FuNGI

A0A1Z5SMC6

Protein Details

Accession

A0A1Z5SMC6

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
17-41	INTPSGPRPVPKKKPEVPKCCDEPD	Hydrophilic
334-360	KTAREQEKWEEKKRKRQEHNTQRETME	Basic
458-483	GQEANPPKRKRGRPRKEKPEPVQITE	Basic
615-643	AEASGAGKKDNRRKTRKKKGRMGDGSVLL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
346-348	KRK
463-476	PPKRKRGRPRKEKP
620-635	AGKKDNRRKTRKKKGR

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011665 BRF1_TBP-bd_dom IPR013763 Cyclin-like_dom IPR036915 Cyclin-like_sf IPR000812 TFIIB IPR013150 TFIIB_cyclin
Gene Ontology	GO:0017025 F:TBP-class protein binding GO:0070897 P:transcription preinitiation complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF07741 BRF1 PF00382 TFIIB
CDD	cd20554 CYCLIN_TFIIIB90_rpt2

Amino Acid Sequences

MPAPVAAPRRAQRLGSINTPSGPRPVPKKKPEVPKCCDEPDPVDEDGAKVCANCGVQLAVSNIVADVTFQEDSRGAAQVQGGFIGEKARHANTLGAGAFRRIGGGERNASQEIENNGRRILQSMCPRLNVPDATRDAAQLLFIIAAGNGFNAGRRSEEVVAACLYMACRRRKENTVLLMDISEIVKVNVFRLGEVYKDLKKTLHINDPEAIGVQQLVEVEPLIEKFCRKLEFGEKTRVVAEDAVKIIKRMKRDWMVSGRHPAGLCGACIILAARMNNFRRSVREVVYIAKVAGVTIHQRLEEFKRTRSAALTVDQFREFASRLKYQHDPPVLAKTAREQEKWEEKKRKRQEHNTQRETMERERQSRERSAIEIPDDNDDASSRATSAAPEVNEEGDLQPQTKRQRVDGPLPTPASTQEPRFDAEGFAIPALPIPVDPALTGEQPATTNDAQEAGQETGQEANPPKRKRGRPRKEKPEPVQITEEELTAEQEIEDEIDEALNDQELMDSLTDLERTKNEERAKVLAEQEKQRAAEQNHERREATGVNWWQAREAWEKGTDEVVTEADLEAEFANDPEVMNCKLSDQESRIKEQIWVAHNEDWLRSQHEKQLIKQIAEASGAGKKDNRRKTRKKKGRMGDGSVLLEAETPIETPADANLAMLKKRAAPNISKFIDYERLAAVYGDRSSPAASSTSQSRAESEAPGNPPSRAASNAPDAQAGADGAATPMQQWDPAAFGMQSPEPTQQNANDPKAPANQDQPAEGGEEDDADEDDGDEGDDPRSSPPVSNVDGYDDYQSDQGEGGYNDDDDYERAVDEASFGFNDGGYF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.5
3	0.51
4	0.46
5	0.46
6	0.48
7	0.42
8	0.39
9	0.38
10	0.37
11	0.42
12	0.51
13	0.58
14	0.65
15	0.74
16	0.77
17	0.84
18	0.89
19	0.89
20	0.85
21	0.84
22	0.81
23	0.76
24	0.71
25	0.65
26	0.6
27	0.54
28	0.51
29	0.42
30	0.37
31	0.31
32	0.28
33	0.24
34	0.2
35	0.16
36	0.11
37	0.11
38	0.13
39	0.13
40	0.13
41	0.13
42	0.12
43	0.12
44	0.14
45	0.16
46	0.14
47	0.13
48	0.13
49	0.11
50	0.11
51	0.1
52	0.08
53	0.07
54	0.09
55	0.09
56	0.09
57	0.11
58	0.11
59	0.13
60	0.14
61	0.16
62	0.12
63	0.13
64	0.15
65	0.16
66	0.15
67	0.14
68	0.13
69	0.11
70	0.11
71	0.14
72	0.12
73	0.14
74	0.17
75	0.18
76	0.19
77	0.2
78	0.22
79	0.19
80	0.24
81	0.21
82	0.2
83	0.19
84	0.19
85	0.19
86	0.16
87	0.15
88	0.11
89	0.13
90	0.15
91	0.2
92	0.23
93	0.25
94	0.29
95	0.29
96	0.3
97	0.28
98	0.27
99	0.27
100	0.32
101	0.33
102	0.3
103	0.3
104	0.3
105	0.3
106	0.28
107	0.26
108	0.25
109	0.31
110	0.39
111	0.41
112	0.41
113	0.42
114	0.42
115	0.44
116	0.4
117	0.33
118	0.32
119	0.33
120	0.34
121	0.33
122	0.31
123	0.26
124	0.22
125	0.2
126	0.12
127	0.1
128	0.07
129	0.06
130	0.06
131	0.05
132	0.05
133	0.04
134	0.04
135	0.04
136	0.04
137	0.06
138	0.08
139	0.08
140	0.1
141	0.12
142	0.16
143	0.17
144	0.21
145	0.2
146	0.2
147	0.2
148	0.18
149	0.16
150	0.12
151	0.11
152	0.14
153	0.2
154	0.24
155	0.29
156	0.35
157	0.41
158	0.47
159	0.54
160	0.57
161	0.59
162	0.58
163	0.54
164	0.49
165	0.43
166	0.36
167	0.3
168	0.21
169	0.13
170	0.08
171	0.07
172	0.09
173	0.09
174	0.09
175	0.11
176	0.11
177	0.1
178	0.13
179	0.13
180	0.12
181	0.16
182	0.2
183	0.2
184	0.22
185	0.23
186	0.22
187	0.25
188	0.3
189	0.32
190	0.38
191	0.36
192	0.38
193	0.39
194	0.38
195	0.35
196	0.29
197	0.23
198	0.14
199	0.11
200	0.07
201	0.06
202	0.05
203	0.05
204	0.05
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.06
209	0.07
210	0.08
211	0.08
212	0.1
213	0.14
214	0.16
215	0.17
216	0.21
217	0.29
218	0.38
219	0.42
220	0.5
221	0.46
222	0.45
223	0.45
224	0.41
225	0.33
226	0.26
227	0.23
228	0.16
229	0.17
230	0.18
231	0.17
232	0.17
233	0.22
234	0.22
235	0.25
236	0.25
237	0.32
238	0.37
239	0.4
240	0.47
241	0.49
242	0.53
243	0.52
244	0.57
245	0.5
246	0.45
247	0.42
248	0.35
249	0.31
250	0.25
251	0.21
252	0.13
253	0.12
254	0.09
255	0.09
256	0.09
257	0.06
258	0.07
259	0.08
260	0.09
261	0.16
262	0.18
263	0.22
264	0.25
265	0.25
266	0.27
267	0.33
268	0.35
269	0.31
270	0.33
271	0.31
272	0.31
273	0.32
274	0.28
275	0.22
276	0.19
277	0.16
278	0.11
279	0.1
280	0.08
281	0.08
282	0.1
283	0.11
284	0.1
285	0.11
286	0.14
287	0.19
288	0.27
289	0.28
290	0.28
291	0.33
292	0.34
293	0.35
294	0.33
295	0.31
296	0.24
297	0.24
298	0.28
299	0.25
300	0.26
301	0.25
302	0.23
303	0.2
304	0.2
305	0.17
306	0.15
307	0.18
308	0.2
309	0.21
310	0.25
311	0.29
312	0.31
313	0.37
314	0.36
315	0.34
316	0.31
317	0.36
318	0.34
319	0.3
320	0.28
321	0.25
322	0.29
323	0.31
324	0.3
325	0.26
326	0.31
327	0.42
328	0.49
329	0.54
330	0.57
331	0.6
332	0.7
333	0.78
334	0.81
335	0.81
336	0.84
337	0.86
338	0.87
339	0.91
340	0.87
341	0.8
342	0.71
343	0.65
344	0.59
345	0.52
346	0.49
347	0.43
348	0.41
349	0.43
350	0.46
351	0.47
352	0.46
353	0.44
354	0.37
355	0.35
356	0.33
357	0.29
358	0.26
359	0.24
360	0.2
361	0.19
362	0.18
363	0.15
364	0.13
365	0.11
366	0.1
367	0.08
368	0.07
369	0.05
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.07
374	0.09
375	0.09
376	0.1
377	0.1
378	0.09
379	0.09
380	0.1
381	0.08
382	0.08
383	0.08
384	0.08
385	0.08
386	0.13
387	0.17
388	0.21
389	0.22
390	0.22
391	0.3
392	0.33
393	0.4
394	0.42
395	0.4
396	0.41
397	0.41
398	0.39
399	0.31
400	0.28
401	0.25
402	0.2
403	0.19
404	0.17
405	0.17
406	0.17
407	0.18
408	0.17
409	0.13
410	0.12
411	0.12
412	0.1
413	0.09
414	0.07
415	0.06
416	0.06
417	0.06
418	0.05
419	0.03
420	0.04
421	0.04
422	0.04
423	0.04
424	0.06
425	0.07
426	0.07
427	0.08
428	0.07
429	0.07
430	0.08
431	0.08
432	0.11
433	0.09
434	0.09
435	0.09
436	0.1
437	0.1
438	0.1
439	0.11
440	0.08
441	0.08
442	0.08
443	0.08
444	0.09
445	0.09
446	0.11
447	0.11
448	0.18
449	0.26
450	0.28
451	0.35
452	0.43
453	0.52
454	0.61
455	0.7
456	0.74
457	0.77
458	0.87
459	0.91
460	0.92
461	0.93
462	0.88
463	0.88
464	0.8
465	0.72
466	0.65
467	0.54
468	0.48
469	0.38
470	0.32
471	0.21
472	0.17
473	0.14
474	0.1
475	0.1
476	0.05
477	0.05
478	0.04
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.04
486	0.04
487	0.04
488	0.04
489	0.03
490	0.03
491	0.03
492	0.04
493	0.04
494	0.04
495	0.04
496	0.05
497	0.06
498	0.06
499	0.07
500	0.08
501	0.14
502	0.16
503	0.23
504	0.26
505	0.28
506	0.3
507	0.32
508	0.33
509	0.3
510	0.33
511	0.32
512	0.33
513	0.34
514	0.35
515	0.36
516	0.34
517	0.33
518	0.35
519	0.3
520	0.35
521	0.41
522	0.47
523	0.49
524	0.51
525	0.49
526	0.43
527	0.45
528	0.36
529	0.27
530	0.26
531	0.23
532	0.24
533	0.26
534	0.25
535	0.23
536	0.23
537	0.25
538	0.21
539	0.21
540	0.19
541	0.2
542	0.21
543	0.21
544	0.22
545	0.19
546	0.14
547	0.13
548	0.11
549	0.08
550	0.08
551	0.07
552	0.06
553	0.05
554	0.06
555	0.05
556	0.05
557	0.05
558	0.04
559	0.05
560	0.05
561	0.05
562	0.05
563	0.08
564	0.09
565	0.1
566	0.1
567	0.1
568	0.12
569	0.14
570	0.17
571	0.18
572	0.25
573	0.27
574	0.32
575	0.33
576	0.31
577	0.32
578	0.3
579	0.33
580	0.28
581	0.3
582	0.29
583	0.3
584	0.31
585	0.3
586	0.28
587	0.24
588	0.22
589	0.23
590	0.23
591	0.23
592	0.27
593	0.35
594	0.37
595	0.38
596	0.47
597	0.45
598	0.42
599	0.42
600	0.38
601	0.31
602	0.29
603	0.26
604	0.17
605	0.16
606	0.16
607	0.15
608	0.17
609	0.24
610	0.32
611	0.42
612	0.51
613	0.59
614	0.7
615	0.81
616	0.88
617	0.92
618	0.93
619	0.93
620	0.93
621	0.93
622	0.9
623	0.86
624	0.81
625	0.74
626	0.64
627	0.54
628	0.44
629	0.32
630	0.24
631	0.16
632	0.1
633	0.06
634	0.05
635	0.05
636	0.06
637	0.06
638	0.05
639	0.06
640	0.07
641	0.07
642	0.06
643	0.1
644	0.12
645	0.13
646	0.14
647	0.15
648	0.19
649	0.23
650	0.29
651	0.3
652	0.35
653	0.42
654	0.51
655	0.52
656	0.47
657	0.43
658	0.41
659	0.44
660	0.37
661	0.32
662	0.23
663	0.22
664	0.21
665	0.21
666	0.18
667	0.13
668	0.13
669	0.12
670	0.11
671	0.11
672	0.12
673	0.12
674	0.12
675	0.11
676	0.11
677	0.13
678	0.17
679	0.21
680	0.24
681	0.24
682	0.25
683	0.26
684	0.27
685	0.28
686	0.27
687	0.28
688	0.28
689	0.31
690	0.31
691	0.28
692	0.28
693	0.26
694	0.25
695	0.23
696	0.23
697	0.23
698	0.29
699	0.32
700	0.31
701	0.29
702	0.27
703	0.24
704	0.22
705	0.17
706	0.1
707	0.07
708	0.06
709	0.06
710	0.06
711	0.06
712	0.05
713	0.07
714	0.08
715	0.08
716	0.09
717	0.09
718	0.1
719	0.1
720	0.12
721	0.1
722	0.1
723	0.13
724	0.14
725	0.15
726	0.16
727	0.21
728	0.21
729	0.23
730	0.26
731	0.25
732	0.34
733	0.4
734	0.43
735	0.42
736	0.42
737	0.44
738	0.48
739	0.5
740	0.45
741	0.43
742	0.44
743	0.41
744	0.4
745	0.37
746	0.31
747	0.28
748	0.23
749	0.17
750	0.11
751	0.11
752	0.1
753	0.1
754	0.09
755	0.08
756	0.08
757	0.07
758	0.07
759	0.07
760	0.07
761	0.07
762	0.08
763	0.08
764	0.09
765	0.09
766	0.11
767	0.14
768	0.15
769	0.16
770	0.2
771	0.25
772	0.28
773	0.3
774	0.29
775	0.31
776	0.33
777	0.32
778	0.3
779	0.25
780	0.23
781	0.22
782	0.21
783	0.16
784	0.14
785	0.13
786	0.13
787	0.13
788	0.14
789	0.13
790	0.13
791	0.13
792	0.14
793	0.14
794	0.11
795	0.14
796	0.12
797	0.11
798	0.11
799	0.11
800	0.1
801	0.11
802	0.11
803	0.1
804	0.1
805	0.11
806	0.11

A0A1Z5SMC6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer