Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Z5TBP2

Protein Details
Accession A0A1Z5TBP2    Localization Confidence High Confidence Score 22.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
131-156ASGTEEPRKKRPYKPRDPNAPKRPLTBasic
288-315PPPPPPPMKEKTPKSKKNKNIAPPTPAAHydrophilic
345-365TGESGKKSKKGRKTATAGAETHydrophilic
373-395QMQPEAPDTEKKKKKKKKGGDSSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
137-153PRKKRPYKPRDPNAPKR
293-306PPMKEKTPKSKKNK
337-357KKRKTADETGESGKKSKKGRK
383-392KKKKKKKKGG
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSNQFSSYDVPSYLRENAGAGGDAFMQGNGSNNFSAPQGEKRMVAVDVEQFVRTRDALSSAYMSLSSSIDKAVKAYIDHTNVILAGDASLNMSYLQQPFDQLAHASHIAQQAFNLASGQGNGVSAASGAGASGTEEPRKKRPYKPRDPNAPKRPLTAYFRYLQEMRGPLGEEMKQAAGGVPQKPGDLSKEATERWNKLSKQEQQPYRDAYQHALKDYEREVKKYKAEKNGGQQEEGAEDDDEDDDEHGDGEGGRDGEVDAAHTKDEQDSDDDDESSDEESSEDDEPAPPPPPPPMKEKTPKSKKNKNIAPPTPAADSNIDPVLTAQSQQQASSSPSKKRKTADETGESGKKSKKGRKTATAGAETPVPAPVAQMQPEAPDTEKKKKKKKKGGDSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.22
3 0.2
4 0.2
5 0.19
6 0.18
7 0.14
8 0.12
9 0.11
10 0.11
11 0.1
12 0.09
13 0.08
14 0.07
15 0.12
16 0.12
17 0.14
18 0.14
19 0.14
20 0.15
21 0.15
22 0.18
23 0.16
24 0.22
25 0.25
26 0.27
27 0.27
28 0.28
29 0.29
30 0.27
31 0.25
32 0.21
33 0.18
34 0.2
35 0.2
36 0.2
37 0.18
38 0.19
39 0.2
40 0.17
41 0.15
42 0.13
43 0.15
44 0.15
45 0.17
46 0.17
47 0.16
48 0.16
49 0.15
50 0.14
51 0.12
52 0.12
53 0.11
54 0.09
55 0.11
56 0.12
57 0.12
58 0.12
59 0.13
60 0.13
61 0.13
62 0.16
63 0.2
64 0.22
65 0.23
66 0.22
67 0.21
68 0.19
69 0.19
70 0.15
71 0.09
72 0.06
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.06
80 0.08
81 0.09
82 0.11
83 0.11
84 0.12
85 0.13
86 0.13
87 0.13
88 0.11
89 0.11
90 0.13
91 0.13
92 0.13
93 0.16
94 0.19
95 0.18
96 0.17
97 0.16
98 0.16
99 0.15
100 0.15
101 0.11
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.08
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.04
112 0.04
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.05
120 0.07
121 0.12
122 0.15
123 0.19
124 0.27
125 0.36
126 0.41
127 0.49
128 0.59
129 0.66
130 0.74
131 0.82
132 0.84
133 0.87
134 0.91
135 0.92
136 0.92
137 0.9
138 0.8
139 0.72
140 0.66
141 0.6
142 0.56
143 0.5
144 0.43
145 0.37
146 0.38
147 0.37
148 0.34
149 0.29
150 0.27
151 0.23
152 0.2
153 0.17
154 0.17
155 0.14
156 0.16
157 0.15
158 0.12
159 0.11
160 0.11
161 0.1
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.11
166 0.11
167 0.12
168 0.12
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.13
173 0.13
174 0.13
175 0.14
176 0.16
177 0.17
178 0.22
179 0.25
180 0.24
181 0.26
182 0.32
183 0.3
184 0.32
185 0.4
186 0.43
187 0.5
188 0.56
189 0.58
190 0.55
191 0.58
192 0.58
193 0.52
194 0.47
195 0.37
196 0.33
197 0.32
198 0.29
199 0.27
200 0.24
201 0.22
202 0.21
203 0.23
204 0.28
205 0.23
206 0.26
207 0.28
208 0.31
209 0.38
210 0.44
211 0.48
212 0.49
213 0.54
214 0.55
215 0.61
216 0.66
217 0.6
218 0.52
219 0.46
220 0.37
221 0.31
222 0.27
223 0.18
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.1
255 0.12
256 0.15
257 0.16
258 0.15
259 0.14
260 0.14
261 0.13
262 0.12
263 0.1
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.08
268 0.09
269 0.09
270 0.08
271 0.09
272 0.1
273 0.12
274 0.13
275 0.11
276 0.11
277 0.18
278 0.24
279 0.26
280 0.32
281 0.36
282 0.45
283 0.54
284 0.62
285 0.67
286 0.71
287 0.79
288 0.82
289 0.87
290 0.88
291 0.89
292 0.89
293 0.88
294 0.88
295 0.84
296 0.8
297 0.73
298 0.66
299 0.59
300 0.5
301 0.42
302 0.34
303 0.28
304 0.24
305 0.22
306 0.19
307 0.15
308 0.15
309 0.16
310 0.13
311 0.13
312 0.13
313 0.17
314 0.18
315 0.18
316 0.18
317 0.17
318 0.21
319 0.3
320 0.34
321 0.38
322 0.47
323 0.53
324 0.59
325 0.62
326 0.67
327 0.66
328 0.7
329 0.7
330 0.67
331 0.66
332 0.67
333 0.67
334 0.58
335 0.55
336 0.5
337 0.47
338 0.5
339 0.54
340 0.57
341 0.63
342 0.71
343 0.76
344 0.79
345 0.82
346 0.81
347 0.78
348 0.69
349 0.6
350 0.53
351 0.43
352 0.36
353 0.28
354 0.2
355 0.13
356 0.14
357 0.17
358 0.18
359 0.19
360 0.21
361 0.2
362 0.22
363 0.23
364 0.24
365 0.22
366 0.27
367 0.32
368 0.41
369 0.5
370 0.58
371 0.68
372 0.76
373 0.85
374 0.88
375 0.92