Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Z5SVW1

Protein Details
Accession A0A1Z5SVW1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
472-495SQSQGTPKKRGRPRKSATDEPNAKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
437-442ARRKRK
478-505PKKRGRPRKSATDEPNAKQSRKSSGKGK
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 12, cyto 9, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
Gene Ontology GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF00867  XPG_I  
CDD cd09870  PIN_YEN1  
Amino Acid Sequences MGINGLWDVIGKGEIVHIADYAAQHFRKHGRPLRIAVDEACWRFTNLTPEQVEKIRDGEPAANPVEKTILWRILRLMKLNVQLLFVYDGPSKPWKSGRGGDGLLDKELVKLLHQLLDTLKVPYHRAPGEAEAECAALEQRGVVDAVWADDGDAFMFGCQTLIKQHKVDGQRIKDYVRIYRAETILKECDLDRDSLVLFAMLAGGDYDTQGLRGCGPKTAAKASRTERGVARKARDIHKYPQQVVLWRQALDHALRSSGSSVEIPTSFPNQKALGNYLYPNISPPEVLDNLRALRQGWEQKIDQYKLRKLLRERFNIWTKGFINHLAPIYLVRALARATPEQRAENLQYAVQLKRTRKNKDDAETPTPSEVKITFSPLPAMEINLSQKPPEEDWDLPGWKGKDGASYDPLQKIEAEILRCFLDHGLPEGGVAPPPEPARRKRKGSVGEEGEADQTKKSTPKQSQDESVSANNSQSQGTPKKRGRPRKSATDEPNAKQSRKSSGKGKEADATPDLPPTPPRPVFKLPRSRFPTQSTPPAPPPVTEPAVQDPAGSSSPEAPASGIKSQMRVSAPPNTVVEPFSPAIARREGFVPGESIPVEDLRELRAASSLLCQHHHHQQQQQQQQNHTSEREAVNPQSQPSSTSVPATQPGRATSSKPSRVHEVIDLT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.1
4 0.09
5 0.09
6 0.11
7 0.11
8 0.13
9 0.18
10 0.19
11 0.19
12 0.25
13 0.31
14 0.37
15 0.47
16 0.53
17 0.56
18 0.62
19 0.67
20 0.7
21 0.67
22 0.62
23 0.53
24 0.5
25 0.47
26 0.42
27 0.39
28 0.32
29 0.29
30 0.29
31 0.3
32 0.33
33 0.29
34 0.35
35 0.34
36 0.36
37 0.39
38 0.42
39 0.41
40 0.34
41 0.34
42 0.27
43 0.26
44 0.26
45 0.27
46 0.25
47 0.28
48 0.29
49 0.28
50 0.26
51 0.26
52 0.25
53 0.2
54 0.22
55 0.23
56 0.29
57 0.27
58 0.28
59 0.32
60 0.38
61 0.42
62 0.41
63 0.4
64 0.37
65 0.42
66 0.45
67 0.41
68 0.35
69 0.31
70 0.28
71 0.26
72 0.21
73 0.18
74 0.16
75 0.16
76 0.18
77 0.25
78 0.25
79 0.26
80 0.32
81 0.34
82 0.39
83 0.45
84 0.46
85 0.45
86 0.45
87 0.44
88 0.43
89 0.39
90 0.33
91 0.28
92 0.23
93 0.17
94 0.18
95 0.15
96 0.11
97 0.13
98 0.14
99 0.17
100 0.17
101 0.18
102 0.17
103 0.22
104 0.22
105 0.19
106 0.2
107 0.18
108 0.21
109 0.23
110 0.29
111 0.25
112 0.26
113 0.27
114 0.29
115 0.33
116 0.3
117 0.28
118 0.21
119 0.2
120 0.18
121 0.16
122 0.12
123 0.07
124 0.06
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.05
147 0.12
148 0.17
149 0.21
150 0.22
151 0.25
152 0.31
153 0.36
154 0.44
155 0.46
156 0.47
157 0.49
158 0.5
159 0.49
160 0.46
161 0.44
162 0.42
163 0.38
164 0.34
165 0.31
166 0.34
167 0.35
168 0.34
169 0.32
170 0.31
171 0.28
172 0.26
173 0.24
174 0.19
175 0.21
176 0.19
177 0.19
178 0.15
179 0.14
180 0.14
181 0.13
182 0.13
183 0.08
184 0.07
185 0.05
186 0.05
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.07
199 0.11
200 0.11
201 0.13
202 0.16
203 0.18
204 0.21
205 0.28
206 0.32
207 0.3
208 0.36
209 0.38
210 0.43
211 0.41
212 0.41
213 0.38
214 0.41
215 0.46
216 0.45
217 0.45
218 0.45
219 0.49
220 0.52
221 0.55
222 0.53
223 0.52
224 0.55
225 0.58
226 0.53
227 0.54
228 0.5
229 0.46
230 0.44
231 0.46
232 0.39
233 0.33
234 0.31
235 0.26
236 0.26
237 0.22
238 0.22
239 0.14
240 0.12
241 0.12
242 0.13
243 0.12
244 0.1
245 0.1
246 0.08
247 0.08
248 0.09
249 0.09
250 0.1
251 0.1
252 0.15
253 0.15
254 0.15
255 0.17
256 0.17
257 0.18
258 0.19
259 0.2
260 0.17
261 0.17
262 0.18
263 0.16
264 0.16
265 0.14
266 0.14
267 0.12
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.11
272 0.12
273 0.13
274 0.13
275 0.13
276 0.14
277 0.15
278 0.15
279 0.11
280 0.12
281 0.16
282 0.21
283 0.21
284 0.24
285 0.24
286 0.28
287 0.34
288 0.34
289 0.34
290 0.34
291 0.36
292 0.41
293 0.44
294 0.44
295 0.44
296 0.52
297 0.56
298 0.56
299 0.56
300 0.55
301 0.58
302 0.57
303 0.51
304 0.46
305 0.39
306 0.33
307 0.31
308 0.25
309 0.2
310 0.18
311 0.17
312 0.12
313 0.11
314 0.1
315 0.1
316 0.08
317 0.07
318 0.05
319 0.06
320 0.06
321 0.07
322 0.09
323 0.1
324 0.11
325 0.14
326 0.16
327 0.16
328 0.16
329 0.18
330 0.18
331 0.19
332 0.18
333 0.15
334 0.15
335 0.17
336 0.17
337 0.19
338 0.22
339 0.23
340 0.3
341 0.38
342 0.43
343 0.45
344 0.53
345 0.55
346 0.55
347 0.59
348 0.58
349 0.56
350 0.52
351 0.48
352 0.42
353 0.35
354 0.3
355 0.24
356 0.18
357 0.15
358 0.13
359 0.17
360 0.16
361 0.17
362 0.18
363 0.16
364 0.18
365 0.15
366 0.15
367 0.1
368 0.11
369 0.13
370 0.14
371 0.14
372 0.12
373 0.13
374 0.14
375 0.14
376 0.16
377 0.18
378 0.16
379 0.19
380 0.23
381 0.23
382 0.21
383 0.24
384 0.21
385 0.17
386 0.18
387 0.15
388 0.15
389 0.17
390 0.19
391 0.19
392 0.21
393 0.23
394 0.25
395 0.25
396 0.2
397 0.18
398 0.16
399 0.16
400 0.16
401 0.16
402 0.13
403 0.15
404 0.14
405 0.14
406 0.14
407 0.11
408 0.1
409 0.08
410 0.1
411 0.1
412 0.09
413 0.09
414 0.1
415 0.09
416 0.09
417 0.09
418 0.07
419 0.08
420 0.1
421 0.16
422 0.2
423 0.28
424 0.38
425 0.45
426 0.52
427 0.55
428 0.62
429 0.66
430 0.67
431 0.68
432 0.63
433 0.56
434 0.51
435 0.46
436 0.39
437 0.31
438 0.25
439 0.16
440 0.12
441 0.12
442 0.16
443 0.2
444 0.27
445 0.33
446 0.42
447 0.5
448 0.54
449 0.58
450 0.58
451 0.56
452 0.5
453 0.45
454 0.37
455 0.3
456 0.27
457 0.22
458 0.18
459 0.16
460 0.14
461 0.19
462 0.26
463 0.32
464 0.41
465 0.45
466 0.54
467 0.63
468 0.73
469 0.76
470 0.78
471 0.79
472 0.8
473 0.83
474 0.83
475 0.81
476 0.8
477 0.78
478 0.69
479 0.72
480 0.66
481 0.59
482 0.53
483 0.48
484 0.48
485 0.47
486 0.5
487 0.49
488 0.54
489 0.62
490 0.61
491 0.61
492 0.57
493 0.52
494 0.51
495 0.44
496 0.38
497 0.29
498 0.28
499 0.26
500 0.2
501 0.22
502 0.21
503 0.28
504 0.31
505 0.33
506 0.37
507 0.46
508 0.54
509 0.6
510 0.68
511 0.63
512 0.69
513 0.73
514 0.72
515 0.69
516 0.66
517 0.66
518 0.61
519 0.67
520 0.6
521 0.58
522 0.57
523 0.59
524 0.53
525 0.44
526 0.42
527 0.39
528 0.38
529 0.33
530 0.32
531 0.3
532 0.33
533 0.32
534 0.27
535 0.22
536 0.22
537 0.22
538 0.19
539 0.14
540 0.13
541 0.14
542 0.15
543 0.14
544 0.12
545 0.13
546 0.16
547 0.17
548 0.21
549 0.2
550 0.23
551 0.24
552 0.29
553 0.29
554 0.28
555 0.3
556 0.33
557 0.34
558 0.35
559 0.36
560 0.32
561 0.31
562 0.3
563 0.27
564 0.23
565 0.21
566 0.19
567 0.18
568 0.18
569 0.2
570 0.24
571 0.23
572 0.2
573 0.21
574 0.23
575 0.23
576 0.22
577 0.2
578 0.16
579 0.19
580 0.17
581 0.16
582 0.14
583 0.13
584 0.13
585 0.12
586 0.13
587 0.12
588 0.15
589 0.14
590 0.13
591 0.14
592 0.14
593 0.13
594 0.18
595 0.21
596 0.22
597 0.25
598 0.28
599 0.3
600 0.4
601 0.47
602 0.49
603 0.52
604 0.58
605 0.65
606 0.71
607 0.76
608 0.73
609 0.71
610 0.72
611 0.7
612 0.67
613 0.59
614 0.52
615 0.49
616 0.45
617 0.44
618 0.41
619 0.39
620 0.4
621 0.4
622 0.39
623 0.37
624 0.36
625 0.33
626 0.32
627 0.34
628 0.29
629 0.3
630 0.3
631 0.28
632 0.35
633 0.34
634 0.33
635 0.31
636 0.32
637 0.34
638 0.34
639 0.34
640 0.38
641 0.47
642 0.53
643 0.54
644 0.56
645 0.59
646 0.6
647 0.6