Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Z5SYK8

Protein Details
Accession A0A1Z5SYK8    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-73AKNTAKTVEKESKKNKKSKKEPTPESSSSEHydrophilic
135-154SEEEAKPKKADKKADKKAEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-64KKTAAAAPAPAKTEKVKSGRVSKPAEAPKKVAKATAKNTAKTVEKESKKNKKSKKE
94-112KPKKAEAKTNGKAKAAAKK
140-163KPKKADKKADKKAEAPKTNGKAKK
260-262KRK
481-515RGGFGGRGRGRGDFGGRGGGRGGGRGGARGGGRGG
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAKDKTSSKKTAAAAPAPAKTEKVKSGRVSKPAEAPKKVAKATAKNTAKTVEKESKKNKKSKKEPTPESSSSEEDEDTSDSSESSDSESEEEAKPKKAEAKTNGKAKAAAKKESSSEESSEEESEDSSDSDSSESEEEAKPKKADKKADKKAEAPKTNGKAKKEASSSDSSSSDDSDSESEEDTKAGAKKPAAAAAKKDDSSDESSSDEESDEESNEKAKPASKTKEDSSDSDESSSSDDDEEMEDAPVAAKAAEESGKKRKAEDSAAGEAAPKRGKVMIEGVPKEPTANLFCGQLSWNVDEEWLTREFEGFGELKGVRIITDRDSGRSKGFGYIEFANVDDAISAVEEKQGAELDGRNIRLDFSEGRQNKQQDKGFNRAQQYGDVDKTPTTTLWVGNISFDADESMLTEAFSESGNIKGIRLPTDRETGAPKGFGYVEFYSVDDAKAAYEAMQGADVAGRPVRLDYASERSNDGGAGGARGGFGGRGRGRGDFGGRGGGRGGGRGGARGGGRGGSFNRGGFGDFSGKKVTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.54
3 0.53
4 0.49
5 0.47
6 0.42
7 0.39
8 0.4
9 0.4
10 0.41
11 0.46
12 0.5
13 0.59
14 0.64
15 0.68
16 0.69
17 0.65
18 0.68
19 0.71
20 0.72
21 0.66
22 0.64
23 0.64
24 0.66
25 0.62
26 0.6
27 0.58
28 0.58
29 0.6
30 0.65
31 0.64
32 0.58
33 0.59
34 0.58
35 0.55
36 0.5
37 0.52
38 0.51
39 0.52
40 0.6
41 0.68
42 0.74
43 0.77
44 0.84
45 0.85
46 0.86
47 0.89
48 0.91
49 0.91
50 0.91
51 0.91
52 0.89
53 0.89
54 0.81
55 0.75
56 0.68
57 0.6
58 0.5
59 0.43
60 0.34
61 0.26
62 0.23
63 0.19
64 0.16
65 0.15
66 0.13
67 0.11
68 0.11
69 0.11
70 0.09
71 0.11
72 0.11
73 0.1
74 0.11
75 0.12
76 0.15
77 0.17
78 0.22
79 0.22
80 0.27
81 0.27
82 0.28
83 0.35
84 0.38
85 0.44
86 0.48
87 0.56
88 0.59
89 0.67
90 0.69
91 0.62
92 0.61
93 0.57
94 0.57
95 0.52
96 0.5
97 0.45
98 0.44
99 0.45
100 0.45
101 0.46
102 0.4
103 0.36
104 0.32
105 0.3
106 0.3
107 0.27
108 0.22
109 0.17
110 0.14
111 0.13
112 0.11
113 0.09
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.11
123 0.13
124 0.17
125 0.2
126 0.25
127 0.25
128 0.31
129 0.39
130 0.43
131 0.52
132 0.58
133 0.66
134 0.72
135 0.8
136 0.78
137 0.77
138 0.8
139 0.8
140 0.75
141 0.69
142 0.68
143 0.64
144 0.69
145 0.67
146 0.6
147 0.57
148 0.55
149 0.56
150 0.5
151 0.46
152 0.43
153 0.43
154 0.42
155 0.38
156 0.36
157 0.3
158 0.27
159 0.25
160 0.2
161 0.14
162 0.13
163 0.1
164 0.11
165 0.1
166 0.11
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.12
172 0.12
173 0.14
174 0.16
175 0.16
176 0.19
177 0.2
178 0.26
179 0.27
180 0.27
181 0.28
182 0.31
183 0.35
184 0.32
185 0.31
186 0.26
187 0.24
188 0.28
189 0.26
190 0.2
191 0.18
192 0.18
193 0.18
194 0.17
195 0.14
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.13
207 0.18
208 0.25
209 0.3
210 0.34
211 0.38
212 0.4
213 0.47
214 0.45
215 0.42
216 0.41
217 0.38
218 0.34
219 0.3
220 0.28
221 0.2
222 0.19
223 0.17
224 0.11
225 0.08
226 0.07
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.04
241 0.07
242 0.08
243 0.12
244 0.2
245 0.25
246 0.26
247 0.27
248 0.29
249 0.3
250 0.33
251 0.34
252 0.31
253 0.29
254 0.29
255 0.27
256 0.26
257 0.22
258 0.21
259 0.17
260 0.12
261 0.1
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.15
266 0.18
267 0.24
268 0.26
269 0.26
270 0.26
271 0.26
272 0.25
273 0.2
274 0.16
275 0.12
276 0.12
277 0.12
278 0.11
279 0.11
280 0.12
281 0.12
282 0.13
283 0.12
284 0.12
285 0.12
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.1
292 0.1
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.11
298 0.09
299 0.07
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.1
305 0.08
306 0.09
307 0.11
308 0.1
309 0.16
310 0.16
311 0.19
312 0.23
313 0.24
314 0.23
315 0.23
316 0.22
317 0.2
318 0.21
319 0.18
320 0.19
321 0.19
322 0.19
323 0.17
324 0.17
325 0.12
326 0.11
327 0.1
328 0.06
329 0.05
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.06
339 0.06
340 0.07
341 0.08
342 0.11
343 0.14
344 0.15
345 0.15
346 0.15
347 0.15
348 0.15
349 0.16
350 0.14
351 0.14
352 0.23
353 0.24
354 0.27
355 0.34
356 0.38
357 0.41
358 0.47
359 0.49
360 0.48
361 0.52
362 0.56
363 0.57
364 0.57
365 0.56
366 0.52
367 0.48
368 0.43
369 0.42
370 0.38
371 0.32
372 0.28
373 0.25
374 0.21
375 0.22
376 0.2
377 0.15
378 0.14
379 0.14
380 0.13
381 0.14
382 0.16
383 0.15
384 0.14
385 0.15
386 0.12
387 0.1
388 0.1
389 0.08
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.07
394 0.06
395 0.06
396 0.07
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.07
401 0.06
402 0.08
403 0.11
404 0.11
405 0.11
406 0.14
407 0.16
408 0.2
409 0.22
410 0.25
411 0.26
412 0.31
413 0.31
414 0.3
415 0.33
416 0.32
417 0.31
418 0.28
419 0.24
420 0.21
421 0.21
422 0.2
423 0.21
424 0.17
425 0.18
426 0.17
427 0.18
428 0.18
429 0.18
430 0.17
431 0.11
432 0.11
433 0.09
434 0.08
435 0.08
436 0.06
437 0.07
438 0.08
439 0.08
440 0.08
441 0.08
442 0.07
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.09
447 0.08
448 0.08
449 0.09
450 0.11
451 0.1
452 0.13
453 0.16
454 0.23
455 0.25
456 0.26
457 0.28
458 0.27
459 0.27
460 0.24
461 0.19
462 0.15
463 0.12
464 0.12
465 0.1
466 0.09
467 0.09
468 0.09
469 0.09
470 0.07
471 0.08
472 0.15
473 0.17
474 0.21
475 0.23
476 0.24
477 0.27
478 0.29
479 0.32
480 0.27
481 0.26
482 0.31
483 0.29
484 0.29
485 0.27
486 0.27
487 0.23
488 0.22
489 0.21
490 0.16
491 0.17
492 0.17
493 0.17
494 0.17
495 0.17
496 0.17
497 0.18
498 0.16
499 0.16
500 0.19
501 0.2
502 0.22
503 0.24
504 0.23
505 0.24
506 0.22
507 0.23
508 0.2
509 0.22
510 0.25
511 0.24
512 0.26