Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X6N6M4

Protein Details
Accession A0A1X6N6M4    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
222-246TSPPPPPKRTSARKGRREQNSPLNEHydrophilic
264-294IEDDPKTPRPQRPRPRPVRKGARTPNPQPFPHydrophilic
397-416EEAQRERKRRRANPNAILAEHydrophilic
721-745SSQLQDEGKRKGRRRKAQGNDSSDDHydrophilic
753-775GTRHQRKAQSEVRKNPPRRGRSKBasic
795-823PSSQRTPKKGIATRPKPRPKSRARGVAASHydrophilic
836-862DDESPKLTSCPRPRIKRPPPRAGQESTHydrophilic
882-905IEPPPSNQLKRPPRTRHMDAKSSRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
198-238PRKASGARPKPRAAHAGTRKLALETSPPPPPKRTSARKGRR
271-286PRPQRPRPRPVRKGAR
729-737KRKGRRRKA
758-775RKAQSEVRKNPPRRGRSK
801-818PKKGIATRPKPRPKSRAR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 11.5, cyto 4, mito 2, plas 1, pero 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MENFQDNLRRRGTTLHSDTSHDVRCKTRPLPSAQTKGKGFEDLGSSFARPSKQPPSSQSRVTRSQDKGEVKVATRDIRTTIWDTGSEDSDDELDMLSRRSISREVSFSPGTSSKKPTASQKPLSNNQGVVIDGQFHEYNPAFLPKKSLPSFRKNKKGLDADTGSGPLLSQPSTSSARVTAESSTSRFPTPEPSGSSQPRKASGARPKPRAAHAGTRKLALETSPPPPPKRTSARKGRREQNSPLNELSSNHDRPSSELIHHQDIEDDPKTPRPQRPRPRPVRKGARTPNPQPFPMPPPFLDSGDEDTQRMKDRKGVNGKGKAKEQCNPIEALSPLSSQKHNDRLTPPPRPLLAFPELSPLSSVHQDSPSQRCKVLESIGHSPGKRLSEDDCDVVVDEEAQRERKRRRANPNAILAELMRGDGDDDLDEDDLLFLDPEVDPKTLCPWCDERLPPVPTPYLSTLIAIAKQASWPDLRPSNSLGLRAPLGAFVGVCQRHRFESHQVPLAKRRGWPTEIEWDRVGARVAALKPRLQAILDDIDEDFLPGASRKEEYEEDGQYADRPRKGSVFWRDVVKSVRKKGSRQTAGVAGQFASFDKTQPGYYGELGYMIINQTIYNLFPPASFHADSTLPLTPTDFIALVLVPEAAVSLITEDMKQTRQEAIATLRESAEYGVAMFPDDHDSADAVSAGERIIMERARVRRKELEEAGDEGFWTSMDEVESSQLQDEGKRKGRRRKAQGNDSSDDSKDGEWAGTRHQRKAQSEVRKNPPRRGRSKAATSDVDAGDDVVMLTDSGPSSQRTPKKGIATRPKPRPKSRARGVAASSDMDIELLRASSDDESPKLTSCPRPRIKRPPPRAGQESTLEKENVPTDYSTDYSDAQEIEPPPSNQLKRPPRTRHMDAKSSRAEAPDDDATPRPRKIYPVSSPPSAAATSGTKPNVSFPLMAAKERRAKP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.51
3 0.49
4 0.52
5 0.55
6 0.55
7 0.56
8 0.49
9 0.46
10 0.43
11 0.47
12 0.51
13 0.52
14 0.54
15 0.54
16 0.58
17 0.65
18 0.69
19 0.74
20 0.74
21 0.77
22 0.7
23 0.68
24 0.61
25 0.54
26 0.45
27 0.38
28 0.36
29 0.28
30 0.28
31 0.25
32 0.24
33 0.22
34 0.24
35 0.24
36 0.21
37 0.27
38 0.35
39 0.4
40 0.46
41 0.52
42 0.58
43 0.62
44 0.69
45 0.71
46 0.68
47 0.71
48 0.71
49 0.72
50 0.68
51 0.69
52 0.69
53 0.65
54 0.62
55 0.58
56 0.56
57 0.5
58 0.51
59 0.48
60 0.45
61 0.42
62 0.4
63 0.36
64 0.33
65 0.35
66 0.33
67 0.32
68 0.28
69 0.27
70 0.27
71 0.27
72 0.28
73 0.24
74 0.2
75 0.17
76 0.15
77 0.14
78 0.12
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.1
83 0.1
84 0.11
85 0.12
86 0.15
87 0.18
88 0.22
89 0.26
90 0.29
91 0.31
92 0.35
93 0.36
94 0.33
95 0.35
96 0.36
97 0.36
98 0.36
99 0.39
100 0.39
101 0.43
102 0.47
103 0.52
104 0.57
105 0.62
106 0.66
107 0.69
108 0.72
109 0.75
110 0.77
111 0.71
112 0.6
113 0.52
114 0.45
115 0.37
116 0.29
117 0.21
118 0.16
119 0.13
120 0.16
121 0.14
122 0.13
123 0.18
124 0.16
125 0.17
126 0.17
127 0.24
128 0.23
129 0.23
130 0.3
131 0.28
132 0.37
133 0.41
134 0.49
135 0.48
136 0.57
137 0.68
138 0.71
139 0.79
140 0.75
141 0.77
142 0.77
143 0.77
144 0.71
145 0.69
146 0.62
147 0.53
148 0.49
149 0.43
150 0.34
151 0.25
152 0.21
153 0.13
154 0.11
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.13
159 0.17
160 0.18
161 0.18
162 0.18
163 0.19
164 0.2
165 0.21
166 0.18
167 0.18
168 0.2
169 0.21
170 0.22
171 0.22
172 0.22
173 0.21
174 0.21
175 0.25
176 0.29
177 0.31
178 0.33
179 0.36
180 0.44
181 0.51
182 0.58
183 0.55
184 0.53
185 0.51
186 0.49
187 0.48
188 0.49
189 0.52
190 0.56
191 0.59
192 0.63
193 0.66
194 0.67
195 0.68
196 0.65
197 0.59
198 0.59
199 0.59
200 0.62
201 0.57
202 0.55
203 0.51
204 0.44
205 0.4
206 0.3
207 0.26
208 0.2
209 0.23
210 0.29
211 0.33
212 0.35
213 0.39
214 0.42
215 0.45
216 0.51
217 0.57
218 0.59
219 0.66
220 0.74
221 0.8
222 0.85
223 0.87
224 0.86
225 0.83
226 0.81
227 0.8
228 0.76
229 0.7
230 0.61
231 0.54
232 0.45
233 0.39
234 0.37
235 0.35
236 0.31
237 0.27
238 0.28
239 0.26
240 0.28
241 0.33
242 0.29
243 0.23
244 0.27
245 0.31
246 0.33
247 0.33
248 0.31
249 0.26
250 0.25
251 0.28
252 0.22
253 0.2
254 0.17
255 0.23
256 0.29
257 0.34
258 0.41
259 0.46
260 0.56
261 0.65
262 0.75
263 0.8
264 0.85
265 0.9
266 0.92
267 0.92
268 0.92
269 0.89
270 0.88
271 0.87
272 0.86
273 0.83
274 0.82
275 0.81
276 0.74
277 0.68
278 0.6
279 0.54
280 0.51
281 0.47
282 0.42
283 0.33
284 0.34
285 0.35
286 0.33
287 0.3
288 0.26
289 0.26
290 0.26
291 0.26
292 0.21
293 0.2
294 0.21
295 0.27
296 0.27
297 0.22
298 0.25
299 0.29
300 0.37
301 0.46
302 0.53
303 0.55
304 0.63
305 0.69
306 0.67
307 0.69
308 0.66
309 0.6
310 0.57
311 0.54
312 0.49
313 0.44
314 0.41
315 0.34
316 0.31
317 0.28
318 0.24
319 0.19
320 0.16
321 0.16
322 0.16
323 0.17
324 0.17
325 0.22
326 0.29
327 0.29
328 0.33
329 0.35
330 0.43
331 0.49
332 0.53
333 0.5
334 0.45
335 0.45
336 0.42
337 0.39
338 0.35
339 0.32
340 0.26
341 0.23
342 0.26
343 0.24
344 0.23
345 0.22
346 0.17
347 0.15
348 0.16
349 0.17
350 0.12
351 0.14
352 0.16
353 0.19
354 0.27
355 0.31
356 0.31
357 0.31
358 0.3
359 0.3
360 0.3
361 0.3
362 0.25
363 0.24
364 0.27
365 0.31
366 0.34
367 0.31
368 0.3
369 0.3
370 0.28
371 0.24
372 0.2
373 0.18
374 0.21
375 0.22
376 0.22
377 0.19
378 0.18
379 0.17
380 0.16
381 0.13
382 0.08
383 0.06
384 0.07
385 0.08
386 0.12
387 0.14
388 0.21
389 0.26
390 0.34
391 0.44
392 0.51
393 0.61
394 0.69
395 0.77
396 0.77
397 0.8
398 0.74
399 0.64
400 0.55
401 0.43
402 0.33
403 0.23
404 0.15
405 0.06
406 0.05
407 0.05
408 0.04
409 0.05
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.05
414 0.05
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.05
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.12
429 0.13
430 0.14
431 0.15
432 0.17
433 0.19
434 0.24
435 0.25
436 0.24
437 0.3
438 0.33
439 0.31
440 0.3
441 0.28
442 0.24
443 0.26
444 0.23
445 0.18
446 0.15
447 0.15
448 0.14
449 0.13
450 0.13
451 0.11
452 0.09
453 0.07
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.08
458 0.08
459 0.11
460 0.15
461 0.17
462 0.18
463 0.19
464 0.23
465 0.23
466 0.23
467 0.2
468 0.17
469 0.16
470 0.14
471 0.12
472 0.07
473 0.07
474 0.05
475 0.05
476 0.04
477 0.09
478 0.1
479 0.11
480 0.12
481 0.13
482 0.14
483 0.17
484 0.19
485 0.22
486 0.29
487 0.31
488 0.37
489 0.39
490 0.39
491 0.44
492 0.46
493 0.41
494 0.35
495 0.36
496 0.34
497 0.33
498 0.33
499 0.29
500 0.35
501 0.35
502 0.34
503 0.3
504 0.27
505 0.25
506 0.24
507 0.21
508 0.1
509 0.08
510 0.1
511 0.11
512 0.14
513 0.15
514 0.16
515 0.17
516 0.18
517 0.18
518 0.14
519 0.14
520 0.12
521 0.13
522 0.12
523 0.12
524 0.11
525 0.11
526 0.1
527 0.1
528 0.07
529 0.04
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.06
534 0.06
535 0.07
536 0.1
537 0.11
538 0.14
539 0.18
540 0.18
541 0.18
542 0.18
543 0.17
544 0.16
545 0.19
546 0.2
547 0.18
548 0.18
549 0.19
550 0.2
551 0.22
552 0.28
553 0.33
554 0.34
555 0.34
556 0.38
557 0.37
558 0.39
559 0.42
560 0.43
561 0.4
562 0.42
563 0.48
564 0.47
565 0.51
566 0.56
567 0.62
568 0.59
569 0.54
570 0.5
571 0.47
572 0.46
573 0.43
574 0.35
575 0.24
576 0.18
577 0.17
578 0.14
579 0.11
580 0.09
581 0.08
582 0.1
583 0.11
584 0.11
585 0.12
586 0.14
587 0.13
588 0.14
589 0.14
590 0.12
591 0.11
592 0.11
593 0.1
594 0.08
595 0.06
596 0.06
597 0.05
598 0.05
599 0.05
600 0.06
601 0.06
602 0.06
603 0.07
604 0.07
605 0.07
606 0.09
607 0.11
608 0.15
609 0.15
610 0.15
611 0.17
612 0.17
613 0.17
614 0.19
615 0.18
616 0.14
617 0.13
618 0.14
619 0.12
620 0.12
621 0.12
622 0.09
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.06
627 0.06
628 0.05
629 0.04
630 0.03
631 0.03
632 0.03
633 0.03
634 0.03
635 0.03
636 0.04
637 0.04
638 0.05
639 0.06
640 0.07
641 0.1
642 0.1
643 0.12
644 0.13
645 0.14
646 0.14
647 0.16
648 0.18
649 0.21
650 0.21
651 0.21
652 0.19
653 0.18
654 0.18
655 0.16
656 0.12
657 0.07
658 0.06
659 0.06
660 0.06
661 0.06
662 0.06
663 0.06
664 0.09
665 0.1
666 0.09
667 0.09
668 0.1
669 0.09
670 0.1
671 0.09
672 0.05
673 0.05
674 0.05
675 0.05
676 0.05
677 0.05
678 0.05
679 0.08
680 0.08
681 0.1
682 0.15
683 0.23
684 0.32
685 0.35
686 0.4
687 0.45
688 0.49
689 0.56
690 0.54
691 0.52
692 0.45
693 0.46
694 0.41
695 0.33
696 0.28
697 0.2
698 0.16
699 0.1
700 0.09
701 0.06
702 0.06
703 0.06
704 0.06
705 0.06
706 0.08
707 0.09
708 0.09
709 0.09
710 0.09
711 0.09
712 0.14
713 0.18
714 0.24
715 0.33
716 0.41
717 0.5
718 0.59
719 0.7
720 0.76
721 0.82
722 0.85
723 0.86
724 0.89
725 0.9
726 0.86
727 0.79
728 0.73
729 0.65
730 0.55
731 0.45
732 0.36
733 0.26
734 0.2
735 0.17
736 0.13
737 0.12
738 0.12
739 0.18
740 0.27
741 0.3
742 0.34
743 0.4
744 0.47
745 0.48
746 0.56
747 0.58
748 0.6
749 0.67
750 0.71
751 0.76
752 0.79
753 0.81
754 0.82
755 0.83
756 0.82
757 0.79
758 0.78
759 0.77
760 0.75
761 0.8
762 0.78
763 0.74
764 0.67
765 0.62
766 0.59
767 0.49
768 0.41
769 0.31
770 0.23
771 0.17
772 0.14
773 0.11
774 0.05
775 0.05
776 0.04
777 0.04
778 0.05
779 0.05
780 0.06
781 0.08
782 0.1
783 0.14
784 0.23
785 0.29
786 0.33
787 0.4
788 0.45
789 0.54
790 0.59
791 0.65
792 0.68
793 0.73
794 0.78
795 0.82
796 0.87
797 0.86
798 0.9
799 0.9
800 0.89
801 0.89
802 0.89
803 0.88
804 0.82
805 0.8
806 0.73
807 0.68
808 0.59
809 0.5
810 0.4
811 0.3
812 0.25
813 0.18
814 0.15
815 0.09
816 0.07
817 0.06
818 0.06
819 0.05
820 0.07
821 0.08
822 0.12
823 0.14
824 0.14
825 0.18
826 0.19
827 0.2
828 0.21
829 0.25
830 0.32
831 0.38
832 0.48
833 0.55
834 0.64
835 0.73
836 0.82
837 0.88
838 0.89
839 0.9
840 0.9
841 0.89
842 0.89
843 0.86
844 0.79
845 0.73
846 0.7
847 0.67
848 0.59
849 0.55
850 0.46
851 0.39
852 0.37
853 0.34
854 0.29
855 0.23
856 0.2
857 0.18
858 0.2
859 0.21
860 0.2
861 0.2
862 0.19
863 0.19
864 0.2
865 0.19
866 0.16
867 0.21
868 0.2
869 0.22
870 0.26
871 0.25
872 0.29
873 0.37
874 0.4
875 0.4
876 0.49
877 0.56
878 0.6
879 0.7
880 0.75
881 0.76
882 0.82
883 0.84
884 0.85
885 0.82
886 0.83
887 0.77
888 0.76
889 0.73
890 0.67
891 0.61
892 0.52
893 0.46
894 0.37
895 0.38
896 0.34
897 0.29
898 0.29
899 0.32
900 0.37
901 0.41
902 0.42
903 0.39
904 0.37
905 0.43
906 0.48
907 0.52
908 0.53
909 0.58
910 0.62
911 0.61
912 0.61
913 0.55
914 0.5
915 0.4
916 0.32
917 0.24
918 0.23
919 0.23
920 0.28
921 0.29
922 0.27
923 0.27
924 0.31
925 0.32
926 0.31
927 0.28
928 0.23
929 0.31
930 0.32
931 0.36
932 0.36
933 0.39