 11, nucl 10.5, cyto 10.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR041692 HHH_9 IPR012340 NA-bd_OB-fold IPR012337 RNaseH-like_sf IPR010994 RuvA_2-like IPR003029 S1_domain IPR036860 SH2_dom_sf IPR042066 Spt6_death-like IPR032706 Spt6_HHH IPR035420 Spt6_SH2 IPR035018 Spt6_SH2_C IPR035019 Spt6_SH2_N IPR028231 Spt6_YqgF IPR017072 TF_Spt6 IPR037027 YqgF/RNaseH-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0003746 F:translation elongation factor activity GO:0006139 P:nucleobase-containing compound metabolic process GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF14635 HHH_7 PF17674 HHH_9 PF14633 SH2_2 PF14639 YqgF
PROSITE	View protein in PROSITE PS50126 S1
CDD	cd09928 SH2_Cterm_SPT6_like cd09918 SH2_Nterm_SPT6_like

Amino Acid Sequences

MFIEELCNSPRFRRFMRKTYFEKLVFDVKRTEKGVKVIDEEHPYYEFKYLRNWEARNFLLDRPELFLKMLKAESEGLVEVIVRIQGEKQFRADLHKAILSDNFSEVADAWNQLRKEIMDKSLARLHTFIARGVKDTIKNECENMLAANCRKAYTDRLDQAPYRPTGMMLGTVPRVLALSNGAGNRGDAICWAYMEENGRVQENGKFTDLRLGNQEKFIPDGKDVAAFVELVERRKPDVLAVSGWSVETRKLYKELQDVIEAKKLMGAPYEDPEDDSERQDPLDVFIVNDECARLYHTSKRAESDHPGLPPLTRYAIALARYMQHPIREYAALGRDISSISFDPHQHLIPMDKLLKYLETSMVDMVNLVGVDINDAAHDSYTANLLPYVCGLGPRKAAQMLKIISQNGGEVINRVDLAGDVERQIKPAASPVVWVNCASFIMITFADVEQEGPEADYLDNTRIHPEDYDLARKIAADALELDEEDVKAEVDEFGPSAVVRRLVKEDQQDKVNDLVLEQYAEQLEKQMSQRKRATLETIRAELISPYEELRHNFQDLGTDQIFTMLTGETGKSLVEGMVVPVSVRRTFPTYLDVRLDCGVEGGIGENEYPEEVVRRQLQPREVWSMGQTIQAKITFLDRRKLTAQLTLRENEMRNPYKRTYDHGLDEWDAELEARDKKEARKVIDASSGRAQRVIKHPLFRPFNSAQAVEFLGPQSRGDCVIRPSSKGPDHLAVTWKVHEGVFQHIDVLELDKENEFSVGRVLRVGGKWSYTDLDELIVLHVKAMAKKVEEMMGDERYQSGSRQQTEQWLTTYTEANPKRSMYAFCLNAKYPGYFYLCFKAGQNAPLANWPVKVIPNAFELRGNKYPDMRALKNGFKLLFSNQGPGGQHNGVPRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.65
3	0.73
4	0.76
5	0.76
6	0.79
7	0.81
8	0.72
9	0.66
10	0.6
11	0.6
12	0.53
13	0.49
14	0.49
15	0.43
16	0.48
17	0.48
18	0.49
19	0.43
20	0.47
21	0.51
22	0.47
23	0.47
24	0.44
25	0.46
26	0.48
27	0.46
28	0.41
29	0.36
30	0.34
31	0.31
32	0.33
33	0.28
34	0.23
35	0.3
36	0.34
37	0.4
38	0.48
39	0.49
40	0.48
41	0.53
42	0.54
43	0.5
44	0.47
45	0.41
46	0.39
47	0.38
48	0.34
49	0.33
50	0.33
51	0.29
52	0.27
53	0.28
54	0.23
55	0.26
56	0.25
57	0.2
58	0.2
59	0.21
60	0.2
61	0.19
62	0.17
63	0.13
64	0.12
65	0.12
66	0.09
67	0.08
68	0.08
69	0.06
70	0.07
71	0.09
72	0.15
73	0.2
74	0.22
75	0.24
76	0.27
77	0.28
78	0.36
79	0.38
80	0.36
81	0.35
82	0.35
83	0.33
84	0.3
85	0.33
86	0.27
87	0.25
88	0.22
89	0.19
90	0.16
91	0.16
92	0.15
93	0.14
94	0.12
95	0.12
96	0.13
97	0.17
98	0.17
99	0.17
100	0.19
101	0.18
102	0.22
103	0.24
104	0.26
105	0.29
106	0.3
107	0.35
108	0.39
109	0.39
110	0.36
111	0.32
112	0.31
113	0.28
114	0.28
115	0.27
116	0.27
117	0.27
118	0.28
119	0.3
120	0.34
121	0.33
122	0.35
123	0.39
124	0.38
125	0.38
126	0.37
127	0.35
128	0.31
129	0.26
130	0.24
131	0.19
132	0.2
133	0.21
134	0.24
135	0.24
136	0.24
137	0.25
138	0.26
139	0.3
140	0.31
141	0.39
142	0.39
143	0.42
144	0.47
145	0.47
146	0.49
147	0.48
148	0.42
149	0.36
150	0.31
151	0.27
152	0.24
153	0.22
154	0.19
155	0.14
156	0.16
157	0.14
158	0.13
159	0.13
160	0.11
161	0.11
162	0.09
163	0.08
164	0.07
165	0.08
166	0.11
167	0.11
168	0.12
169	0.12
170	0.12
171	0.13
172	0.12
173	0.11
174	0.08
175	0.1
176	0.09
177	0.09
178	0.1
179	0.08
180	0.1
181	0.13
182	0.14
183	0.15
184	0.16
185	0.16
186	0.16
187	0.17
188	0.19
189	0.19
190	0.2
191	0.19
192	0.19
193	0.18
194	0.27
195	0.26
196	0.24
197	0.29
198	0.32
199	0.31
200	0.33
201	0.35
202	0.27
203	0.29
204	0.3
205	0.24
206	0.2
207	0.2
208	0.18
209	0.18
210	0.17
211	0.15
212	0.12
213	0.1
214	0.09
215	0.14
216	0.15
217	0.16
218	0.18
219	0.19
220	0.2
221	0.22
222	0.22
223	0.17
224	0.2
225	0.2
226	0.19
227	0.2
228	0.18
229	0.17
230	0.17
231	0.15
232	0.12
233	0.11
234	0.13
235	0.13
236	0.15
237	0.18
238	0.2
239	0.25
240	0.3
241	0.33
242	0.31
243	0.35
244	0.35
245	0.34
246	0.36
247	0.31
248	0.25
249	0.23
250	0.22
251	0.17
252	0.16
253	0.16
254	0.13
255	0.16
256	0.18
257	0.16
258	0.16
259	0.18
260	0.2
261	0.19
262	0.2
263	0.19
264	0.16
265	0.16
266	0.17
267	0.15
268	0.12
269	0.14
270	0.12
271	0.1
272	0.11
273	0.12
274	0.11
275	0.11
276	0.09
277	0.07
278	0.07
279	0.09
280	0.1
281	0.12
282	0.19
283	0.26
284	0.31
285	0.32
286	0.36
287	0.37
288	0.39
289	0.41
290	0.39
291	0.36
292	0.31
293	0.31
294	0.28
295	0.25
296	0.22
297	0.19
298	0.15
299	0.12
300	0.11
301	0.12
302	0.15
303	0.16
304	0.15
305	0.14
306	0.15
307	0.15
308	0.18
309	0.17
310	0.16
311	0.17
312	0.17
313	0.18
314	0.17
315	0.17
316	0.17
317	0.18
318	0.17
319	0.15
320	0.15
321	0.13
322	0.13
323	0.12
324	0.11
325	0.09
326	0.09
327	0.11
328	0.11
329	0.13
330	0.15
331	0.15
332	0.14
333	0.14
334	0.14
335	0.13
336	0.16
337	0.16
338	0.15
339	0.15
340	0.15
341	0.15
342	0.14
343	0.14
344	0.13
345	0.11
346	0.12
347	0.12
348	0.11
349	0.1
350	0.1
351	0.08
352	0.06
353	0.04
354	0.04
355	0.03
356	0.03
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.03
361	0.04
362	0.04
363	0.03
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.05
376	0.08
377	0.1
378	0.12
379	0.13
380	0.14
381	0.15
382	0.18
383	0.18
384	0.17
385	0.21
386	0.2
387	0.21
388	0.22
389	0.22
390	0.19
391	0.19
392	0.17
393	0.11
394	0.11
395	0.08
396	0.06
397	0.07
398	0.07
399	0.06
400	0.06
401	0.05
402	0.05
403	0.06
404	0.06
405	0.06
406	0.07
407	0.09
408	0.1
409	0.1
410	0.11
411	0.09
412	0.09
413	0.11
414	0.12
415	0.09
416	0.1
417	0.11
418	0.13
419	0.13
420	0.13
421	0.1
422	0.09
423	0.09
424	0.08
425	0.06
426	0.04
427	0.05
428	0.05
429	0.05
430	0.05
431	0.05
432	0.06
433	0.06
434	0.06
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.04
440	0.04
441	0.04
442	0.05
443	0.05
444	0.07
445	0.08
446	0.08
447	0.1
448	0.1
449	0.1
450	0.1
451	0.11
452	0.13
453	0.14
454	0.18
455	0.18
456	0.17
457	0.17
458	0.17
459	0.16
460	0.13
461	0.11
462	0.07
463	0.07
464	0.07
465	0.07
466	0.07
467	0.07
468	0.06
469	0.06
470	0.05
471	0.05
472	0.04
473	0.03
474	0.04
475	0.04
476	0.04
477	0.04
478	0.04
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.05
483	0.06
484	0.09
485	0.09
486	0.11
487	0.15
488	0.17
489	0.21
490	0.28
491	0.31
492	0.31
493	0.34
494	0.33
495	0.31
496	0.3
497	0.28
498	0.2
499	0.15
500	0.14
501	0.1
502	0.1
503	0.08
504	0.08
505	0.06
506	0.06
507	0.06
508	0.07
509	0.07
510	0.09
511	0.12
512	0.2
513	0.22
514	0.3
515	0.35
516	0.36
517	0.4
518	0.39
519	0.43
520	0.41
521	0.45
522	0.4
523	0.38
524	0.35
525	0.31
526	0.3
527	0.22
528	0.17
529	0.11
530	0.08
531	0.07
532	0.09
533	0.11
534	0.12
535	0.16
536	0.18
537	0.18
538	0.17
539	0.17
540	0.19
541	0.17
542	0.21
543	0.17
544	0.15
545	0.14
546	0.15
547	0.15
548	0.11
549	0.11
550	0.05
551	0.05
552	0.06
553	0.06
554	0.05
555	0.05
556	0.05
557	0.05
558	0.05
559	0.04
560	0.05
561	0.05
562	0.05
563	0.05
564	0.05
565	0.05
566	0.06
567	0.09
568	0.09
569	0.1
570	0.11
571	0.14
572	0.16
573	0.17
574	0.22
575	0.22
576	0.24
577	0.27
578	0.25
579	0.23
580	0.23
581	0.22
582	0.16
583	0.14
584	0.11
585	0.07
586	0.06
587	0.05
588	0.05
589	0.04
590	0.04
591	0.04
592	0.04
593	0.04
594	0.05
595	0.04
596	0.06
597	0.07
598	0.11
599	0.15
600	0.2
601	0.25
602	0.29
603	0.34
604	0.35
605	0.38
606	0.41
607	0.38
608	0.34
609	0.31
610	0.29
611	0.25
612	0.27
613	0.25
614	0.18
615	0.2
616	0.19
617	0.18
618	0.16
619	0.21
620	0.22
621	0.23
622	0.31
623	0.29
624	0.33
625	0.35
626	0.39
627	0.34
628	0.36
629	0.38
630	0.36
631	0.4
632	0.37
633	0.37
634	0.37
635	0.36
636	0.33
637	0.37
638	0.38
639	0.38
640	0.42
641	0.43
642	0.46
643	0.47
644	0.48
645	0.47
646	0.45
647	0.45
648	0.42
649	0.43
650	0.36
651	0.35
652	0.29
653	0.21
654	0.16
655	0.12
656	0.1
657	0.09
658	0.12
659	0.12
660	0.15
661	0.18
662	0.22
663	0.3
664	0.35
665	0.37
666	0.42
667	0.44
668	0.44
669	0.51
670	0.48
671	0.44
672	0.46
673	0.44
674	0.36
675	0.37
676	0.35
677	0.31
678	0.38
679	0.44
680	0.41
681	0.44
682	0.49
683	0.55
684	0.61
685	0.56
686	0.56
687	0.48
688	0.49
689	0.46
690	0.41
691	0.32
692	0.27
693	0.28
694	0.2
695	0.19
696	0.14
697	0.13
698	0.13
699	0.13
700	0.12
701	0.11
702	0.14
703	0.14
704	0.16
705	0.18
706	0.27
707	0.28
708	0.31
709	0.33
710	0.39
711	0.41
712	0.42
713	0.42
714	0.38
715	0.39
716	0.38
717	0.4
718	0.35
719	0.34
720	0.32
721	0.29
722	0.25
723	0.22
724	0.21
725	0.17
726	0.21
727	0.22
728	0.2
729	0.2
730	0.18
731	0.19
732	0.17
733	0.18
734	0.12
735	0.1
736	0.12
737	0.11
738	0.12
739	0.11
740	0.12
741	0.1
742	0.09
743	0.14
744	0.14
745	0.14
746	0.14
747	0.15
748	0.18
749	0.19
750	0.23
751	0.19
752	0.19
753	0.2
754	0.21
755	0.22
756	0.19
757	0.19
758	0.15
759	0.14
760	0.13
761	0.13
762	0.12
763	0.12
764	0.11
765	0.1
766	0.12
767	0.13
768	0.15
769	0.18
770	0.2
771	0.19
772	0.21
773	0.23
774	0.24
775	0.23
776	0.25
777	0.25
778	0.26
779	0.25
780	0.23
781	0.22
782	0.21
783	0.21
784	0.19
785	0.23
786	0.27
787	0.3
788	0.33
789	0.34
790	0.41
791	0.45
792	0.46
793	0.4
794	0.35
795	0.34
796	0.33
797	0.33
798	0.26
799	0.31
800	0.33
801	0.35
802	0.36
803	0.35
804	0.37
805	0.37
806	0.38
807	0.35
808	0.4
809	0.41
810	0.43
811	0.47
812	0.44
813	0.45
814	0.44
815	0.38
816	0.31
817	0.3
818	0.31
819	0.28
820	0.29
821	0.31
822	0.3
823	0.3
824	0.3
825	0.33
826	0.31
827	0.32
828	0.34
829	0.29
830	0.29
831	0.34
832	0.37
833	0.31
834	0.28
835	0.27
836	0.25
837	0.26
838	0.29
839	0.25
840	0.23
841	0.27
842	0.29
843	0.29
844	0.32
845	0.32
846	0.36
847	0.41
848	0.44
849	0.41
850	0.43
851	0.45
852	0.48
853	0.53
854	0.49
855	0.51
856	0.53
857	0.57
858	0.58
859	0.6
860	0.51
861	0.45
862	0.45
863	0.4
864	0.42
865	0.36
866	0.35
867	0.31
868	0.35
869	0.34
870	0.34
871	0.36
872	0.28
873	0.3

A0A1Z5SRL3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer