FuNGI

A0A1X6MQ50

Protein Details

Accession

A0A1X6MQ50

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
275-315	EDESEAERKRRKRKGKEKDSGSRSLKRKRSKKSRSDSESDS	Basic
318-364	EEEAERYKAKKRRRKAQDSDSDEDMDRDRKRKRKKRRHDDESDESGS	Basic
366-399	DSDSGKNERKKSKSKSKSRNRKRKHDSSESESES	Basic
410-438	DGSSWRSKSKSKSKSKSSSKSSRAKRSSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
282-308	RKRRKRKGKEKDSGSRSLKRKRSKKSR
324-333	YKAKKRRRKA
344-354	RDRKRKRKKRR
371-389	KNERKKSKSKSKSRNRKRK
415-435	RSKSKSKSKSKSSSKSSRAKR

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MSGRKPNALEQKLHQAALADAKKTLTQKECEALIPDASARMAAINFLLGTGLLKAMKDTKGVVSFRAVLKKELDVKKDMSGEENMVLSHIQASGNEGIWTKHLKAKTELHQTVIDRCLKSLVQKQLIKAVKSVKYPTRKIYMLFHLDPSVEMTGGPWYTDNELDTEFIKLLCSACLRFIREKSLPKSKSTSEDSSSRTQPLYPISAAPPYPTAQQILAFLSKSRITETQLNVEHVEMLLNVLVLDGEIEKVPAFAASLWDSSMNAGDDRDGSDSEDESEAERKRRKRKGKEKDSGSRSLKRKRSKKSRSDSESDSDSEEEAERYKAKKRRRKAQDSDSDEDMDRDRKRKRKKRRHDDESDESGSDDSDSGKNERKKSKSKSKSRNRKRKHDSSESESESLSETASSGSEDGSSWRSKSKSKSKSKSSSKSSRAKRSSSPAMDASGGIDISDSFGGAYVYRAIKQERVALGLSQAPCTRCPTFDFCKSGGPVDSQECVYYGDWLAMANVARE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.36
3	0.33
4	0.38
5	0.37
6	0.27
7	0.24
8	0.25
9	0.29
10	0.31
11	0.36
12	0.33
13	0.34
14	0.37
15	0.41
16	0.41
17	0.4
18	0.4
19	0.35
20	0.29
21	0.26
22	0.21
23	0.18
24	0.16
25	0.14
26	0.1
27	0.09
28	0.08
29	0.08
30	0.07
31	0.07
32	0.07
33	0.07
34	0.07
35	0.05
36	0.06
37	0.06
38	0.07
39	0.07
40	0.07
41	0.09
42	0.14
43	0.15
44	0.16
45	0.17
46	0.21
47	0.28
48	0.29
49	0.29
50	0.28
51	0.31
52	0.34
53	0.4
54	0.37
55	0.32
56	0.34
57	0.38
58	0.44
59	0.46
60	0.45
61	0.42
62	0.43
63	0.45
64	0.46
65	0.41
66	0.34
67	0.3
68	0.28
69	0.25
70	0.23
71	0.17
72	0.15
73	0.14
74	0.11
75	0.09
76	0.08
77	0.07
78	0.07
79	0.11
80	0.12
81	0.12
82	0.13
83	0.13
84	0.13
85	0.15
86	0.19
87	0.17
88	0.21
89	0.23
90	0.26
91	0.31
92	0.39
93	0.45
94	0.52
95	0.51
96	0.49
97	0.51
98	0.49
99	0.48
100	0.46
101	0.43
102	0.32
103	0.31
104	0.31
105	0.27
106	0.32
107	0.35
108	0.38
109	0.41
110	0.43
111	0.44
112	0.5
113	0.54
114	0.49
115	0.45
116	0.44
117	0.4
118	0.41
119	0.47
120	0.46
121	0.5
122	0.54
123	0.55
124	0.54
125	0.51
126	0.49
127	0.48
128	0.48
129	0.46
130	0.43
131	0.39
132	0.34
133	0.32
134	0.3
135	0.26
136	0.19
137	0.11
138	0.09
139	0.08
140	0.09
141	0.09
142	0.09
143	0.07
144	0.08
145	0.1
146	0.1
147	0.1
148	0.09
149	0.1
150	0.11
151	0.11
152	0.1
153	0.09
154	0.08
155	0.08
156	0.08
157	0.08
158	0.08
159	0.09
160	0.09
161	0.13
162	0.17
163	0.2
164	0.24
165	0.25
166	0.31
167	0.35
168	0.43
169	0.45
170	0.52
171	0.5
172	0.49
173	0.52
174	0.48
175	0.48
176	0.47
177	0.45
178	0.38
179	0.41
180	0.42
181	0.42
182	0.41
183	0.37
184	0.31
185	0.27
186	0.25
187	0.22
188	0.21
189	0.17
190	0.16
191	0.16
192	0.18
193	0.17
194	0.16
195	0.15
196	0.13
197	0.14
198	0.13
199	0.13
200	0.11
201	0.12
202	0.12
203	0.12
204	0.12
205	0.11
206	0.1
207	0.11
208	0.12
209	0.12
210	0.13
211	0.13
212	0.15
213	0.21
214	0.22
215	0.27
216	0.28
217	0.29
218	0.27
219	0.25
220	0.22
221	0.16
222	0.14
223	0.07
224	0.05
225	0.04
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.02
231	0.03
232	0.02
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.04
238	0.04
239	0.03
240	0.04
241	0.03
242	0.05
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.07
248	0.07
249	0.07
250	0.06
251	0.05
252	0.05
253	0.05
254	0.05
255	0.06
256	0.07
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.08
261	0.08
262	0.09
263	0.08
264	0.08
265	0.13
266	0.14
267	0.2
268	0.26
269	0.32
270	0.42
271	0.51
272	0.61
273	0.68
274	0.77
275	0.82
276	0.87
277	0.9
278	0.89
279	0.89
280	0.85
281	0.83
282	0.78
283	0.75
284	0.71
285	0.71
286	0.7
287	0.7
288	0.73
289	0.75
290	0.8
291	0.82
292	0.85
293	0.86
294	0.88
295	0.85
296	0.82
297	0.76
298	0.68
299	0.6
300	0.5
301	0.41
302	0.31
303	0.24
304	0.19
305	0.15
306	0.12
307	0.1
308	0.1
309	0.12
310	0.13
311	0.21
312	0.27
313	0.37
314	0.46
315	0.55
316	0.64
317	0.73
318	0.82
319	0.83
320	0.87
321	0.87
322	0.86
323	0.81
324	0.72
325	0.63
326	0.52
327	0.43
328	0.35
329	0.3
330	0.26
331	0.28
332	0.34
333	0.42
334	0.53
335	0.62
336	0.72
337	0.77
338	0.85
339	0.9
340	0.93
341	0.94
342	0.93
343	0.92
344	0.89
345	0.85
346	0.76
347	0.64
348	0.53
349	0.43
350	0.33
351	0.24
352	0.15
353	0.1
354	0.09
355	0.11
356	0.14
357	0.22
358	0.28
359	0.35
360	0.44
361	0.5
362	0.59
363	0.67
364	0.75
365	0.78
366	0.83
367	0.86
368	0.89
369	0.92
370	0.94
371	0.95
372	0.93
373	0.94
374	0.93
375	0.93
376	0.91
377	0.91
378	0.87
379	0.84
380	0.83
381	0.77
382	0.67
383	0.56
384	0.47
385	0.38
386	0.3
387	0.22
388	0.13
389	0.08
390	0.07
391	0.08
392	0.08
393	0.06
394	0.06
395	0.06
396	0.06
397	0.08
398	0.12
399	0.14
400	0.14
401	0.19
402	0.22
403	0.28
404	0.37
405	0.46
406	0.53
407	0.63
408	0.72
409	0.77
410	0.85
411	0.9
412	0.9
413	0.89
414	0.89
415	0.88
416	0.88
417	0.87
418	0.87
419	0.84
420	0.79
421	0.76
422	0.75
423	0.75
424	0.7
425	0.65
426	0.56
427	0.51
428	0.46
429	0.39
430	0.31
431	0.22
432	0.17
433	0.11
434	0.1
435	0.07
436	0.08
437	0.08
438	0.07
439	0.05
440	0.06
441	0.06
442	0.06
443	0.07
444	0.1
445	0.12
446	0.14
447	0.18
448	0.2
449	0.24
450	0.26
451	0.32
452	0.29
453	0.3
454	0.3
455	0.27
456	0.27
457	0.29
458	0.27
459	0.24
460	0.26
461	0.25
462	0.25
463	0.31
464	0.31
465	0.27
466	0.31
467	0.35
468	0.4
469	0.46
470	0.5
471	0.45
472	0.51
473	0.51
474	0.49
475	0.43
476	0.39
477	0.35
478	0.33
479	0.34
480	0.28
481	0.26
482	0.24
483	0.24
484	0.21
485	0.19
486	0.16
487	0.14
488	0.13
489	0.13
490	0.12
491	0.12

A0A1X6MQ50

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer