Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X6MSQ2

Protein Details
Accession A0A1X6MSQ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-48QRGGRRGWRDWEKNNRSREABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-37GAQRGGRGGFNGGRGGGAQRGGRRGWR
Subcellular Location(s) nucl 10.5, mito 9, cyto_nucl 8, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007783  eIF3d  
Gene Ontology GO:0016282  C:eukaryotic 43S preinitiation complex  
GO:0033290  C:eukaryotic 48S preinitiation complex  
GO:0005852  C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex  
GO:0098808  F:mRNA cap binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0002191  P:cap-dependent translational initiation  
GO:0001732  P:formation of cytoplasmic translation initiation complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF05091  eIF-3_zeta  
Amino Acid Sequences MGRGGGANRGGAQRGGRGGFNGGRGGGAQRGGRRGWRDWEKNNRSREASVAISPDWAMLEEIEFHRLAKLRLEVDDPEDLDDYGRLYAYEKTYDRITTKSEKPLQILDRIKYNTTTSDDPVIQELASKDTATVYTTDVILSGLMCAPRSVYPWDIVVVREGNKLFFDKRDGGPFDTVTVNENAADPPQDPQAVNPNNPNEKVAVPETPSINTATSLSLEATYINQNFAFQTVIENPPPAAVEFSKPNPFYGPEETEPLASCGYRYRVFDLGVTEDEDIKLCVRTEVDGYTPGQDNPRAGQGLVTIRALNEFDSRSPGAGGAPDWRTKLDSQRGAVVATEMKNNSCKLAKWTVQSVLAGAELLKIGFISRVNPRDNTRHVILSTTSTRPMDFAAQLNVSLANGWGIVRTVTDMCMKQPEGKYVLVKDPNKPVLRLYAVPANAFTGEDDEDEGAFDGEEPDSVGAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.27
3 0.24
4 0.23
5 0.27
6 0.27
7 0.28
8 0.26
9 0.21
10 0.19
11 0.2
12 0.2
13 0.17
14 0.18
15 0.2
16 0.22
17 0.27
18 0.29
19 0.34
20 0.38
21 0.41
22 0.47
23 0.54
24 0.59
25 0.64
26 0.74
27 0.78
28 0.8
29 0.82
30 0.79
31 0.73
32 0.66
33 0.59
34 0.53
35 0.45
36 0.41
37 0.36
38 0.29
39 0.26
40 0.24
41 0.2
42 0.16
43 0.13
44 0.1
45 0.07
46 0.08
47 0.1
48 0.11
49 0.13
50 0.13
51 0.13
52 0.16
53 0.18
54 0.18
55 0.2
56 0.24
57 0.23
58 0.25
59 0.28
60 0.26
61 0.27
62 0.29
63 0.25
64 0.22
65 0.21
66 0.19
67 0.16
68 0.15
69 0.12
70 0.09
71 0.09
72 0.07
73 0.08
74 0.12
75 0.14
76 0.2
77 0.2
78 0.22
79 0.24
80 0.28
81 0.28
82 0.26
83 0.3
84 0.31
85 0.36
86 0.44
87 0.49
88 0.48
89 0.49
90 0.54
91 0.52
92 0.53
93 0.53
94 0.45
95 0.45
96 0.45
97 0.44
98 0.38
99 0.37
100 0.31
101 0.3
102 0.31
103 0.25
104 0.27
105 0.26
106 0.25
107 0.25
108 0.21
109 0.17
110 0.16
111 0.15
112 0.13
113 0.13
114 0.12
115 0.11
116 0.11
117 0.12
118 0.1
119 0.1
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.06
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.08
134 0.08
135 0.11
136 0.13
137 0.13
138 0.13
139 0.14
140 0.16
141 0.15
142 0.14
143 0.15
144 0.14
145 0.14
146 0.16
147 0.16
148 0.15
149 0.16
150 0.18
151 0.17
152 0.16
153 0.19
154 0.2
155 0.21
156 0.27
157 0.29
158 0.29
159 0.29
160 0.28
161 0.25
162 0.21
163 0.2
164 0.16
165 0.14
166 0.12
167 0.1
168 0.1
169 0.09
170 0.08
171 0.09
172 0.07
173 0.08
174 0.09
175 0.1
176 0.1
177 0.11
178 0.2
179 0.22
180 0.23
181 0.27
182 0.31
183 0.33
184 0.33
185 0.33
186 0.24
187 0.22
188 0.23
189 0.2
190 0.16
191 0.15
192 0.17
193 0.17
194 0.16
195 0.16
196 0.15
197 0.13
198 0.12
199 0.11
200 0.09
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.05
217 0.07
218 0.09
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.09
226 0.08
227 0.07
228 0.08
229 0.11
230 0.14
231 0.19
232 0.19
233 0.19
234 0.19
235 0.2
236 0.21
237 0.23
238 0.25
239 0.21
240 0.23
241 0.23
242 0.23
243 0.21
244 0.19
245 0.15
246 0.1
247 0.09
248 0.09
249 0.12
250 0.14
251 0.15
252 0.17
253 0.19
254 0.19
255 0.2
256 0.19
257 0.18
258 0.16
259 0.16
260 0.13
261 0.11
262 0.11
263 0.1
264 0.09
265 0.07
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.09
272 0.09
273 0.1
274 0.11
275 0.11
276 0.13
277 0.14
278 0.14
279 0.15
280 0.15
281 0.15
282 0.14
283 0.17
284 0.15
285 0.14
286 0.13
287 0.14
288 0.15
289 0.16
290 0.15
291 0.13
292 0.12
293 0.13
294 0.13
295 0.11
296 0.11
297 0.11
298 0.1
299 0.14
300 0.15
301 0.14
302 0.14
303 0.13
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.12
308 0.14
309 0.16
310 0.17
311 0.17
312 0.19
313 0.21
314 0.29
315 0.32
316 0.34
317 0.34
318 0.38
319 0.37
320 0.35
321 0.33
322 0.26
323 0.21
324 0.17
325 0.19
326 0.15
327 0.16
328 0.19
329 0.19
330 0.21
331 0.2
332 0.2
333 0.23
334 0.3
335 0.33
336 0.34
337 0.38
338 0.38
339 0.38
340 0.37
341 0.31
342 0.23
343 0.19
344 0.15
345 0.1
346 0.08
347 0.06
348 0.05
349 0.05
350 0.04
351 0.04
352 0.06
353 0.06
354 0.1
355 0.17
356 0.24
357 0.27
358 0.31
359 0.36
360 0.42
361 0.47
362 0.5
363 0.45
364 0.43
365 0.4
366 0.39
367 0.35
368 0.33
369 0.32
370 0.29
371 0.29
372 0.26
373 0.26
374 0.24
375 0.25
376 0.23
377 0.21
378 0.2
379 0.2
380 0.2
381 0.2
382 0.2
383 0.18
384 0.14
385 0.12
386 0.1
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.05
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.09
395 0.09
396 0.11
397 0.16
398 0.16
399 0.18
400 0.24
401 0.25
402 0.3
403 0.33
404 0.37
405 0.35
406 0.38
407 0.41
408 0.39
409 0.46
410 0.48
411 0.48
412 0.49
413 0.55
414 0.6
415 0.59
416 0.56
417 0.49
418 0.48
419 0.49
420 0.45
421 0.4
422 0.38
423 0.36
424 0.36
425 0.34
426 0.28
427 0.24
428 0.22
429 0.18
430 0.13
431 0.13
432 0.13
433 0.14
434 0.12
435 0.12
436 0.12
437 0.12
438 0.1
439 0.08
440 0.08
441 0.08
442 0.07
443 0.08
444 0.08