Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X6MSV1

Protein Details
Accession A0A1X6MSV1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
378-399RFDWFFKNRSPQKLQRRCNALLHydrophilic
447-468AAAPAPNKRAYKKRKIQTCCTTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
415-461KTKGPKGKKRGIEAVDKSEEKKPSRSSTPTGTAAAPAPNKRAYKKRK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.833, cyto 7, cyto_mito 5.833, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001650  Helicase_C  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR015194  ISWI_HAND-dom  
IPR036306  ISWI_HAND-dom_sf  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR015195  SLIDE  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0031491  F:nucleosome binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF09110  HAND  
PF00271  Helicase_C  
PF09111  SLIDE  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18793  SF2_C_SNF  
Amino Acid Sequences MAIDEYNKPDSDKFIFLLTTRAGGLGINVTTADIVVLYDSDLNSRADLQAMDRAHRIGQTKQVYVFRFITEGSVEERMLERTAQALRLDQLVMQQGRMQHTKAANKEDRLEMIAHGAETMVNSRSQWEGEDFRAGNILIELGLQQRKALQFNPLALSKCKRKLNYSVDSYFKETMRAGPSKTEKAPKMPRAPTRIQMQDFQFFSSRLAELQKQELAAHKRANDIPATLREPGGPEDTPEKLEAERLAAQQSIDIDQSVVAYYVVPSLTCNTSVEPLTEEQQQEKEELAAEGFEDWRRMTELLAFGIQDKTSDEVAAYYPVFEKKWKELAKYPRMKARIEEGEAKRHKWSNLEQLLSKKIATHIYERIKKDITEFPVFRFDWFFKNRSPQKLQRRCNALLGMIEKDAEQKQAEEIKTKGPKGKKRGIEAVDKSEEKKPSRSSTPTGTAAAPAPNKRAYKKRKIQTCCTT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.26
3 0.24
4 0.28
5 0.23
6 0.2
7 0.17
8 0.16
9 0.14
10 0.12
11 0.13
12 0.11
13 0.1
14 0.09
15 0.09
16 0.09
17 0.09
18 0.08
19 0.07
20 0.04
21 0.04
22 0.04
23 0.04
24 0.05
25 0.06
26 0.07
27 0.08
28 0.1
29 0.11
30 0.11
31 0.12
32 0.12
33 0.12
34 0.13
35 0.13
36 0.18
37 0.19
38 0.21
39 0.21
40 0.22
41 0.22
42 0.25
43 0.27
44 0.24
45 0.32
46 0.35
47 0.36
48 0.41
49 0.46
50 0.44
51 0.46
52 0.44
53 0.36
54 0.31
55 0.28
56 0.24
57 0.19
58 0.18
59 0.15
60 0.16
61 0.14
62 0.14
63 0.15
64 0.15
65 0.16
66 0.15
67 0.12
68 0.13
69 0.15
70 0.17
71 0.17
72 0.17
73 0.17
74 0.18
75 0.18
76 0.15
77 0.16
78 0.2
79 0.2
80 0.18
81 0.19
82 0.21
83 0.26
84 0.28
85 0.26
86 0.25
87 0.31
88 0.37
89 0.4
90 0.47
91 0.48
92 0.48
93 0.51
94 0.47
95 0.43
96 0.38
97 0.33
98 0.24
99 0.2
100 0.18
101 0.14
102 0.12
103 0.1
104 0.08
105 0.07
106 0.09
107 0.07
108 0.07
109 0.08
110 0.09
111 0.1
112 0.11
113 0.12
114 0.14
115 0.16
116 0.17
117 0.22
118 0.21
119 0.2
120 0.21
121 0.2
122 0.16
123 0.13
124 0.11
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.08
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.13
133 0.15
134 0.17
135 0.18
136 0.2
137 0.21
138 0.23
139 0.26
140 0.26
141 0.26
142 0.27
143 0.32
144 0.34
145 0.39
146 0.43
147 0.43
148 0.45
149 0.53
150 0.58
151 0.61
152 0.6
153 0.57
154 0.55
155 0.54
156 0.53
157 0.46
158 0.37
159 0.31
160 0.24
161 0.24
162 0.25
163 0.25
164 0.22
165 0.26
166 0.3
167 0.33
168 0.37
169 0.4
170 0.36
171 0.43
172 0.51
173 0.53
174 0.58
175 0.6
176 0.63
177 0.63
178 0.65
179 0.61
180 0.58
181 0.57
182 0.49
183 0.47
184 0.43
185 0.41
186 0.38
187 0.35
188 0.29
189 0.23
190 0.22
191 0.18
192 0.15
193 0.11
194 0.13
195 0.14
196 0.14
197 0.16
198 0.16
199 0.15
200 0.15
201 0.2
202 0.22
203 0.24
204 0.25
205 0.23
206 0.26
207 0.26
208 0.27
209 0.22
210 0.19
211 0.17
212 0.18
213 0.19
214 0.17
215 0.16
216 0.14
217 0.15
218 0.15
219 0.16
220 0.12
221 0.11
222 0.13
223 0.13
224 0.14
225 0.13
226 0.13
227 0.1
228 0.11
229 0.1
230 0.1
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.12
236 0.11
237 0.11
238 0.1
239 0.08
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.05
250 0.05
251 0.04
252 0.05
253 0.06
254 0.07
255 0.08
256 0.09
257 0.08
258 0.1
259 0.11
260 0.11
261 0.11
262 0.11
263 0.12
264 0.16
265 0.16
266 0.15
267 0.17
268 0.17
269 0.16
270 0.15
271 0.13
272 0.1
273 0.1
274 0.08
275 0.06
276 0.06
277 0.05
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.06
282 0.07
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.11
287 0.11
288 0.12
289 0.12
290 0.12
291 0.11
292 0.12
293 0.12
294 0.09
295 0.08
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.08
300 0.08
301 0.09
302 0.1
303 0.09
304 0.08
305 0.09
306 0.11
307 0.12
308 0.14
309 0.17
310 0.2
311 0.29
312 0.32
313 0.35
314 0.42
315 0.52
316 0.6
317 0.66
318 0.65
319 0.64
320 0.64
321 0.61
322 0.55
323 0.53
324 0.49
325 0.43
326 0.49
327 0.44
328 0.51
329 0.52
330 0.52
331 0.49
332 0.46
333 0.43
334 0.39
335 0.43
336 0.43
337 0.47
338 0.48
339 0.46
340 0.46
341 0.49
342 0.44
343 0.38
344 0.29
345 0.25
346 0.27
347 0.27
348 0.27
349 0.32
350 0.41
351 0.48
352 0.49
353 0.51
354 0.48
355 0.46
356 0.46
357 0.44
358 0.41
359 0.42
360 0.41
361 0.38
362 0.44
363 0.44
364 0.4
365 0.38
366 0.33
367 0.32
368 0.36
369 0.36
370 0.33
371 0.44
372 0.5
373 0.55
374 0.62
375 0.64
376 0.71
377 0.78
378 0.82
379 0.8
380 0.81
381 0.74
382 0.71
383 0.64
384 0.54
385 0.48
386 0.43
387 0.36
388 0.28
389 0.25
390 0.19
391 0.21
392 0.2
393 0.19
394 0.17
395 0.15
396 0.2
397 0.27
398 0.28
399 0.29
400 0.29
401 0.36
402 0.42
403 0.46
404 0.49
405 0.51
406 0.59
407 0.64
408 0.72
409 0.71
410 0.72
411 0.77
412 0.75
413 0.76
414 0.72
415 0.71
416 0.68
417 0.63
418 0.58
419 0.55
420 0.57
421 0.5
422 0.52
423 0.52
424 0.52
425 0.59
426 0.62
427 0.61
428 0.62
429 0.65
430 0.61
431 0.56
432 0.49
433 0.42
434 0.38
435 0.38
436 0.36
437 0.33
438 0.34
439 0.39
440 0.44
441 0.5
442 0.58
443 0.62
444 0.67
445 0.74
446 0.79
447 0.82
448 0.85