Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X6N409

Protein Details
Accession A0A1X6N409    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-43VINPLTSQEHRRQKRRAERFDSTRQLDFHydrophilic
102-133SETKDISMKEKKRGKKRKGKARQDAQGPKNKNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
110-130KEKKRGKKRKGKARQDAQGPK
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_mito 8, mito 7.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017336  Snurportin-1  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0061015  P:snRNA import into nucleus  
Amino Acid Sequences MSHDRKTSYKVPPAAVINPLTSQEHRRQKRRAERFDSTRQLDFFADLTLGPSDEEADEDDSAKHEPEIVHEGVSSFASMLPSSGLSETTFSSTAAAQTQSSSETKDISMKEKKRGKKRKGKARQDAQGPKNKNLGRWADKCMYAELLEMIEDAEIIMPIHDGIPEDIETGWVAVTPVPAGKRCLAVTHHTSGIAGIAPNLTLRSRVLGKPLMKPFPSPLPPQTVLDCILDENWRENGILHVLDVLKWKGQDVGECETPFRFWWRDTRLSELTPFPPPPSAADFHAQDAPKSSSESSRYQFPHPNTLLPIPYHTNTTLSHLANALIPMTRAPRCVSVSIPSADQHDAPAMDLDAAPAPLIQLQTVPAEIKSDGLLLYVAQATYEPGTSPLSSWVPLQGYATSADARNPGNERIDNAAESPLVVFERLVKRRLSIGASESSPEVSMEENM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.52
3 0.44
4 0.37
5 0.32
6 0.32
7 0.3
8 0.28
9 0.32
10 0.37
11 0.46
12 0.54
13 0.62
14 0.68
15 0.75
16 0.83
17 0.88
18 0.89
19 0.87
20 0.88
21 0.87
22 0.88
23 0.87
24 0.8
25 0.74
26 0.64
27 0.57
28 0.47
29 0.4
30 0.3
31 0.21
32 0.17
33 0.12
34 0.13
35 0.11
36 0.1
37 0.09
38 0.08
39 0.09
40 0.08
41 0.09
42 0.09
43 0.11
44 0.11
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.13
49 0.13
50 0.11
51 0.12
52 0.12
53 0.15
54 0.21
55 0.2
56 0.19
57 0.19
58 0.19
59 0.17
60 0.17
61 0.13
62 0.07
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.07
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.08
73 0.1
74 0.1
75 0.12
76 0.13
77 0.11
78 0.12
79 0.12
80 0.12
81 0.13
82 0.13
83 0.11
84 0.11
85 0.12
86 0.14
87 0.14
88 0.15
89 0.14
90 0.14
91 0.15
92 0.19
93 0.2
94 0.25
95 0.35
96 0.37
97 0.47
98 0.54
99 0.62
100 0.68
101 0.77
102 0.8
103 0.82
104 0.87
105 0.89
106 0.91
107 0.94
108 0.93
109 0.92
110 0.89
111 0.88
112 0.88
113 0.84
114 0.83
115 0.76
116 0.69
117 0.68
118 0.61
119 0.54
120 0.51
121 0.52
122 0.51
123 0.5
124 0.52
125 0.47
126 0.47
127 0.45
128 0.39
129 0.32
130 0.23
131 0.2
132 0.14
133 0.11
134 0.09
135 0.07
136 0.06
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.05
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.06
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.06
164 0.07
165 0.09
166 0.11
167 0.12
168 0.13
169 0.13
170 0.16
171 0.17
172 0.2
173 0.24
174 0.24
175 0.23
176 0.21
177 0.21
178 0.18
179 0.16
180 0.12
181 0.07
182 0.05
183 0.04
184 0.04
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.08
191 0.11
192 0.11
193 0.15
194 0.2
195 0.23
196 0.29
197 0.34
198 0.36
199 0.34
200 0.34
201 0.33
202 0.33
203 0.34
204 0.3
205 0.28
206 0.3
207 0.31
208 0.31
209 0.3
210 0.24
211 0.22
212 0.2
213 0.17
214 0.11
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.09
225 0.08
226 0.07
227 0.08
228 0.07
229 0.08
230 0.1
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.11
236 0.11
237 0.13
238 0.14
239 0.18
240 0.2
241 0.2
242 0.21
243 0.18
244 0.18
245 0.17
246 0.17
247 0.15
248 0.13
249 0.21
250 0.26
251 0.34
252 0.35
253 0.41
254 0.4
255 0.39
256 0.41
257 0.36
258 0.32
259 0.28
260 0.27
261 0.21
262 0.2
263 0.19
264 0.19
265 0.19
266 0.19
267 0.17
268 0.2
269 0.2
270 0.21
271 0.25
272 0.23
273 0.19
274 0.21
275 0.21
276 0.18
277 0.19
278 0.18
279 0.18
280 0.22
281 0.27
282 0.25
283 0.31
284 0.33
285 0.36
286 0.42
287 0.41
288 0.46
289 0.42
290 0.43
291 0.38
292 0.37
293 0.35
294 0.28
295 0.29
296 0.23
297 0.23
298 0.23
299 0.21
300 0.21
301 0.19
302 0.24
303 0.27
304 0.23
305 0.23
306 0.21
307 0.2
308 0.19
309 0.19
310 0.13
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.12
315 0.13
316 0.14
317 0.15
318 0.19
319 0.21
320 0.23
321 0.23
322 0.23
323 0.26
324 0.26
325 0.25
326 0.22
327 0.23
328 0.22
329 0.2
330 0.17
331 0.15
332 0.14
333 0.13
334 0.13
335 0.1
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.06
348 0.08
349 0.09
350 0.1
351 0.11
352 0.09
353 0.11
354 0.11
355 0.11
356 0.1
357 0.1
358 0.09
359 0.08
360 0.08
361 0.06
362 0.08
363 0.08
364 0.07
365 0.06
366 0.07
367 0.08
368 0.08
369 0.09
370 0.08
371 0.08
372 0.11
373 0.12
374 0.12
375 0.16
376 0.16
377 0.17
378 0.17
379 0.2
380 0.19
381 0.19
382 0.2
383 0.16
384 0.16
385 0.16
386 0.17
387 0.15
388 0.14
389 0.16
390 0.18
391 0.18
392 0.22
393 0.24
394 0.26
395 0.3
396 0.31
397 0.32
398 0.34
399 0.36
400 0.32
401 0.3
402 0.27
403 0.21
404 0.2
405 0.17
406 0.13
407 0.11
408 0.1
409 0.09
410 0.15
411 0.25
412 0.29
413 0.33
414 0.33
415 0.34
416 0.38
417 0.43
418 0.39
419 0.33
420 0.34
421 0.35
422 0.35
423 0.35
424 0.31
425 0.28
426 0.24
427 0.2
428 0.16