Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Z5SSQ3

Protein Details
Accession A0A1Z5SSQ3    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
53-72TEAQKFKYDRETNQKKRKSGHydrophilic
234-254KERSHKGEKSEKKRKRGHVEDBasic
309-333GPTPISPLKRTKREKEKDRDSTKDDBasic
351-379SKHPEYREDKHARRRSRSKDRGERERESVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
228-250GSRREHKERSHKGEKSEKKRKRG
317-325KRTKREKEK
357-392REDKHARRRSRSKDRGERERESVTISKPAKTSTRHA
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039999  LYAR  
IPR014898  Znf_C2H2_LYAR  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08790  zf-LYAR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51804  ZF_C2HC_LYAR  
Amino Acid Sequences MVSFSCEGCGDVLTKKKLDSHRNQCYGASFTCLDCQTNFGYDTSYRAHTSCITEAQKFKYDRETNQKKRKSGMPGAFPDQHAQAMVPRNPYVEEVPEGADDSQAVAVVDVPPRAPTPPPAPEALPENVNVFDFLVSEETPKGSRKQVEAPNGARMVEEQRHYANGDSRYAQYSNGDGSQYSQYGFSYGHTPVQPGFQRYDSWNNMTDSQASQGALMPPPPPYVTPGPGSRREHKERSHKGEKSEKKRKRGHVEDLDLSSKRPASRGDDSMTDAPAIHGSGGRVLHSGLTGGLSKLVTDPEFYDDRIDAGPTPISPLKRTKREKEKDRDSTKDDRRKSSYTSYSTSTATKSSKHPEYREDKHARRRSRSKDRGERERESVTISKPAKTSTRHARSPSSSPEPHHHRSRTHGSSRHRDDHHHHHRPGSVQPSTSNQLTRHQPGSAAGASGSGNDKAALFLSFITKGPESERGCSVNKALKRYHREQTSQQLRITGGGSGVGGSGGGGDEDAGELMDDKELWKSLRVRRNERGEVVLFVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.31
3 0.38
4 0.47
5 0.55
6 0.6
7 0.63
8 0.7
9 0.74
10 0.74
11 0.69
12 0.63
13 0.57
14 0.47
15 0.41
16 0.32
17 0.26
18 0.3
19 0.29
20 0.27
21 0.23
22 0.24
23 0.21
24 0.23
25 0.23
26 0.18
27 0.2
28 0.18
29 0.22
30 0.22
31 0.24
32 0.23
33 0.22
34 0.24
35 0.24
36 0.28
37 0.28
38 0.32
39 0.33
40 0.37
41 0.42
42 0.44
43 0.49
44 0.46
45 0.46
46 0.49
47 0.5
48 0.53
49 0.6
50 0.66
51 0.69
52 0.78
53 0.83
54 0.77
55 0.77
56 0.76
57 0.74
58 0.73
59 0.71
60 0.69
61 0.67
62 0.69
63 0.67
64 0.61
65 0.53
66 0.44
67 0.36
68 0.27
69 0.21
70 0.2
71 0.24
72 0.26
73 0.28
74 0.27
75 0.28
76 0.28
77 0.3
78 0.27
79 0.22
80 0.2
81 0.18
82 0.18
83 0.18
84 0.18
85 0.16
86 0.13
87 0.11
88 0.09
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.05
93 0.06
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.1
99 0.11
100 0.13
101 0.14
102 0.17
103 0.22
104 0.27
105 0.29
106 0.3
107 0.3
108 0.3
109 0.34
110 0.3
111 0.25
112 0.2
113 0.19
114 0.18
115 0.17
116 0.15
117 0.11
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.09
124 0.09
125 0.1
126 0.12
127 0.14
128 0.17
129 0.21
130 0.24
131 0.27
132 0.36
133 0.42
134 0.49
135 0.54
136 0.53
137 0.53
138 0.5
139 0.46
140 0.37
141 0.31
142 0.28
143 0.24
144 0.23
145 0.2
146 0.2
147 0.21
148 0.22
149 0.23
150 0.23
151 0.21
152 0.22
153 0.22
154 0.22
155 0.25
156 0.24
157 0.23
158 0.18
159 0.17
160 0.16
161 0.15
162 0.14
163 0.11
164 0.13
165 0.14
166 0.13
167 0.13
168 0.11
169 0.1
170 0.11
171 0.11
172 0.09
173 0.11
174 0.11
175 0.14
176 0.14
177 0.15
178 0.14
179 0.21
180 0.22
181 0.21
182 0.23
183 0.2
184 0.22
185 0.25
186 0.32
187 0.29
188 0.29
189 0.31
190 0.3
191 0.3
192 0.28
193 0.26
194 0.19
195 0.17
196 0.16
197 0.12
198 0.11
199 0.11
200 0.12
201 0.11
202 0.11
203 0.1
204 0.1
205 0.11
206 0.11
207 0.1
208 0.13
209 0.15
210 0.16
211 0.19
212 0.24
213 0.28
214 0.35
215 0.4
216 0.43
217 0.49
218 0.54
219 0.57
220 0.59
221 0.65
222 0.67
223 0.71
224 0.74
225 0.69
226 0.68
227 0.72
228 0.74
229 0.74
230 0.75
231 0.73
232 0.73
233 0.79
234 0.81
235 0.81
236 0.8
237 0.79
238 0.76
239 0.74
240 0.67
241 0.61
242 0.55
243 0.44
244 0.37
245 0.28
246 0.21
247 0.16
248 0.15
249 0.14
250 0.17
251 0.21
252 0.24
253 0.24
254 0.24
255 0.26
256 0.26
257 0.24
258 0.18
259 0.14
260 0.11
261 0.09
262 0.08
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.04
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.06
279 0.05
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.06
284 0.07
285 0.07
286 0.1
287 0.11
288 0.11
289 0.12
290 0.11
291 0.12
292 0.11
293 0.11
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.1
299 0.12
300 0.13
301 0.15
302 0.24
303 0.31
304 0.41
305 0.49
306 0.55
307 0.64
308 0.73
309 0.81
310 0.82
311 0.85
312 0.85
313 0.85
314 0.81
315 0.76
316 0.76
317 0.76
318 0.74
319 0.68
320 0.65
321 0.63
322 0.61
323 0.59
324 0.57
325 0.55
326 0.5
327 0.49
328 0.45
329 0.41
330 0.4
331 0.36
332 0.29
333 0.25
334 0.22
335 0.22
336 0.24
337 0.29
338 0.37
339 0.42
340 0.43
341 0.48
342 0.55
343 0.59
344 0.64
345 0.66
346 0.66
347 0.7
348 0.76
349 0.76
350 0.77
351 0.81
352 0.81
353 0.83
354 0.85
355 0.85
356 0.87
357 0.88
358 0.88
359 0.87
360 0.81
361 0.74
362 0.67
363 0.56
364 0.51
365 0.45
366 0.36
367 0.37
368 0.34
369 0.32
370 0.3
371 0.32
372 0.33
373 0.33
374 0.4
375 0.42
376 0.49
377 0.52
378 0.55
379 0.59
380 0.58
381 0.6
382 0.6
383 0.57
384 0.52
385 0.5
386 0.55
387 0.56
388 0.59
389 0.62
390 0.59
391 0.53
392 0.58
393 0.64
394 0.64
395 0.64
396 0.65
397 0.65
398 0.7
399 0.76
400 0.76
401 0.69
402 0.67
403 0.65
404 0.69
405 0.71
406 0.71
407 0.65
408 0.61
409 0.62
410 0.58
411 0.58
412 0.54
413 0.46
414 0.37
415 0.37
416 0.38
417 0.39
418 0.38
419 0.36
420 0.3
421 0.34
422 0.39
423 0.42
424 0.39
425 0.36
426 0.34
427 0.31
428 0.34
429 0.28
430 0.21
431 0.16
432 0.15
433 0.14
434 0.14
435 0.15
436 0.1
437 0.1
438 0.1
439 0.1
440 0.09
441 0.1
442 0.09
443 0.08
444 0.08
445 0.11
446 0.12
447 0.12
448 0.15
449 0.15
450 0.16
451 0.18
452 0.26
453 0.27
454 0.28
455 0.32
456 0.33
457 0.34
458 0.36
459 0.38
460 0.37
461 0.38
462 0.41
463 0.45
464 0.5
465 0.57
466 0.62
467 0.66
468 0.67
469 0.69
470 0.71
471 0.74
472 0.75
473 0.72
474 0.66
475 0.6
476 0.52
477 0.47
478 0.4
479 0.3
480 0.2
481 0.14
482 0.13
483 0.1
484 0.09
485 0.07
486 0.06
487 0.04
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.03
492 0.03
493 0.03
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.05
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.07
503 0.09
504 0.12
505 0.14
506 0.19
507 0.27
508 0.36
509 0.44
510 0.54
511 0.61
512 0.68
513 0.77
514 0.78
515 0.74
516 0.72
517 0.65