Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X6NFW1

Protein Details
Accession A0A1X6NFW1    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
185-209IEDGRKPKKEIPKRKNKHSPQEVSSBasic
356-390GGRGAVKKAIDKRQKKTSQKEKKRRPFAPGQTAGPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-12PRPATRRP
179-217KGKGKEIEDGRKPKKEIPKRKNKHSPQEVSSKKPVARKK
306-341RREKIEHEALGKVAKEEKEKRSAGKGAWYLKNADKK
354-413ASGGRGAVKKAIDKRQKKTSQKEKKRRPFAPGQTAGPARKRTSSGPEDDGQRSGKRRRMG
Subcellular Location(s) mito 17, mito_nucl 13.333, cyto_mito 9.833, nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009292  RRP36  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0000469  P:cleavage involved in rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF06102  RRP36  
Amino Acid Sequences MPRRPRPATRRPPPKAVLVAPAAPALTSPTAARQKQSQHEQPRDPAASDPEIESENDALESDEEEDAASGSSSSNSSHGSDIEDEIEDVDVDAPRVAQYVDEEDLDGLDTESEPESSSEEEEPLHLVRELPYLASLPFGALRNAQKTLSRATAFSDSEDEETEDEVSGPEQDTSRSDAKGKGKEIEDGRKPKKEIPKRKNKHSPQEVSSKKPVARKKLGVEESKVVPRDPRFLTLAGEFDSKRFQTQYGFLAGMHTHEMKTLRDNLKRARKLLANSPRDLREEREQEVQRLERAYKRAESQVSKDRREKIEHEALGKVAKEEKEKRSAGKGAWYLKNADKKELLLRAKYDALAASGGRGAVKKAIDKRQKKTSQKEKKRRPFAPGQTAGPARKRTSSGPEDDGQRSGKRRRMG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.76
3 0.67
4 0.63
5 0.56
6 0.51
7 0.42
8 0.39
9 0.3
10 0.23
11 0.19
12 0.16
13 0.13
14 0.12
15 0.11
16 0.19
17 0.28
18 0.3
19 0.33
20 0.36
21 0.44
22 0.52
23 0.62
24 0.63
25 0.65
26 0.73
27 0.77
28 0.76
29 0.76
30 0.69
31 0.6
32 0.53
33 0.48
34 0.41
35 0.35
36 0.31
37 0.24
38 0.23
39 0.22
40 0.2
41 0.15
42 0.12
43 0.11
44 0.1
45 0.09
46 0.08
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.07
54 0.07
55 0.06
56 0.05
57 0.05
58 0.06
59 0.07
60 0.07
61 0.09
62 0.11
63 0.12
64 0.13
65 0.13
66 0.15
67 0.16
68 0.16
69 0.16
70 0.14
71 0.13
72 0.12
73 0.12
74 0.09
75 0.08
76 0.08
77 0.06
78 0.07
79 0.07
80 0.06
81 0.06
82 0.07
83 0.07
84 0.06
85 0.07
86 0.1
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.09
94 0.06
95 0.05
96 0.05
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.09
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.11
116 0.11
117 0.09
118 0.1
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.08
123 0.06
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.12
128 0.15
129 0.17
130 0.19
131 0.19
132 0.2
133 0.21
134 0.23
135 0.25
136 0.23
137 0.2
138 0.22
139 0.26
140 0.23
141 0.23
142 0.21
143 0.17
144 0.17
145 0.17
146 0.15
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.08
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.08
160 0.12
161 0.14
162 0.14
163 0.16
164 0.21
165 0.27
166 0.31
167 0.32
168 0.32
169 0.31
170 0.36
171 0.38
172 0.4
173 0.42
174 0.46
175 0.49
176 0.5
177 0.51
178 0.51
179 0.58
180 0.6
181 0.64
182 0.65
183 0.72
184 0.74
185 0.83
186 0.88
187 0.87
188 0.87
189 0.85
190 0.81
191 0.73
192 0.76
193 0.69
194 0.63
195 0.59
196 0.53
197 0.46
198 0.47
199 0.48
200 0.47
201 0.5
202 0.5
203 0.49
204 0.54
205 0.57
206 0.53
207 0.5
208 0.44
209 0.4
210 0.39
211 0.35
212 0.27
213 0.24
214 0.23
215 0.26
216 0.24
217 0.24
218 0.22
219 0.22
220 0.23
221 0.2
222 0.2
223 0.15
224 0.16
225 0.14
226 0.12
227 0.15
228 0.13
229 0.14
230 0.13
231 0.13
232 0.13
233 0.15
234 0.17
235 0.16
236 0.16
237 0.15
238 0.16
239 0.15
240 0.13
241 0.13
242 0.11
243 0.09
244 0.11
245 0.12
246 0.12
247 0.15
248 0.23
249 0.28
250 0.32
251 0.37
252 0.44
253 0.53
254 0.57
255 0.55
256 0.52
257 0.5
258 0.49
259 0.54
260 0.55
261 0.5
262 0.48
263 0.51
264 0.48
265 0.47
266 0.45
267 0.4
268 0.39
269 0.38
270 0.38
271 0.43
272 0.42
273 0.41
274 0.44
275 0.41
276 0.34
277 0.33
278 0.33
279 0.29
280 0.31
281 0.32
282 0.3
283 0.32
284 0.36
285 0.39
286 0.4
287 0.42
288 0.48
289 0.52
290 0.55
291 0.58
292 0.59
293 0.58
294 0.6
295 0.57
296 0.56
297 0.58
298 0.54
299 0.5
300 0.44
301 0.4
302 0.37
303 0.33
304 0.26
305 0.21
306 0.21
307 0.27
308 0.34
309 0.39
310 0.44
311 0.47
312 0.49
313 0.51
314 0.53
315 0.46
316 0.47
317 0.48
318 0.48
319 0.5
320 0.48
321 0.46
322 0.47
323 0.54
324 0.47
325 0.46
326 0.39
327 0.37
328 0.42
329 0.46
330 0.45
331 0.41
332 0.41
333 0.4
334 0.4
335 0.38
336 0.32
337 0.24
338 0.2
339 0.17
340 0.15
341 0.12
342 0.11
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.11
347 0.13
348 0.16
349 0.22
350 0.29
351 0.4
352 0.49
353 0.58
354 0.65
355 0.72
356 0.8
357 0.83
358 0.86
359 0.87
360 0.88
361 0.9
362 0.94
363 0.94
364 0.95
365 0.96
366 0.91
367 0.88
368 0.88
369 0.87
370 0.86
371 0.81
372 0.73
373 0.7
374 0.7
375 0.67
376 0.64
377 0.6
378 0.52
379 0.51
380 0.51
381 0.48
382 0.52
383 0.54
384 0.53
385 0.52
386 0.54
387 0.55
388 0.54
389 0.53
390 0.48
391 0.47
392 0.49
393 0.52