Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X6MJR1

Protein Details
Accession A0A1X6MJR1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
550-572SGTDKRTNFAKDRKKNGPGKASSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
480-480R
563-564KK
Subcellular Location(s) cyto_mito 10.333, cyto 10, mito 9.5, cyto_nucl 8.833, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000286  His_deacetylse  
IPR023801  His_deacetylse_dom  
IPR037138  His_deacetylse_dom_sf  
IPR023696  Ureohydrolase_dom_sf  
Gene Ontology GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00850  Hist_deacetyl  
CDD cd09998  HDAC_Hos3  
Amino Acid Sequences MIATNLEHPLTAQKTAVYLQKACLQHQYIRSRDTSCIVERPERLRAVNIGLAAAVSRLEECTPVSNARSAAQQTGEPASADDLAAALGQLNIASSSRPKDPQDPIEFVHSSAKVDLLHNAAVKFIHGDIEGDVYLENLKRWSQESHEKVSKGESEIPATLAQGDLYLCPESIDAIQGALGTVCEAVDAVVASTRRAAAPDPDKANTPRAFVAVRPPGHHCGEDTPSGFCFVNNVGVAAAHGKLNKLLAHLQHGINRVVVFDIDLHHGNGTQSIAWQINEETYRKTIEEMHGAPAGKPGLRMFYGSIHDVLSYPCEDGKPELVQAASVSIHGPHGQHIENIHLQPYESEQQFWDELYDGLYVKLRERASAFLEGTGGAGDDVLVFISCGFDASEHEYPSMSRHGRHVPTSFYKRFAQDTIKFAERFSGGRLISVLEGGYSDRALTSGAMAHLIGLVDPVGVDESWWSLNNLTELEKATKKRRGGRVSQPSAPAPWIGRTLEVFASIDSSHTVAPTTSSRASVPLSSRTLRERKNPPVKSADSDPEVSPHKSGTDKRTNFAKDRKKNGPGKASSPESTTLVESSDGSSFSSLSDIPEEGVQPKKLPRVILRLGSAPKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.24
3 0.3
4 0.27
5 0.26
6 0.28
7 0.34
8 0.36
9 0.36
10 0.41
11 0.4
12 0.41
13 0.49
14 0.55
15 0.52
16 0.54
17 0.56
18 0.51
19 0.49
20 0.46
21 0.43
22 0.38
23 0.4
24 0.41
25 0.44
26 0.47
27 0.49
28 0.52
29 0.5
30 0.48
31 0.44
32 0.42
33 0.39
34 0.36
35 0.31
36 0.24
37 0.2
38 0.18
39 0.15
40 0.12
41 0.07
42 0.05
43 0.05
44 0.07
45 0.07
46 0.08
47 0.09
48 0.13
49 0.16
50 0.18
51 0.2
52 0.22
53 0.23
54 0.23
55 0.27
56 0.25
57 0.25
58 0.24
59 0.23
60 0.23
61 0.24
62 0.24
63 0.19
64 0.17
65 0.16
66 0.14
67 0.13
68 0.1
69 0.07
70 0.07
71 0.06
72 0.06
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.04
79 0.05
80 0.06
81 0.09
82 0.13
83 0.18
84 0.23
85 0.26
86 0.33
87 0.4
88 0.48
89 0.52
90 0.52
91 0.49
92 0.51
93 0.48
94 0.42
95 0.41
96 0.32
97 0.26
98 0.23
99 0.23
100 0.18
101 0.18
102 0.19
103 0.16
104 0.18
105 0.19
106 0.18
107 0.18
108 0.16
109 0.15
110 0.14
111 0.11
112 0.1
113 0.08
114 0.09
115 0.09
116 0.11
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.07
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.1
126 0.12
127 0.14
128 0.17
129 0.21
130 0.31
131 0.36
132 0.43
133 0.48
134 0.47
135 0.46
136 0.47
137 0.43
138 0.36
139 0.37
140 0.3
141 0.27
142 0.27
143 0.28
144 0.24
145 0.21
146 0.18
147 0.12
148 0.1
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.07
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.04
167 0.04
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.09
183 0.1
184 0.15
185 0.19
186 0.25
187 0.28
188 0.29
189 0.32
190 0.34
191 0.4
192 0.34
193 0.32
194 0.26
195 0.25
196 0.24
197 0.21
198 0.28
199 0.28
200 0.28
201 0.28
202 0.31
203 0.34
204 0.35
205 0.35
206 0.27
207 0.24
208 0.25
209 0.26
210 0.23
211 0.19
212 0.18
213 0.2
214 0.19
215 0.14
216 0.13
217 0.1
218 0.12
219 0.11
220 0.11
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.06
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.09
231 0.1
232 0.1
233 0.13
234 0.13
235 0.17
236 0.2
237 0.21
238 0.23
239 0.26
240 0.24
241 0.22
242 0.21
243 0.16
244 0.13
245 0.12
246 0.08
247 0.06
248 0.07
249 0.08
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.08
257 0.06
258 0.05
259 0.07
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.09
265 0.11
266 0.12
267 0.12
268 0.12
269 0.13
270 0.13
271 0.13
272 0.14
273 0.14
274 0.18
275 0.17
276 0.18
277 0.2
278 0.2
279 0.19
280 0.18
281 0.17
282 0.13
283 0.12
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.09
289 0.11
290 0.13
291 0.13
292 0.13
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.1
297 0.08
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.06
313 0.06
314 0.05
315 0.05
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.1
321 0.1
322 0.11
323 0.11
324 0.14
325 0.15
326 0.16
327 0.15
328 0.13
329 0.12
330 0.12
331 0.15
332 0.16
333 0.14
334 0.14
335 0.13
336 0.15
337 0.16
338 0.15
339 0.12
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.07
345 0.07
346 0.09
347 0.09
348 0.09
349 0.15
350 0.14
351 0.15
352 0.16
353 0.18
354 0.19
355 0.22
356 0.22
357 0.16
358 0.16
359 0.15
360 0.13
361 0.11
362 0.08
363 0.04
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.03
369 0.02
370 0.02
371 0.02
372 0.03
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.04
377 0.05
378 0.11
379 0.14
380 0.14
381 0.14
382 0.14
383 0.15
384 0.17
385 0.22
386 0.18
387 0.17
388 0.21
389 0.28
390 0.31
391 0.35
392 0.35
393 0.34
394 0.42
395 0.5
396 0.47
397 0.43
398 0.44
399 0.42
400 0.42
401 0.4
402 0.4
403 0.35
404 0.37
405 0.38
406 0.4
407 0.38
408 0.35
409 0.34
410 0.27
411 0.23
412 0.22
413 0.23
414 0.18
415 0.18
416 0.19
417 0.16
418 0.15
419 0.14
420 0.12
421 0.05
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.06
433 0.06
434 0.07
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.06
439 0.06
440 0.04
441 0.04
442 0.03
443 0.03
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.06
450 0.07
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.1
455 0.11
456 0.11
457 0.12
458 0.12
459 0.14
460 0.18
461 0.23
462 0.28
463 0.35
464 0.41
465 0.47
466 0.54
467 0.62
468 0.66
469 0.69
470 0.74
471 0.77
472 0.77
473 0.75
474 0.7
475 0.61
476 0.55
477 0.47
478 0.38
479 0.28
480 0.24
481 0.22
482 0.19
483 0.19
484 0.18
485 0.2
486 0.18
487 0.18
488 0.15
489 0.12
490 0.14
491 0.12
492 0.12
493 0.1
494 0.1
495 0.09
496 0.09
497 0.09
498 0.07
499 0.1
500 0.12
501 0.16
502 0.17
503 0.18
504 0.18
505 0.2
506 0.22
507 0.24
508 0.25
509 0.26
510 0.3
511 0.31
512 0.33
513 0.4
514 0.46
515 0.48
516 0.54
517 0.57
518 0.63
519 0.72
520 0.74
521 0.72
522 0.72
523 0.7
524 0.66
525 0.63
526 0.58
527 0.52
528 0.5
529 0.44
530 0.4
531 0.4
532 0.36
533 0.3
534 0.25
535 0.24
536 0.28
537 0.34
538 0.39
539 0.45
540 0.47
541 0.51
542 0.59
543 0.63
544 0.65
545 0.69
546 0.7
547 0.69
548 0.75
549 0.8
550 0.81
551 0.82
552 0.83
553 0.83
554 0.78
555 0.74
556 0.73
557 0.7
558 0.62
559 0.57
560 0.5
561 0.42
562 0.38
563 0.33
564 0.25
565 0.2
566 0.19
567 0.17
568 0.16
569 0.15
570 0.13
571 0.13
572 0.13
573 0.11
574 0.11
575 0.12
576 0.1
577 0.11
578 0.13
579 0.12
580 0.13
581 0.14
582 0.16
583 0.18
584 0.23
585 0.24
586 0.26
587 0.31
588 0.38
589 0.39
590 0.45
591 0.48
592 0.51
593 0.57
594 0.59
595 0.56
596 0.56