Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H0EFL6

Protein Details
Accession H0EFL6    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-38SSHALAKNAKDKKHRTSKKSEKREVPSKVLSTHydrophilic
263-282ATVPAKKPVRQQPKGLKMRFHydrophilic
324-362TDTSSKKEASHGKKRRHEEKSGRKAEKKSKNSELQQIKIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-29KNAKDKKHRTSKKSEKR
329-353KKEASHGKKRRHEEKSGRKAEKKSK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MPKATPSSHALAKNAKDKKHRTSKKSEKREVPSKVLSTEFVEDSGDDSASDSDAESLPKIPSKSALTNNGKPPAPDGSDSSSENDSSSQESTEGEESGAEEQDDEDEEEVSQTAKGTNVPAPSAPPVVTTRAPVKYTPPTGFEKTTVKDVGAVSDAFKKSNLGGKQIWYFTAPASVPISSIENISLLDVKNGDTVYSKDGADYGFAKSSENDPEQNSGTILMIPSSTSEGYKTVSRPIDQVLHLRRIVSLPGVNDSGSASSKATVPAKKPVRQQPKGLKMRFLPIGFGEGDGGKLGSESSEESDVEMVDASNSVPAEPTKTHKTDTSSKKEASHGKKRRHEEKSGRKAEKKSKNSELQQIKIRPGYS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.58
3 0.62
4 0.66
5 0.72
6 0.76
7 0.8
8 0.8
9 0.84
10 0.88
11 0.89
12 0.92
13 0.92
14 0.9
15 0.9
16 0.91
17 0.87
18 0.84
19 0.8
20 0.72
21 0.65
22 0.57
23 0.49
24 0.42
25 0.38
26 0.3
27 0.23
28 0.2
29 0.17
30 0.17
31 0.16
32 0.12
33 0.09
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.07
39 0.08
40 0.09
41 0.1
42 0.1
43 0.11
44 0.13
45 0.17
46 0.17
47 0.17
48 0.2
49 0.25
50 0.31
51 0.35
52 0.44
53 0.48
54 0.55
55 0.61
56 0.62
57 0.57
58 0.51
59 0.47
60 0.42
61 0.37
62 0.31
63 0.28
64 0.27
65 0.3
66 0.31
67 0.31
68 0.27
69 0.24
70 0.22
71 0.2
72 0.15
73 0.15
74 0.14
75 0.12
76 0.11
77 0.11
78 0.13
79 0.13
80 0.13
81 0.1
82 0.09
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.08
87 0.06
88 0.06
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.09
104 0.12
105 0.13
106 0.13
107 0.13
108 0.15
109 0.16
110 0.16
111 0.14
112 0.13
113 0.14
114 0.17
115 0.17
116 0.18
117 0.21
118 0.23
119 0.25
120 0.23
121 0.26
122 0.29
123 0.33
124 0.32
125 0.31
126 0.33
127 0.35
128 0.36
129 0.34
130 0.32
131 0.28
132 0.31
133 0.27
134 0.22
135 0.21
136 0.2
137 0.18
138 0.15
139 0.14
140 0.11
141 0.16
142 0.17
143 0.14
144 0.14
145 0.14
146 0.13
147 0.2
148 0.2
149 0.18
150 0.19
151 0.22
152 0.25
153 0.25
154 0.24
155 0.18
156 0.18
157 0.13
158 0.15
159 0.12
160 0.1
161 0.11
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.09
167 0.09
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.08
182 0.09
183 0.11
184 0.1
185 0.09
186 0.1
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.1
194 0.1
195 0.12
196 0.15
197 0.16
198 0.17
199 0.16
200 0.19
201 0.19
202 0.19
203 0.17
204 0.13
205 0.11
206 0.1
207 0.09
208 0.06
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.07
214 0.06
215 0.07
216 0.08
217 0.1
218 0.12
219 0.13
220 0.17
221 0.19
222 0.2
223 0.21
224 0.23
225 0.25
226 0.24
227 0.3
228 0.29
229 0.32
230 0.31
231 0.3
232 0.28
233 0.25
234 0.24
235 0.19
236 0.16
237 0.12
238 0.14
239 0.15
240 0.14
241 0.13
242 0.13
243 0.12
244 0.11
245 0.11
246 0.09
247 0.09
248 0.1
249 0.14
250 0.19
251 0.21
252 0.23
253 0.32
254 0.4
255 0.45
256 0.52
257 0.59
258 0.65
259 0.66
260 0.73
261 0.74
262 0.77
263 0.82
264 0.75
265 0.71
266 0.62
267 0.63
268 0.59
269 0.48
270 0.39
271 0.3
272 0.3
273 0.25
274 0.22
275 0.17
276 0.11
277 0.11
278 0.1
279 0.09
280 0.06
281 0.06
282 0.05
283 0.04
284 0.05
285 0.06
286 0.08
287 0.1
288 0.1
289 0.11
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.1
294 0.07
295 0.06
296 0.06
297 0.05
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.12
304 0.14
305 0.21
306 0.27
307 0.3
308 0.33
309 0.35
310 0.42
311 0.48
312 0.56
313 0.59
314 0.58
315 0.59
316 0.6
317 0.64
318 0.67
319 0.67
320 0.68
321 0.68
322 0.71
323 0.77
324 0.84
325 0.87
326 0.84
327 0.85
328 0.85
329 0.87
330 0.88
331 0.89
332 0.89
333 0.87
334 0.88
335 0.88
336 0.88
337 0.86
338 0.84
339 0.83
340 0.84
341 0.83
342 0.84
343 0.82
344 0.78
345 0.78
346 0.74
347 0.71