Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Z5SQV6

Protein Details
Accession A0A1Z5SQV6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-129EDASAGKRKARRQPAKHIKGPNGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
95-126VRRSPRKAPKLDEDASAGKRKARRQPAKHIKG
Subcellular Location(s) cysk 13, cyto 9, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR004036  Endonuclease-III-like_CS2  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
IPR000445  HhH_motif  
IPR030841  NTH1  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0140078  F:class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000703  F:oxidized pyrimidine nucleobase lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00633  HHH  
PF00730  HhH-GPD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01155  ENDONUCLEASE_III_2  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MPAHGSAFGGIVLSSDGTLMEFVGEKRRSTRHSLRNFTNGNESGDVKIEDAVKEESPLSALPSSPNRPNGFSESGKRKRSAPATSDAVSGRDSNVRRSPRKAPKLDEDASAGKRKARRQPAKHIKGPNGSLTVEPPPNWERMYDMTTAMRKRVIAPVDTMGCESLAEEHRSPQDQRLQTLVSLMLSSQTKDTVTAAAMRNLQQNLPGGFFLQSLLDVNPDELNELIGKVGFHNTKTKYIKNVAIILREKFNSDIPDTIEGLVSLPGVGPKMAYLCMSAAWGRDEGIGVDVHVHRITNLWGWHKTANAEQTRAELESWLPREKWHDINHMLVGFGQTICLPVGRRCGECDLATEKLCPSAVAGSPVKRKVKKEVELKVQPKVEGDSVVKEEFTEVKKDDVGIEIEAESAEAGAVEVMQTAGRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.05
3 0.05
4 0.05
5 0.06
6 0.05
7 0.06
8 0.07
9 0.08
10 0.18
11 0.2
12 0.22
13 0.27
14 0.34
15 0.38
16 0.46
17 0.56
18 0.57
19 0.65
20 0.72
21 0.73
22 0.76
23 0.74
24 0.67
25 0.66
26 0.58
27 0.51
28 0.45
29 0.4
30 0.31
31 0.31
32 0.28
33 0.2
34 0.2
35 0.18
36 0.16
37 0.17
38 0.19
39 0.16
40 0.17
41 0.17
42 0.15
43 0.14
44 0.14
45 0.14
46 0.12
47 0.13
48 0.16
49 0.22
50 0.28
51 0.32
52 0.4
53 0.39
54 0.41
55 0.45
56 0.47
57 0.46
58 0.45
59 0.48
60 0.51
61 0.58
62 0.6
63 0.58
64 0.55
65 0.57
66 0.61
67 0.6
68 0.53
69 0.51
70 0.51
71 0.51
72 0.5
73 0.43
74 0.36
75 0.29
76 0.25
77 0.19
78 0.21
79 0.21
80 0.25
81 0.32
82 0.4
83 0.43
84 0.49
85 0.58
86 0.62
87 0.71
88 0.72
89 0.71
90 0.71
91 0.74
92 0.7
93 0.62
94 0.55
95 0.5
96 0.47
97 0.46
98 0.38
99 0.33
100 0.37
101 0.43
102 0.48
103 0.54
104 0.61
105 0.63
106 0.74
107 0.81
108 0.85
109 0.85
110 0.83
111 0.79
112 0.75
113 0.69
114 0.62
115 0.53
116 0.45
117 0.37
118 0.32
119 0.29
120 0.24
121 0.22
122 0.23
123 0.22
124 0.23
125 0.23
126 0.21
127 0.18
128 0.2
129 0.23
130 0.19
131 0.18
132 0.2
133 0.24
134 0.25
135 0.24
136 0.22
137 0.19
138 0.2
139 0.24
140 0.23
141 0.19
142 0.2
143 0.22
144 0.22
145 0.22
146 0.2
147 0.15
148 0.12
149 0.11
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.13
154 0.13
155 0.15
156 0.17
157 0.2
158 0.21
159 0.23
160 0.28
161 0.27
162 0.28
163 0.28
164 0.27
165 0.24
166 0.24
167 0.2
168 0.11
169 0.1
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.09
179 0.07
180 0.07
181 0.12
182 0.12
183 0.14
184 0.16
185 0.16
186 0.19
187 0.19
188 0.19
189 0.15
190 0.17
191 0.15
192 0.14
193 0.13
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.09
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.09
217 0.09
218 0.1
219 0.17
220 0.19
221 0.27
222 0.31
223 0.33
224 0.34
225 0.38
226 0.41
227 0.37
228 0.41
229 0.35
230 0.37
231 0.37
232 0.33
233 0.32
234 0.28
235 0.26
236 0.21
237 0.21
238 0.18
239 0.16
240 0.17
241 0.16
242 0.18
243 0.17
244 0.17
245 0.14
246 0.12
247 0.11
248 0.09
249 0.07
250 0.05
251 0.04
252 0.04
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.06
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.09
281 0.1
282 0.11
283 0.12
284 0.16
285 0.19
286 0.21
287 0.23
288 0.24
289 0.25
290 0.25
291 0.25
292 0.3
293 0.29
294 0.29
295 0.27
296 0.28
297 0.28
298 0.27
299 0.23
300 0.15
301 0.14
302 0.19
303 0.22
304 0.24
305 0.22
306 0.23
307 0.28
308 0.32
309 0.37
310 0.36
311 0.41
312 0.4
313 0.43
314 0.44
315 0.39
316 0.34
317 0.27
318 0.23
319 0.15
320 0.13
321 0.1
322 0.07
323 0.08
324 0.08
325 0.09
326 0.1
327 0.11
328 0.2
329 0.23
330 0.24
331 0.26
332 0.3
333 0.32
334 0.31
335 0.33
336 0.29
337 0.29
338 0.29
339 0.28
340 0.23
341 0.22
342 0.22
343 0.17
344 0.14
345 0.15
346 0.15
347 0.2
348 0.23
349 0.27
350 0.35
351 0.43
352 0.51
353 0.52
354 0.55
355 0.6
356 0.66
357 0.69
358 0.72
359 0.74
360 0.75
361 0.8
362 0.8
363 0.77
364 0.7
365 0.62
366 0.54
367 0.48
368 0.38
369 0.33
370 0.31
371 0.28
372 0.28
373 0.28
374 0.26
375 0.22
376 0.23
377 0.23
378 0.24
379 0.25
380 0.22
381 0.24
382 0.25
383 0.26
384 0.25
385 0.23
386 0.22
387 0.17
388 0.17
389 0.15
390 0.14
391 0.13
392 0.12
393 0.08
394 0.06
395 0.05
396 0.04
397 0.04
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.04
402 0.04