Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X6N6T8

Protein Details
Accession A0A1X6N6T8    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MHPHSQSPRFHQQQQQHQIHHydrophilic
61-80LERQRQIRLQQQQQQQQQQQHydrophilic
192-211AERMEEKRRRKHAKIAHMSRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
197-205EKRRRKHAK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10, cyto 4.5, mito 4, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MHPHSQSPRFHQQQQQHQIHLIHLQQQQQQQRQLLELQEQRERQQQQQLLQLQEQLRLEELERQRQIRLQQQQQQQQQQQQLQTASPSAGHLHGQLLHHQRHVSGGLSPALSDRTSRHLGRQSPAADAPFGQNMTYLPQDIQMQQRLLAEMAQAEFINSMQTGTPQAERDAREEREMQEILRAEAMKKIMEAERMEEKRRRKHAKIAHMSRYNDLMTQSDKDFITRIQVSQLVTPDPYADDFYAQVYGAILRSRLGVQTQDDRVLKFGSGGGVGLGLGQKGPGRRQSAMQRMEAQVERIVNNARMREKEKISLNNLQGALGKTSGRSYKAAPRQLLQVDSGSSPTPSPVPAHGHISKADAIHHEATGAAKEAAKIGRETLGSAAHTHEHDRQDPLTHRESLVILERLYDLVLDLEQMRRDQPPPEEEEDFLAWEVEYEAHVQRLWLGLRVTAPLETSVPHPFISLLMPIKGKRLLPRAARYLDDHQTLVTLTLLVACFSQADVIVKAHVLDTLKESEEYHEVDAQTQAFMQSIIQSILPVVAKAELRIVSGLLGLLFERNHVAGVACTKPGLALLTLFISRVEVIKQNMATATEVSELPPPEDTDQWQSVFDNLFNFLAHDFLHLFPSVRISRTLGIPHSNVPNADVIDHPVWQYLATMALHASAEQQQILVTSLRELVLENVTSVNKGWVADEEERRSRLANVNIFLHALGLDSSQIAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.78
3 0.71
4 0.69
5 0.63
6 0.56
7 0.53
8 0.45
9 0.42
10 0.4
11 0.43
12 0.43
13 0.49
14 0.56
15 0.58
16 0.62
17 0.58
18 0.55
19 0.52
20 0.5
21 0.46
22 0.45
23 0.43
24 0.41
25 0.44
26 0.44
27 0.45
28 0.5
29 0.5
30 0.48
31 0.52
32 0.52
33 0.49
34 0.56
35 0.59
36 0.55
37 0.52
38 0.53
39 0.44
40 0.44
41 0.4
42 0.32
43 0.27
44 0.24
45 0.23
46 0.26
47 0.3
48 0.35
49 0.39
50 0.4
51 0.41
52 0.44
53 0.49
54 0.5
55 0.54
56 0.54
57 0.58
58 0.66
59 0.73
60 0.77
61 0.81
62 0.79
63 0.76
64 0.75
65 0.72
66 0.66
67 0.62
68 0.54
69 0.46
70 0.4
71 0.34
72 0.26
73 0.21
74 0.18
75 0.15
76 0.15
77 0.15
78 0.14
79 0.14
80 0.17
81 0.18
82 0.25
83 0.31
84 0.32
85 0.34
86 0.34
87 0.32
88 0.31
89 0.31
90 0.25
91 0.19
92 0.19
93 0.18
94 0.17
95 0.17
96 0.16
97 0.16
98 0.15
99 0.15
100 0.14
101 0.18
102 0.24
103 0.25
104 0.32
105 0.38
106 0.42
107 0.44
108 0.5
109 0.45
110 0.43
111 0.44
112 0.38
113 0.31
114 0.26
115 0.25
116 0.21
117 0.2
118 0.15
119 0.13
120 0.12
121 0.15
122 0.15
123 0.13
124 0.11
125 0.13
126 0.15
127 0.18
128 0.23
129 0.25
130 0.25
131 0.25
132 0.26
133 0.25
134 0.23
135 0.2
136 0.15
137 0.11
138 0.11
139 0.1
140 0.09
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.06
148 0.07
149 0.09
150 0.1
151 0.13
152 0.13
153 0.16
154 0.2
155 0.21
156 0.25
157 0.3
158 0.3
159 0.32
160 0.33
161 0.32
162 0.33
163 0.32
164 0.27
165 0.25
166 0.24
167 0.21
168 0.21
169 0.2
170 0.15
171 0.18
172 0.19
173 0.14
174 0.13
175 0.16
176 0.15
177 0.19
178 0.19
179 0.2
180 0.28
181 0.31
182 0.37
183 0.41
184 0.47
185 0.52
186 0.62
187 0.67
188 0.63
189 0.69
190 0.73
191 0.78
192 0.8
193 0.8
194 0.79
195 0.78
196 0.74
197 0.66
198 0.6
199 0.49
200 0.39
201 0.31
202 0.23
203 0.18
204 0.19
205 0.18
206 0.18
207 0.17
208 0.16
209 0.16
210 0.14
211 0.19
212 0.17
213 0.17
214 0.16
215 0.19
216 0.19
217 0.2
218 0.21
219 0.16
220 0.15
221 0.15
222 0.13
223 0.11
224 0.11
225 0.1
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.09
243 0.1
244 0.12
245 0.18
246 0.19
247 0.24
248 0.24
249 0.23
250 0.24
251 0.22
252 0.2
253 0.14
254 0.13
255 0.09
256 0.08
257 0.07
258 0.06
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.04
263 0.04
264 0.03
265 0.04
266 0.06
267 0.08
268 0.11
269 0.16
270 0.2
271 0.21
272 0.26
273 0.34
274 0.42
275 0.44
276 0.43
277 0.41
278 0.39
279 0.41
280 0.36
281 0.29
282 0.22
283 0.2
284 0.17
285 0.15
286 0.16
287 0.16
288 0.18
289 0.2
290 0.2
291 0.22
292 0.26
293 0.3
294 0.3
295 0.32
296 0.35
297 0.38
298 0.4
299 0.44
300 0.41
301 0.4
302 0.38
303 0.33
304 0.3
305 0.25
306 0.2
307 0.14
308 0.13
309 0.09
310 0.11
311 0.13
312 0.13
313 0.13
314 0.15
315 0.23
316 0.31
317 0.36
318 0.35
319 0.34
320 0.37
321 0.37
322 0.36
323 0.28
324 0.21
325 0.16
326 0.15
327 0.15
328 0.1
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.1
336 0.14
337 0.15
338 0.21
339 0.21
340 0.22
341 0.22
342 0.23
343 0.21
344 0.17
345 0.17
346 0.13
347 0.14
348 0.14
349 0.13
350 0.11
351 0.1
352 0.09
353 0.09
354 0.08
355 0.06
356 0.05
357 0.06
358 0.07
359 0.08
360 0.09
361 0.09
362 0.08
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.1
367 0.1
368 0.09
369 0.1
370 0.1
371 0.09
372 0.1
373 0.12
374 0.16
375 0.17
376 0.18
377 0.2
378 0.19
379 0.23
380 0.25
381 0.28
382 0.26
383 0.25
384 0.23
385 0.22
386 0.22
387 0.19
388 0.19
389 0.16
390 0.12
391 0.12
392 0.12
393 0.11
394 0.1
395 0.09
396 0.05
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.05
401 0.06
402 0.07
403 0.07
404 0.09
405 0.1
406 0.12
407 0.14
408 0.17
409 0.19
410 0.23
411 0.27
412 0.27
413 0.25
414 0.26
415 0.23
416 0.21
417 0.17
418 0.13
419 0.08
420 0.07
421 0.07
422 0.05
423 0.05
424 0.06
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.1
431 0.1
432 0.1
433 0.1
434 0.11
435 0.11
436 0.12
437 0.13
438 0.1
439 0.1
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.1
444 0.11
445 0.12
446 0.12
447 0.12
448 0.11
449 0.11
450 0.11
451 0.12
452 0.11
453 0.12
454 0.14
455 0.14
456 0.17
457 0.19
458 0.2
459 0.23
460 0.29
461 0.34
462 0.39
463 0.44
464 0.48
465 0.48
466 0.47
467 0.46
468 0.45
469 0.43
470 0.37
471 0.31
472 0.25
473 0.23
474 0.21
475 0.17
476 0.11
477 0.07
478 0.05
479 0.06
480 0.06
481 0.06
482 0.06
483 0.06
484 0.06
485 0.05
486 0.06
487 0.05
488 0.06
489 0.07
490 0.07
491 0.08
492 0.08
493 0.08
494 0.08
495 0.09
496 0.09
497 0.08
498 0.11
499 0.13
500 0.14
501 0.14
502 0.15
503 0.15
504 0.17
505 0.17
506 0.16
507 0.17
508 0.16
509 0.17
510 0.18
511 0.16
512 0.13
513 0.12
514 0.1
515 0.07
516 0.07
517 0.07
518 0.06
519 0.07
520 0.08
521 0.07
522 0.07
523 0.07
524 0.09
525 0.09
526 0.08
527 0.07
528 0.09
529 0.09
530 0.09
531 0.13
532 0.11
533 0.11
534 0.12
535 0.11
536 0.09
537 0.09
538 0.09
539 0.06
540 0.05
541 0.05
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.07
546 0.07
547 0.07
548 0.07
549 0.08
550 0.08
551 0.12
552 0.13
553 0.12
554 0.12
555 0.11
556 0.11
557 0.11
558 0.11
559 0.08
560 0.07
561 0.07
562 0.09
563 0.1
564 0.1
565 0.09
566 0.09
567 0.08
568 0.09
569 0.1
570 0.13
571 0.15
572 0.19
573 0.19
574 0.2
575 0.2
576 0.2
577 0.19
578 0.16
579 0.15
580 0.12
581 0.12
582 0.12
583 0.16
584 0.15
585 0.15
586 0.16
587 0.16
588 0.17
589 0.18
590 0.2
591 0.23
592 0.25
593 0.25
594 0.25
595 0.23
596 0.24
597 0.23
598 0.21
599 0.16
600 0.15
601 0.15
602 0.14
603 0.14
604 0.11
605 0.11
606 0.1
607 0.11
608 0.1
609 0.1
610 0.13
611 0.13
612 0.14
613 0.13
614 0.2
615 0.21
616 0.2
617 0.22
618 0.23
619 0.25
620 0.27
621 0.31
622 0.28
623 0.3
624 0.31
625 0.34
626 0.36
627 0.36
628 0.32
629 0.29
630 0.28
631 0.24
632 0.23
633 0.19
634 0.19
635 0.18
636 0.19
637 0.18
638 0.16
639 0.16
640 0.14
641 0.14
642 0.09
643 0.11
644 0.1
645 0.1
646 0.09
647 0.1
648 0.1
649 0.1
650 0.12
651 0.13
652 0.14
653 0.14
654 0.14
655 0.13
656 0.13
657 0.15
658 0.14
659 0.1
660 0.1
661 0.12
662 0.12
663 0.12
664 0.12
665 0.13
666 0.15
667 0.14
668 0.14
669 0.15
670 0.15
671 0.16
672 0.16
673 0.15
674 0.13
675 0.13
676 0.14
677 0.14
678 0.2
679 0.27
680 0.34
681 0.39
682 0.44
683 0.45
684 0.45
685 0.44
686 0.42
687 0.43
688 0.44
689 0.43
690 0.42
691 0.43
692 0.43
693 0.42
694 0.37
695 0.29
696 0.2
697 0.14
698 0.1
699 0.08
700 0.08